More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_1716 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013512  Sdel_1716  ABC transporter related protein  100 
 
 
286 aa  577  1e-164  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.604131  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2281  RNA pseudouridine synthase  52.33 
 
 
285 aa  295  8e-79  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0582  sulfate/thiosulfate import ATP-binding protein CysA (Sulfate-transporting ATPase)  52.52 
 
 
291 aa  286  2e-76  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0438  ABC transporter related  51.22 
 
 
289 aa  286  4e-76  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1995  ABC transporter related  49.65 
 
 
289 aa  277  1e-73  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1284  molybdenum ABC transporter, ATP-binding protein  47.12 
 
 
289 aa  276  3e-73  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0371  ABC transporter related  52.1 
 
 
302 aa  276  4e-73  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0417  ABC transporter related  49.65 
 
 
301 aa  273  2.0000000000000002e-72  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0680  ABC transporter related  46.5 
 
 
309 aa  265  7e-70  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0315  sulfate/thiosulfate import ATP-binding protein CysA (Sulfate-transporting ATPase)  49.43 
 
 
284 aa  264  1e-69  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.599525  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1712  ATPase  48.95 
 
 
299 aa  263  2e-69  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.370393 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0360  molybdenum transport ATP-binding protein  48.92 
 
 
283 aa  262  4.999999999999999e-69  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0454  ABC transporter-related protein  49.65 
 
 
301 aa  259  3e-68  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.457213  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0926  ABC transporter-related protein  46.88 
 
 
290 aa  256  3e-67  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.00057204  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0345  molybdenum ABC transporter, ATP-binding protein  43.06 
 
 
294 aa  233  2.0000000000000002e-60  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.127515  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0322  molybdenum ABC transporter, ATP-binding protein  43.06 
 
 
296 aa  233  2.0000000000000002e-60  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2671  ABC transporter related  46.59 
 
 
314 aa  211  9e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.452313  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2243  ABC transporter related  46.06 
 
 
281 aa  190  2e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2342  ABC transporter related protein  47.66 
 
 
274 aa  187  1e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.477655  normal  0.561455 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3143  ABC transporter related  47.11 
 
 
275 aa  187  2e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1442  ABC transporter related  47.2 
 
 
315 aa  183  3e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1031  ABC transport system, ATP-binding protein  42.33 
 
 
339 aa  169  4e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5846  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  47.14 
 
 
346 aa  169  6e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.268935  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4408  ABC transporter related  40.44 
 
 
373 aa  168  7e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.792188  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2789  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.86 
 
 
337 aa  168  7e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.669148  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1391  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  42.68 
 
 
350 aa  167  2e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4484  ABC transporter-related protein  44.91 
 
 
330 aa  167  2e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.495687 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6758  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  47.14 
 
 
346 aa  167  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.420036  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1682  ABC transporter-like  43.84 
 
 
329 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.677404  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2180  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  41.15 
 
 
346 aa  167  2.9999999999999998e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000665  spermidine putrescine transport ATP-binding protein PotA  43.69 
 
 
339 aa  166  5e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.518175  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2534  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  42.22 
 
 
354 aa  165  5.9999999999999996e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0417932  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1328  ABC transporter related  44.61 
 
 
328 aa  165  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0207377  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0110  sulfate ABC transporter, ATP-binding protein, putative  45.37 
 
 
359 aa  165  8e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0107  putative sulfate ABC transporter, ATP-binding protein  45.37 
 
 
386 aa  165  8e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3997  ABC transporter related  45.32 
 
 
329 aa  165  9e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0225535  normal  0.167206 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1722  ABC transporter ATP-binding protein  45.32 
 
 
329 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.109279 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1271  ABC transporter related  45.1 
 
 
329 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0543066 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1602  ABC transporter  46.34 
 
 
329 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0412984 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1314  ABC transporter related  45.59 
 
 
329 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.159195  normal  0.508 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4874  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.64 
 
 
360 aa  164  2.0000000000000002e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.544883  normal  0.368971 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5390  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  47.17 
 
 
345 aa  163  3e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.695996  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0913  maltose/maltodextrin ABC transporter, ATP-binding protein  37.87 
 
 
368 aa  163  3e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.872871  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0967  ABC transporter related  37.87 
 
 
368 aa  163  3e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.855115  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0943  ABC transporter related  43.72 
 
 
209 aa  163  3e-39  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000624644  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4601  ABC transporter related  42.6 
 
