134 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_3636 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_3636  extracellular solute-binding protein family 3  100 
 
 		 238 aa  461  1e-129  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.59453 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1628  extracellular solute-binding protein  54.31 
 
 		 279 aa  207  1e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.625521  normal  0.0285875 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4109  extracellular solute-binding protein  55.15 
 
 		 264 aa  196  3e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.664204  normal  0.53519 
 
 
-
 
NC_003296  RS04698  periplasmic substrate binding ABC transporter protein  51.12 
 
 		 245 aa  195  5.000000000000001e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.291783 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6190  extracellular solute-binding protein family 3  47.77 
 
 		 273 aa  195  5.000000000000001e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.221084  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3873  extracellular solute-binding protein  46.88 
 
 		 250 aa  193  2e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.543903  normal  0.744123 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5977  extracellular solute-binding protein  48.23 
 
 		 244 aa  192  3e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4553  extracellular solute-binding protein  48.67 
 
 		 247 aa  191  7e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.221841  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7267  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  46.46 
 
 		 264 aa  186  2e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6273  extracellular solute-binding protein  46.46 
 
 		 244 aa  186  3e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2836  extracellular solute-binding protein  47.37 
 
 		 248 aa  182  4.0000000000000006e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.918231  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3717  extracellular solute-binding protein  47.96 
 
 		 243 aa  181  8.000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.241075  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4651  extracellular solute-binding protein  47.96 
 
 		 243 aa  181  8.000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.545523  normal  0.899041 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6880  extracellular solute-binding protein  46.88 
 
 		 244 aa  181  1e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.21399  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5602  extracellular solute-binding protein  46.02 
 
 		 244 aa  177  2e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4744  extracellular solute-binding protein family 3  44.2 
 
 		 277 aa  177  2e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.273902  normal  0.741652 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5653  extracellular solute-binding protein  46.61 
 
 		 243 aa  175  5e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.493733 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5966  extracellular solute-binding protein  46.02 
 
 		 349 aa  175  6e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0148213 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6466  extracellular solute-binding protein  44.69 
 
 		 244 aa  171  5.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.59873  normal  0.0219509 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3154  extracellular solute-binding protein family 3  45.98 
 
 		 249 aa  168  6e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0903537  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1361  extracellular solute-binding protein  37.56 
 
 		 269 aa  147  1.0000000000000001e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8634  extracellular solute-binding protein family 3  44.76 
 
 		 237 aa  141  7e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.365468  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45195  predicted protein  37.56 
 
 		 253 aa  127  1.0000000000000001e-28  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.177256  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3455  putative amino acid ABC transporter, substrate-binding protein  38.42 
 
 		 223 aa  125  7e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0588  extracellular solute-binding protein family 3  31.79 
 
 		 207 aa  110  2.0000000000000002e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2646  extracellular solute-binding protein  32.75 
 
 		 266 aa  106  3e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.997273  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0285  extracellular solute-binding protein  30.51 
 
 		 266 aa  103  2e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.994895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6284  putative periplasmic-binding protein  29.41 
 
 		 265 aa  75.9  0.0000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2601  extracellular solute-binding protein  28.7 
 
 		 265 aa  66.6  0.0000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.186233 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4313  extracellular solute-binding protein  30.26 
 
 		 278 aa  65.1  0.000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.438014  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0461  amino acid ABC transporter, periplasmic solute-binding protein  27.69 
 
 		 286 aa  61.6  0.000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1297  extracellular solute-binding protein  28.92 
 
 		 248 aa  61.2  0.00000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0609  glutamine ABC transporter, glutamine-binding protein  26.32 
 
 		 286 aa  60.8  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0109579  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2649  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  29.41 
 
 		 269 aa  56.6  0.0000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0237  extracellular solute-binding protein family 3  23.04 
 
 		 267 aa  53.9  0.000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.640745  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0122  amino acid ABC transporter periplasmic protein  23.84 
 
 		 281 aa  53.1  0.000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4039  extracellular solute-binding protein family 3  28.21 
 
 		 295 aa  50.8  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3131  extracellular solute-binding protein  28.79 
 
 		 266 aa  50.8  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0249016 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5554  extracellular solute-binding protein  28.14 
 
 		 245 aa  50.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.340153  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5919  extracellular solute-binding protein  28.14 
 
 		 245 aa  50.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4588  extracellular solute-binding protein  33.61 
 
 		 275 aa  50.8  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0319028  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3925  extracellular solute-binding protein family 3  28.21 
 
 		 295 aa  50.8  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2380  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  26.15 
 
 		 249 aa  50.1  0.00003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.730778  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1806  extracellular solute-binding protein  24.22 
 
 		 253 aa  50.1  0.00003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0263139  unclonable  0.0000000066734 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1775  extracellular solute-binding protein  28.72 
 
 		 251 aa  49.3  0.00005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.742308  hitchhiker  0.000324527 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5260  extracellular solute-binding protein  33.71 
 
 		 277 aa  49.3  0.00005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0991  arginine ABC transporter periplasmic arginine-binding protein ArtJ  25.34 
 
 		 243 aa  49.3  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0924  arginine ABC transporter, periplasmic arginine-binding protein ArtJ  25.34 
 
 		 243 aa  49.3  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0338236  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0959  arginine ABC transporter periplasmic arginine-binding protein ArtJ  25.34 
 
