More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_04860 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_04860  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  100 
 
 		 763 aa  1558    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.820236 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0432  glycosyl transferase family 51  53.52 
 
 		 784 aa  708    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.440855 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1399  glycosyl transferase family 51  45.68 
 
 		 807 aa  574  1.0000000000000001e-162  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.248953  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0604  glycosyl transferase family 51  45.54 
 
 		 833 aa  567  1e-160  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0810058  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3041  glycosyl transferase family 51  47 
 
 		 765 aa  567  1e-160  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3099  glycosyl transferase family 51  47.62 
 
 		 838 aa  537  1e-151  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.113974  hitchhiker  0.000163958 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26280  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  40.35 
 
 		 821 aa  502  1e-140  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.419693  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0429  glycosyl transferase family 51  43.97 
 
 		 821 aa  496  1e-139  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.195502 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3399  glycosyl transferase family protein  37.59 
 
 		 766 aa  430  1e-119  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.809051  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3180  glycosyl transferase family 51  38.06 
 
 		 772 aa  427  1e-118  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0978  membrane carboxypeptidase  38.49 
 
 		 768 aa  424  1e-117  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0109  PASTA  38.03 
 
 		 801 aa  419  1e-116  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.820003  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1026  glycosyl transferase family 51  38.48 
 
 		 773 aa  418  9.999999999999999e-116  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3246  glycosyl transferase family 51  34.89 
 
 		 727 aa  413  1e-114  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3526  glycosyl transferase family protein  37.61 
 
 		 723 aa  413  1e-114  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.121527  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5307  glycosyl transferase family 51  37.68 
 
 		 789 aa  404  1e-111  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.93625 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2004  glycosyl transferase family protein  38.36 
 
 		 820 aa  404  1e-111  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0304  transglycosylase  35.44 
 
 		 773 aa  404  1e-111  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.201618 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8912  glycosyl transferase family 51  35.53 
 
 		 740 aa  399  1e-109  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.882154 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18460  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  37.54 
 
 		 727 aa  391  1e-107  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0250  glycosyl transferase family 51  36.8 
 
 		 892 aa  384  1e-105  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0340145 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0195  family 51 glycosyl transferase  35.83 
 
 		 739 aa  385  1e-105  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.89929 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5853  glycosyl transferase family protein  35.45 
 
 		 819 aa  370  1e-101  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.698953  normal  0.762762 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25450  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  36.45 
 
 		 817 aa  369  1e-100  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0326  glycosyl transferase family protein  37.08 
 
 		 807 aa  369  1e-100  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.563186  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0460  multimodular transpeptidase-transglycosylase  33.29 
 
 		 744 aa  359  9.999999999999999e-98  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.361167  normal  0.657816 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0754  twin-arginine translocation pathway signal  34.97 
 
 		 880 aa  354  2.9999999999999997e-96  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2902  Peptidoglycan glycosyltransferase  36.46 
 
 		 759 aa  350  5e-95  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.786765  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1426  peptidoglycan glycosyltransferase  35.21 
 
 		 1057 aa  348  2e-94  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.591884 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3010  Peptidoglycan glycosyltransferase  36.56 
 
 		 737 aa  342  2e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.993006  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4921  Peptidoglycan glycosyltransferase  37.55 
 
 		 747 aa  342  2e-92  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8177  Peptidoglycan glycosyltransferase  35.33 
 
 		 736 aa  337  3.9999999999999995e-91  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0337  glycosyl transferase family protein  34.11 
 
 		 871 aa  336  1e-90  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0174987 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4277  glycosyl transferase family protein  34.06 
 
 		 877 aa  328  2.0000000000000001e-88  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.113216  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3240  glycosyl transferase family protein  37.25 
 
 		 758 aa  327  5e-88  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3015  glycosyl transferase family protein  35.69 
 
 		 758 aa  320  5e-86  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.166966  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4664  glycosyl transferase family 51  33.38 
 
 		 721 aa  316  9.999999999999999e-85  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.748672  hitchhiker  0.00235934 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0511  glycosyl transferase family 51  34.47 
 
 		 726 aa  310  5.9999999999999995e-83  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0481562  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36250  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  32.78 
 
 		 720 aa  304  3.0000000000000004e-81  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.808415 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5713  Peptidoglycan glycosyltransferase  33.43 
 
 		 766 aa  302  1e-80  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4354  glycosyl transferase family protein  34.05 
 
 		 801 aa  300  6e-80  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02290  penicillin-binding protein, 1A family  34.93 
 
 		 710 aa  297  5e-79  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1056  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.84 
 
 		 705 aa  288  2e-76  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4870  glycosyl transferase family 51  32.43 
 
 		 814 aa  288  2e-76  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08350  penicillin-binding protein, 1A family  32.37 
 
 		 723 aa  283  1e-74  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.207948 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3548  glycosyl transferase family protein  33.28 
 
 		 710 aa  282  2e-74  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0586  glycosyl transferase family 51  34.94 
 
 		 722 aa  282  2e-74  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.690048  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4746  glycosyl transferase family 51  33.28 
 
 		 680 aa  282  2e-74  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.842414  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4796  glycosyl transferase family protein  32.22 
 
 		 808 aa  281  3e-74  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.686979  normal  0.170085 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3923  glycosyl transferase family protein  32.79 
 
 		 710 aa  279  1e-73  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.304998  normal  0.0998899 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4382  glycosyl transferase family 51  32.2 
 
