More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_0436 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_4378  FAD-binding protein  86.97 
 
 		 436 aa  765    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0332  monooxygenase FAD-binding  94.16 
 
 		 429 aa  837    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4606  tryptophan halogenase  72.97 
 
 		 420 aa  645    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.577017 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0436  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 429 aa  894    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3389  FAD-binding protein  77.97 
 
 		 424 aa  688    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0337  monooxygenase FAD-binding  94.16 
 
 		 429 aa  838    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0340  monooxygenase, FAD-binding  86.18 
 
 		 435 aa  778    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3686  monooxygenase, FAD-binding protein  86.18 
 
 		 435 aa  779    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0342  tryptophan halogenase  79.8 
 
 		 422 aa  695    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0340  monooxygenase FAD-binding  94.39 
 
 		 429 aa  841    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.131128 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3521  tryptophan halogenase  75.12 
 
 		 424 aa  645    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.956189  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0331  monooxygenase, FAD-binding  85.71 
 
 		 435 aa  775    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0330  monooxygenase FAD-binding  93.93 
 
 		 429 aa  841    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0315  tryptophan halogenase  72.12 
 
 		 420 aa  632  1e-180  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000735026 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3898  tryptophan halogenase  71.84 
 
 		 429 aa  627  1e-178  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004059  FAD-binding protein inferred for ABFAE pathway  64.52 
 
 		 414 aa  546  1e-154  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.371428  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2108  FAD dependent oxidoreductase  60.88 
 
 		 413 aa  526  1e-148  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.478337  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5104  hypothetical protein  58.71 
 
 		 415 aa  495  1e-139  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4387  tryptophan halogenase  58.91 
 
 		 409 aa  497  1e-139  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000478087  normal  0.336171 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0428  monooxygenase, FAD-binding  58.25 
 
 		 415 aa  485  1e-136  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00208516  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0428  FAD dependent oxidoreductase  61.25 
 
 		 410 aa  488  1e-136  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.25324  normal  0.196339 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3913  monooxygenase FAD-binding  56.93 
 
 		 416 aa  481  1e-134  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.445041  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0708  monooxygenase FAD-binding  55.77 
 
 		 416 aa  476  1e-133  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1615  dehydrogenase  58.35 
 
 		 405 aa  477  1e-133  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5621  monooxygenase, FAD-binding:FAD dependent oxidoreductase:tryptophan halogenase  55.58 
 
 		 409 aa  473  1e-132  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4779  monooxygenase FAD-binding  52.64 
 
 		 419 aa  470  1.0000000000000001e-131  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3702  monooxygenase FAD-binding  52.64 
 
 		 419 aa  470  1.0000000000000001e-131  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.378943  normal  0.20919 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3883  monooxygenase FAD-binding  55.83 
 
 		 409 aa  459  9.999999999999999e-129  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.964641  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00759  putative oxidoreductase protein  53.35 
 
 		 419 aa  445  1.0000000000000001e-124  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.134999  normal  0.0681702 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0945  putative oxidoreductase  53.71 
 
 		 414 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.183705  normal  0.443912 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3046  tryptophan halogenase  53.71 
 
 		 414 aa  444  1e-123  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0354433  normal  0.187901 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4091  tryptophan halogenase  52.71 
 
 		 415 aa  438  9.999999999999999e-123  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3616  tryptophan halogenase  52.96 
 
 		 415 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.190224  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1497  tryptophan halogenase  53.73 
 
 		 406 aa  437  1e-121  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.756039  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2756  FAD dependent oxidoreductase  50.9 
 
 		 417 aa  409  1e-113  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.471979  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2822  flavoprotein/dehydrogenase  43.6 
 
 		 413 aa  365  1e-100  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1863  tryptophan halogenase  43.84 
 
 		 415 aa  357  1.9999999999999998e-97  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03920  Monooxygenase, FAD-binding:FAD dependent oxidoreductase:Tryptophanhalogenase  41.32 
 
 		 415 aa  336  5e-91  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.117201  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2003  tryptophan halogenase  41.09 
 
 		 415 aa  335  1e-90  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.923769 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0135  tryptophan halogenase  39.17 
 
 		 417 aa  318  2e-85  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.138396  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1110  tryptophan halogenase  40.19 
 
 		 416 aa  301  1e-80  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03738  hydroxylase  32.5 
 
 		 461 aa  189  1e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3957  tryptophan halogenase  29.64 
 
 		 444 aa  165  1.0000000000000001e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1494  oxidoreductase, FAD-binding, putative  29.6 
 
 		 455 aa  163  5.0000000000000005e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0467837  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3311  tryptophan halogenase  30.92 
 
 		 449 aa  162  7e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4197  monooxygenase, FAD-binding:FAD dependent oxidoreductase:tryptophan halogenase  30.67 
 
 		 444 aa  162  1e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.107815 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2333  FAD binding domain-containing protein  32.33 
 
 		 480 aa  162  1e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0931  tryptophan halogenase  29.59 
 
 		 439 aa  160  3e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0788  non-heme halogenase, putative  29.59 
 
