More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_0294 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_1017  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.38 
 
 		 1323 aa  760    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0385374  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0294  multi-sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 1071 aa  2180    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.565561 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3243  PAS sensor protein  44.05 
 
 		 1323 aa  785    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3738  Na+/proline symporter-like protein  40.73 
 
 		 950 aa  532  1e-149  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1498  GAF sensor signal transduction histidine kinase  43.06 
 
 		 1070 aa  531  1e-149  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.308131  normal  0.537019 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2030  histidine kinase  41.83 
 
 		 927 aa  524  1e-147  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.182465 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1502  Histidine kinase  41.58 
 
 		 919 aa  517  1.0000000000000001e-145  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2045  putative GAF sensor protein  42.35 
 
 		 1079 aa  513  1e-144  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0456906  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1429  hypothetical protein  42.9 
 
 		 910 aa  509  9.999999999999999e-143  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2650  ATP-binding region ATPase domain protein  41.18 
 
 		 913 aa  508  9.999999999999999e-143  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.574534  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2648  putative phytochrome sensor protein  43.92 
 
 		 1087 aa  505  1e-141  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1586  putative phytochrome sensor protein  43.41 
 
 		 1087 aa  502  1e-140  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0975529 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4149  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  40.42 
 
 		 919 aa  498  1e-139  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.315835 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1230  serine phosphatase  43.37 
 
 		 1100 aa  495  9.999999999999999e-139  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.081901 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1897  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  43.78 
 
 		 1088 aa  495  9.999999999999999e-139  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2100  putative phytochrome sensor protein  39.37 
 
 		 1082 aa  493  9.999999999999999e-139  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.758651  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2991  GAF sensor signal transduction histidine kinase  41.95 
 
 		 1069 aa  490  1e-137  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2900  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.95 
 
 		 1069 aa  489  1e-136  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.095908  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1631  sensor histidine kinase  40.87 
 
 		 903 aa  485  1e-135  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.857286 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2805  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.15 
 
 		 1070 aa  486  1e-135  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2045  histidine kinase  37.48 
 
 		 906 aa  485  1e-135  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.189516  normal  0.433786 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0666  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  41.58 
 
 		 917 aa  485  1e-135  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.220304  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2061  Na+/solute symporter  40.52 
 
 		 671 aa  479  1e-134  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.274324 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2659  serine phosphatase  40.38 
 
 		 1083 aa  479  1e-133  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.623664  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0236  histidine kinase  43.26 
 
 		 935 aa  473  1e-132  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00442274 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1904  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.17 
 
 		 932 aa  459  1e-127  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.636099  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0898  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.93 
 
 		 1172 aa  453  1.0000000000000001e-126  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.149338  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3779  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.88 
 
 		 920 aa  456  1.0000000000000001e-126  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0715  Na+/solute symporter  40.69 
 
 		 1039 aa  453  1.0000000000000001e-126  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.723376  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5112  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.8 
 
 		 901 aa  432  1e-119  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0169  Na+/solute symporter  37.97 
 
 		 894 aa  432  1e-119  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0827667  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1803  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.97 
 
 		 894 aa  432  1e-119  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.27583 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1408  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.38 
 
 		 897 aa  429  1e-118  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.263667  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1474  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.01 
 
 		 894 aa  426  1e-118  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3978  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.27 
 
 		 1152 aa  411  1e-113  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.508831  normal  0.169335 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2693  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.62 
 
 		 893 aa  413  1e-113  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.194917  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0409  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  32.6 
 
 		 1171 aa  407  1.0000000000000001e-112  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2428  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.25 
 
 		 945 aa  406  1e-111  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.396366 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0869  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.22 
 
 		 1316 aa  404  1e-111  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0225926  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3169  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.36 
 
 		 1168 aa  406  1e-111  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02752  two-component system sensor protein  32.87 
 
 		 1150 aa  402  9.999999999999999e-111  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0316  sensor histidine kinase/response regulator  31.93 
 
 		 1174 aa  399  1e-109  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0523  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  30.76 
 
 		 1179 aa  398  1e-109  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.183484 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1507  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  41.92 
 
 		 896 aa  399  1e-109  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.808684  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0090  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  32.23 
 
 		 1163 aa  397  1e-109  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0860  putative two-component hybrid sensor histidine kinase and response regulator  32.42 
 
 		 1169 aa  394  1e-108  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0827695 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35230  integral membrane sensor hybrid histidine protein kinase  33.16 
 
 		 1161 aa  391  1e-107  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.234785  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0921  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  41.67 
 
 		 1169 aa  387  1e-106  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.306622  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3460  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.76 
 
