More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_5926 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_5926  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
480 aa  909    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4471  major facilitator superfamily MFS_1  50 
 
 
487 aa  320  3.9999999999999996e-86  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5900  major facilitator superfamily transporter  47.25 
 
 
482 aa  315  9.999999999999999e-85  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4178  major facilitator superfamily MFS_1  28.64 
 
 
503 aa  124  5e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3215  major facilitator superfamily MFS_1  29.53 
 
 
494 aa  122  9.999999999999999e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0907  major facilitator transporter  26.9 
 
 
477 aa  112  1.0000000000000001e-23  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0239598  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6826  major facilitator transporter  30.81 
 
 
523 aa  111  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1235  major facilitator superfamily MFS_1  31.9 
 
 
491 aa  112  2.0000000000000002e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.839802 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0629  major facilitator superfamily MFS_1  30.14 
 
 
499 aa  107  6e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4127  major facilitator superfamily MFS_1  28.61 
 
 
485 aa  104  4e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.773525  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5351  major facilitator superfamily MFS_1  29.25 
 
 
678 aa  103  5e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2831  putative membrane transport protein  28.69 
 
 
485 aa  101  2e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.017692  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1011  major facilitator transporter  29.71 
 
 
473 aa  99.8  9e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5759  major facilitator superfamily MFS_1  34.81 
 
 
474 aa  97.4  4e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0996976  normal  0.476223 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3651  major facilitator transporter  33.54 
 
 
517 aa  97.1  7e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3397  major facilitator transporter  30.32 
 
 
504 aa  96.3  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7073  Arabinose efflux permease-like protein  30.98 
 
 
492 aa  96.3  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0869  major facilitator superfamily MFS_1  29.35 
 
 
487 aa  95.1  2e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0748352  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1765  major facilitator transporter  24.35 
 
 
471 aa  95.1  2e-18  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.719018  decreased coverage  0.000452829 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0887  major facilitator superfamily MFS_1  31.15 
 
 
494 aa  95.1  2e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3936  major facilitator transporter  29.25 
 
 
650 aa  95.1  3e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4677  major facilitator superfamily MFS_1  28.63 
 
 
482 aa  93.6  6e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.767972  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2262  major facilitator superfamily MFS_1  30.4 
 
 
484 aa  93.2  9e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000865567  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2070  major facilitator transporter  26.24 
 
 
502 aa  93.2  9e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1507  major facilitator transporter  30.06 
 
 
457 aa  92.4  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000169816 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2888  major facilitator superfamily MFS_1  28.57 
 
 
482 aa  93.2  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.293011  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5274  hypothetical protein  29.56 
 
 
477 aa  92.4  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.355684  normal  0.184804 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4203  major facilitator transporter  28.57 
 
 
506 aa  92  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.318181  normal  0.987085 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0992  major facilitator superfamily MFS_1  27.15 
 
 
475 aa  92.4  2e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00829704  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1811  major facilitator superfamily MFS_1  29.32 
 
 
492 aa  90.9  5e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7243  putative transmembrane efflux protein  30.05 
 
 
476 aa  90.5  7e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.279533 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1968  major facilitator transporter  24.56 
 
 
491 aa  87.8  3e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.632276 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2569  major facilitator transporter  30.75 
 
 
487 aa  88.2  3e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2614  major facilitator superfamily transporter  30.75 
 
 
487 aa  88.2  3e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1789  major facilitator superfamily MFS_1  36.4 
 
 
512 aa  87.8  4e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.407024 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2608  major facilitator transporter  31.01 
 
 
487 aa  87.8  4e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.145364  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3140  major facilitator transporter  31.27 
 
 
479 aa  87.8  4e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.185762  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1004  major facilitator transporter  24.83 
 
 
473 aa  87.8  4e-16  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2707  major facilitator superfamily MFS_1  26.41 
 
 
472 aa  85.5  0.000000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0898  major facilitator transporter  28.64 
 
 
464 aa  85.5  0.000000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.325125  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1001  major facilitator transporter  27.15 
 
 
470 aa  82  0.00000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.141392  normal  0.0130853 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4123  major facilitator transporter  29.07 
 
 
488 aa  82  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.625658  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1095  major facilitator transporter  28.06 
 
 
477 aa  82.4  0.00000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0115  major facilitator superfamily MFS_1  31.03 
 
 
554 aa  80.9  0.00000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.434385  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2255  major facilitator superfamily MFS_1  31.67 
 
 
480 aa  80.1  0.00000000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3828  major facilitator transporter  29.22 
 
 
643 aa  80.1  0.00000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.395524  normal  0.17414 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3018  major facilitator superfamily MFS_1  29.84 
 
