61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_0510 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_0510  secreted porin family protein  100 
 
 		 400 aa  821    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.938246  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3973  putative secreted protein  30.64 
 
 		 475 aa  121  1.9999999999999998e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.388131 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2599  hypothetical protein  27.76 
 
 		 418 aa  117  3.9999999999999997e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.444399  normal  0.302776 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5280  hypothetical protein  27.55 
 
 		 390 aa  111  2.0000000000000002e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2501  hypothetical protein  26.89 
 
 		 408 aa  111  3e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2624  hypothetical protein  28.42 
 
 		 470 aa  110  6e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.573828  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0404  hypothetical protein  27.05 
 
 		 475 aa  106  6e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.331514  normal  0.597244 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2083  hypothetical protein  29.55 
 
 		 382 aa  104  3e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000452376  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0287  hypothetical protein  28.01 
 
 		 386 aa  103  7e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.000514859  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1465  hypothetical protein  28.01 
 
 		 383 aa  103  8e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00157925  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03254  secreted protein of porin family  30.06 
 
 		 346 aa  102  1e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1530  porin  29.4 
 
 		 380 aa  101  2e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.232384  normal  0.862821 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00710  hypothetical protein  28.82 
 
 		 387 aa  100  5e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0519  hypothetical protein  27.36 
 
 		 388 aa  99.4  1e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1730  hypothetical protein  27.48 
 
 		 365 aa  99.4  1e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.143837 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0275  porin  26.94 
 
 		 387 aa  97.1  5e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.450177  hitchhiker  0.0000113069 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2526  hypothetical protein  27.18 
 
 		 387 aa  92.8  9e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0440119  normal  0.0252757 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2437  hypothetical protein  27.45 
 
 		 387 aa  92.8  1e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0765297  normal  0.234648 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2535  porin  27.6 
 
 		 387 aa  91.3  2e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00634878  hitchhiker  0.000395636 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2365  hypothetical protein  27.45 
 
 		 387 aa  92  2e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000963211  normal  0.0778781 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2728  porin  28.32 
 
 		 379 aa  91.7  2e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0767008  hitchhiker  0.0000304831 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2395  porin  25.85 
 
 		 477 aa  90.9  4e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.50155  normal  0.306848 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1749  porin  27.34 
 
 		 387 aa  90.5  5e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0474963  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1745  porin  27.34 
 
 		 387 aa  89.7  9e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00151108  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1788  porin  27.34 
 
 		 387 aa  89  1e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0218483  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1401  hypothetical protein  26.98 
 
 		 348 aa  88.2  2e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00461856  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1860  porin  26.88 
 
 		 380 aa  87  5e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0469133  normal  0.231412 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2561  porin  26.57 
 
 		 386 aa  87  5e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.23329  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1605  hypothetical protein  26.91 
 
 		 433 aa  85.9  0.000000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.877441  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3418  hypothetical protein  27.57 
 
 		 351 aa  84.7  0.000000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0904  hypothetical protein  28.71 
 
 		 356 aa  84  0.000000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.844767  hitchhiker  0.00000607436 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3753  hypothetical protein  25.72 
 
 		 344 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.30057 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4728  hypothetical protein  24.58 
 
 		 464 aa  79.7  0.00000000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.828062  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2612  hypothetical protein  27.48 
 
 		 346 aa  77.4  0.0000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3138  hypothetical protein  26.01 
 
 		 346 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.363093 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3415  hypothetical protein  28.85 
 
 		 549 aa  68.9  0.0000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1263  hypothetical protein  24.56 
 
 		 346 aa  66.6  0.0000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1995  hypothetical protein  25.85 
 
 		 572 aa  65.9  0.000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.290719  normal  0.0311795 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4187  hypothetical protein  27.71 
 
 		 357 aa  65.1  0.000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.429179 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4962  hypothetical protein  28.09 
 
 		 352 aa  63.9  0.000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.936284  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0322  hypothetical protein  27.8 
 
 		 362 aa  62.4  0.00000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0302  hypothetical protein  30.43 
 
 		 360 aa  61.2  0.00000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0852461  normal  0.204946 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3321  hypothetical protein  27.42 
 
 		 347 aa  60.8  0.00000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0273  hypothetical protein  28.43 
 
 		 354 aa  60.5  0.00000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.74892  hitchhiker  0.000266668 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1411  hypothetical protein  29.61 
 
 		 360 aa  60.1  0.00000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0104  hypothetical protein  24.92 
 
 		 351 aa  59.7  0.00000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.901888  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3626  hypothetical protein  25.99 
 
 		 593 aa  59.3  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0838658  normal  0.628947 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2691  hypothetical protein  28.69 
 
 		 585 aa  54.7  0.000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0485847  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1239  hypothetical protein  23.5 
 
 		 343 aa  53.1  0.000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.335743  normal  0.717707 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3303  hypothetical protein  24.09 
 
 		 448 aa  51.2  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.877956  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1428  hypothetical protein  29.55 
 
 		 441 aa  50.4  0.00006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.134202  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2826  hypothetical protein  29.14 
 
 		 441 aa  48.9  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0604  hypothetical protein  23.97 
 
 		 468 aa  47  0.0006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1166  hypothetical protein  23.73 
 
 		 343 aa  46.6  0.0007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.875673 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2537  hypothetical protein  25.56 
 
 		 371 aa  46.2  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.125269  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1498  hypothetical protein  28.77 
 
 		 409 aa  45.1  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0114368  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3572  hypothetical protein  32.26 
 
 		 452 aa  44.7  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.544352  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1424  hypothetical protein  21.01 
 
 		 560 aa  44.7  0.003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3388  hypothetical protein  24.31 
 
 		 569 aa  44.3  0.004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.174396 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1630  hypothetical protein  23.32 
 
 		 450 aa  43.5  0.006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.234159 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1077  hypothetical protein  28.17 
 
 		 551 aa  43.1  0.008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.350555 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>