More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_2254 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_2254  hypothetical protein  100 
 
 		 264 aa  534  1e-151  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.57305  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2760  protein of unknown function DUF152  70.72 
 
 		 264 aa  384  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3023  protein of unknown function DUF152  68.82 
 
 		 264 aa  372  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3173  hypothetical protein  61.45 
 
 		 276 aa  338  5e-92  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.652021  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1637  hypothetical protein  59.85 
 
 		 265 aa  315  5e-85  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.491316  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2152  hypothetical protein  59.54 
 
 		 264 aa  304  8.000000000000001e-82  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.144936  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1530  hypothetical protein  57.14 
 
 		 283 aa  301  1e-80  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1479  hypothetical protein  57.14 
 
 		 265 aa  300  2e-80  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0106997  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4844  protein of unknown function DUF152  59.06 
 
 		 257 aa  290  1e-77  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4166  hypothetical protein  60.91 
 
 		 267 aa  286  2e-76  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.206924 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1763  hypothetical protein  60.25 
 
 		 242 aa  284  1.0000000000000001e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2260  hypothetical protein  59.09 
 
 		 255 aa  281  6.000000000000001e-75  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.516462  normal  0.73418 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3533  hypothetical protein  58.75 
 
 		 256 aa  280  2e-74  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.406811  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5410  hypothetical protein  54.94 
 
 		 259 aa  280  2e-74  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3877  hypothetical protein  59.59 
 
 		 255 aa  278  5e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.282753  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1411  hypothetical protein  55.12 
 
 		 258 aa  274  9e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0881104  normal  0.275348 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3093  hypothetical protein  56.79 
 
 		 256 aa  274  1.0000000000000001e-72  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0996  hypothetical protein  50.63 
 
 		 263 aa  273  1.0000000000000001e-72  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.063722  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3291  hypothetical protein  56.38 
 
 		 255 aa  273  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.613887  normal  0.213428 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2502  hypothetical protein  57.32 
 
 		 256 aa  273  3e-72  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.341887  normal  0.521161 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3109  protein of unknown function DUF152  54.77 
 
 		 255 aa  269  2.9999999999999997e-71  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.158574 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2883  hypothetical protein  54.36 
 
 		 255 aa  268  8e-71  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0393736  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5255  protein of unknown function DUF152  56.38 
 
 		 255 aa  268  8.999999999999999e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.76056  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2651  hypothetical protein  57.26 
 
 		 252 aa  264  1e-69  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.683201  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1133  protein of unknown function DUF152  56.25 
 
 		 261 aa  263  2e-69  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0471176 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3006  protein of unknown function DUF152  55.19 
 
 		 255 aa  263  2e-69  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3335  hypothetical protein  57.2 
 
 		 248 aa  261  1e-68  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.466504 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0618  hypothetical protein  55.14 
 
 		 255 aa  258  9e-68  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.506998  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0258  hypothetical protein  55.42 
 
 		 250 aa  246  4e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.626731 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2211  hypothetical protein  53.06 
 
 		 254 aa  242  5e-63  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0643  hypothetical protein  51.43 
 
 		 255 aa  239  4e-62  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0890735  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2550  hypothetical protein  52.02 
 
 		 255 aa  237  1e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.810005  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3271  hypothetical protein  50.78 
 
 		 252 aa  219  3.9999999999999997e-56  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1578  hypothetical protein  54.22 
 
 		 250 aa  217  2e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0230  hypothetical protein  54.22 
 
 		 250 aa  215  7e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4772  hypothetical protein  54.13 
 
 		 257 aa  212  5.999999999999999e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00107349  normal  0.0417622 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0485  hypothetical protein  50.59 
 
 		 253 aa  207  1e-52  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.379995  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0672  hypothetical protein  50.97 
 
 		 261 aa  201  9.999999999999999e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1128  hypothetical protein  41.39 
 
 		 278 aa  191  1e-47  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.390835 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0423  hypothetical protein  43.98 
 
 		 247 aa  183  2.0000000000000003e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1091  protein of unknown function DUF152  48.12 
 
 		 273 aa  179  4.999999999999999e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.247412  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2463  hypothetical protein  42.58 
 
 		 212 aa  158  1e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.299947 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0879  hypothetical protein  40.09 
 
 		 232 aa  148  7e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0208806  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0083  hypothetical protein  35.66 
 
 		 266 aa  141  9.999999999999999e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0239  hypothetical protein  36.44 
 
 		 240 aa  139  3.9999999999999997e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.314776  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5182  hypothetical protein  40.37 
 
 		 242 aa  138  8.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.366969  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0177  protein of unknown function DUF152  40.54 
 
 		 260 aa  136  3.0000000000000003e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.51612 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0261  hypothetical protein  37.93 
 
 		 255 aa  136  4e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.270785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0911  hypothetical protein  35.5 
 
