More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeD_A0310 on replicon NC_011205
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011080  SNSL254_A0319  Rhs family protein  99.18 
 
 		 729 aa  1506    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.946115  normal  0.027027 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0322  Rhs-family protein  92.88 
 
 		 730 aa  1365    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0393811 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0310  Rhs family protein  100 
 
 		 729 aa  1516    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.261642  normal  0.473286 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0329  Rhs family protein  85.87 
 
 		 743 aa  1197    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.312709  normal  0.985789 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3019  type VI secretion system Vgr family protein  44.67 
 
 		 1048 aa  553  1e-156  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.103132  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6682  type VI secretion system Vgr family protein  44.11 
 
 		 1057 aa  551  1e-155  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0129  Rhs element Vgr protein  43.36 
 
 		 872 aa  539  9.999999999999999e-153  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.176404  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1613  Rhs element Vgr protein  43.51 
 
 		 858 aa  536  1e-151  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1281  Rhs element Vgr protein  45.1 
 
 		 676 aa  538  1e-151  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0166  Rhs element Vgr protein  43.51 
 
 		 930 aa  536  1e-151  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.275346  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0143  Rhs element Vgr protein  43.51 
 
 		 896 aa  536  1e-151  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.420233  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0250  type VI secretion system Vgr family protein  47.21 
 
 		 794 aa  529  1e-149  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6124  type VI secretion system Vgr family protein  45.05 
 
 		 714 aa  524  1e-147  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.029227  normal  0.478766 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3024  Rhs element Vgr protein  45.09 
 
 		 725 aa  523  1e-147  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.130505 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4429  Rhs element Vgr protein  43.19 
 
 		 724 aa  523  1e-147  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2174  Rhs element Vgr protein  46.61 
 
 		 775 aa  501  1e-140  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1901  Rhs element Vgr protein  46.61 
 
 		 775 aa  501  1e-140  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1703  Rhs element Vgr protein  46.61 
 
 		 775 aa  501  1e-140  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1486  type VI secretion system Vgr family protein  42.13 
 
 		 922 aa  499  1e-140  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0912  Rhs element Vgr protein  46.61 
 
 		 775 aa  501  1e-140  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0342  Rhs element Vgr protein  46.42 
 
 		 775 aa  499  1e-140  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.795549  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0251  Rhs element Vgr protein  46.61 
 
 		 775 aa  501  1e-140  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.628249  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1934  hypothetical protein  42.13 
 
 		 874 aa  499  1e-140  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.652792  normal  0.85907 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1199  Rhs element Vgr protein  46.61 
 
 		 775 aa  501  1e-140  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1374  Rhs element Vgr protein  42.13 
 
 		 916 aa  499  1e-140  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3178  type VI secretion system Vgr family protein  43.77 
 
 		 1981 aa  497  1e-139  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.568675 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0241  Rhs element Vgr protein  43.87 
 
 		 907 aa  479  1e-134  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4009  Rhs element Vgr protein  43.42 
 
 		 756 aa  474  1e-132  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0849352  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2127  Rhs element Vgr protein  42.4 
 
 		 748 aa  475  1e-132  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.519632 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2047  Rhs element Vgr protein  43.46 
 
 		 572 aa  473  1e-132  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3486  Rhs element Vgr protein  42.28 
 
 		 774 aa  472  1.0000000000000001e-131  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.740933  normal  0.610265 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2735  Rhs element Vgr protein  41.57 
 
 		 788 aa  467  9.999999999999999e-131  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0298298  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3752  Rhs element Vgr protein  43.34 
 
 		 755 aa  466  9.999999999999999e-131  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.617325 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4483  type VI secretion system Vgr family protein  42.14 
 
 		 778 aa  462  9.999999999999999e-129  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3868  type VI secretion system Vgr family protein  43.53 
 
 		 730 aa  456  1e-127  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0373872  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0300  type VI secretion system Vgr family protein  41.97 
 
 		 794 aa  453  1.0000000000000001e-126  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2808  Rhs element Vgr protein  38.89 
 
 		 734 aa  449  1.0000000000000001e-124  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0410  Rhs element Vgr protein  38.45 
 
 		 734 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.447319  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1193  Rhs element Vgr protein  38.45 
 
 		 731 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.598361  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2828  Rhs element Vgr protein  38.45 
 
 		 734 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0698  type VI secretion system Vgr family protein  41.8 
 
 		 792 aa  449  1.0000000000000001e-124  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1607  Rhs element Vgr protein  38.45 
 
 		 734 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1581  Rhs element Vgr protein  42.02 
 
 		 757 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.206829 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0265  Rhs element Vgr protein  38.78 
 
 		 731 aa  449  1.0000000000000001e-124  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1790  Rhs element Vgr protein  38.45 
 
 		 734 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.129982  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2953  Rhs element Vgr protein  38.45 
 
 		 734 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.527761  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0460  Rhs element Vgr protein  38.45 
 
 		 734 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.141236  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1173  Rhs element Vgr protein  38.56 
 
 		 734 aa  444  1e-123  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3778  type VI secretion system Vgr family protein  41.54 
 
 		 796 aa  445  1e-123  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.938556  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1827  Rhs element Vgr protein  44.79 
 
 		 540 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.336809 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3783  Rhs element Vgr protein  39.77 
 
