79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_0810 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_0810  glutaconate CoA-transferase  100 
 
 		 325 aa  679    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.417423 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3035  glutaconate CoA-transferase  74.14 
 
 		 321 aa  487  1e-136  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2825  coenzyme A transferase  73.98 
 
 		 320 aa  482  1e-135  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1387  coenzyme A transferase  73.04 
 
 		 320 aa  480  1e-134  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1709  coenzyme A transferase  71.79 
 
 		 321 aa  480  1e-134  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0403  glutaconate CoA-transferase  61.66 
 
 		 326 aa  425  1e-118  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.255219  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2696  Glutaconate CoA-transferase  56.52 
 
 		 322 aa  385  1e-106  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1906  coenzyme A transferase  55.11 
 
 		 325 aa  374  1e-102  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0723821 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0811  coenzyme A transferase  31.15 
 
 		 332 aa  128  2.0000000000000002e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.255875 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4180  3-oxoadipate CoA-transferase  32.18 
 
 		 297 aa  124  2e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3923  3-oxoadipate CoA-transferase  30.65 
 
 		 304 aa  119  6e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.99885  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1644  glutaconate CoA-transferase  30.18 
 
 		 317 aa  119  7.999999999999999e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2751  putative acyl CoA-transferase subunit A  30.21 
 
 		 276 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000616772  normal  0.229124 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2058  coenzyme A transferase  30.4 
 
 		 268 aa  111  2.0000000000000002e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.599622  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38220  3-oxoadipate:succinyl-CoA transferase subunit A  30.29 
 
 		 289 aa  110  3e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.722574  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5072  coenzyme A transferase  29.04 
 
 		 329 aa  108  1e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.000990125  normal  0.375198 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4813  coenzyme A transferase  28.28 
 
 		 305 aa  106  6e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.168158  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1134  coenzyme A transferase  31.06 
 
 		 299 aa  106  7e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.012829  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3046  coenzyme A transferase  27.49 
 
 		 271 aa  105  9e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.94721  normal  0.612276 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4842  coenzyme A transferase  26.98 
 
 		 305 aa  105  9e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.130717  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2328  3-oxoadipate CoA-transferase  31.56 
 
 		 295 aa  104  2e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.504192 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12980  acyl CoA:acetate/3-ketoacid CoA transferase, alpha subunit  29.76 
 
 		 273 aa  103  4e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2205  coenzyme A transferase  28.24 
 
 		 599 aa  103  6e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.401277  normal  0.0481798 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2126  coenzyme A transferase  29.57 
 
 		 313 aa  99.8  6e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2969  coenzyme A transferase  28.71 
 
 		 300 aa  99.4  7e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.177711  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02760  putative CoA transferase, subunit A  29.19 
 
 		 283 aa  98.2  2e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0433466 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1888  putative coenzyme A transferase  27.34 
 
 		 276 aa  97.8  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.817278  normal  0.651618 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1040  putative coenzyme A transferase, subunit A  29.57 
 
 		 302 aa  97.4  3e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000012559  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4309  3-oxoadipate:succinyl-CoA transferase, subunit A  29 
 
 		 285 aa  96.7  5e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4013  glutaconate CoA-transferase  29 
 
 		 285 aa  95.9  9e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0148032 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0312  putative CoA transferase, subunit A  28.19 
 
 		 283 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2561  coenzyme A transferase  27.34 
 
 		 331 aa  95.1  1e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4619  coenzyme A transferase  27.18 
 
 		 281 aa  93.6  4e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1472  coenzyme A transferase  31.6 
 
 		 251 aa  91.3  2e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2072  coenzyme A transferase  26.09 
 
 		 294 aa  90.9  3e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1221  coenzyme A transferase  27.78 
 
 		 272 aa  89  1e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2837  3-oxoadipate CoA-transferase  31.34 
 
 		 271 aa  88.6  1e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.351609  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5087  coenzyme A transferase  31.21 
 
 		 265 aa  88.6  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.903463  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1267  coenzyme A transferase  28.23 
 