 		 279 aa  135  8e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1653  hypothetical protein  36.36 
 
 		 256 aa  135  8e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00346479  normal  0.628895 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1611  hypothetical protein  39.81 
 
 		 244 aa  135  9e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000407567 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0338  protein of unknown function DUF152  33.72 
 
 		 267 aa  133  1.9999999999999998e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000382886  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2304  hypothetical protein  35.48 
 
 		 263 aa  133  1.9999999999999998e-30  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60200  hypothetical protein  39.45 
 
 		 242 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000445092 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0596  protein of unknown function DUF152  41.18 
 
 		 241 aa  133  3e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0333607 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4835  hypothetical protein  40.66 
 
 		 240 aa  132  6e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.464968 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2951  hypothetical protein  35.84 
 
 		 263 aa  132  6e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1336  hypothetical protein  34.04 
 
 		 244 aa  132  6.999999999999999e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.013723  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0816  protein of unknown function DUF152  40.51 
 
 		 242 aa  131  9e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.245631  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2251  protein of unknown function DUF152  36.29 
 
 		 253 aa  131  9e-30  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004393  hypothetical protein  36.29 
 
 		 242 aa  131  1.0000000000000001e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0529769  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3460  protein of unknown function DUF152  33.59 
 
 		 264 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4546  hypothetical protein  40.34 
 
 		 246 aa  130  3e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3013  protein of unknown function DUF152  41.2 
 
 		 252 aa  129  5.0000000000000004e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3263  hypothetical protein  42.86 
 
 		 230 aa  129  6e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0200173  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3252  hypothetical protein  42.86 
 
 		 230 aa  129  6e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.227906  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3314  hypothetical protein  42.86 
 
 		 230 aa  129  6e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.14611 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3397  protein of unknown function DUF152  33.47 
 
 		 264 aa  129  7.000000000000001e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.97667  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0882  hypothetical protein  32.56 
 
 		 267 aa  128  1.0000000000000001e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000314964  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3434  hypothetical protein  32.93 
 
 		 266 aa  128  1.0000000000000001e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2773  hypothetical protein  40.09 
 
 		 243 aa  127  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000469937  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2990  hypothetical protein  40.09 
 
 		 243 aa  127  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2876  hypothetical protein  40.09 
 
 		 243 aa  127  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.391481  normal  0.650339 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0281  hypothetical protein  34.4 
 
 		 265 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2878  hypothetical protein  40.09 
 
 		 243 aa  127  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.334761 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27360  conserved hypothetical protein TIGR00726  41.1 
 
 		 234 aa  126  5e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2857  hypothetical protein  39.63 
 
 		 243 aa  125  6e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.269162  normal  0.142595 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1345  hypothetical protein  40 
 
 		 265 aa  125  6e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2510  protein of unknown function DUF152  35.29 
 
 		 249 aa  125  6e-28  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0152  protein of unknown function DUF152  37.77 
 
 		 259 aa  125  7e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2020  protein of unknown function DUF152  38.89 
 
 		 255 aa  125  7e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.511087  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1605  hypothetical protein  40.55 
 
 		 245 aa  125  1e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1114  hypothetical protein  40.95 
 
 		 241 aa  125  1e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0920  protein of unknown function DUF152  37.5 
 
 		 254 aa  124  1e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0670  hypothetical protein  40.18 
 
 		 246 aa  124  2e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0922  hypothetical protein  34.98 
 
 		 261 aa  124  2e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1871  hypothetical protein  38.3 
 
 		 236 aa  124  2e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.176148 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2033  protein of unknown function DUF152  36.14 
 
 		 272 aa  123  2e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1076  protein of unknown function DUF152  33.76 
 
 		 273 aa  124  2e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2604  hypothetical protein  38.94 
 
 		 254 aa  124  2e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000133256  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11950  hypothetical protein  38.03 
 
 		 242 aa  124  2e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2889  protein of unknown function DUF152  39.42 
 
 		 252 aa  123  4e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.169639  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2888  protein of unknown function DUF152  32.97 
 
 		 272 aa  123  4e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.000000159444  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3073  hypothetical protein  37.33 
 
 		 243 aa  122  5e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0206514  normal  0.0108609 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1354  hypothetical protein  40.43 
 
 		 263 aa  122  5e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.487707  normal  0.98055 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1977  hypothetical protein  35.84 
 
 		 244 aa  122  7e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3610  hypothetical protein  35.63 
 
 		 248 aa  122  7e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.197134  hitchhiker  0.00698537 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0624  hypothetical protein  38.66 
 
 		 246 aa  122  8e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2796  protein of unknown function DUF152  39.42 
 
 		 252 aa  122  8e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0368  hypothetical protein  34.56 
 
 		 246 aa  121  9e-27  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>