74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_3327 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_3327  hypothetical protein  100 
 
 
428 aa  876    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.802157  normal  0.933717 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4214  hypothetical protein  30.62 
 
 
376 aa  100  4e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.208947  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1853  lipoprotein  47.37 
 
 
558 aa  99.8  8e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0367597  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6006  hypothetical protein  31.85 
 
 
366 aa  99.8  9e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6092  hypothetical protein  34.8 
 
 
254 aa  97.8  3e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4609  hypothetical protein  39.01 
 
 
543 aa  96.3  1e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.318539  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6114  hypothetical protein  34.2 
 
 
367 aa  94.4  4e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.513941  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0352  protein of unknown function DUF303 acetylesterase putative  33.9 
 
 
665 aa  93.2  8e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.259474  normal  0.181219 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2656  hypothetical protein  39.87 
 
 
571 aa  91.3  3e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0537  hypothetical protein  33.33 
 
 
1029 aa  86.3  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.244955  normal  0.441829 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0572  hypothetical protein  33.51 
 
 
347 aa  82.8  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2528  hypothetical protein  38.13 
 
 
221 aa  82.8  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00180911  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2527  FG-GAP repeat protein  32.63 
 
 
1433 aa  81.6  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000205902  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2139  CHU large protein, SAP or adhesin AidA-related  30.73 
 
 
688 aa  81.3  0.00000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.534536  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5606  hypothetical protein  31.18 
 
 
408 aa  81.3  0.00000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6600  hypothetical protein  28.57 
 
 
398 aa  80.5  0.00000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6007  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.41 
 
 
1015 aa  80.5  0.00000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00134837  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4541  hypothetical protein  40.16 
 
 
996 aa  80.1  0.00000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.444049  normal  0.286675 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0723  hypothetical protein  30.98 
 
 
1318 aa  79.3  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.661776 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0502  lipoprotein  34.59 
 
 
1575 aa  77.4  0.0000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.620204  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0821  hypothetical protein  35.52 
 
 
1055 aa  77  0.0000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.661621  normal  0.324111 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2349  hypothetical protein  42.24 
 
 
230 aa  75.9  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0736668  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2066  metallophosphoesterase  37.4 
 
 
686 aa  75.9  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2050  FG-GAP repeat protein  27.78 
 
 
1437 aa  76.3  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2105  glycoside hydrolase family 9  39.52 
 
 
803 aa  72.8  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.867838  normal  0.536914 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4181  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  38.94 
 
 
570 aa  72.4  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.100139  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0617  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  25.53 
 
 
1773 aa  72  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.716673  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2655  Spore coat protein CotH  33.59 
 
 
1174 aa  72  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4535  hypothetical protein  33.11 
 
 
333 aa  72  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.896481 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1758  lipoprotein  32.22 
 
 
933 aa  70.9  0.00000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.25404 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0718  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  35.17 
 
 
1783 aa  70.5  0.00000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.281324  normal  0.533675 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1580  hypothetical protein  32.95 
 
 
601 aa  70.1  0.00000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000412506  normal  0.738361 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2283  polymorphic outer membrane protein  34.75 
 
 
1296 aa  69.3  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3003  Cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  26.61 
 
 
900 aa  67.4  0.0000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2120  hypothetical protein  38.84 
 
 
362 aa  67.4  0.0000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1341  conserved repeat domain protein  32.18 
 
 
1668 aa  67.8  0.0000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.831003 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2794  hypothetical protein  30.53 
 
 
725 aa  67  0.0000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.423654 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2409  hypothetical protein  28.16 
 
 
336 aa  67  0.0000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00135262  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3347  hypothetical protein  29.41 
 
 
477 aa  66.6  0.0000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.702063  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5663  hypothetical protein  26.94 
 
 
324 aa  66.6  0.0000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0726  hypothetical protein  28.99 
 
 
1263 aa  66.2  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.434756  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1579  hypothetical protein  28.19 
 
 
394 aa  63.9  0.000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.039353  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5604  hypothetical protein  36.21 
 
 
1294 aa  63.5  0.000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0535  hypothetical protein  29.41 
 
 
1003 aa  63.5  0.000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.525327 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1867  lipoprotein  29.05 
 
 
634 aa  63.5  0.000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5262  hypothetical protein  28.19 
 
 
1215 aa  63.5  0.000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.653834  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5291  hypothetical protein  35.4 
 
 
736 aa  63.2  0.000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.775862  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2337  hypothetical protein  26.5 
 
 
1147 aa  63.2  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00625396  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0384  hypothetical protein  29.09 
 
 
700 aa  62.4  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000000171472  normal  0.22141 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0385  metallophosphoesterase  32.09 
 
 
701 aa  62.4  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00164005  normal  0.49014 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1906  lipoprotein  26.63 
 
 
647 aa  61.2  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2437  hypothetical protein  27.81 
 
 
846 aa  61.2  0.00000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3308  hypothetical protein  29.41 
 
 
340 aa  60.5  0.00000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4867  hypothetical protein  27.17 
 
 
657 aa  60.8  0.00000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.863369 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1942  hypothetical protein  28.99 
 
 
501 aa  60.1  0.00000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.507224 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4118  hypothetical protein  27.54 
 
 
755 aa  60.1  0.00000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.637469 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1757  hypothetical protein  28.41 
 
 
341 aa  57.8  0.0000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.154893 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0532  hypothetical protein  29.12 
 
 
757 aa  57.4  0.0000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0519891  normal  0.677455 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1660  hypothetical protein  29.41 
 
 
491 aa  57.4  0.0000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.293166 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2179  hypothetical protein  31.09 
 
 
541 aa  56.2  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1747  hypothetical protein  33.04 
 
 
495 aa  56.2  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2067  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  27.07 
 
 
687 aa  55.1  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2183  hypothetical protein  30.89 
 
 
571 aa  53.1  0.000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2027  hypothetical protein  25.7 
 
 
693 aa  51.6  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5728  Ig family protein  27.68 
 
 
646 aa  49.7  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.972475  normal  0.254446 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4401  lipolytic protein G-D-S-L family  30 
 
 
728 aa  49.7  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3748  hypothetical protein  29.31 
 
 
371 aa  48.9  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.012971  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6627  hypothetical protein  28.35 
 
 
523 aa  48.1  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.665855 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1919  hypothetical protein  36.78 
 
 
308 aa  47.8  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.608638 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3132  conserved repeat domain protein  31.18 
 
 
5517 aa  45.8  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.593801 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5066  hypothetical protein  25.6 
 
 
807 aa  45.4  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.493331  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0938  hypothetical protein  32.63 
 
 
586 aa  44.7  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000915423  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0873  CHU large protein  30.38 
 
 
1053 aa  44.3  0.005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.539179 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5064  conserved repeat domain protein  32.67 
 
 
853 aa  43.5  0.008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>