 		 243 aa  49.3  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1022  arginine ABC transporter periplasmic arginine-binding protein ArtJ  25.34 
 
 		 243 aa  49.3  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.186752  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1041  arginine ABC transporter periplasmic arginine-binding protein ArtJ  25.34 
 
 		 243 aa  49.3  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.385191  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2782  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  22.44 
 
 		 243 aa  48.9  0.00006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0257892  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1019  arginine ABC transporter, periplasmic arginine-binding protein ArtJ  22.44 
 
 		 243 aa  49.3  0.00006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.211484 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3062  extracellular solute-binding protein family 3  30.46 
 
 		 318 aa  48.9  0.00006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000243689 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00865  arginine transporter subunit  22.44 
 
 		 243 aa  48.9  0.00007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0964  arginine ABC transporter, periplasmic arginine-binding protein ArtJ  22.44 
 
 		 243 aa  48.9  0.00007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0932  arginine ABC transporter, periplasmic arginine-binding protein ArtJ  22.44 
 
 		 243 aa  48.9  0.00007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2736  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  22.44 
 
 		 243 aa  48.9  0.00007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0318086  normal  0.950747 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0448  extracellular solute-binding protein family 3  23.38 
 
 		 298 aa  48.9  0.00007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.917749  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00871  hypothetical protein  22.44 
 
 		 243 aa  48.9  0.00007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0179  extracellular solute-binding protein family 3  25.57 
 
 		 261 aa  48.5  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.861568 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6426  extracellular solute-binding protein  27.71 
 
 		 245 aa  48.5  0.00008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2471  arginine ABC transporter, periplasmic arginine-binding protein ArtJ  22.44 
 
 		 243 aa  48.5  0.00009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.198291  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2277  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  25.57 
 
 		 243 aa  47.8  0.0001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2377  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  25.67 
 
 		 243 aa  47.8  0.0001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.730778  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0904  glutamine-binding periplasmic protein  23.83 
 
 		 254 aa  48.1  0.0001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.207514  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3130  extracellular solute-binding protein  30.82 
 
 		 263 aa  48.1  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0125374 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3233  extracellular solute-binding protein  30.34 
 
 		 277 aa  47.8  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.638648 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1835  extracellular solute-binding protein family 3  31.45 
 
 		 262 aa  47.8  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0545252  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0414  extracellular solute-binding protein  27.43 
 
 		 252 aa  47  0.0002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0888  arginine ABC transporter, periplasmic arginine-binding protein ArtJ  21.79 
 
 		 243 aa  47.4  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.214233  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6191  extracellular solute-binding protein  36.63 
 
 		 262 aa  47.4  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3807  extracellular solute-binding protein  25.75 
 
 		 255 aa  46.6  0.0003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0339434  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2725  extracellular solute-binding protein  27.1 
 
 		 255 aa  46.6  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.377172 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1539  extracellular solute-binding protein family 3  25.52 
 
 		 283 aa  46.6  0.0003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000136922  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5218  extracellular solute-binding protein  27.03 
 
 		 290 aa  46.6  0.0004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1168  extracellular solute-binding protein family 3  29.03 
 
 		 255 aa  46.2  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7508  ABC transporter substrate binding protein (amino acid)  23.64 
 
 		 272 aa  46.2  0.0005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1539  amino acid ABC transporter periplasmic protein  21.91 
 
 		 284 aa  45.8  0.0005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.363793  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1512  extracellular solute-binding protein  25.81 
 
 		 276 aa  46.2  0.0005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1138  extracellular solute-binding protein family 3  29.03 
 
 		 255 aa  46.2  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0736  extracellular solute-binding protein  28.37 
 
 		 279 aa  45.1  0.0009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.580874  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0906  amino acid-binding protein  26.06 
 
 		 256 aa  44.7  0.001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1498  extracellular solute-binding protein  28.99 
 
 		 247 aa  45.1  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6331  extracellular solute-binding protein  28.57 
 
 		 268 aa  45.1  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.483344  normal  0.916228 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0836  amino acid-binding protein  26.06 
 
 		 256 aa  44.7  0.001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.462057  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1376  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  23.29 
 
 		 243 aa  44.7  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3278  extracellular solute-binding protein  31.96 
 
 		 276 aa  44.7  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.806697  normal  0.241519 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6996  extracellular solute-binding protein  28.57 
 
 		 268 aa  45.1  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0898754 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3796  extracellular solute-binding protein family 3  25.66 
 
 		 281 aa  44.7  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0150584  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6259  extracellular solute-binding protein family 3  27.82 
 
 		 270 aa  43.9  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.0000314466  normal  0.29457 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2280  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  24.62 
 
 		 244 aa  43.9  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3308  extracellular solute-binding protein  26.28 
 
 		 248 aa  44.3  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.944301  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2850  extracellular solute-binding protein  25.97 
 
 		 275 aa  43.9  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.610403 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1652  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  22.6 
 
 		 244 aa  43.9  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.513751 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0143  extracellular solute-binding protein  29.07 
 
 		 252 aa  44.3  0.002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.216874  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1872  extracellular solute-binding protein  29.63 
 
 		 306 aa  43.9  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.634039  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5245  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  27.91 
 
 		 261 aa  43.5  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2274  cystine transporter subunit  26.19 
 
 		 266 aa  43.5  0.003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2031  cystine transporter subunit  26.19 
 
 		 266 aa  43.5  0.003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>