171 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_1002 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_1002  glucose/galactose transporter  100 
 
 		 406 aa  800    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00935633  normal  0.690968 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3687  glucose/galactose transporter  74.21 
 
 		 413 aa  601  1.0000000000000001e-171  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.202302  normal  0.04252 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0466  glucose/galactose transporter  62.81 
 
 		 408 aa  478  1e-134  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.187531  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3397  glucose/galactose transporter  52.35 
 
 		 419 aa  408  1e-113  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0875  glucose/galactose transporter  50.12 
 
 		 429 aa  374  1e-102  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.742352  hitchhiker  0.000720356 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1696  glucose/galactose transporter  47 
 
 		 444 aa  362  5.0000000000000005e-99  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0309117  normal  0.239808 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6560  glucose/galactose transporter  45.45 
 
 		 438 aa  359  4e-98  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.13532  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4488  glucose/galactose transporter  46.4 
 
 		 440 aa  357  2.9999999999999997e-97  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.797276  normal  0.125839 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3038  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  45.09 
 
 		 443 aa  347  2e-94  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000693301 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6211  glucose/galactose transporter  45.41 
 
 		 431 aa  346  4e-94  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0776  glucose/galactose transporter  46.1 
 
 		 441 aa  345  1e-93  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.747868  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2077  glucose/galactose transporter  45.45 
 
 		 426 aa  332  9e-90  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1104  glucose/galactose transporter  44.06 
 
 		 437 aa  328  9e-89  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0045785  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1199  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  44.06 
 
 		 438 aa  327  2.0000000000000001e-88  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.985389  normal  0.598645 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0948  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  44.26 
 
 		 441 aa  325  6e-88  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000625246  normal  0.50538 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04321  glucose-galactose transporter  45.86 
 
 		 407 aa  323  3e-87  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0805  glucose/galactose transporter  44.28 
 
 		 429 aa  320  3.9999999999999996e-86  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0716  glucose/galactose transporter  43.8 
 
 		 429 aa  315  7e-85  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3424  glucose/galactose transporter  44.63 
 
 		 429 aa  315  7e-85  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.640609  normal  0.0976131 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2530  major facilitator transporter  43.9 
 
 		 452 aa  312  6.999999999999999e-84  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2597  major facilitator transporter  43.66 
 
 		 452 aa  310  2.9999999999999997e-83  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.802084  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3114  glucose/galactose transporter  46.82 
 
 		 430 aa  306  6e-82  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00000902202  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2696  major facilitator transporter  43.63 
 
 		 452 aa  304  2.0000000000000002e-81  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4115  glucose/galactose transporter  43.99 
 
 		 429 aa  302  7.000000000000001e-81  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.312497  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1028  glucose/galactose transporter family protein  38.69 
 
 		 433 aa  290  3e-77  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2702  glucose/galactose transporter  38.58 
 
 		 433 aa  288  1e-76  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0791256  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3207  glucose/galactose transporter  38.62 
 
 		 432 aa  286  5e-76  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1088  glucose/galactose transporter  38.62 
 
 		 432 aa  286  5e-76  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.307429  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1148  glucose/galactose transporter  38.62 
 
 		 432 aa  286  5e-76  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0988235  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1182  glucose/galactose transporter  38.62 
 
 		 432 aa  286  5e-76  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.884299  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4175  glucose/galactose transporter  38.84 
 
 		 446 aa  285  8e-76  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1315  glucose/galactose transporter  38.63 
 
 		 435 aa  285  9e-76  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0258067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1080  glucose/galactose transporter  38.89 
 
 		 432 aa  284  2.0000000000000002e-75  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000174019  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3503  glucose/galactose transporter  38.99 
 
 		 435 aa  279  6e-74  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2931  glucose/galactose transporter  39.72 
 
 		 432 aa  276  4e-73  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000470631  normal  0.974041 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3013  glucose/galactose transporter  39.72 
 
 		 432 aa  276  4e-73  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0638848  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3110  glucose/galactose transporter  39.72 
 
 		 432 aa  275  8e-73  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0409592  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1215  glucose/galactose transporter  38.46 
 
 		 434 aa  275  9e-73  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000975208  normal  0.526597 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1396  glucose/galactose transporter  38.63 
 
 		 1140 aa  259  5.0000000000000005e-68  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.866269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1119  glucose/galactose transporter  38.85 
 
 		 418 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000391013  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2389  glucose/galactose transporter family protein  35.9 
 
 		 436 aa  233  6e-60  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.706169  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5388  glucose/galactose transporter  36.19 
 
 		 424 aa  228  1e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3705  glucose/galactose transporter family protein  36.14 
 
 		 407 aa  221  1.9999999999999999e-56  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1317  glucose/galactose transporter  33.74 
 
 		 435 aa  220  3e-56  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1132  glucose/galactose transporter  34.79 
 
 		 431 aa  218  1e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.165253  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3761  glucose/galactose transporter  34.81 
 
 		 410 aa  218  2e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.807951 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2298  glucose/galactose transporter  33.98 
 
 		 423 aa  217  2.9999999999999998e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00747197  normal  1 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4572  hypothetical protein  33.98 
 
 		 423 aa  217  2.9999999999999998e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2286  glucose/galactose transporter  33.98 
 
