78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_3095 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_3095  P4 family phage/plasmid primase  100 
 
 		 486 aa  1011    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.406256  normal  0.59304 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0217  P4 family phage/plasmid primase  51.57 
 
 		 486 aa  467  9.999999999999999e-131  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.01089  unclonable  0.0000111311 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2662  Phage/plasmid primase P4-like protein  30.48 
 
 		 632 aa  162  2e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2911  P4 family phage/plasmid primase  31.23 
 
 		 769 aa  155  1e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1052  plasmid/phage primase  27.92 
 
 		 828 aa  147  3e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0990831  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5359  P4 family phage/plasmid primase  28.81 
 
 		 531 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00485157  hitchhiker  0.00000000000000190106 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0490  phage/plasmid primase, P4 family  28.66 
 
 		 882 aa  117  6e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.958319  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0983  P4 family phage/plasmid primase  28.62 
 
 		 612 aa  114  3e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1734  P4 family phage/plasmid primase  27.78 
 
 		 624 aa  108  2e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1475  phage DNA polymerase  24.32 
 
 		 788 aa  102  1e-20  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0353  P4 family phage/plasmid primase  26.76 
 
 		 613 aa  102  1e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.764732  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2363  P4 family phage/plasmid primase  23.42 
 
 		 900 aa  101  3e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.134439  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3115  P4 family phage/plasmid primase  27.27 
 
 		 695 aa  97.1  7e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00327339  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0448  Phage-plasmid primase P4-like  30.2 
 
 		 746 aa  96.7  9e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0927  P4 family phage/plasmid primase  30.2 
 
 		 746 aa  96.7  9e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1244  putative Phage / plasmid primase P4  27.35 
 
 		 749 aa  95.9  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.372159  normal  0.928701 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1986  P4 family phage/plasmid primase  30.61 
 
 		 717 aa  94.7  3e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2797  P4 family phage/plasmid primase  24.29 
 
 		 782 aa  94.4  4e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4888  P4 family phage/plasmid primase  27.78 
 
 		 697 aa  94.4  5e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.100684  normal  0.121248 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2847  P4 family phage/plasmid primase  30.2 
 
 		 717 aa  92.4  2e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.318392  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2865  P4 family phage/plasmid primase  28.98 
 
 		 717 aa  90.9  5e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0870344  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1367  P4 family phage/plasmid primase  26.93 
 
 		 524 aa  88.6  2e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.357272  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0072  phage/plasmid DNA primase, putative  25.15 
 
 		 757 aa  87  7e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.612885  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1000  Phage/plasmid primase P4-like  24.55 
 
 		 723 aa  86.7  8e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.760681  hitchhiker  0.00622147 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1465  hypothetical protein  25.15 
 
 		 770 aa  86.3  0.000000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.237309  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6272  P4 family phage/plasmid primase  22.48 
 
 		 725 aa  84.3  0.000000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.613455  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1323  hypothetical protein  24.64 
 
 		 526 aa  84  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.103734  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0842  hypothetical protein  24.64 
 
 		 526 aa  84  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.464315  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0665  P4 family phage/plasmid primase  24.71 
 
 		 463 aa  84  0.000000000000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2199  P4 family phage/plasmid primase  26.39 
 
 		 554 aa  83.2  0.000000000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6606  putative Phage / plasmid primase P4  25.38 
 
 		 624 aa  82  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1315  Phage/plasmid primase P4-like  24.24 
 
 		 771 aa  80.1  0.00000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0874  nucleoside triphosphatase, D5 family  24.7 
 
 		 774 aa  79.7  0.00000000000009  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2551  P4 family phage/plasmid primase  27.74 
 
 		 507 aa  78.6  0.0000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00685324  normal  1 
 
 
-
 
NC_013749  Htur_5275  phage/plasmid primase, P4 family  24.55 
 
 		 1285 aa  78.2  0.0000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.413265  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3221  hypothetical protein  25.25 
 
 		 760 aa  75.1  0.000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.038701  n/a   
 
 
-
 
NC_011893  Mnod_8782  hypothetical protein  22.49 
 
 		 482 aa  75.9  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.242638  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1180  P4 family phage/plasmid primase  22.05 
 
 		 843 aa  74.3  0.000000000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000898776  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5782  P4 family phage/plasmid primase  24.82 
 
