182 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smon_0180 on replicon NC_013515
Organism: Streptobacillus moniliformis DSM 12112



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013515  Smon_1486  YadA domain protein  63.81 
 
 
1065 aa  765    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0180  YadA domain protein  100 
 
 
1230 aa  2392    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1483  YadA domain protein  56.35 
 
 
1333 aa  920    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1243  YadA domain protein  47.75 
 
 
1411 aa  356  1e-96  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0171  YadA domain protein  46.56 
 
 
1212 aa  327  8.000000000000001e-88  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0178  YadA domain protein  40 
 
 
691 aa  317  7e-85  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0228  YadA domain protein  71.1 
 
 
600 aa  290  2e-76  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1482  YadA domain protein  46.8 
 
 
595 aa  287  1.0000000000000001e-75  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1341  YadA domain protein  64.55 
 
 
563 aa  278  6e-73  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1334  YadA domain protein  43.64 
 
 
565 aa  273  1e-71  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1485  YadA domain protein  45.87 
 
 
572 aa  246  1.9999999999999999e-63  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0179  YadA domain protein  80.3 
 
 
998 aa  223  9.999999999999999e-57  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0600  YadA domain protein  55.1 
 
 
601 aa  206  2e-51  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0177  YadA domain protein  69.18 
 
 
1014 aa  197  7e-49  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1487  YadA domain protein  62.99 
 
 
1813 aa  182  4e-44  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1225  YadA-like protein  27.29 
 
 
2095 aa  177  9e-43  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.342692 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3939  haemagluttinin family protein  30.13 
 
 
1549 aa  150  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.78822 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03460  putative adhesin  32.68 
 
 
1616 aa  140  2e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03411  hypothetical protein  32.68 
 
 
1616 aa  140  2e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4106  putative haemagglutinins/invasins protein  32.68 
 
 
1616 aa  139  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1400  putative adhesin  35 
 
 
1916 aa  139  4e-31  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0441  outer membrane protein, haemagluttinin-like  30.38 
 
 
2866 aa  138  6.0000000000000005e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.192445  normal  0.347106 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0794  outer membrane protein  27.72 
 
 
1516 aa  137  9e-31  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  decreased coverage  0.00112166  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5048  hemagluttinin domain-containing protein  29.76 
 
 
2814 aa  137  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0112  Hep_Hag family protein  26.89 
 
 
827 aa  134  1.0000000000000001e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4975  Hep_Hag family protein  33.24 
 
 
1588 aa  134  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3144  hemagluttinin motif-containing protein  29.52 
 
 
2728 aa  133  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5223  hemagluttinin domain-containing protein  29.52 
 
 
2778 aa  133  3e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.224013 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0362  YadA domain protein  46.81 
 
 
2073 aa  128  6e-28  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2396  YadA domain protein  28.89 
 
 
655 aa  128  7e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.340419 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0173  YadA domain protein  46.81 
 
 
2078 aa  128  7e-28  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1408  YadA domain protein  46.81 
 
 
2078 aa  128  7e-28  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0174  YadA domain protein  46.81 
 
 
2091 aa  128  9e-28  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3477  hemagluttinin domain-containing protein  36.16 
 
 
2505 aa  126  2e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.987353 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0227  YadA domain protein  48.18 
 
 
2092 aa  126  3e-27  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1324  haemagluttinin family protein  29.3 
 
 
831 aa  125  7e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0293866  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2506  haemagluttinin family protein  29.3 
 
 
831 aa  125  7e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1320  haemagluttinin family protein  29.3 
 
 
816 aa  125  7e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5846  YadA-like protein  31.97 
 
 
492 aa  124  9e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2168  hemagluttinin motif-containing protein  32.33 
 
 
1654 aa  124  9e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.306442  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0582  haemagluttinin family protein  29.3 
 
 
820 aa  124  9e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0301  YadA domain protein  48.57 
 
 
2075 aa  124  9.999999999999999e-27  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0306  haemagluttinin family protein  29.3 
 
 
816 aa  124  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.700295  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4223  YadA domain-containing protein  27.5 
 
 
1613 aa  124  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.551449  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1247  haemagluttinin family protein  29.3 
 
 
816 aa  124  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.735961  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0985  haemagluttinin family protein  29.3 
 
 
816 aa  124  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.205403  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3814  putative haemagglutinin  31.73 
 
 
1674 aa  122  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0557041  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5212  YadA domain-containing protein  29.09 
 
 
575 aa  121  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.146936 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0323  YadA-like haemagluttinin  29.78 
 
 
589 aa  120  1.9999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.445866  normal  0.627542 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4575  hemagluttinin domain-containing protein  35.06 
 
 
2493 aa  119  5e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3834  YadA domain-containing protein  34.11 
 
