57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_1112 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_1180  hypothetical protein  87.47 
 
 		 902 aa  1532    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1112  hypothetical protein  100 
 
 		 901 aa  1822    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0403332  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0423  hypothetical protein  34.17 
 
 		 809 aa  399  1e-109  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3113  hypothetical protein  24.96 
 
 		 757 aa  139  2e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0847993 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0686  hypothetical protein  25.13 
 
 		 732 aa  124  7e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.621901  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0797  protease domain-containing protein  39.89 
 
 		 1393 aa  102  4e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3141  protease domain-containing protein  39.25 
 
 		 1393 aa  100  2e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1809  putative protease  37.23 
 
 		 656 aa  94.4  9e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.328878  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2564  PKD domain-containing protein  36.65 
 
 		 1107 aa  83.2  0.00000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.543991 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4740  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  37.29 
 
 		 1217 aa  82.8  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.51333  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1428  chitinase  36.93 
 
 		 972 aa  80.1  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3882  leucine-rich repeat-containing protein  30.61 
 
 		 816 aa  79.7  0.0000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0248  PKD domain-containing protein  29.23 
 
 		 3278 aa  77  0.000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.748556 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2158  NHL repeat-containing protein  38.57 
 
 		 1750 aa  74.3  0.00000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2136  chitinase  37.11 
 
 		 869 aa  73.2  0.00000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000620509  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3093  glycoside hydrolase family protein  35.58 
 
 		 868 aa  70.9  0.0000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.73338  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3083  glycoside hydrolase family 18  35.58 
 
 		 867 aa  70.5  0.0000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.204167  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1284  glycoside hydrolase family 18  34.97 
 
 		 868 aa  68.9  0.0000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.113127  normal  0.562085 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3236  glycoside hydrolase family protein  34.97 
 
 		 868 aa  68.9  0.0000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2805  glycosyl hydrolase family chitinase  34.78 
 
 		 868 aa  67.8  0.0000000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2984  glycosyl hydrolase family chitinase  33.67 
 
 		 868 aa  67.4  0.000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3767  protease domain-containing protein  46.39 
 
 		 1311 aa  67  0.000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000363962 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1100  glycoside hydrolase family protein  33.76 
 
 		 863 aa  67  0.000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.167101  normal  0.565849 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2888  glycosyl hydrolase family chitinase  34.16 
 
 		 868 aa  66.6  0.000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6125  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  34.92 
 
 		 1212 aa  67  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  unclonable  0.000714594  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06955  chitinase  29.89 
 
 		 855 aa  67  0.000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0832  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  42.06 
 
 		 1292 aa  63.9  0.00000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0106  chitinase  31.52 
 
 		 848 aa  63.9  0.00000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000945  chitinase  29.73 
 
 		 848 aa  63.2  0.00000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2974  PKD domain-containing protein  32.22 
 
 		 833 aa  59.7  0.0000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004053  hypothetical protein  29.47 
 
 		 994 aa  58.9  0.0000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000445976  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2651  PKD domain-containing protein  30.12 
 
 		 611 aa  56.6  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2474  hypothetical protein  35.09 
 
 		 826 aa  57  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.552746  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02194  hypothetical protein  28 
 
 		 985 aa  56.2  0.000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1644  PKD domain containing protein  32.84 
 
 		 820 aa  54.7  0.000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2588  hypothetical protein  29.3 
 
 		 1022 aa  54.7  0.000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2139  hypothetical protein  37.78 
 
 		 1011 aa  53.5  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000321254  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0555  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.92 
 
 		 1399 aa  53.1  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0581373 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0007  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  38.79 
 
 		 913 aa  53.5  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3714  PKD domain containing protein  34.38 
 
 		 1771 aa  51.2  0.00008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.333758  normal  0.0659323 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0781  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  37.14 
 
 		 1283 aa  50.4  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.223596  hitchhiker  0.00753256 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0513  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  38.1 
 
 		 1212 aa  50.1  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1733  hypothetical protein  43.28 
 
 		 746 aa  48.9  0.0004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.658961  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1507  hypothetical protein  31.71 
 
 		 873 aa  48.5  0.0006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.48117  hitchhiker  0.0000051412 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1670  PKD domain containing protein  31.82 
 
 		 635 aa  48.1  0.0007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  unclonable  0.00387943  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1743  PKD domain containing protein  31.82 
 
 		 635 aa  48.1  0.0007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.619925  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1505  Glycoside hydrolase, family 20, catalytic core  29.26 
 
 		 816 aa  48.1  0.0008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.869244  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2921  PKD domain containing protein  31.05 
 
 		 623 aa  48.1  0.0008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0007  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  41.56 
 
 		 911 aa  46.2  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000289605 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0819  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  35.38 
 
 		 1286 aa  46.2  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000454384 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0899  hypothetical protein  34.33 
 
 		 987 aa  45.4  0.004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0750964  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3196  glycosyl hydrolase family chitinase  29.8 
 
 		 861 aa  45.8  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0825971  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3050  protease-associated PA  35.71 
 
 		 1220 aa  45.4  0.005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000558142  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3517  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  34.62 
 
 		 1212 aa  45.1  0.006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.183545 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3708  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  34.62 
 
 		 1212 aa  45.1  0.006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.342982  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3585  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  34.62 
 
 		 1212 aa  45.1  0.006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.591718  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0622  PKD domain containing protein  30.41 
 
 		 1057 aa  44.3  0.01  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.40107 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>