 		 978 aa  73.9  0.000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3229  hypothetical protein  25.68 
 
 		 759 aa  73.2  0.00000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000988084 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3701  P4 family phage/plasmid primase  23.05 
 
 		 798 aa  72.8  0.00000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0879  hypothetical protein  25.7 
 
 		 738 aa  71.6  0.00000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2258  phage DNA polymerase  22.86 
 
 		 542 aa  71.2  0.00000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0839  hypothetical protein  26.47 
 
 		 765 aa  70.1  0.00000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.469557  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3437  hypothetical protein  24.58 
 
 		 462 aa  70.1  0.00000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.95376  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1354  hypothetical protein  23.58 
 
 		 470 aa  70.1  0.00000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0809995  normal  0.479035 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2648  hypothetical protein  25.11 
 
 		 755 aa  69.3  0.0000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1166  hypothetical protein  24.84 
 
 		 467 aa  66.6  0.0000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3729  P4 family phage/plasmid primase  21.91 
 
 		 874 aa  65.5  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3780  P4 family phage/plasmid primase  21.91 
 
 		 874 aa  65.5  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1160  hypothetical protein  21.32 
 
 		 842 aa  64.7  0.000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0104949  n/a   
 
 
-
 
NC_013208  Aaci_3149  phage/plasmid primase, P4 family  23.19 
 
 		 1061 aa  61.6  0.00000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0479  ATPase-like protein  26.03 
 
 		 1039 aa  60.1  0.00000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5167  hypothetical protein  25.52 
 
 		 472 aa  59.3  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1079  DNA primase small subunit  25.21 
 
 		 1036 aa  59.3  0.0000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1974  hypothetical protein  21.99 
 
 		 485 aa  58.2  0.0000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0135  hypothetical protein  29.35 
 
 		 479 aa  56.2  0.000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0946  D5 family nucleoside triphosphatase  23.68 
 
 		 605 aa  56.6  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0819  phage DNA polymerase  25.51 
 
 		 501 aa  55.8  0.000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.020371  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0642  Phage or plasmid primase P4-like  21.74 
 
 		 540 aa  55.1  0.000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0349968  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4847  bacteriophage P4 DNA primase  23.55 
 
 		 776 aa  53.9  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.645663  normal  0.521901 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5881  DNA primase catalytic core domain protein  20.45 
 
 		 1117 aa  52  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000211197 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3752  primase P4-like protein  21.74 
 
 		 799 aa  50.4  0.00007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0890  D5 family nucleoside triphosphatase  22.96 
 
 		 763 aa  49.7  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3426  P4 family phage/plasmid primase  20.36 
 
 		 857 aa  48.1  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00902831  normal  0.0299262 
 
 
-
 
NC_010373  M446_7040  hypothetical protein  20.75 
 
 		 450 aa  48.5  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.445259 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3269  P4 family phage/plasmid primase  21.35 
 
 		 775 aa  47.4  0.0006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.592172  n/a   
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4533  P4 family phage/plasmid primase  22.99 
 
 		 1172 aa  47  0.0008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4492  phage/plasmid primase, P4 family  22.99 
 
 		 1172 aa  47  0.0008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4012  D5 family nucleoside triphosphatase  21.84 
 
 		 777 aa  46.6  0.0009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2964  bacteriophage P4 DNA primase  21.86 
 
 		 777 aa  47  0.0009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000273638 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0320  putative nucleoside triphosphatase, D5 family  23.97 
 
 		 777 aa  47  0.0009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.382888 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0043  P4 family phage/plasmid primase  22.15 
 
 		 777 aa  46.6  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1053  P4 family phage/plasmid primase  22.15 
 
 		 777 aa  46.6  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3860  D5 family nucleoside triphosphatase  23.68 
 
 		 763 aa  46.6  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.503803  normal  0.0447982 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2196  P4 family phage/plasmid primase  21.26 
 
 		 955 aa  44.7  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.319674  hitchhiker  0.00463191 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3110  plasmid and phage DNA primase  26.43 
 
 		 777 aa  45.1  0.003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.926213  normal  0.17029 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0622  P4 family phage/plasmid primase  21.7 
 
 		 477 aa  43.9  0.006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.77951  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>