More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_0365 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_0365  GrpE protein  100 
 
 		 298 aa  572  1.0000000000000001e-162  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0113  GrpE protein  66.67 
 
 		 299 aa  207  2e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0002175 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0114  GrpE protein  58.52 
 
 		 265 aa  203  2e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.750568  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0237  GrpE protein  59.3 
 
 		 218 aa  199  3.9999999999999996e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0528  co-chaperone GrpE  64.79 
 
 		 193 aa  196  5.000000000000001e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0246  GrpE protein  62.69 
 
 		 240 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.614627 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6948  GrpE protein  52.6 
 
 		 217 aa  167  2e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4806  GrpE protein  51.7 
 
 		 235 aa  162  9e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4353  GrpE protein  51.2 
 
 		 271 aa  157  2e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.85949 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4232  GrpE protein  50.97 
 
 		 193 aa  156  5.0000000000000005e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.997886  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2116  GrpE protein  49.69 
 
 		 267 aa  150  2e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0346149 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0635  GrpE protein  51.53 
 
 		 209 aa  150  3e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.579743  normal  0.0834953 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0082  GrpE protein  53.28 
 
 		 222 aa  147  2.0000000000000003e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0463  GrpE protein  47.67 
 
 		 215 aa  139  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.214185  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0474  GrpE protein  47.67 
 
 		 215 aa  139  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0450  GrpE protein  47.09 
 
 		 215 aa  138  8.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4362  GrpE protein  47.14 
 
 		 212 aa  138  1e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0710081  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5470  GrpE protein  45.81 
 
 		 250 aa  137  3.0000000000000003e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.958521 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0259  GrpE protein  47.02 
 
 		 205 aa  135  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0957161  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38570  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  53.59 
 
 		 261 aa  133  3e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.312052  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0232  GrpE protein  51.63 
 
 		 278 aa  133  3.9999999999999996e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.284998  normal  0.283245 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0487  GrpE protein  49.32 
 
 		 199 aa  130  2.0000000000000002e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.204173  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10356  heat shock protein GrpE  50.77 
 
 		 235 aa  130  3e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.202189  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0197  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  50 
 
 		 264 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.135076  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3807  GrpE protein  50.39 
 
 		 228 aa  126  3e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3620  GrpE protein  49.25 
 
 		 222 aa  126  4.0000000000000003e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5217  GrpE protein  54.61 
 
 		 232 aa  122  6e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04430  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  45.38 
 
 		 188 aa  122  8e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.231715 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4269  GrpE protein  45.39 
 
 		 214 aa  120  3e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0350  GrpE protein  47.83 
 
 		 199 aa  117  3e-25  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.851943 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0441  GrpE protein  47.1 
 
 		 209 aa  116  6e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1281  co-chaperone GrpE  40.16 
 
 		 232 aa  112  6e-24  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0202  GrpE protein  43.03 
 
 		 217 aa  112  1.0000000000000001e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00258444  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1312  heat shock protein GrpE  40.48 
 
 		 218 aa  109  5e-23  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18800  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  47.29 
 
 		 220 aa  108  1e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00738423  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05500  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  43.9 
 
 		 208 aa  103  4e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0377  heat shock protein GrpE  35.22 
 
 		 248 aa  102  5e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1749  heat shock protein GrpE  37.14 
 
 		 242 aa  102  8e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.935809  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4694  GrpE protein  35.59 
 
 		 246 aa  101  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.958337 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3708  GrpE protein  44.44 
 
 		 206 aa  100  2e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.500996 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12170  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  39.35 
 
 		 224 aa  100  4e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.19805  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1973  GrpE protein  35.85 
 
 		 223 aa  99  8e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.268651  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1194  GrpE protein  40.69 
 
 		 201 aa  98.6  1e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.422814 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4300  GrpE protein  37.86 
 
 		 213 aa  96.7  4e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000230249  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3533  heat shock protein GrpE  38.28 
 
 		 189 aa  94.7  1e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00974284  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2126  GrpE protein  35.86 
 
 		 200 aa  94.7  1e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.743495  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1053  GrpE protein  40.62 
 
 		 207 aa  94  3e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1405  GrpE protein  35.2 
 
 		 190 aa  93.6  4e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1323  GrpE protein  32.93 
 
 		 226 aa  91.7  1e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0802  heat shock protein GrpE  32.6 
 
 		 188 aa  91.7  2e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000114529  hitchhiker  2.29846e-19 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1025  heat shock protein GrpE  41.09 
 
 		 194 aa  91.3  2e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3095  GrpE protein  40.15 
 
 		 210 aa  91.3  2e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0785  GrpE protein  38.64 
 
 		 207 aa  90.9  2e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1673  heat shock protein GrpE  33.85 
 
