More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_3726 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_3726  two component transcriptional regulator, LytTR family  100 
 
 		 252 aa  515  1.0000000000000001e-145  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.304835 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6676  two component transcriptional regulator, LytTR family  40.24 
 
 		 253 aa  195  6e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6060  two component transcriptional regulator, LytTR family  38.91 
 
 		 253 aa  190  2e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0758  two component transcriptional regulator, LytTR family  39.61 
 
 		 256 aa  184  9e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.649382 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7151  two component transcriptional regulator, LytTR family  41.11 
 
 		 249 aa  181  1e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1475  two component transcriptional regulator, LytTR family  36.96 
 
 		 255 aa  179  4.999999999999999e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.059663 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4001  LytTR family two component transcriptional regulator  38.74 
 
 		 255 aa  178  5.999999999999999e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5824  two component transcriptional regulator, LytTR family  38.67 
 
 		 258 aa  177  1e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0489181 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2091  two component transcriptional regulator, LytTR family  38.52 
 
 		 259 aa  177  1e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0504817  normal  0.478744 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2661  two component transcriptional regulator, LytTR family  35.83 
 
 		 252 aa  175  8e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1317  two component transcriptional regulator, LytTR family  35.63 
 
 		 261 aa  174  9.999999999999999e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1794  two component transcriptional regulator, LytTR family  37.69 
 
 		 260 aa  169  5e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4908  LytTR family two component transcriptional regulator  39.3 
 
 		 255 aa  167  1e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2354  two component transcriptional regulator, LytTR family  40.23 
 
 		 256 aa  166  2e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3229  LytTR family two component transcriptional regulator  38.89 
 
 		 250 aa  166  4e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0271  two component transcriptional regulator, LytTR family  36.33 
 
 		 256 aa  162  4.0000000000000004e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0600  two component transcriptional regulator, LytTR family  35.47 
 
 		 265 aa  162  5.0000000000000005e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.315052 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2256  two component transcriptional regulator, LytTR family  37.93 
 
 		 262 aa  157  1e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.596319 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1836  two component transcriptional regulator, LytTR family  37.98 
 
 		 258 aa  155  6e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.367672  normal  0.467017 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6406  two component transcriptional regulator, LytTR family  36.8 
 
 		 252 aa  155  9e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12408  two-component system response regulator  35.83 
 
 		 251 aa  154  1e-36  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.401855  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0307  two component transcriptional regulator, LytTR family  35.46 
 
 		 250 aa  152  4e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2789  response regulator receiver  32.94 
 
 		 254 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0804  two component transcriptional regulator, LytTR family  36.11 
 
 		 251 aa  148  8e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2775  two component transcriptional regulator, LytTR family  35.55 
 
 		 258 aa  145  5e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5335  two component transcriptional regulator, LytTR family  35.94 
 
 		 253 aa  145  7.0000000000000006e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.709567 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5312  two component transcriptional regulator, LytTR family  35.04 
 
 		 255 aa  144  1e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0977362 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0800  two component transcriptional regulator, LytTR family  34.92 
 
 		 251 aa  143  2e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2439  LytTr DNA-binding region  33.33 
 
 		 255 aa  141  9e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.697869  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4674  LytTR family two component transcriptional regulator  32.55 
 
 		 254 aa  136  4e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.124147  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1444  two component transcriptional regulator, LytTR family  32.95 
 
 		 256 aa  135  5e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.317386 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2868  two component transcriptional regulator, LytTR family  34.48 
 
 		 259 aa  135  9e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0154807  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6102  two component transcriptional regulator, LytTR family  33.46 
 
 		 252 aa  133  3e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5405  two component transcriptional regulator, LytTR family  31.1 
 
 		 243 aa  125  7e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.379459 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1209  LytTr DNA-binding region  30.04 
 
 		 240 aa  112  7.000000000000001e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0765  LytR/AlgR family transcriptional regulator  31.2 
 
 		 247 aa  109  4.0000000000000004e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.584976  normal  0.255142 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0979  LytTR family two component transcriptional regulator  32.2 
 
 		 242 aa  108  1e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0238694 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5142  two component transcriptional regulator, LytTR family  28.74 
 
 		 244 aa  105  7e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.546377  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2186  two component transcriptional regulator, LytTR family  28.74 
 
 		 275 aa  105  7e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3487  LytR/AlgR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 253 aa  99.4  6e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.76921  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0837  response regulator receiver protein  43.59 
 
 		 153 aa  99  6e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.925678  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0420  LytR/AlgR family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 317 aa  97.8  2e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0328897  normal  0.0302219 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1004  two component transcriptional regulator, LytTR family  27.71 
 
 		 257 aa  95.5  6e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00878343  normal  0.279198 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3159  response regulator receiver  30.29 
 
 		 242 aa  95.5  6e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4386  two component transcriptional regulator, LytTR family  27.2 
 
 		 260 aa  94.4  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0067  LytTR family two component transcriptional regulator  30.36 
 
 		 268 aa  93.2  3e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.169577  normal  0.169612 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3838  LytR/AlgR family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 254 aa  93.6  3e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.479778 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2974  LytTR family two component transcriptional regulator  28.51 
 
 		 266 aa  93.2  4e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.318128 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0374  two component transcriptional regulator, LytTR family  28.57 
 