 
474 aa  79.3  0.0000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000682578  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3842  major facilitator transporter  29.22 
 
 
643 aa  79.7  0.0000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.632161  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00710  arabinose efflux permease family protein  30.16 
 
 
487 aa  79.7  0.0000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.909323  normal  0.190181 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3916  major facilitator superfamily transporter  29.22 
 
 
643 aa  79.7  0.0000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3385  major facilitator superfamily transporter  28.71 
 
 
489 aa  79.7  0.0000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.318101 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1211  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.03 
 
 
474 aa  78.2  0.0000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000173794  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4068  major facilitator superfamily MFS_1  29.91 
 
 
484 aa  77.8  0.0000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.473826 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2370  major facilitator superfamily MFS_1  25.89 
 
 
474 aa  76.3  0.000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5354  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.88 
 
 
449 aa  76.6  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.759907  normal  0.552203 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1017  major facilitator superfamily MFS_1  27.21 
 
 
525 aa  74.3  0.000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1619  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  23.19 
 
 
475 aa  73.6  0.000000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0344843  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4837  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.99 
 
 
478 aa  72.4  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.179905 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0910  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.78 
 
 
497 aa  72.4  0.00000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0303117  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08840  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.46 
 
 
592 aa  71.2  0.00000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1295  putative membrane transport protein  29.72 
 
 
500 aa  70.5  0.00000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.345301  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2785  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  26.65 
 
 
500 aa  70.5  0.00000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6965  major facilitator transporter  30.77 
 
 
548 aa  69.3  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.69368  normal  0.965318 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4455  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.72 
 
 
478 aa  69.7  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4542  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.72 
 
 
484 aa  69.7  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.717772 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3042  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.19 
 
 
685 aa  69.7  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.141693  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0487  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  23.71 
 
 
456 aa  69.7  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.130342 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0312  major facilitator transporter  26.82 
 
 
473 aa  68.6  0.0000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17940  arabinose efflux permease family protein  33.33 
 
 
457 aa  69.3  0.0000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0320  transporter, major facilitator family protein  27.02 
 
 
474 aa  68.9  0.0000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.196123 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3321  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.8 
 
 
650 aa  68.9  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.157992  normal  0.0742968 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1815  major facilitator superfamily MFS_1  25 
 
 
448 aa  68.2  0.0000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.39624  normal  0.935092 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2683  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.76 
 
 
511 aa  67.8  0.0000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000215764  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1604  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  25.56 
 
 
515 aa  67.8  0.0000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2877  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.76 
 
 
511 aa  67.8  0.0000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0363154  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5021  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.65 
 
 
478 aa  67.8  0.0000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.796578 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1916  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.48 
 
 
478 aa  67  0.0000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0782092  hitchhiker  0.00395657 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0331  MFS family transporter  30.12 
 
 
515 aa  67  0.0000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0402  major facilitator superfamily protein  25.05 
 
 
508 aa  67  0.0000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.537567  normal  0.124421 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2880  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  28.76 
 
 
511 aa  67  0.0000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00104329 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0614  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.35 
 
 
607 aa  66.2  0.000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.222069  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2227  EmrB/QacA family drug resistance transporter  23.75 
 
 
465 aa  66.2  0.000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00238209  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2685  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.88 
 
 
511 aa  65.5  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0846353  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2632  multidrug resistance protein B  28.76 
 
 
511 aa  65.1  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000173688  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2320  putative membrane transport protein  30.19 
 
 
483 aa  65.9  0.000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1058  major facilitator transporter  30.86 
 
 
471 aa  65.5  0.000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.111803  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1778  major facilitator transporter  24.94 
 
 
474 aa  64.7  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000929318  normal  0.0431251 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2631  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  25.56 
 
 
515 aa  65.1  0.000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.383083  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2706  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.24 
 
 
537 aa  64.3  0.000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0186  major facilitator superfamily MFS_1  25.48 
 
 
475 aa  64.7  0.000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2916  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.78 
 
 
511 aa  64.3  0.000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0905383  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0464  major facilitator transporter  25.82 
 
 
450 aa  63.9  0.000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.193996 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1950  major facilitator transporter  24.69 
 
 
461 aa  64.3  0.000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0136  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.13 
 
 
504 aa  63.9  0.000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.903569  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2756  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.1 
 
 
682 aa  63.5  0.000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2786  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.1 
 
 
682 aa  63.5  0.000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2800  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.1 
 
 
682 aa  63.5  0.000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.375758  normal  0.713659 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3698  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.7 
 
 
483 aa  63.5  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2608  multidrug resistance protein B  27.88 
 
 
511 aa  63.5  0.000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000057385  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0339  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.57 
 
 
554 aa  63.5  0.000000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>