More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_25920 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_25920  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  100 
 
 		 351 aa  714    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.84065  normal  0.959468 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2678  alpha/beta hydrolase fold protein  61.13 
 
 		 333 aa  357  1.9999999999999998e-97  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.906981 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0343  alpha/beta fold family hydrolase  33.07 
 
 		 372 aa  199  7.999999999999999e-50  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1050  alpha/beta hydrolase fold  31.87 
 
 		 322 aa  145  8.000000000000001e-34  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.173196  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4640  hypothetical protein  43.65 
 
 		 280 aa  94  4e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.376604  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3008  hydrolase  29.21 
 
 		 319 aa  87  4e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0906767 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4088  alpha/beta hydrolase fold protein  42.54 
 
 		 309 aa  79.3  0.00000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.90454  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2916  alpha/beta hydrolase fold protein  34.78 
 
 		 284 aa  68.2  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2212  putative lipase  34.78 
 
 		 315 aa  66.6  0.0000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.799877  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25910  putative lipase  34.78 
 
 		 315 aa  66.6  0.0000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0600573 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4126  alpha/beta hydrolase fold  36.89 
 
 		 393 aa  66.2  0.0000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.000164833  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2481  alpha/beta hydrolase fold protein  36.45 
 
 		 275 aa  66.6  0.0000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2024  alpha/beta hydrolase fold  36.3 
 
 		 329 aa  65.5  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.44574 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5552  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  35.94 
 
 		 370 aa  64.3  0.000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.077135  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5301  putative oxidoreductase protein  37.17 
 
 		 258 aa  64.3  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0102616  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1023  alpha/beta family hydrolase  27.64 
 
 		 287 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1988  alpha/beta hydrolase superfamily protein  36.44 
 
 		 321 aa  62  0.00000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.150126 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0222  alpha/beta hydrolase fold  32.61 
 
 		 308 aa  62  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.267301 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1874  Beta-ketoacyl synthase  34.88 
 
 		 2762 aa  60.8  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.441588 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0174  cyclic nucleotide-binding protein  25.12 
 
 		 456 aa  60.5  0.00000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000271627  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0068  alpha/beta hydrolase fold-containing protein  32.46 
 
 		 297 aa  60.1  0.00000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.392587  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3756  alpha/beta hydrolase fold  34.51 
 
 		 504 aa  59.7  0.00000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.740741  normal  0.0321393 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3619  putative hydrolase  28.81 
 
 		 301 aa  59.7  0.00000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0960552  normal  0.130689 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6666  alpha/beta hydrolase fold  30.22 
 
 		 294 aa  59.7  0.00000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.203299  normal  0.734858 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2732  alpha/beta hydrolase fold  35.94 
 
 		 292 aa  59.7  0.00000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3105  alpha/beta hydrolase fold  28.99 
 
 		 291 aa  59.7  0.00000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3621  alpha/beta hydrolase fold protein  33.55 
 
 		 335 aa  59.7  0.00000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0448853  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2696  alpha/beta hydrolase fold protein  34.31 
 
 		 268 aa  58.9  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.094894  normal  0.233594 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4195  alpha/beta hydrolase fold protein  31.82 
 
 		 308 aa  58.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.558809 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2073  alpha/beta hydrolase fold protein  32.79 
 
 		 229 aa  58.5  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0626  Alpha/beta hydrolase fold  32.46 
 
 		 308 aa  58.2  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.434824 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4769  alpha/beta hydrolase fold  33.87 
 
 		 282 aa  57.8  0.0000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1546  alpha/beta hydrolase fold  34.19 
 
 		 285 aa  57  0.0000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.834926  hitchhiker  0.0047604 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0994  alpha/beta hydrolase fold  32.5 
 
 		 281 aa  57  0.0000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.795664 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26090  putative hydrolase  29.65 
 
 		 319 aa  57  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.860193 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13227  lipase lipV  37.38 
 
 		 261 aa  57  0.0000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2863  alpha/beta hydrolase fold protein  37.04 
 
 		 314 aa  56.6  0.0000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.334442  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1259  alpha/beta hydrolase fold  32.17 
 
 		 284 aa  56.6  0.0000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1981  alpha/beta hydrolase fold protein  25.94 
 
 		 278 aa  56.6  0.0000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.141718 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1487  alpha/beta hydrolase fold protein  34.46 
 
 		 267 aa  56.2  0.0000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.672056  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0898  alpha/beta hydrolase fold protein  38.1 
 
 		 320 aa  56.6  0.0000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0778  alpha/beta hydrolase fold  32.17 
 
 		 290 aa  56.2  0.0000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.588108  normal  0.620375 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4189  alpha/beta hydrolase fold protein  34.51 
 
 		 281 aa  55.8  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2178  alpha/beta hydrolase fold  36 
 
 		 288 aa  55.8  0.000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.100362  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2255  alpha/beta hydrolase fold  36 
 
 		 288 aa  55.8  0.000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.170585  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4983  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  31.86 
 
 		 367 aa  55.5  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.40688 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2748  alpha/beta hydrolase fold protein  29.2 
 
 		 311 aa  55.5  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00012747 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2519  alpha/beta hydrolase fold  32.5 
 
 		 243 aa  55.1  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.54258 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0558  alpha/beta hydrolase fold  38.04 
 
 		 338 aa  55.1  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2609  3-oxoadipate enol-lactonase  26.4 
 