 
382 aa  163  3e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.531787  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3882  polyamine ABC transporter, ATP-binding protein, putative  45.85 
 
 
329 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1358  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  40.99 
 
 
374 aa  162  5.0000000000000005e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2888  ABC transporter related  39.72 
 
 
360 aa  162  6e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1237  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  44.39 
 
 
370 aa  162  6e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0981  ABC transporter related  45.75 
 
 
353 aa  162  6e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5131  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.53 
 
 
381 aa  162  7e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1157  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  42.86 
 
 
372 aa  162  7e-39  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.602801  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0832  ABC transporter related  41.2 
 
 
344 aa  162  7e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003668  spermidine putrescine transport ATP-binding protein PotA  42.01 
 
 
373 aa  162  9e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3882  sugar transport ATP-binding protein  37.13 
 
 
366 aa  161  1e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.151408 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0123  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  44.93 
 
 
354 aa  161  1e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3329  hypothetical protein  45.41 
 
 
349 aa  161  1e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0596951  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3016  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.24 
 
 
384 aa  161  1e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.926404  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1782  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  44.09 
 
 
364 aa  161  1e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.132629  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0122  ABC transporter related  37.5 
 
 
347 aa  161  1e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.617953  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1871  ABC transporter ATP-binding protein  43.81 
 
 
331 aa  161  1e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0846  ABC transporter related  42 
 
 
342 aa  161  1e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1014  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  41.33 
 
 
357 aa  161  1e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.939142  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1370  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  43.11 
 
 
373 aa  161  1e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0790  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  45.81 
 
 
372 aa  160  2e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.279429 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2906  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  41.81 
 
 
388 aa  160  2e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1383  ABC transporter related  43.05 
 
 
368 aa  160  2e-38  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1333  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  45.95 
 
 
361 aa  160  2e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.938281  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3044  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  41.81 
 
 
384 aa  160  2e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6066  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  41.81 
 
 
381 aa  160  2e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21910  putative ATP-binding component of ABC transporter  44.02 
 
 
331 aa  160  2e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000308593 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4541  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  46.41 
 
 
367 aa  160  3e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.68861  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0198  ABC transporter related  39.21 
 
 
365 aa  160  3e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0274814  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4042  ABC transporter related  45.45 
 
 
360 aa  159  3e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.643948  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0204  ABC transporter related  39.21 
 
 
365 aa  160  3e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4115  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  41.67 
 
 
357 aa  160  3e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3469  ABC spermidine/putrescine transporter, ATPase subunit  41.82 
 
 
393 aa  159  3e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.647978 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2383  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  41.81 
 
 
384 aa  160  3e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.888136  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2997  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  41.81 
 
 
384 aa  160  3e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.412177  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1865  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.64 
 
 
364 aa  160  3e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.919871  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2366  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  41.55 
 
 
367 aa  160  3e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3415  ABC transporter related protein  37.41 
 
 
354 aa  159  4e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00408185  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0666  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.18 
 
 
367 aa  159  4e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0172946 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3183  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  43.38 
 
 
353 aa  159  4e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0268964  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5862  ABC transporter related  40.18 
 
 
365 aa  159  4e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.70856 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1128  sulfate/thiosulfate import ATP-binding protein CysA  41.33 
 
 
357 aa  159  4e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1216  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding subunit  45.95 
 
 
361 aa  159  4e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1882  ABC polyamine/opine transporter, ATPase subunit  43.18 
 
 
367 aa  159  4e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  unclonable  0.000264611  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0530  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.18 
 
 
367 aa  159  4e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2557  ABC transporter related protein  41.33 
 
 
402 aa  159  4e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.000490216  normal  0.117456 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2991  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  40.77 
 
 
384 aa  159  4e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2147  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  41.36 
 
 
371 aa  159  5e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3781  ABC transporter related  39 
 
 
345 aa  159  5e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0699  maltose/mannitol ABC transporter, ATP-binding protein, putative  36.96 
 
 
370 aa  159  5e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3104  ABC transporter ATP-binding protein  45.95 
 
 
361 aa  159  5e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50650  Mo transporter, inner membrane ATP-binding component, ModC1  42.49 
 
 
380 aa  159  6e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0400965  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1674  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.72 
 
 
386 aa  159  6e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.446059  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0163  ABC transporter related  42.72 
 
 
369 aa  159  6e-38  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7192  putative ABC transporter ATP-binding protein  37.74 
 
 
361 aa  159  7e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.27359  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>