More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_2928 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_1925  ABC transporter related  57.98 
 
 		 726 aa  659    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2881  ABC transporter related protein  71.84 
 
 		 608 aa  781    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000328864  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1157  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease components  60.03 
 
 		 638 aa  642    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0429798  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1444  ABC transporter-like protein  73.56 
 
 		 613 aa  843    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0895961  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3228  ABC transporter related protein  63.12 
 
 		 591 aa  666    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3407  ABC transporter related  60.13 
 
 		 625 aa  641    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0356305 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5718  ABC transporter related  62.35 
 
 		 589 aa  709    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2928  ABC transporter, HlyB/MsbA family  100 
 
 		 602 aa  1174    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.807188  normal  0.509369 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3034  ABC transporter related  62.74 
 
 		 597 aa  681    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.624415  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3184  ABC transporter related protein  60.13 
 
 		 671 aa  679    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0347906  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3181  ABC transporter related  61.51 
 
 		 625 aa  632  1e-180  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.368888 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3979  ABC transporter related protein  57 
 
 		 609 aa  625  1e-178  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4360  ABC transporter related  54.15 
 
 		 610 aa  573  1.0000000000000001e-162  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12840  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  51.03 
 
 		 617 aa  551  1e-155  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.376239  normal  0.0776203 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1995  ABC transporter related protein  55.59 
 
 		 635 aa  530  1e-149  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.589214  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20810  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  50.58 
 
 		 606 aa  505  9.999999999999999e-143  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.391072  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27260  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  47.32 
 
 		 730 aa  491  1e-137  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0467711  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1493  ABC transporter related protein  48.74 
 
 		 605 aa  490  1e-137  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.625489  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2231  ABC transporter related  52.31 
 
 		 608 aa  479  1e-134  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1209  ABC transporter related  44.2 
 
 		 584 aa  428  1e-118  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3763  ABC transporter related  42.54 
 
 		 984 aa  305  1.0000000000000001e-81  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.849502  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2448  ABC transporter, ATP-binding  29.61 
 
 		 594 aa  281  2e-74  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.946245 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4712  ABC transporter related  37.28 
 
 		 631 aa  277  4e-73  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.576376  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12933  ATPase  28.94 
 
 		 585 aa  275  2.0000000000000002e-72  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.756809  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5296  ABC transporter related  36.93 
 
 		 1522 aa  273  6e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6413  ABC transporter related  36.12 
 
 		 577 aa  270  4e-71  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.637608  normal  0.411769 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2922  ABC transporter related protein  36.72 
 
 		 581 aa  268  2e-70  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.364865  normal  0.717354 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2628  ABC transporter related  34.39 
 
 		 583 aa  266  7e-70  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1525  ABC transporter related  31.43 
 
 		 581 aa  266  8.999999999999999e-70  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.628149  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2616  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  31.53 
 
 		 577 aa  265  2e-69  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0639798  normal  0.935147 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30570  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  38.59 
 
 		 1257 aa  265  2e-69  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2998  ABC transporter related protein  31.71 
 
 		 575 aa  264  3e-69  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000215819  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1429  ABC transporter related  37.68 
 
 		 1284 aa  264  4e-69  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.442581  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6331  ABC transporter related protein  30.47 
 
 		 593 aa  262  1e-68  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3626  ABC transporter related  32.73 
 
 		 588 aa  262  1e-68  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.058238  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1516  ABC transporter related  39.43 
 
 		 1231 aa  261  2e-68  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.347232 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2180  ABC transporter related  29.87 
 
 		 582 aa  261  2e-68  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4923  ABC transporter related  28.42 
 
 		 593 aa  260  5.0000000000000005e-68  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0406307 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0505  hypothetical protein  29.5 
 
 		 606 aa  260  5.0000000000000005e-68  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18960  ABC transporter related  27.85 
 
 		 556 aa  259  9e-68  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0787  lipid export ABC transport protein  27.49 
 
 		 572 aa  258  2e-67  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.113646  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1399  ABC transporter related  28.98 
 
 		 596 aa  253  6e-66  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0150403 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0378  ABC transporter related  34.29 
 
 		 577 aa  253  7e-66  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0641  ABC transporter related  31.07 
 
 		 577 aa  253  8.000000000000001e-66  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.061779  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2836  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  30.6 
 
 		 585 aa  253  8.000000000000001e-66  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.333651  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1514  ABC transporter, ATPase subunit  31.73 
 
 		 591 aa  252  1e-65  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.143347  normal  0.756975 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0650  ABC transporter related  31.99 
 
 		 577 aa  252  1e-65  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.430432  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1343  ABC transporter related  29.44 
 
 		 577 aa  252  1e-65  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3781  ABC transporter related  28.71 
 
 		 588 aa  252  1e-65  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000284212  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0625  ABC transporter related  31.8 
 
 		 577 aa  252  1e-65  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1706  ABC transporter related  30.72 
 