 		 271 aa  54.7  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3967  alpha/beta hydrolase fold  30.39 
 
 		 306 aa  55.1  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2055  alpha/beta hydrolase fold  33.09 
 
 		 322 aa  55.1  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000011604 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4400  alpha/beta hydrolase fold  30.39 
 
 		 306 aa  55.1  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.334375 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2387  alpha/beta hydrolase fold  36.75 
 
 		 288 aa  55.1  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0869571  normal  0.603358 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4279  alpha/beta hydrolase fold  34.34 
 
 		 290 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0429244  normal  0.222336 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2535  alpha/beta hydrolase fold  34.04 
 
 		 344 aa  54.7  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4655  alpha/beta hydrolase fold protein  33.09 
 
 		 305 aa  54.3  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.159987  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3027  alpha/beta hydrolase fold protein  33.9 
 
 		 285 aa  54.3  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0675  alpha/beta hydrolase fold  26.5 
 
 		 290 aa  54.7  0.000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0467323 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3834  alpha/beta hydrolase fold  28.7 
 
 		 270 aa  54.3  0.000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.441877 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4523  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  35.05 
 
 		 271 aa  54.3  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.104364  normal  0.231171 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0511  alpha/beta hydrolase fold protein  32.65 
 
 		 265 aa  53.9  0.000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.327319  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1628  alpha/beta hydrolase fold protein  33.33 
 
 		 229 aa  53.9  0.000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.989142  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3071  alpha/beta hydrolase fold  27.5 
 
 		 290 aa  53.9  0.000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.357729  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0062  alpha/beta hydrolase fold protein  26.11 
 
 		 301 aa  53.9  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3858  alpha/beta hydrolase fold  33.58 
 
 		 327 aa  53.5  0.000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.387123 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1701  alpha/beta hydrolase fold protein  29.06 
 
 		 303 aa  53.5  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2473  hypothetical protein  27.88 
 
 		 286 aa  53.5  0.000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3664  alpha/beta hydrolase fold protein  37.8 
 
 		 350 aa  53.5  0.000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2479  alpha/beta hydrolase fold  32.93 
 
 		 277 aa  53.5  0.000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3669  alpha/beta hydrolase fold  31.71 
 
 		 306 aa  53.9  0.000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4235  alpha/beta hydrolase fold  32.79 
 
 		 252 aa  53.5  0.000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.125145  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4089  hydrolase, alpha/beta fold family  26.92 
 
 		 262 aa  53.1  0.000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.05653  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3952  alpha/beta hydrolase fold  37.21 
 
 		 340 aa  53.1  0.000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.675872  normal  0.742045 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4516  alpha/beta hydrolase fold  30.94 
 
 		 310 aa  53.5  0.000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.320967  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3776  alpha/beta hydrolase fold  36.89 
 
 		 361 aa  53.5  0.000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.904669  decreased coverage  0.00241214 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1726  alpha/beta hydrolase fold protein  29.91 
 
 		 303 aa  53.1  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1992  alpha/beta hydrolase fold  35.43 
 
 		 314 aa  53.1  0.000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0244  alpha/beta hydrolase fold protein  30.52 
 
 		 303 aa  53.1  0.000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02030  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  29.07 
 
 		 341 aa  53.1  0.000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0037  putative alpha/beta hydrolase  36.13 
 
 		 276 aa  53.1  0.000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4310  alpha/beta hydrolase fold protein  30.61 
 
 		 309 aa  53.1  0.000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.680972  normal  0.0221146 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5068  alpha/beta hydrolase fold protein  26.86 
 
 		 297 aa  52.8  0.000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4196  alpha/beta hydrolase fold  27.5 
 
 		 294 aa  52.8  0.000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1786  cyclic nucleotide-binding protein  31.9 
 
 		 462 aa  52.8  0.000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00355982 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2065  cyclic nucleotide-binding protein  33.94 
 
 		 462 aa  52.8  0.000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3543  alpha/beta hydrolase fold  30.63 
 
 		 268 aa  52.8  0.000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.447096  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1759  Alpha/beta hydrolase fold hydrolase or acyltransferase  30.19 
 
 		 265 aa  52.8  0.000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.11889  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4047  alpha/beta hydrolase fold  29.57 
 
 		 270 aa  52.8  0.000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1629  3-oxoadipate enol-lactonase  31.93 
 
 		 260 aa  52.8  0.000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.351821  normal  0.603035 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2087  alpha/beta hydrolase fold  24.42 
 
 		 294 aa  52.8  0.000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.416647 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1226  alpha/beta hydrolase fold protein  30.25 
 
 		 292 aa  52.4  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00330311  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1900  putative hydrolase  31.3 
 
 		 275 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.118605  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1174  alpha/beta fold family hydrolase  32.18 
 
 		 303 aa  52.4  0.00001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2251  Alpha/beta hydrolase fold-1  28.57 
 
 		 284 aa  52  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.154511  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3829  alpha/beta hydrolase fold  31.97 
 
 		 331 aa  52  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1972  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  34.69 
 
 		 263 aa  52.8  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0198  alpha/beta hydrolase fold  27.78 
 
 		 311 aa  52.4  0.00001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.593906 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2218  alpha/beta hydrolase fold  34.02 
 
 		 340 aa  52.4  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.158046  normal  0.0966577 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2445  alpha/beta hydrolase fold  33.67 
 
 		 340 aa  52.4  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.54824  normal  0.191947 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>