68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_5857 on replicon NC_009621
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009621  Smed_5857  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 220 aa  438  9.999999999999999e-123  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.664827  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4990  transcriptional regulator, TetR family  83.49 
 
 		 212 aa  350  1e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.613992  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3031  transcriptional regulator, TetR family  50.26 
 
 		 205 aa  191  9e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3415  transcriptional regulator, TetR family  49.48 
 
 		 209 aa  189  2e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.52107  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0875  transcriptional regulator, TetR family  48.97 
 
 		 209 aa  186  3e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4739  TetR family transcriptional regulator  46.91 
 
 		 217 aa  174  9e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1654  hypothetical protein  46.35 
 
 		 338 aa  173  9.999999999999999e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.900303  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0589  hypothetical protein  46.35 
 
 		 341 aa  173  9.999999999999999e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.684153  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0699  hypothetical protein  46.35 
 
 		 338 aa  173  9.999999999999999e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.299256  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0546  TetR family transcriptional regulator  44.14 
 
 		 228 aa  173  1.9999999999999998e-42  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.62495  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4006  TetR family transcriptional regulator  44.14 
 
 		 228 aa  173  1.9999999999999998e-42  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0210  TetR family transcriptional regulator  45.12 
 
 		 221 aa  173  1.9999999999999998e-42  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0516  TetR family transcriptional regulator  46.56 
 
 		 378 aa  172  2.9999999999999996e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.477479  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0758.1  hypothetical protein  46.35 
 
 		 773 aa  172  2.9999999999999996e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2102  TetR family transcriptional regulator  46.56 
 
 		 333 aa  172  2.9999999999999996e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0307267  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2007  TetR family transcriptional regulator  46.56 
 
 		 341 aa  172  2.9999999999999996e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.820101  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0885  TetR family transcriptional regulator  46.37 
 
 		 340 aa  165  5.9999999999999996e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2789  TetR family transcriptional regulator  35.2 
 
 		 203 aa  80.9  0.00000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.384058 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3112  TetR family transcriptional regulator  31.98 
 
 		 207 aa  76.3  0.0000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1922  transcriptional regulator, TetR family  24.49 
 
 		 210 aa  57  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0515657  normal  0.344284 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6234  transcriptional regulator, TetR family  31.12 
 
 		 214 aa  52  0.000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.662077  normal  0.711722 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13072  TetR family transcriptional regulator  44.78 
 
 		 204 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.483288 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3690  transcriptional regulator, TetR family  43.86 
 
 		 191 aa  50.1  0.00003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.225915 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2776  transcriptional regulator, TetR family  42.03 
 
 		 206 aa  49.7  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.205598  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0143  TetR family transcriptional regulator  28.34 
 
 		 266 aa  49.3  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.170765  normal  0.0134311 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0403  TetR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 195 aa  48.5  0.00008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5092  transcriptional regulator, TetR family  40.35 
 
 		 209 aa  48.1  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.193405 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5999  transcriptional regulator, TetR family  34.45 
 
 		 215 aa  46.2  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2753  transcriptional regulator, TetR family  38.57 
 
 		 197 aa  45.8  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.920315  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2214  transcriptional regulator, TetR family  27.97 
 
 		 219 aa  45.8  0.0005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.411668  normal  0.665917 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4478  transcriptional regulator, TetR family  42.65 
 
 		 211 aa  45.8  0.0005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1049  TetR family transcriptional regulator  26.63 
 
 		 230 aa  45.4  0.0006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0599696  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4931  TetR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 497 aa  45.4  0.0007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.475051  normal  0.080695 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0401  transcriptional regulator, TetR family  38.24 
 
 		 245 aa  45.4  0.0007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0464223  normal  0.180866 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2537  TetR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 87 aa  44.3  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1926  TetR family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 224 aa  44.3  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.857726  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2095  transcriptional regulator, TetR family  40.3 
 
 		 194 aa  44.3  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.546455  normal  0.514839 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2647  transcriptional regulator, TetR family  39.71 
 
 		 217 aa  43.9  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4400  regulatory protein TetR  34.31 
 
 		 184 aa  43.9  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0291  putative transcriptional regulator, TetR family  45.61 
 
 		 212 aa  44.3  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1129  TetR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 231 aa  43.9  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1173  regulatory protein, TetR  30.63 
 
 		 202 aa  43.5  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.959952 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8965  putative transcriptional regulator, TetR family  42.11 
 
 		 173 aa  43.1  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0208  transcriptional regulator, TetR family  38.71 
 
 		 193 aa  43.1  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.168668  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0384  TetR family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 191 aa  43.1  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4585  transcriptional regulator, TetR family  35.92 
 
 		 220 aa  43.1  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.448621  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1173  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 218 aa  43.5  0.003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4951  TetR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 239 aa  43.5  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.717286  normal  0.572747 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7736  putative transcriptional regulator, TetR family  32.28 
 
 		 205 aa  43.1  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.97147  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4085  putative transcriptional regulator, TetR family  37.31 
 
 		 232 aa  42.7  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.750305  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2176  TetR family transcriptional regulator  29.23 
 
 		 209 aa  42.7  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000096918  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2406  TetR family transcriptional regulator  29.23 
 
 		 209 aa  42.7  0.004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2242  TetR family transcriptional regulator  29.23 
 
 		 209 aa  42.7  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.640782  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2990  TetR family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 288 aa  42.4  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.989251  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4103  regulatory protein TetR  35.85 
 
 		 220 aa  42.4  0.005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.557347 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1164  TetR family transcriptional regulator  29.76 
 
 		 184 aa  42.4  0.005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000872016  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0938  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 235 aa  42.4  0.006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8100  transcriptional regulator, TetR family  43.75 
 
 		 218 aa  42.4  0.006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.978856  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4455  transcriptional regulator, TetR family  26.57 
 
 		 215 aa  42  0.007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0390638 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5083  putative transcriptional regulator, TetR family  30.99 
 
 		 189 aa  42  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.636855 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5597  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 189 aa  42  0.008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5998  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 189 aa  42  0.008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000044097 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5011  putative transcriptional regulator, TetR family  31.58 
 
 		 203 aa  42  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0804167 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4471  transcriptional regulator, TetR family  35.85 
 
 		 220 aa  42  0.008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1536  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 217 aa  41.6  0.009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.000773904  normal  0.689031 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7473  TetR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 217 aa  41.6  0.009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2475  transcriptional regulator, TetR family  46.03 
 
 		 222 aa  41.6  0.009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.260568  hitchhiker  0.0024636 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0928  transcriptional regulator, TetR family  43.4 
 
 		 184 aa  41.6  0.01  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.312785  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>