More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_6001 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_6001  NmrA family protein  100 
 
 		 281 aa  553  1e-156  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0281153 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6618  NmrA family protein  57.14 
 
 		 282 aa  296  2e-79  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1963  NmrA family protein  52.25 
 
 		 296 aa  265  5.999999999999999e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.145776 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5809  NmrA family protein  37.68 
 
 		 279 aa  164  1.0000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.839032  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3559  NmrA family protein  38.3 
 
 		 283 aa  161  1e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4300  NmrA family protein  38.38 
 
 		 268 aa  154  1e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.620911  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0344  NmrA family protein  38.85 
 
 		 281 aa  152  7e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1213  NmrA family protein  35.07 
 
 		 273 aa  142  5e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.423436  normal  0.352226 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0272  NmrA family protein  34.98 
 
 		 274 aa  139  4.999999999999999e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5185  NADPH:quinone reductase and related Zn-dependent oxidoreductase-like protein  36.27 
 
 		 584 aa  132  3.9999999999999996e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0220056 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7958  nucleotide-diphosphate-sugar epimerase  35.74 
 
 		 271 aa  131  2.0000000000000002e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5261  NmrA family protein  35.17 
 
 		 271 aa  128  1.0000000000000001e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1235  hypothetical protein  34.93 
 
 		 272 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3651  NmrA family protein  33.68 
 
 		 276 aa  127  3e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5449  nucleotide-diphosphate-sugar epimerase  34.71 
 
 		 274 aa  125  6e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0124495  normal  0.101659 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2046  NmrA family protein  37.28 
 
 		 274 aa  124  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.146802 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4673  NmrA family protein  34.15 
 
 		 279 aa  124  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.909291  normal  0.648206 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3339  NmrA family protein  33.8 
 
 		 279 aa  121  9.999999999999999e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5627  NmrA family protein  33.68 
 
 		 273 aa  121  9.999999999999999e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00676313 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2660  NmrA family protein  35.21 
 
 		 280 aa  120  1.9999999999999998e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7197  NmrA family protein  35.23 
 
 		 285 aa  119  3.9999999999999996e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0324  NmrA family protein  34.14 
 
 		 280 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1449  NmrA family protein  34.51 
 
 		 275 aa  117  1.9999999999999998e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0204448  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0911  NmrA family protein  34.04 
 
 		 269 aa  113  3e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4686  NmrA family protein  34.47 
 
 		 274 aa  113  3e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.742277  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1339  NmrA family protein  31.49 
 
 		 274 aa  111  1.0000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0037  NmrA family protein  36.17 
 
 		 280 aa  111  2.0000000000000002e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0712158  normal  0.162843 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1360  NmrA family protein  33.94 
 
 		 288 aa  110  3e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1958  NmrA family protein  32.39 
 
 		 284 aa  109  4.0000000000000004e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.190624  normal  0.373159 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5325  NmrA family protein  31.29 
 
 		 286 aa  109  4.0000000000000004e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.260355  normal  0.558765 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0634  NmrA family protein  33.9 
 
 		 279 aa  106  5e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.196658 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2493  NmrA family protein  32.51 
 
 		 288 aa  102  5e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5612  NmrA family protein  32.98 
 
 		 287 aa  102  6e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.940246  normal  0.705439 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1674  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  31.41 
 
 		 279 aa  99.8  5e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.117563  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4590  NmrA family protein  35.53 
 
 		 283 aa  99.4  7e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.03216 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8402  NmrA family protein  32.27 
 
 		 291 aa  97.1  3e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0312  NmrA family protein  31.93 
 
 		 299 aa  95.1  1e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.212335  normal  0.352411 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4166  nucleotide-diphosphate-sugar epimerase  31.69 
 
 		 281 aa  93.6  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.013923  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2575  NmrA family protein  31.83 
 
 		 295 aa  92.4  8e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2693  NmrA family protein  29.1 
 
 		 292 aa  90.9  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.142856  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4894  NmrA family protein  34.72 
 
 		 280 aa  90.9  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3166  NmrA family protein  29.09 
 
 		 273 aa  90.9  2e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4150  NmrA family protein  32.17 
 
 		 280 aa  90.5  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0515383  normal  0.0693726 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0660  NmrA family protein  34.23 
 
 		 240 aa  90.5  3e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0576  hypothetical protein  29.54 
 
 		 434 aa  90.1  4e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2763  NmrA family protein  30.48 
 
 		 291 aa  89.7  5e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6609  NmrA family protein  31.32 
 
 		 310 aa  86.7  4e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22520  hypothetical protein  31.19 
 
 		 351 aa  86.7  4e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000139034  hitchhiker  0.0000222268 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4018  NmrA family protein  30.45 
 
 		 285 aa  85.9  6e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2684  NmrA family protein  32.59 
 