 		 242 aa  92.4  7e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3594  two component transcriptional regulator, LytTR family  25.52 
 
 		 260 aa  91.3  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.833136  normal  0.0457058 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1001  LytR/AlgR family transcriptional regulator  27.51 
 
 		 262 aa  89.4  5e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0103069 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2906  two component transcriptional regulator, LytTR family  29.88 
 
 		 245 aa  89.4  6e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0904  LytTR family two component transcriptional regulator  28.81 
 
 		 243 aa  89  6e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0190  LytR/AlgR family transcriptional regulator  29.22 
 
 		 244 aa  89  7e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.625509  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6586  two component transcriptional regulator, LytTR family  27.23 
 
 		 246 aa  88.6  9e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.318104  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1527  LytTR family two component transcriptional regulator  29.44 
 
 		 246 aa  88.2  1e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.109257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1542  LytTr DNA-binding region  28.64 
 
 		 245 aa  87.4  2e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.300206 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0252  two-component response regulator  27.62 
 
 		 246 aa  87  2e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1761  two component transcriptional regulator, LytTR family  30.43 
 
 		 251 aa  87.8  2e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0246  two-component response regulator  27.62 
 
 		 246 aa  87  2e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1585  LytTr DNA-binding region  28.96 
 
 		 259 aa  86.7  3e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.80455  normal  0.0356965 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3976  LytTR family two component transcriptional regulator  26.51 
 
 		 247 aa  86.7  3e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2397  two component transcriptional regulator, LytTR family  28.29 
 
 		 261 aa  85.9  6e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3544  two component transcriptional regulator, LytTR family  26.91 
 
 		 251 aa  85.5  7e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0394969  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0227  LytR/AlgR family transcriptional regulator  28.69 
 
 		 265 aa  85.5  7e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.312706  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0387  response regulator  26.61 
 
 		 261 aa  84.7  0.000000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2443  LytTR family two component transcriptional regulator  25.99 
 
 		 279 aa  84.7  0.000000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3913  LytTR family two component transcriptional regulator  28.27 
 
 		 268 aa  84.7  0.000000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.316099  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0858  response regulator receiver protein  41.75 
 
 		 141 aa  84.3  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.748894  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2278  LytTr DNA-binding response regulator  30.24 
 
 		 280 aa  84  0.000000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.421967  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2434  putative two-component response-regulatory protein YehT  30.59 
 
 		 236 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.318628  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2172  LytR/AlgR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 252 aa  83.6  0.000000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0721488  normal  0.0255714 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2533  response regulator  27.27 
 
 		 244 aa  83.6  0.000000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2282  response regulator receiver protein  30.19 
 
 		 276 aa  82.8  0.000000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.81  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5573  response regulator LytR  25 
 
 		 246 aa  82.8  0.000000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0183  response regulator  27.85 
 
 		 246 aa  82.8  0.000000000000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3668  two-component response regulator AlgR  30.14 
 
 		 243 aa  82.8  0.000000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00827536  normal  0.334671 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2328  LytTR family two component transcriptional regulator  28.11 
 
 		 255 aa  82.8  0.000000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.261765  decreased coverage  0.00199939 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5303  two component transcriptional regulator, LytTR family  25.88 
 
 		 261 aa  82.4  0.000000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.153649 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1860  two component transcriptional regulator, LytTR family  30.45 
 
 		 266 aa  82.4  0.000000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2673  response regulator receiver protein  26.09 
 
 		 268 aa  82  0.000000000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.587227  normal  0.606797 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02291  predicted response regulator in two-component system withYpdA  26.88 
 
 		 244 aa  82  0.000000000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1276  two component transcriptional regulator, LytTR family  26.88 
 
 		 244 aa  82  0.000000000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.435037  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3613  response regulator  26.88 
 
 		 244 aa  82  0.000000000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.560415 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2750  response regulator  26.88 
 
 		 244 aa  82  0.000000000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1288  LytTR family two component transcriptional regulator  26.88 
 
 		 244 aa  82  0.000000000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.524379  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5621  response regulator LytR  25 
 
 		 246 aa  82  0.000000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2671  response regulator  26.88 
 
 		 244 aa  82  0.000000000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2518  response regulator  26.88 
 
 		 244 aa  82  0.000000000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5565  response regulator LytR  25 
 
 		 246 aa  81.3  0.00000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1246  LytTR family two component transcriptional regulator  27.31 
 
 		 254 aa  81.3  0.00000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0488  response regulator receiver protein  27.84 
 
 		 252 aa  81.6  0.00000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3405  LytTR family two component transcriptional regulator  29.48 
 
 		 244 aa  81.3  0.00000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.732179  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5384  response regulator LytR  25.45 
 
 		 246 aa  81.3  0.00000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.662493  normal  0.485514 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5234  LytTR family two component transcriptional regulator  25.89 
 
 		 246 aa  80.5  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5295  response regulator LytR  24.55 
 
 		 246 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5122  response regulator  24.55 
 
 		 246 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5536  response regulator LytR  24.55 
 
 		 246 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01160  response regulator of the LytR/AlgR family  24.6 
 
 		 238 aa  80.9  0.00000000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2697  LytR/AlgR family transcriptional regulator  25.31 
 
 		 240 aa  80.9  0.00000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>