 		 1175 aa  387  1e-106  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.549126 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3284  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.76 
 
 		 1168 aa  387  1e-106  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.431447 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21700  putative two-component sensor  31.89 
 
 		 1159 aa  389  1e-106  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1850  putative two-component sensor  31.99 
 
 		 1159 aa  389  1e-106  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.460329  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4025  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  31.77 
 
 		 1159 aa  384  1e-105  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0792472  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1695  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  31.77 
 
 		 1159 aa  384  1e-105  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.948496  normal  0.574545 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3900  sensory box histidine kinase/response regulator  32.12 
 
 		 1157 aa  385  1e-105  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1660  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  32.26 
 
 		 1156 aa  385  1e-105  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0486727  normal  0.0112915 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2695  sensor histidine kinase  30.88 
 
 		 1147 aa  383  1e-105  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4564  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  40.75 
 
 		 1169 aa  385  1e-105  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.519353  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0274  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  32.23 
 
 		 1169 aa  384  1e-105  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.41273  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0663  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.65 
 
 		 1172 aa  385  1e-105  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.564919 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00164  sensor histidine kinase  32.63 
 
 		 1177 aa  385  1e-105  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1292  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  31.77 
 
 		 1159 aa  382  1e-104  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0372313  normal  0.867611 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1250  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  31.88 
 
 		 1158 aa  382  1e-104  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0252543 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0939  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  39.05 
 
 		 1168 aa  383  1e-104  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1585  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  32.16 
 
 		 1158 aa  382  1e-104  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.484303 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0058  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  38.06 
 
 		 1170 aa  382  1e-104  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.950876  normal  0.562732 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2742  sensor histidine kinase/response regulator  30.9 
 
 		 1145 aa  377  1e-103  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0620  two component sensor kinase/response regulator hybrid  30.55 
 
 		 1169 aa  376  1e-102  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0837  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  41.18 
 
 		 1168 aa  374  1e-102  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.303418 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0252  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.79 
 
 		 1174 aa  369  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.854881  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4823  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  40.92 
 
 		 1169 aa  367  1e-100  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0165  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  30.33 
 
 		 1168 aa  365  2e-99  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.53132  normal  0.851256 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0224  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.59 
 
 		 1167 aa  365  2e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2557  histidine kinase  30.32 
 
 		 1142 aa  364  4e-99  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.257497  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1864  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  30.26 
 
 		 1159 aa  361  4e-98  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0562222 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2361  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.71 
 
 		 1146 aa  361  5e-98  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00248753 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2724  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  30.32 
 
 		 1140 aa  357  5e-97  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.178694  hitchhiker  0.00103188 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2348  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  30.41 
 
 		 1145 aa  356  1e-96  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2531  histidine kinase  29.6 
 
 		 1146 aa  354  4e-96  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.014523  hitchhiker  0.00504999 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2829  membrane associated response regulator, histidine kinase  31.32 
 
 		 1148 aa  354  4e-96  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1985  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.92 
 
 		 1138 aa  354  4e-96  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1753  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  29.71 
 
 		 1146 aa  354  5e-96  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1749  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  30.27 
 
 		 1146 aa  353  1e-95  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0353406  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1534  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  30.65 
 
 		 1140 aa  351  5e-95  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.254728  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2433  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.49 
 
 		 1146 aa  348  3e-94  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0799381 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1792  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  30.16 
 
 		 1146 aa  348  3e-94  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.103598  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1470  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  29.96 
 
 		 1140 aa  347  7e-94  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2522  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.82 
 
 		 1146 aa  343  1e-92  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00042371 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4538  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.58 
 
 		 1172 aa  330  8e-89  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002203  sensor histidine kinase  32.01 
 
 		 1055 aa  329  1.0000000000000001e-88  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1829  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  29.22 
 
 		 1185 aa  330  1.0000000000000001e-88  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2078  sensor histidine kinase/response regulator  29.63 
 
 		 1141 aa  328  5e-88  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.45474  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2613  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  28.89 
 
 		 1166 aa  320  1e-85  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0523  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.6 
 
 		 1145 aa  319  1e-85  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3255  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.77 
 
 		 1177 aa  318  5e-85  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0680649  normal  0.187811 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3139  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  29.09 
 
 		 1161 aa  315  3.9999999999999997e-84  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.305564 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3419  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  28.1 
 
 		 1184 aa  313  1e-83  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.285921  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0068  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  28.06 
 
 		 1156 aa  303  2e-80  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0675  two-component sensor kinase CbrA  28.12 
 
 		 975 aa  301  4e-80  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1424  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.67 
 
 		 1152 aa  301  5e-80  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.68675 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>