More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_1076 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_1076  ABC transporter related  100 
 
 		 301 aa  619  1e-176  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2521  ABC transporter related  45.96 
 
 		 284 aa  280  3e-74  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.436198 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2797  ABC transporter, ATPase subunit  49.32 
 
 		 297 aa  252  7e-66  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.689137  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2277  ABC transporter related  42.86 
 
 		 293 aa  240  2.9999999999999997e-62  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1984  ABC transporter related  40.77 
 
 		 295 aa  239  4e-62  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1955  ABC transporter, ATP-binding protein  40.77 
 
 		 282 aa  235  7e-61  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1980  ABC transporter related  41.2 
 
 		 294 aa  232  6e-60  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.240272  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0358  ABC transporter related  41.26 
 
 		 303 aa  231  1e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2664  ABC transporter related  42.56 
 
 		 296 aa  230  2e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000181001  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1750  ABC transporter, ATP-binding protein  40.75 
 
 		 292 aa  228  1e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2631  ABC transporter related  39.93 
 
 		 295 aa  226  3e-58  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.789941  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5232  ABC transporter related  41.64 
 
 		 300 aa  224  1e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.548962  hitchhiker  0.00635683 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0073  ABC transporter related  39.3 
 
 		 292 aa  224  2e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.403382  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1588  ABC transporter related  40.07 
 
 		 292 aa  223  3e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2791  ABC transporter related  40.07 
 
 		 292 aa  223  3e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12100  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  39.37 
 
 		 299 aa  223  3e-57  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1559  ABC transporter related  40.07 
 
 		 292 aa  223  3e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1452  ABC transporter related  40.07 
 
 		 292 aa  223  4e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18810  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  38.46 
 
 		 291 aa  217  2e-55  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.222917 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1187  ABC transporter, ATP-binding protein  39.38 
 
 		 293 aa  215  5.9999999999999996e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1168  ABC transporter related protein  42.36 
 
 		 288 aa  213  2.9999999999999995e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0914  ABC transporter related  37.97 
 
 		 290 aa  213  3.9999999999999995e-54  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3995  ABC transporter related  39.86 
 
 		 286 aa  211  9e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.259313  normal  0.940234 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3211  ABC transporter ATP-binding protein  39.51 
 
 		 307 aa  210  2e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00761631  normal  0.0394821 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0819  ABC transporter related protein  36.81 
 
 		 287 aa  210  2e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.989778  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0949  ABC transporter related  35.21 
 
 		 289 aa  209  4e-53  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1415  ABC transporter related protein  37.54 
 
 		 286 aa  207  2e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1029  ABC transporter related  39.66 
 
 		 300 aa  206  4e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.967418  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4876  ABC transporter related protein  38.14 
 
 		 299 aa  198  7e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1835  ABC transporter related  35.05 
 
 		 295 aa  198  1.0000000000000001e-49  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1458  ABC transporter related  37.59 
 
 		 290 aa  196  3e-49  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.237048  normal  0.276078 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1094  ABC transporter, ATP-binding protein  35.09 
 
 		 290 aa  194  2e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0536636  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3435  ABC transporter-like protein  35.42 
 
 		 295 aa  181  2e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0458  ABC transporter-like protein  35.51 
 
 		 309 aa  176  6e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2870  ABC transporter related protein  35.05 
 
 		 296 aa  174  9.999999999999999e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0454  ABC transporter related  42.16 
 
 		 251 aa  174  1.9999999999999998e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2982  ABC transporter related protein  35.93 
 
 		 288 aa  172  5e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4743  ABC transporter related  42.72 
 
 		 267 aa  171  1e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.249045  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3078  ABC transporter, ATP-binding protein  37.7 
 
 		 314 aa  171  2e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.437201  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1122  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  35.26 
 
 		 320 aa  170  3e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0781  ABC transporter, ATP-binding protein  34.42 
 
 		 309 aa  170  3e-41  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0297  ABC transporter related protein  35.19 
 
 		 289 aa  169  6e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3471  gliding motility-associated ABC transporter ATP- binding subunit GldA  36.52 
 
 		 305 aa  168  1e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000514218  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0295  ABC transporter related  35.87 
 
 		 298 aa  167  2e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.520917  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13010  ABC transporter related  31.82 
 
 		 310 aa  166  2.9999999999999998e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1624  ABC transporter related protein  30.82 
 
 		 309 aa  166  4e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0610867  normal  0.950566 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2429  ABC transporter-like protein protein  38.74 
 
 		 328 aa  166  4e-40  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3144  ABC transporter related  36.89 
 
 		 306 aa  166  4e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2706  ABC transporter related protein  35.29 
 