 
536 aa  118  6e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.466914  normal  0.508963 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5560  YadA domain protein  33.43 
 
 
2396 aa  117  8.999999999999998e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.503173  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7374  YadA/haemagluttinin like protein  29.89 
 
 
1854 aa  117  2.0000000000000002e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00142444  normal  0.240899 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1489  Hep_Hag family protein  29.63 
 
 
831 aa  117  2.0000000000000002e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.500286  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0209  large adhesin  30.67 
 
 
5143 aa  117  2.0000000000000002e-24  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2395  Haemagluttinin domain protein  26.38 
 
 
2141 aa  115  4.0000000000000004e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.819478  normal  0.219334 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0589  adhesin  33.58 
 
 
386 aa  112  4.0000000000000004e-23  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0602  adhesin  31.9 
 
 
404 aa  108  6e-22  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2893  YadA domain-containing protein  27.72 
 
 
597 aa  107  1e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.45367  normal  0.508754 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2229  Hep_Hag family protein  33.52 
 
 
1068 aa  107  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0459  haemagluttinin family protein  32.05 
 
 
2757 aa  106  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.312259  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5619  YadA-like  26.77 
 
 
1471 aa  106  2e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5983  YadA domain-containing protein  26.77 
 
 
1471 aa  106  2e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00228839 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0774  YadA domain-containing protein  30.14 
 
 
650 aa  106  2e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000258117  hitchhiker  0.0000000471777 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8539  YadA domain protein  28.1 
 
 
2157 aa  106  3e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1946  putative cell surface protein  32.05 
 
 
1916 aa  106  3e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2083  putative outer membrane protein  32.85 
 
 
1186 aa  105  4e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.345097  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02671  adhesin-like protein A  27.27 
 
 
1265 aa  105  6e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6245  YadA domain-containing protein  33.23 
 
 
1117 aa  105  6e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1595  Hep_Hag family protein  34.38 
 
 
617 aa  104  8e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.855766  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4376  haemagglutinin and invasin like cell surface protein  49.55 
 
 
977 aa  104  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0957  outer membrane protein, putative  31.95 
 
 
2025 aa  104  1e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2621  YadA domain protein  29.59 
 
 
877 aa  104  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.171767  normal  0.911362 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3522  hemagluttinin domain-containing protein  30.42 
 
 
1487 aa  104  1e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6476  YadA domain-containing protein  25.88 
 
 
1546 aa  104  1e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.240563 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1750  haemagluttinin family protein  29.61 
 
 
1074 aa  103  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6591  hemaglutinin/autotransporter like protein  28.84 
 
 
1326 aa  103  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.266295  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0840  haemagluttinin family protein  29.61 
 
 
1090 aa  102  3e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2439  YadA domain-containing protein  36.59 
 
 
737 aa  102  3e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000109302  unclonable  0.0000000000563921 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1361  haemagluttinin family protein  29.61 
 
 
1090 aa  102  3e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0513  haemagluttinin family protein  29.61 
 
 
1090 aa  102  3e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.421174  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1590  haemagluttinin family protein  29.86 
 
 
1122 aa  102  4e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0643  haemagluttinin family protein  29.86 
 
 
1122 aa  102  4e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.696074  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2268  YadA-like  26.61 
 
 
597 aa  101  7e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2883  YadA domain-containing protein  26.61 
 
 
597 aa  101  7e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1027  outer membrane protein, putative  32.53 
 
 
1012 aa  100  1e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1565  haemagluttinin family protein  29.65 
 
 
1122 aa  100  1e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2381  Hep_Hag family protein  31.66 
 
 
1626 aa  99.8  3e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1090  haemagluttinin motif-containing protein  31.4 
 
 
1669 aa  99.4  4e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0649  hemagluttinin motif-containing protein  31.3 
 
 
1535 aa  98.6  6e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0499566  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1168  surface-exposed protein  31.4 
 
 
1705 aa  98.6  7e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1776  surface-exposed protein  31.4 
 
 
1766 aa  98.2  8e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.885924  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5930  YadA domain-containing protein  32.99 
 
 
1434 aa  98.2  9e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0544  YadA domain protein  25.85 
 
 
2392 aa  97.8  1e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.14824 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4227  YadA domain-containing protein  25.08 
 
 
3355 aa  97.8  1e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.739468 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2582  YadA domain-containing protein  30.06 
 
 
4384 aa  97.1  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000000293422 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1514  outer membrane protein, putative autotransporter and adhesin  28.61 
 
 
810 aa  97.1  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.71119  normal  0.170139 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2027  putative outer membrane protein  32.53 
 
 
962 aa  97.1  2e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.782084  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3152  YadA domain-containing protein  27.17 
 
 
4191 aa  95.9  4e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0072  outer membrane protein  46.56 
 
 
740 aa  95.1  6e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>