 		 423 aa  217  2.9999999999999998e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2040  glucose/galactose transporter  33.98 
 
 		 423 aa  217  2.9999999999999998e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.441952  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2087  glucose/galactose transporter  33.98 
 
 		 423 aa  217  2.9999999999999998e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1217  glucose/galactose transporter  33.41 
 
 		 431 aa  215  9.999999999999999e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00556902  normal  0.207324 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1259  L-fucose transporter  34.57 
 
 		 417 aa  214  1.9999999999999998e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1148  glucose/galactose transporter  34.48 
 
 		 428 aa  214  2.9999999999999995e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0931456  normal  0.671302 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1017  glucose/galactose transporter  33.89 
 
 		 428 aa  213  4.9999999999999996e-54  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3173  glucose/galactose transporter  33.17 
 
 		 431 aa  213  4.9999999999999996e-54  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000854879  normal  0.83373 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4021  L-fucose transporter  35.54 
 
 		 417 aa  212  1e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1403  glucose/galactose transporter  34.01 
 
 		 415 aa  211  2e-53  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000325262  normal  0.0455356 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1663  glucose/galactose transporter  34.38 
 
 		 415 aa  211  2e-53  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.24323  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2027  glucose/galactose transporter  35.63 
 
 		 415 aa  210  3e-53  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03795  glucose/galactose transporter family protein  32.86 
 
 		 420 aa  210  4e-53  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.268682  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2211  glucose/galactose transporter  34.74 
 
 		 424 aa  209  6e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.17788  hitchhiker  0.00147708 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2208  glucose/galactose transporter  34.65 
 
 		 423 aa  207  2e-52  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2310  glucose/galactose transporter  35.73 
 
 		 423 aa  206  4e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.788662  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3671  glucose/galactose transporter  33.1 
 
 		 435 aa  206  5e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2132  glucose/galactose transporter  34.9 
 
 		 423 aa  206  5e-52  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0292  glucose/galactose transporter  34.63 
 
 		 389 aa  206  6e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0119  glucose/galactose transporter  32.19 
 
 		 425 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1656  glucose/galactose transporter  32.64 
 
 		 458 aa  201  1.9999999999999998e-50  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4128  L-fucose transporter  34.68 
 
 		 431 aa  201  1.9999999999999998e-50  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1890  glucose/galactose transporter  35.05 
 
 		 421 aa  198  2.0000000000000003e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.621908  normal  0.769175 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2750  L-fucose transporter  34.45 
 
 		 431 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1789  glucose/galactose transporter  33.82 
 
 		 421 aa  196  5.000000000000001e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0540025  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2649  glucose/galactose transporter family protein  34.67 
 
 		 428 aa  195  2e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.000985214  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5644  L-fucose transporter  33.33 
 
 		 417 aa  193  6e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.183274  normal  0.735779 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3930  glucose/galactose transporter  34.27 
 
 		 436 aa  191  1e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.121013  normal  0.215751 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1266  L-fucose-proton symporter  35 
 
 		 403 aa  192  1e-47  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2986  glucose/galactose transporter  31.19 
 
 		 412 aa  190  5e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2606  glucose/galactose transporter  33.17 
 
 		 435 aa  189  9e-47  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.246448  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1776  glucose/galactose transporter  33.17 
 
 		 437 aa  186  5e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.223071  normal  0.453321 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1241  glucose/galactose transporter  33.73 
 
 		 426 aa  184  3e-45  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.184837  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01229  glucose-galactose transporter  33.49 
 
 		 427 aa  182  7e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0194609  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1273  glucose/galactose transporter  33.81 
 
 		 426 aa  181  1e-44  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1994  L-fucose transporter  31.55 
 
 		 432 aa  181  2e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.486095 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2125  glucose/galactose transporter  32.89 
 
 		 468 aa  175  9.999999999999999e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.957571 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08721  glucose/galactose transporter  31.09 
 
 		 440 aa  175  9.999999999999999e-43  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.066118  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0644  L-fucose transporter  30.24 
 
 		 409 aa  174  1.9999999999999998e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.510185  normal  0.606188 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5334  glucose/galactose transporter  32.6 
 
 		 405 aa  173  3.9999999999999995e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.120939  normal  0.764594 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3386  glucose/galactose transporter  33.42 
 
 		 412 aa  170  4e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.134569 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0562  glucose/galactose transporter  32.43 
 
 		 413 aa  170  4e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.336996 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2428  L-fucose permease  30.64 
 
 		 433 aa  169  6e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5715  L-fucose transporter  30.24 
 
 		 417 aa  167  4e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.988636  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4044  L-fucose transporter  28.96 
 
 		 420 aa  167  4e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3137  L-fucose transporter  29.1 
 
 		 438 aa  164  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.436667 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3185  L-fucose transporter  29.1 
 
 		 438 aa  164  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.780035  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0773  fucose permease  30.64 
 
 		 485 aa  165  2.0000000000000002e-39  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.380581 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3120  L-fucose transporter  29.1 
 
 		 438 aa  164  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.38497  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3200  L-fucose transporter  29.1 
 
 		 438 aa  164  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3300  L-fucose transporter  29.1 
 
 		 438 aa  164  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02756  L-fucose:H+ symporter permease  32.51 
 
 		 411 aa  164  2.0000000000000002e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>