 		 267 aa  84.3  0.000000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.66579 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4033  NmrA family protein  29.01 
 
 		 293 aa  83.2  0.000000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.027293  normal  0.618163 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1673  NmrA family protein  32.93 
 
 		 290 aa  83.2  0.000000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.491569  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2152  hypothetical protein  27.27 
 
 		 301 aa  83.2  0.000000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.978239 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3935  NmrA family protein  28.81 
 
 		 288 aa  82.4  0.000000000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00694182 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0547  NmrA family protein  29.62 
 
 		 287 aa  82  0.000000000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1991  NmrA family protein  33.33 
 
 		 290 aa  81.6  0.00000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5083  NmrA family protein  29.51 
 
 		 292 aa  81.6  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.624172  normal  0.697102 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8682  NmrA family protein  27.92 
 
 		 276 aa  80.9  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0200  NmrA family protein  29.5 
 
 		 281 aa  79.7  0.00000000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.352919  normal  0.33471 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2993  NmrA family protein  30.95 
 
 		 306 aa  79.3  0.00000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0106693  normal  0.0973127 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6340  NmrA family protein  29.62 
 
 		 287 aa  79.3  0.00000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1828  NmrA family protein  29.63 
 
 		 293 aa  79  0.00000000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.479104  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0977  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.82 
 
 		 294 aa  79  0.00000000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0152042  normal  0.193057 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4838  NmrA family protein  32.74 
 
 		 304 aa  78.6  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00518193  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6522  NmrA family protein  31.38 
 
 		 295 aa  77.8  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.114988  normal  0.107947 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0817  NmrA family protein  30.63 
 
 		 289 aa  77.8  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3022  NmrA family protein  30.42 
 
 		 280 aa  76.3  0.0000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.589818  normal  0.26374 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0483  NmrA family protein  30.74 
 
 		 295 aa  75.9  0.0000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4454  NmrA family protein  28.47 
 
 		 281 aa  75.9  0.0000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4112  NmrA family protein  31.15 
 
 		 293 aa  75.5  0.0000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1700  NmrA family protein  24.82 
 
 		 281 aa  75.1  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.560345  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6079  NmrA family protein  30.38 
 
 		 292 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.105085 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3759  NmrA family protein  27.3 
 
 		 292 aa  74.3  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.791935  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1768  hypothetical protein  24.41 
 
 		 291 aa  73.6  0.000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6433  NmrA-like  29.45 
 
 		 287 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6668  NmrA family protein  29.45 
 
 		 287 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0183081  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0235  NmrA family protein  40.28 
 
 		 292 aa  73.6  0.000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.19532  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00992  NmrA-like family protein (AFU_orthologue; AFUA_8G01860)  26.62 
 
 		 288 aa  73.2  0.000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.961582  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2181  NmrA family protein  28.07 
 
 		 284 aa  72.4  0.000000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9342  hypothetical protein  28.12 
 
 		 278 aa  71.6  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.894169  normal  0.787552 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0403  NmrA family protein  27.56 
 
 		 287 aa  71.6  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1006  NmrA family protein  25.44 
 
 		 272 aa  71.6  0.00000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6266  NmrA family protein  29.11 
 
 		 287 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0469029 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6339  NmrA family protein  30.56 
 
 		 302 aa  70.5  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00193526 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1710  NmrA family protein  30.9 
 
 		 280 aa  70.5  0.00000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.835703  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3410  NmrA-like  28.33 
 
 		 285 aa  70.5  0.00000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.630504  normal  0.478679 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3007  NmrA-like protein  29.51 
 
 		 280 aa  70.5  0.00000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.543476  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3053  NmrA family protein  29.51 
 
 		 280 aa  70.5  0.00000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1079  NmrA family protein  29.57 
 
 		 294 aa  70.1  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.153764 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3020  hypothetical protein  29.01 
 
 		 289 aa  70.1  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.375622  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2683  NmrA family protein  29.93 
 
 		 304 aa  70.1  0.00000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.522631 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6198  NmrA family protein  32.97 
 
 		 250 aa  69.7  0.00000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.823191  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4346  NmrA family protein  27.65 
 
 		 292 aa  69.3  0.00000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.182028  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4824  NmrA family protein  23.96 
 
 		 276 aa  68.9  0.00000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0799506  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1852  NmrA family protein  30.14 
 
 		 278 aa  68.9  0.00000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0902  NmrA family protein  28.67 
 
 		 294 aa  68.2  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6882  NmrA-like  28.93 
 
 		 276 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.236164  normal  1 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_37667  predicted protein  24.28 
 
 		 365 aa  68.2  0.0000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.658602  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2414  NmrA family protein  29.35 
 
 		 285 aa  68.2  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0724287 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0253  NmrA family protein  22.38 
 
 		 288 aa  68.6  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>