 		 439 aa  160  3e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.702938  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2119  tryptophan halogenase  34.77 
 
 		 507 aa  160  3e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0671126  normal  0.0332938 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3184  tryptophan halogenase  28.64 
 
 		 441 aa  159  8e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.153347  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2465  tryptophan halogenase  32.27 
 
 		 495 aa  158  2e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.842716  normal  0.17253 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2237  tryptophan halogenase  30.15 
 
 		 444 aa  154  2e-36  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3116  tryptophan halogenase  33 
 
 		 417 aa  150  3e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.406166  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2969  tryptophan halogenase  27.72 
 
 		 455 aa  149  6e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.339747  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4161  putative tryptophan halogenase  31.3 
 
 		 470 aa  149  9e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.326464 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1332  oxidoreductase, FAD-binding, putative  28.39 
 
 		 449 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.401661  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2763  oxidoreductase, FAD-binding, putative  27.42 
 
 		 445 aa  145  1e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2048  putative tryptophan halogenase  32.07 
 
 		 480 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.826968  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1005  FAD binding domain-containing protein  32.07 
 
 		 480 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0347975  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2240  alkylhalidase  32.07 
 
 		 480 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.345155  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2103  putative tryptophan halogenase  32.07 
 
 		 480 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0674783  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2031  tryptophan halogenase  28.97 
 
 		 413 aa  132  1.0000000000000001e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0818162  normal  0.0655371 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0530  tryptophan halogenase  27.95 
 
 		 491 aa  131  2.0000000000000002e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.680136  normal  0.208224 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2065  tryptophan halogenase  32.11 
 
 		 439 aa  127  5e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.215345 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1825  FAD dependent oxidoreductase  24.64 
 
 		 455 aa  126  7e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.133963  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10884  conserved hypothetical protein  30.77 
 
 		 647 aa  125  2e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.106325 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2724  tryptophan halogenase  28.28 
 
 		 506 aa  122  9e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.656683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3158  tryptophan halogenase  27.44 
 
 		 584 aa  99.8  8e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000257719 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3552  FAD dependent oxidoreductase  23.67 
 
 		 563 aa  99.8  9e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5510  tryptophan halogenase  25.91 
 
 		 587 aa  92.8  1e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.211989 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2641  monooxygenase, FAD-binding  26.49 
 
 		 401 aa  90.5  5e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6353  FAD dependent oxidoreductase  24.16 
 
 		 606 aa  87.8  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000576963 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02880  halogenase  27.02 
 
 		 540 aa  87  6e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0023  geranylgeranyl reductase  25.23 
 
 		 398 aa  86.3  9e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2756  tryptophan halogenase  27.89 
 
 		 618 aa  85.9  0.000000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3043  geranylgeranyl reductase  26.07 
 
 		 376 aa  84  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.483009 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0437  FAD dependent oxidoreductase  23.87 
 
 		 549 aa  83.6  0.000000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2279  geranylgeranyl reductase  25.53 
 
 		 413 aa  82.8  0.00000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0260  monooxygenase FAD-binding  26.61 
 
 		 568 aa  82.4  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.958147  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5928  FAD dependent oxidoreductase  22.22 
 
 		 515 aa  80.9  0.00000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00202441  hitchhiker  0.00883605 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6189  FAD dependent oxidoreductase  23.1 
 
 		 549 aa  80.1  0.00000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.386656  normal  0.0972683 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6985  FAD dependent oxidoreductase  24.37 
 
 		 566 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.176502  normal  0.543352 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5266  FAD dependent oxidoreductase  24.09 
 
 		 566 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4728  FAD dependent oxidoreductase  24.09 
 
 		 566 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6708  FAD dependent oxidoreductase  24.09 
 
 		 566 aa  77.4  0.0000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4493  monooxygenase FAD-binding  25.41 
 
 		 488 aa  76.3  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.575117  normal  0.0380746 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1087  electron transfer flavoprotein  23.02 
 
 		 384 aa  75.5  0.000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.384904  normal  0.110599 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2269  geranylgeranyl reductase  26.99 
 
 		 398 aa  75.5  0.000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2887  halogenase PrnC  23.81 
 
 		 566 aa  73.9  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.939862  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1117  PrnC  23.81 
 
 		 566 aa  73.6  0.000000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1134  geranylgeranyl reductase  24.63 
 
 		 389 aa  73.6  0.000000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.719323  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2735  halogenase PrnC  23.81 
 
 		 566 aa  73.6  0.000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2388  flavoprotein-containing dehydrogenase  25.46 
 
 		 414 aa  73.2  0.000000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0523144  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01623  conserved hypothetical protein  24.21 
 
 		 476 aa  72.4  0.00000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.282796 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2626  monooxygenase FAD-binding  21.64 
 
 		 356 aa  72.4  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3109  monooxygenase FAD-binding  24.2 
 
 		 444 aa  72.4  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1066  geranylgeranyl reductase  25.81 
 
 		 382 aa  71.2  0.00000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000111291  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1397  putative halogenase  22.59 
 
 		 552 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.666039  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0003  halogenase PrnC  22.59 
 
 		 552 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.567897  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>