53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_0747 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_0747  cupin-like protein  100 
 
 		 169 aa  334  2.9999999999999997e-91  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.179804  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2878  Cupin 2 conserved barrel domain-containing protein  45.91 
 
 		 161 aa  148  4e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.505096  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1878  Cupin 2 conserved barrel domain-containing protein  43.14 
 
 		 158 aa  119  1.9999999999999998e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.0087666  normal  0.0137906 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5299  hypothetical protein  37.21 
 
 		 166 aa  74.3  0.0000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148055  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2141  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.38 
 
 		 159 aa  71.2  0.000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0144  cupin 2 domain-containing protein  31.29 
 
 		 165 aa  68.6  0.00000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0604  cupin 2, barrel  34.75 
 
 		 165 aa  65.5  0.0000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.398371  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0617  cupin 2 domain-containing protein  34.75 
 
 		 165 aa  65.5  0.0000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.546436  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0595  cupin 2 domain-containing protein  34.75 
 
 		 165 aa  65.5  0.0000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.906672  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0760  cupin 2 domain-containing protein  32.09 
 
 		 178 aa  61.2  0.000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.26011  normal  0.519438 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2790  cupin 2 domain-containing protein  38.24 
 
 		 153 aa  59.3  0.00000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1228  Cupin 2 conserved barrel domain protein  39.08 
 
 		 135 aa  55.5  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.066401  normal  0.685252 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4562  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.92 
 
 		 153 aa  54.7  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5660  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.04 
 
 		 170 aa  54.3  0.0000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.215719 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1181  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.89 
 
 		 192 aa  53.1  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.229288 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3405  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.3 
 
 		 156 aa  53.1  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0565  hypothetical protein  31.19 
 
 		 155 aa  52  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.916683  normal  0.52627 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6233  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.51 
 
 		 163 aa  52  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.398434  normal  0.379299 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3902  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27.64 
 
 		 166 aa  51.2  0.000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.760355  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0950  Cupin 2 conserved barrel domain protein  39.73 
 
 		 389 aa  49.7  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4882  hypothetical protein  24.48 
 
 		 145 aa  49.3  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.192272  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2964  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.32 
 
 		 160 aa  49.3  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.75352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5062  hypothetical protein  31.52 
 
 		 157 aa  48.1  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.421326  normal  0.406339 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2609  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.91 
 
 		 160 aa  48.1  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.629  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3189  cupin 2, barrel  33.33 
 
 		 190 aa  48.1  0.00006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00000805068  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0692  cupin 2 domain-containing protein  39.39 
 
 		 163 aa  47.8  0.00007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5545  cupin 2 domain-containing protein  33.7 
 
 		 141 aa  47.8  0.00007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0105  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27.27 
 
 		 204 aa  47.8  0.00008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1864  Cupin 2 conserved barrel domain protein  23.68 
 
 		 144 aa  47.4  0.00009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3191  cupin 2, barrel  31.67 
 
 		 179 aa  47  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000053457  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3153  cupin 2 domain-containing protein  30.69 
 
 		 135 aa  47  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1709  cupin 2, barrel  27.5 
 
 		 163 aa  47.4  0.0001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.448021 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0102  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27.27 
 
 		 204 aa  47.4  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.66506 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0633  cupin 2 domain-containing protein  28.1 
 
 		 158 aa  47  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.643791  normal  0.229137 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3608  cupin 2 domain-containing protein  39.77 
 
 		 159 aa  45.8  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.13649  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3363  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.28 
 
 		 181 aa  45.8  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.331871 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3707  cupin 2, barrel  32.58 
 
 		 138 aa  44.3  0.0008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.52835  normal  0.602346 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3791  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.72 
 
 		 159 aa  43.9  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.302037  normal  0.0222415 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1435  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.31 
 
 		 122 aa  43.9  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.438384  normal  0.13585 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1368  hypothetical protein  32.88 
 
 		 116 aa  44.3  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.505892  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1128  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.42 
 
 		 111 aa  43.5  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00311434  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1923  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.84 
 
 		 145 aa  43.5  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0356258  normal  0.456316 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0483  Cupin 2 conserved barrel domain protein  23.66 
 
 		 172 aa  43.5  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.319109  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1021  transcriptional regulator, XRE family  37.04 
 
 		 191 aa  42.4  0.003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.438557  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3067  cupin 2 domain-containing protein  25.58 
 
 		 145 aa  42.4  0.003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2309  hypothetical protein  27.59 
 
 		 139 aa  42  0.004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.5332  hitchhiker  0.00622303 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2586  Cupin 2 conserved barrel domain protein  43.75 
 
 		 126 aa  42  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000628471  hitchhiker  0.000111842 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2191  cupin region  30.77 
 
 		 122 aa  41.6  0.006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.357832  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0425  Cupin 2 conserved barrel domain protein  39.22 
 
 		 110 aa  41.2  0.006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0839073  hitchhiker  0.0000787974 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0109  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.7 
 
 		 377 aa  40.8  0.008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.146013 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1714  cupin 2 domain-containing protein  28.42 
 
 		 150 aa  40.8  0.008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.259313 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4666  transcriptional regulator, XRE family  39.22 
 
 		 197 aa  40.8  0.009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.223091  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4297  cupin 2 domain-containing protein  31.08 
 
 		 144 aa  40.8  0.01  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>