 		 785 aa  439  9.999999999999999e-123  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.757692  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3347  Rhs element Vgr protein  43.37 
 
 		 841 aa  419  1e-116  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.57735  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2840  Rhs element Vgr protein  43.48 
 
 		 838 aa  421  1e-116  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.363054  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0497  Rhs element Vgr protein  43.17 
 
 		 841 aa  420  1e-116  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3015  Rhs element Vgr protein  37.06 
 
 		 645 aa  417  9.999999999999999e-116  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0201  type VI secretion system Vgr family protein  39.51 
 
 		 777 aa  419  9.999999999999999e-116  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0481  Rhs element Vgr protein  43.37 
 
 		 841 aa  419  9.999999999999999e-116  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1505  type VI secretion system Vgr family protein  42.88 
 
 		 826 aa  415  1e-114  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.483265 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0163  hypothetical protein  38.22 
 
 		 646 aa  413  1e-114  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.766784  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01110  hypothetical protein  38.56 
 
 		 643 aa  411  1e-113  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.124023  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4080  type VI secretion system Vgr family protein  39.54 
 
 		 771 aa  409  1e-113  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000279673 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2332  Rhs element Vgr protein  39.12 
 
 		 741 aa  409  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00996193  normal  0.0126654 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01160  hypothetical protein  39.09 
 
 		 741 aa  409  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.73633  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0169  hypothetical protein  39.09 
 
 		 741 aa  405  1e-111  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1679  type VI secretion system Vgr family protein  40.07 
 
 		 1048 aa  405  1e-111  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00352314 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0985  Rhs element Vgr protein  41.06 
 
 		 843 aa  404  1e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2254  type VI secretion system Vgr family protein  42.69 
 
 		 862 aa  401  9.999999999999999e-111  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2865  type VI secretion system Vgr family protein  39.27 
 
 		 780 aa  400  9.999999999999999e-111  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3479  Rhs element Vgr protein  40.68 
 
 		 845 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.380247 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3914  type VI secretion system Vgr family protein  40.22 
 
 		 845 aa  399  1e-109  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.120628  normal  0.788068 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1930  type VI secretion system Vgr family protein  42.88 
 
 		 862 aa  398  1e-109  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.931752  normal  0.0420074 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2439  type VI secretion system Vgr family protein  38.05 
 
 		 712 aa  399  1e-109  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3960  hypothetical protein  39.51 
 
 		 689 aa  392  1e-108  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0894  type VI secretion system Vgr family protein  41.6 
 
 		 886 aa  393  1e-108  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29390  hypothetical protein  38.99 
 
 		 689 aa  395  1e-108  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3859  type VI secretion system Vgr family protein  41.9 
 
 		 901 aa  392  1e-107  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3489  hypothetical protein  39.23 
 
 		 767 aa  390  1e-107  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.159566  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5680  type VI secretion system Vgr family protein  41.5 
 
 		 975 aa  390  1e-107  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.555449  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26600  Rhs element Vgr protein  38.91 
 
 		 687 aa  388  1e-106  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.417964  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0065  type VI secretion system Vgr family protein  39.33 
 
 		 822 aa  384  1e-105  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3133  Rhs element Vgr protein  38.46 
 
 		 767 aa  384  1e-105  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.054847  normal  0.114782 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1216  type VI secretion system Vgr family protein  35.32 
 
 		 683 aa  373  1e-102  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5366  Rhs element Vgr protein  38.86 
 
 		 1284 aa  375  1e-102  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.317319  normal  0.534977 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2447  type VI secretion system Vgr family protein  36.59 
 
 		 735 aa  373  1e-102  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.764507  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3035  type VI secretion system Vgr family protein  34.62 
 
 		 683 aa  367  1e-100  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2760  type VI secretion system Vgr family protein  35.12 
 
 		 613 aa  365  1e-99  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.68949 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2618  Rhs element Vgr protein  34.82 
 
 		 618 aa  365  1e-99  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.576781 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4187  Rhs element Vgr protein  35.76 
 
 		 769 aa  359  8e-98  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5469  type VI secretion system Vgr family protein  39.1 
 
 		 1284 aa  358  1.9999999999999998e-97  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.387829  normal  0.0913862 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3106  hypothetical protein  33.44 
 
 		 618 aa  356  8.999999999999999e-97  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.166384  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2455  Rhs element Vgr protein  37.92 
 
 		 783 aa  352  2e-95  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0279877  normal  0.549341 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1191  Rhs element Vgr protein  32.99 
 
 		 703 aa  345  1e-93  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2014  type VI secretion system Vgr family protein  35.64 
 
 		 753 aa  344  2.9999999999999997e-93  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.758033  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3415  Rhs element Vgr protein  37.81 
 
 		 669 aa  343  7e-93  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.960838  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33960  hypothetical protein  35.05 
 
 		 668 aa  341  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000148732  normal  0.101757 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2788  type VI secretion system Vgr family protein  36.3 
 
 		 889 aa  336  9e-91  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.154315 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0023  type VI secretion system Vgr family protein  36.94 
 
 		 885 aa  335  2e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2360  Rhs element Vgr protein  31.78 
 
 		 618 aa  334  3e-90  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5197  type VI secretion system Vgr family protein  36.12 
 
 		 837 aa  333  5e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0918871 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0511  Rhs element Vgr protein  33.33 
 
 		 661 aa  333  9e-90  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>