 		 771 aa  276  8e-73  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.099328 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0697  Peptidoglycan glycosyltransferase  34 
 
 		 695 aa  274  3e-72  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0235  glycosyl transferase family 51  30.47 
 
 		 830 aa  273  1e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2337  glycosyl transferase family 51  33.7 
 
 		 750 aa  270  1e-70  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.360484  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2308  penicillin-binding protein 1A  32.08 
 
 		 761 aa  268  2.9999999999999995e-70  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0308818  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1128  penicillin-binding protein, 1A family  29.83 
 
 		 648 aa  268  4e-70  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05690  penicillin-binding protein, 1A family  30.93 
 
 		 806 aa  267  5e-70  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0444  1A family penicillin-binding protein  30.98 
 
 		 654 aa  263  1e-68  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1056  penicillin-binding protein, 1A family  31.94 
 
 		 751 aa  260  7e-68  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1710  penicillin-binding protein 1A  32.67 
 
 		 905 aa  258  2e-67  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000352248  normal  0.214747 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4021  glycosyl transferase family protein  34.7 
 
 		 700 aa  256  7e-67  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000948759 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0343  penicillin-binding protein, 1A family  30.01 
 
 		 774 aa  256  1.0000000000000001e-66  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.314658  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0217  penicillin-binding protein, 1A family  32.36 
 
 		 643 aa  256  1.0000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.380595  hitchhiker  0.00649941 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0220  penicillin-binding protein, 1A family  32.36 
 
 		 643 aa  256  1.0000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0242  penicillin-binding protein, 1A family  30.4 
 
 		 730 aa  253  1e-65  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00000113999  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0362  1A family penicillin-binding protein  30.7 
 
 		 741 aa  252  2e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.244077 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3939  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.94 
 
 		 840 aa  251  4e-65  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1010  penicillin-binding protein, 1A family  31.81 
 
 		 710 aa  250  8e-65  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0316  penicillin-binding protein, 1A family  29.74 
 
 		 750 aa  250  8e-65  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.223118 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0858  penicillin-binding protein, 1A family  31.39 
 
 		 618 aa  249  1e-64  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00486988  hitchhiker  0.00041503 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4341  glycosyl transferase family 51  31.06 
 
 		 764 aa  249  1e-64  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00883822  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0235  penicillin-binding protein, 1A family  29.17 
 
 		 880 aa  249  2e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3703  penicillin-binding protein, 1A family  30.91 
 
 		 712 aa  248  2e-64  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.053736 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0739  penicillin-binding protein, 1A family  29.88 
 
 		 668 aa  248  3e-64  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2871  1A family penicillin-binding protein  34.2 
 
 		 860 aa  248  4e-64  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1365  glycosyl transferase family protein  32.92 
 
 		 818 aa  248  4e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.488414 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3639  glycosyl transferase family protein  34.59 
 
 		 703 aa  247  6.999999999999999e-64  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1300  penicillin-binding protein, 1A family  30.8 
 
 		 648 aa  246  9.999999999999999e-64  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.396458  hitchhiker  0.0031785 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0227  penicillin-binding protein 1A  31.6 
 
 		 732 aa  245  3e-63  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.369543  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2643  penicillin-binding protein, 1A family  30.35 
 
 		 755 aa  244  3.9999999999999997e-63  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1369  1A family penicillin-binding protein  29.23 
 
 		 765 aa  244  6e-63  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3106  family 51 glycosyl transferase  30.33 
 
 		 719 aa  243  7e-63  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.265076  hitchhiker  0.000700529 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1068  glycosyl transferase family protein  32.44 
 
 		 828 aa  243  1e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2526  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.07 
 
 		 764 aa  242  2e-62  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0494  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.69 
 
 		 816 aa  242  2e-62  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5209  glycosyl transferase family protein  31.22 
 
 		 824 aa  242  2e-62  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.567607  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5899  glycosyl transferase family 51  31.29 
 
 		 726 aa  241  2.9999999999999997e-62  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.118947  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1696  penicillin-binding protein, 1A family  30.65 
 
 		 761 aa  241  4e-62  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.235679  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0041  penicillin-binding protein 1A  29.66 
 
 		 735 aa  241  4e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6778  1A family penicillin-binding protein  31.43 
 
 		 714 aa  241  4e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.395595  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4526  glycosyl transferase family protein  31.53 
 
 		 1065 aa  241  5e-62  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0580  penicillin-binding protein, 1A family  29.17 
 
 		 739 aa  240  5.999999999999999e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7653  putative penicillin-binding protein pbpC/mrcB-like protein  31 
 
 		 734 aa  239  1e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.278881 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3542  penicillin-binding protein, 1A family  29.49 
 
 		 817 aa  239  1e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2100  1A family penicillin-binding protein  29.91 
 
 		 661 aa  239  1e-61  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0926  penicillin-binding protein 1A  29.93 
 
 		 640 aa  239  2e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0590  penicillin-binding protein 1A  29.52 
 
 		 762 aa  239  2e-61  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5442  glycosyl transferase family protein  30.92 
 
 		 817 aa  239  2e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.248132 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2535  penicillin-binding protein, 1A family  30.29 
 
 		 643 aa  238  3e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1945  penicillin-binding protein 1A  30.04 
 
 		 752 aa  238  4e-61  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.419198  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>