76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_3291 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_3291  integrase family protein  100 
 
 		 450 aa  935    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.671392  normal  0.608056 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6168  integrase family protein  25.76 
 
 		 411 aa  115  2.0000000000000002e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5531  integrase family protein  25.37 
 
 		 461 aa  60.1  0.00000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000000725821  normal  0.462507 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5173  integrase family protein  24.19 
 
 		 411 aa  58.9  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.54702 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2705  phage integrase family protein  22.9 
 
 		 386 aa  58.5  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.248695  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3281  integrase family protein  24.76 
 
 		 372 aa  57.8  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.739809 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5336  integrase family protein  24.65 
 
 		 378 aa  55.8  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.850487 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2633  phage integrase family protein  22.44 
 
 		 419 aa  54.3  0.000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1953  integrase family protein  24.39 
 
 		 405 aa  53.9  0.000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.247559  normal  0.500213 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3592  phage integrase family protein  22.57 
 
 		 419 aa  53.5  0.000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1462  Tn5520-like integrase (transfer factor)  21.78 
 
 		 402 aa  52.8  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.174557  normal  0.0965208 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03935  integrase  21.65 
 
 		 406 aa  52.8  0.00001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.439206  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4655  tyrosine recombinase XerC  43.28 
 
 		 365 aa  50.1  0.00008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.223284 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4288  tyrosine recombinase XerC  43.28 
 
 		 365 aa  50.1  0.00009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.710874 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0247  integrase family protein  43.28 
 
 		 322 aa  49.3  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.121071  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3189  integrase family protein  43.28 
 
 		 320 aa  48.9  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00303256 
 
 
-
 
NC_002950  PG0874  mobilizable transposon, int protein  21.48 
 
 		 367 aa  48.9  0.0002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0746163 
 
 
-
 
NC_002950  PG0819  integrase  27.11 
 
 		 409 aa  48.9  0.0002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1454  integrase  27.11 
 
 		 409 aa  48.9  0.0002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0952  integrase family protein  39.71 
 
 		 412 aa  48.1  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.571908  normal  0.0199815 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0817  tyrosine recombinase XerD  37.68 
 
 		 305 aa  48.1  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.763193  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4805  tyrosine recombinase XerC  41.79 
 
 		 367 aa  48.5  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.104736  normal  0.146847 
 
 
-
 
NC_002978  WD0752  phage integrase family site specific recombinase  39.66 
 
 		 309 aa  47.8  0.0004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.232674  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0974  integrase family protein  37.88 
 
 		 430 aa  47.8  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0711773  normal  0.0223597 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1639  integrase family protein  32.93 
 
 		 301 aa  47.8  0.0004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0514216  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2348  phage integrase family protein  25 
 
 		 301 aa  47.8  0.0004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2069  phage integrase family protein  24.48 
 
 		 419 aa  47.4  0.0005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0530977  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1729  hypothetical protein  24.29 
 
 		 404 aa  47  0.0007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000763037 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1239  hypothetical protein  41.94 
 
 		 299 aa  47  0.0007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.968724 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1220  site-specific tyrosine recombinase XerC  44.07 
 
 		 330 aa  46.6  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0271  site-specific tyrosine recombinase XerC  37.5 
 
 		 351 aa  45.8  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.28022  normal  0.462537 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0602  site-specific tyrosine recombinase XerC  44.07 
 
 		 324 aa  46.2  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00926796 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5470  tyrosine recombinase XerD  38.71 
 
 		 316 aa  46.6  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.602612  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2861  phage integrase family protein  28.81 
 
 		 153 aa  46.2  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.328637 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0401  site-specific tyrosine recombinase XerC  39.06 
 
 		 324 aa  46.2  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.145415 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3665  integrase family protein  33.93 
 
 		 313 aa  46.2  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.211751 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0163  integrase family protein  39.24 
 
 		 342 aa  46.2  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.70922  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0180  site-specific tyrosine recombinase XerC  40 
 
 		 324 aa  46.2  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0553  site-specific tyrosine recombinase XerC  39.06 
 
 		 329 aa  45.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.172687  normal  0.167276 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1177  integrase family protein  37.5 
 
 		 329 aa  45.8  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.151473 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00445  tyrosine type site-specific recombinase  22.66 
 
 		 405 aa  45.4  0.002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.459489  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1600  phage integrase family protein  20.91 
 
 		 404 aa  45.8  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0177  site-specific tyrosine recombinase XerC  39.06 
 
 		 323 aa  45.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2501  site-specific tyrosine recombinase XerC  40.32 
 
 		 312 aa  45.4  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.504706  normal  0.936606 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0106  phage integrase family protein  37.7 
 
 		 295 aa  45.1  0.003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0211  integrase family protein  29.73 
 
 		 384 aa  44.7  0.003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000967186 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1191  site-specific tyrosine recombinase XerC  43.1 
 
 		 313 aa  44.7  0.003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.60628  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0426  site-specific tyrosine recombinase XerC  37.5 
 
 		 321 aa  45.1  0.003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4262  integrase family protein  36.36 
 
 		 379 aa  44.7  0.003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1827  tyrosine recombinase XerD  37.1 
 
 		 306 aa  44.7  0.004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0536  site-specific tyrosine recombinase XerC  37.5 
 
 		 300 aa  44.7  0.004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.538013  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3124  integrase family protein  37.5 
 
 		 323 aa  44.7  0.004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1839  integrase family protein  24.04 
 
 		 310 aa  44.3  0.004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3099  integrase family protein  24.86 
 
 		 441 aa  44.3  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.979662 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3661  site-specific tyrosine recombinase XerC  38.71 
 
 		 311 aa  43.9  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1113  integrase  28.05 
 
 		 407 aa  43.9  0.005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1457  integrase family protein  39.39 
 
 		 326 aa  44.3  0.005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2809  phage integrase family protein  37.5 
 
 		 311 aa  43.9  0.006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0447  phage integrase family site specific recombinase  41.07 
 
 		 307 aa  43.9  0.006  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3796  phage integrase family protein  25.29 
 
 		 304 aa  43.9  0.006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2797  tyrosine recombinase XerD  38.71 
 
 		 298 aa  43.9  0.006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.650693  normal  0.205647 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02665  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.79 
 
 		 336 aa  43.9  0.006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1914  integrase/recombinase  25.29 
 
 		 304 aa  43.9  0.006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00100079  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1906  integrase family protein  27.47 
 
 		 295 aa  43.9  0.006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.713326  normal  0.217947 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0928  integrase family protein  38.81 
 
 		 326 aa  43.9  0.006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.669409 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4202  integrase family protein  36.62 
 
 		 406 aa  43.5  0.007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0912  integrase/recombinase  25.86 
 
 		 304 aa  43.5  0.007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0261382  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3550  integrase family protein  37.5 
 
 		 324 aa  43.5  0.008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.74971  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0466  Fis family transcriptional regulator  23.59 
 
 		 362 aa  43.5  0.008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1733  integrase family protein  39.06 
 
 		 333 aa  43.5  0.008  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3960  site-specific tyrosine recombinase XerC  41.38 
 
 		 311 aa  43.5  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.011638  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2016  phage integrase family protein  39.06 
 
 		 333 aa  43.1  0.009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0772  phage integrase  41.38 
 
 		 304 aa  43.5  0.009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.672054 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1634  integrase family protein  33.33 
 
 		 354 aa  43.1  0.009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.280587  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1428  phage integrase  39.34 
 
 		 317 aa  43.1  0.009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.473602  normal  0.0585003 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1282  tyrosine recombinase XerD  41.18 
 
 		 295 aa  43.1  0.01  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.63418  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>