 		 586 aa  250  5e-65  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000217452  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6252  ABC transporter related  37.84 
 
 		 1436 aa  250  6e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2506  ABC transporter related protein  34.31 
 
 		 578 aa  249  1e-64  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.120759  normal  0.309345 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1597  ABC transporter related  30.71 
 
 		 583 aa  249  1e-64  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3783  ABC transporter related  35.43 
 
 		 1301 aa  248  2e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.377067  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0830  ABC transporter related  35.63 
 
 		 612 aa  248  2e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000934514 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2301  ABC transporter-like protein protein  31.57 
 
 		 583 aa  248  2e-64  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2748  ABC transporter related  32.86 
 
 		 595 aa  249  2e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3415  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  33.58 
 
 		 580 aa  247  3e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2197  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease components  35.64 
 
 		 627 aa  247  4e-64  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09400  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  32.7 
 
 		 578 aa  247  4e-64  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.780202  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2798  ABC transporter related  34.25 
 
 		 611 aa  247  4.9999999999999997e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3252  ABC transporter related  39.12 
 
 		 577 aa  246  6e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.516071  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1429  ABC transporter related  28.63 
 
 		 581 aa  246  6.999999999999999e-64  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1259  ATP-binding transport protein; multicopy suppressor of HtrB  32.12 
 
 		 579 aa  246  8e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2351  ABC transporter related protein  33.53 
 
 		 581 aa  246  8e-64  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.589414  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4827  ABC transporter related  34.33 
 
 		 641 aa  246  8e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.42011 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1166  ABC transporter related protein  29.04 
 
 		 588 aa  246  8e-64  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2703  ABC transporter-related protein  34.25 
 
 		 611 aa  246  9.999999999999999e-64  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1250  ABC transporter, ATP-binding protein  30.99 
 
 		 604 aa  246  9.999999999999999e-64  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00143997 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3025  ABC transporter related  31.35 
 
 		 582 aa  246  9.999999999999999e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0544  ABC transporter related  31.43 
 
 		 587 aa  245  1.9999999999999999e-63  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3356  ABC transporter related  37.78 
 
 		 577 aa  245  1.9999999999999999e-63  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2200  ABC transporter related  27.89 
 
 		 592 aa  245  1.9999999999999999e-63  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.257555  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21680  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  35.44 
 
 		 579 aa  244  3e-63  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1955  ABC transporter, transmembrane region  31.6 
 
 		 607 aa  244  3.9999999999999997e-63  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.464432 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0839  ABC transporter-related protein  30 
 
 		 585 aa  244  3.9999999999999997e-63  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.677417  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1938  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  31.28 
 
 		 593 aa  244  3.9999999999999997e-63  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3639  ABC transporter related  37.44 
 
 		 582 aa  244  3.9999999999999997e-63  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1890  ABC transporter related  30.66 
 
 		 586 aa  244  3.9999999999999997e-63  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0664725  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0270  ABC transporter related  34.44 
 
 		 626 aa  244  3.9999999999999997e-63  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2781  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  30.1 
 
 		 609 aa  244  5e-63  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000466613  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0802  ABC transporter-like protein  32.21 
 
 		 572 aa  243  6e-63  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3940  ABC transporter related  31.85 
 
 		 595 aa  243  6e-63  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4014  ABC transporter related  31.85 
 
 		 595 aa  243  6e-63  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.606422  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3954  ABC transporter related  31.85 
 
 		 595 aa  243  6e-63  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.320073  decreased coverage  0.00177663 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0289  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  29.78 
 
 		 600 aa  243  7e-63  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1773  ABC transporter related  28.71 
 
 		 581 aa  243  7e-63  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.0000430308  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2050  ABC transporter related protein  38.44 
 
 		 581 aa  243  7e-63  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.382467  normal  0.714233 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2584  ABC transporter, transmembrane region:ABC transporter related  33.83 
 
 		 768 aa  243  7.999999999999999e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0387  ABC transporter-related protein  30.89 
 
 		 634 aa  243  7.999999999999999e-63  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.112413  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1416  ABC transporter related  30.52 
 
 		 601 aa  243  9e-63  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.218265  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4445  ABC transporter related  34.14 
 
 		 650 aa  243  1e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.789394  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4532  ABC transporter related  34.14 
 
 		 650 aa  243  1e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.329885  normal  0.446055 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0219  ABC transporter related  31.76 
 
 		 582 aa  242  1e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.523639  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0367  ABC transporter related  30.82 
 
 		 618 aa  242  1e-62  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0353572 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0674  ABC transporter related  29.25 
 
 		 589 aa  242  1e-62  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1440  ABC transporter related protein  37 
 
 		 596 aa  241  2e-62  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.531129 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3423  ABC transporter-related protein  32.34 
 
 		 611 aa  241  2e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000173526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0159  ABC transporter related  32.93 
 
 		 541 aa  242  2e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>