 		 208 aa  91.3  2e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0666687  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4434  heat shock protein GrpE  32.6 
 
 		 188 aa  91.7  2e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000213644  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1639  heat shock protein GrpE  33.85 
 
 		 208 aa  91.3  2e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.980219  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4214  heat shock protein GrpE  32.6 
 
 		 188 aa  90.9  3e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.121908  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4052  heat shock protein GrpE  32.6 
 
 		 188 aa  90.9  3e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00116461  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4062  heat shock protein GrpE  32.6 
 
 		 188 aa  90.9  3e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00424563  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4540  heat shock protein GrpE  32.6 
 
 		 188 aa  90.9  3e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.002362  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4337  heat shock protein GrpE  32.6 
 
 		 188 aa  90.9  3e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.21014e-34 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2828  heat shock protein GrpE  34.31 
 
 		 241 aa  89.7  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000182531  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3010  heat shock protein GrpE  34.31 
 
 		 250 aa  89.4  7e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.582953  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00161  heat shock protein GrpE  35.38 
 
 		 247 aa  89  8e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.0174287 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3216  heat shock protein GrpE  34.38 
 
 		 195 aa  89  8e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.116428  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4166  heat shock protein GrpE  32.04 
 
 		 188 aa  88.2  2e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0177219  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2058  GrpE protein  37.58 
 
 		 194 aa  87.4  2e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2551  GrpE protein  34.93 
 
 		 260 aa  87  3e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.124542 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0491  GrpE protein  30.32 
 
 		 261 aa  87  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0506  GrpE protein  30.32 
 
 		 261 aa  87  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00117132 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0965  heat shock protein GrpE  36.91 
 
 		 195 aa  87.4  3e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000249934  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1749  GrpE protein  37.31 
 
 		 201 aa  87  3e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1378  heat shock protein GrpE  35.71 
 
 		 192 aa  87  3e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.00000000000995394  normal  0.160188 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2887  heat shock protein GrpE  35.71 
 
 		 192 aa  87  3e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  6.654980000000001e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2974  heat shock protein GrpE  35.71 
 
 		 192 aa  87  3e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000000000364467  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0095  GrpE protein  35.92 
 
 		 282 aa  87  3e-16  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.266913 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12810  GrpE protein  30.94 
 
 		 231 aa  87.4  3e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.239064  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1149  heat shock protein GrpE  33.85 
 
 		 210 aa  86.7  4e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.67207  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3041  heat shock protein GrpE  32.87 
 
 		 198 aa  86.7  4e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.004999  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2897  heat shock protein GrpE  34.38 
 
 		 196 aa  86.3  6e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4448  heat shock protein GrpE  32.17 
 
 		 192 aa  86.3  6e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000207397  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2877  heat shock protein GrpE  34.38 
 
 		 196 aa  86.3  6e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.651941  normal  0.125347 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2895  heat shock protein GrpE  34.38 
 
 		 196 aa  86.3  6e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.804576  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2080  heat shock protein GrpE  31.84 
 
 		 195 aa  86.3  6e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1035  GrpE protein  38.81 
 
 		 189 aa  86.3  6e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00038029  hitchhiker  0.000654048 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0730  heat shock protein GrpE  36.11 
 
 		 195 aa  85.5  0.000000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0176899  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2473  protein GrpE (heat shock protein)  35.21 
 
 		 194 aa  84.3  0.000000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3506  heat shock protein GrpE  39.2 
 
 		 188 aa  84.3  0.000000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.175972  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2072  heat shock protein GrpE  31.13 
 
 		 207 aa  84.3  0.000000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0077  GrpE protein  34.67 
 
 		 172 aa  84.7  0.000000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000749846  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1167  GrpE protein  35.77 
 
 		 178 aa  84.7  0.000000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0077  GrpE protein  34.67 
 
 		 172 aa  84.7  0.000000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0763151  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3684  heat shock protein GrpE  36.67 
 
 		 190 aa  84.3  0.000000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000000160031  normal  0.0536804 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4396  heat shock protein GrpE  31.97 
 
 		 192 aa  84  0.000000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0382773  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1343  heat shock protein GrpE  34.07 
 
 		 259 aa  83.6  0.000000000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01170  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  35.94 
 
 		 243 aa  83.2  0.000000000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00151  heat shock protein GrpE  34.07 
 
 		 259 aa  82.8  0.000000000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.948871 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1061  Ribulose-phosphate 3-epimerase  34.32 
 
 		 197 aa  82.4  0.000000000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000037652  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4181  GrpE protein  33.83 
 
 		 286 aa  82.4  0.000000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.321411 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3002  heat shock protein GrpE  34.32 
 
 		 197 aa  82.4  0.000000000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  7.86694e-16  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>