 		 285 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7928  3-oxoadipate CoA-transferase  28.32 
 
 		 273 aa  88.6  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.386225  normal  0.327959 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2285  coenzyme A transferase  30.28 
 
 		 276 aa  87.8  2e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.275927  normal  0.260145 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1584  glutaconate CoA-transferase  30.69 
 
 		 286 aa  88.2  2e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.803865  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0299  coenzyme A transferase  27.24 
 
 		 273 aa  87.4  3e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1558  coenzyme A transferase  28.01 
 
 		 296 aa  86.7  5e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4600  putative glutaconate CoA-transferase, subunit A  28.57 
 
 		 269 aa  84.3  0.000000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3297  coenzyme A transferase  27.39 
 
 		 293 aa  83.2  0.000000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0965913 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3751  coenzyme A transferase  28.24 
 
 		 298 aa  83.2  0.000000000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5132  coenzyme A transferase  26.84 
 
 		 268 aa  78.2  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.914807  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1076  coenzyme A transferase  24.82 
 
 		 272 aa  76.3  0.0000000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.616034 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1203  putative CoA transferase, subunit A  25.53 
 
 		 272 aa  75.5  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.917021 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1489  coenzyme A transferase  25.68 
 
 		 296 aa  75.5  0.000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2804  coenzyme A transferase  24.57 
 
 		 280 aa  73.9  0.000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000211937 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5267  coenzyme A transferase  26.03 
 
 		 295 aa  73.2  0.000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.174288 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4684  coenzyme A transferase  25 
 
 		 295 aa  72.8  0.000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.537215  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4770  coenzyme A transferase  25 
 
 		 295 aa  72.8  0.000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0352343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13584  CoA-transferase subunit alpha  25 
 
 		 292 aa  72.8  0.000000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.972  normal  0.101355 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2354  coenzyme A transferase  24.75 
 
 		 289 aa  71.6  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.20907  normal  0.0705771 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5069  coenzyme A transferase  24.66 
 
 		 295 aa  70.5  0.00000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.539559 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1432  coenzyme A transferase  26.54 
 
 		 297 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.768493  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2064  coenzyme A transferase  25.59 
 
 		 286 aa  70.5  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.852286  normal  0.684027 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2605  coenzyme A transferase  24.75 
 
 		 280 aa  70.1  0.00000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.315961  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2154  coenzyme A transferase  23.92 
 
 		 291 aa  69.3  0.00000000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1380  coenzyme A transferase  24.62 
 
 		 261 aa  68.2  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.161573  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3617  putative glutaconate CoA-transferase, subunit A  29.41 
 
 		 272 aa  67  0.0000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.32721  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3827  coenzyme A transferase  22.92 
 
 		 290 aa  67  0.0000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2744  coenzyme A transferase  25.64 
 
 		 293 aa  63.2  0.000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.933072  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2823  coenzyme A transferase  27 
 
 		 285 aa  61.6  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3982  coenzyme A transferase  25.25 
 
 		 297 aa  57.8  0.0000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2497  coenzyme A transferase  27.94 
 
 		 590 aa  48.5  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.501333  normal  0.32873 
 
 
-
 
NC_006681  CNL05860  Succinyl-CoA:3-ketoacid-coenzyme A transferase, putative  26.67 
 
 		 561 aa  47  0.0004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.124065  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1390  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  25.96 
 
 		 234 aa  44.7  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5561  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  24.52 
 
 		 233 aa  44.3  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.670135  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2003  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  24.9 
 
 		 220 aa  43.5  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.881736  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1021  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  24.89 
 
 		 463 aa  43.5  0.005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2696  3-oxoacid CoA-transferase B subunit  26.8 
 
 		 448 aa  43.5  0.005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.494818  normal  0.507072 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1855  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  23.17 
 
 		 217 aa  42.7  0.009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.945952 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4553  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  23.46 
 
 		 254 aa  42.4  0.01  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.233149  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0656  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  27.82 
 
 		 235 aa  42.4  0.01  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.985837 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7413  ScoB  25.29 
 
 		 461 aa  42.4  0.01  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.811733  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>