 		 369 aa  166  4e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000123322  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1365  ABC transporter related  35.63 
 
 		 313 aa  166  5.9999999999999996e-40  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3059  ABC transporter related  38.07 
 
 		 328 aa  165  9e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.588956  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0981  ABC transporter related  32.75 
 
 		 325 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0340  ABC transporter related  37.55 
 
 		 243 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2411  ABC transporter related  36.84 
 
 		 360 aa  164  1.0000000000000001e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.96204 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0363  ABC transporter related  37.12 
 
 		 243 aa  165  1.0000000000000001e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0068  ATPase  35.4 
 
 		 329 aa  164  2.0000000000000002e-39  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4023  ABC transporter related  36.87 
 
 		 344 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000171205 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1770  ABC transporter related protein  33.78 
 
 		 308 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.471072  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1501  ABC transporter  35.63 
 
 		 313 aa  163  3e-39  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0222  hypothetical protein  35.65 
 
 		 308 aa  162  4.0000000000000004e-39  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.238657 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1661  ABC transporter related  36.74 
 
 		 304 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2419  ABC transporter related  36.12 
 
 		 328 aa  162  5.0000000000000005e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.513097 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04471  putative multidrug efflux ABC transporter  33.66 
 
 		 337 aa  162  6e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.797798  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2796  ABC transporter related  33.44 
 
 		 326 aa  162  8.000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.982119 
 
 
-
 
NC_002936  DET1619  ABC transporter, ATP-binding protein  35.22 
 
 		 313 aa  162  9e-39  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.54081  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1561  ABC transporter, ATP-binding protein  35.61 
 
 		 312 aa  160  2e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.327811  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2810  ABC transporter related protein  37.33 
 
 		 315 aa  160  2e-38  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000850582  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3519  ABC transporter related  32.8 
 
 		 339 aa  160  2e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1751  ATPase  37.13 
 
 		 337 aa  161  2e-38  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.253958  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2587  ABC transporter related  32.8 
 
 		 339 aa  160  2e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06461  putative multidrug efflux ABC transporter  38.82 
 
 		 337 aa  160  2e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.645354 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4183  ABC transporter related  35.4 
 
 		 240 aa  160  2e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.804613  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1788  ABC transporter related protein  33.02 
 
 		 317 aa  160  2e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.703394  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39000  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  33.11 
 
 		 322 aa  160  3e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.447872 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3230  ABC transporter related  36.64 
 
 		 316 aa  160  3e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0381022 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3051  ABC transporter related  31.22 
 
 		 309 aa  160  3e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3073  ABC transporter related  34.31 
 
 		 307 aa  160  3e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1723  ABC transporter ATP-binding protein  36.53 
 
 		 308 aa  159  4e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1352  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.05 
 
 		 331 aa  159  5e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.467202  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07240  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  32.48 
 
 		 332 aa  159  5e-38  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.44685 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0040  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  34.14 
 
 		 321 aa  159  5e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0364  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.24 
 
 		 334 aa  159  5e-38  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1403  ABC transporter-related protein  38.46 
 
 		 296 aa  159  6e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.357223 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3201  ABC transporter related  34.33 
 
 		 303 aa  159  6e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.528814  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0061  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  31.23 
 
 		 338 aa  159  6e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00188149  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04731  putative multidrug efflux ABC transporter  32.67 
 
 		 338 aa  159  7e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2181  ABC transporter related  38.84 
 
 		 326 aa  158  8e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0670  ABC transporter related  40.89 
 
 		 318 aa  158  9e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4230  ABC transporter-like  36.04 
 
 		 331 aa  157  1e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.723514  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0448  multidrug ABC transporter  32.37 
 
 		 338 aa  158  1e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.380616  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2556  ABC transporter related protein  36.89 
 
 		 272 aa  158  1e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.90963  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0427  ABC transporter related  39.61 
 
 		 317 aa  158  1e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0295  ABC transporter related  35.09 
 
 		 315 aa  158  1e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05041  putative multidrug efflux ABC transporter  32.67 
 
 		 338 aa  157  1e-37  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.288968  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3319  ABC transporter, ATP-binding protein  33.06 
 
 		 301 aa  157  2e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2220  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  32.45 
 
 		 321 aa  157  2e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00218593  normal  0.341746 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2070  ABC transporter-related protein  32.78 
 
 		 316 aa  157  2e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.894734  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0221  ABC transporter related  34.96 
 
 		 253 aa  157  2e-37  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.207021  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1755  ABC transporter related  36.49 
 
 		 316 aa  157  2e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.707927  normal  0.143983 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2089  ABC transporter related  39.25 
 
 		 288 aa  157  2e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.268618  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>