68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_2756 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008577  Shewana3_1819  hypothetical protein  57.85 
 
 		 1154 aa  1342    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0470618 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1709  hypothetical protein  58.02 
 
 		 1154 aa  1336    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.18586  normal  0.0585819 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1132  hypothetical protein  61.64 
 
 		 1174 aa  1442    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00035988 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2756  hypothetical protein  100 
 
 		 1162 aa  2392    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.206504  normal  0.110579 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1081  hypothetical protein  50.6 
 
 		 1107 aa  1113    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.202194  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1326  hypothetical protein  53.29 
 
 		 1141 aa  1222    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.770705  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3233  hypothetical protein  43.56 
 
 		 1129 aa  919    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2241  hypothetical protein  44.49 
 
 		 731 aa  594  1e-168  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0974985 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2238  hypothetical protein  45.56 
 
 		 389 aa  350  9e-95  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0102712 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4847  putative restriction enzyme  26.62 
 
 		 1219 aa  180  2e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.0000521229  normal  0.767237 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02940  hypothetical protein  23.55 
 
 		 1140 aa  177  8e-43  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.45552  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5027  type II restriction enzyme  22.73 
 
 		 1180 aa  174  1e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.776061  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1608  hypothetical protein  24.57 
 
 		 1182 aa  165  5.0000000000000005e-39  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.102768 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3731  hypothetical protein  28.07 
 
 		 1174 aa  156  2.9999999999999998e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2493  type IIS restriction enzyme  28.21 
 
 		 1183 aa  154  7e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1677  hypothetical protein  24.28 
 
 		 1171 aa  154  1e-35  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00114545 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1895  type IIS restriction enzyme  25.36 
 
 		 612 aa  150  2.0000000000000003e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.4814  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2288  type II restriction enzyme  25.34 
 
 		 1160 aa  149  3e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1235  hypothetical protein  23.54 
 
 		 1484 aa  147  1e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.616183  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0295  type II restriction enzyme  25.76 
 
 		 1167 aa  147  1e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0561  hypothetical protein  27.5 
 
 		 1162 aa  146  2e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2107  hypothetical protein  25.53 
 
 		 1270 aa  146  2e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1299  Eco57I restriction endonuclease  25.67 
 
 		 1144 aa  144  9e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0387167  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0601  hypothetical protein  27.66 
 
 		 1497 aa  141  6e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.548482  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3080  hypothetical protein  28.06 
 
 		 1425 aa  141  8.999999999999999e-32  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0339  putative restriction enzyme  27.14 
 
 		 1205 aa  139  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00710778  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02930  hypothetical protein  25.84 
 
 		 1131 aa  127  1e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.264298  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1156  hypothetical protein  24.9 
 
 		 1324 aa  124  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1916  hypothetical protein  20.9 
 
 		 1430 aa  122  3e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2208  hypothetical protein  26.84 
 
 		 1218 aa  112  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00220427  normal  0.956264 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2038  hypothetical protein  20.4 
 
 		 1241 aa  105  4e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.769996  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_260  hypothetical protein  22.78 
 
 		 1359 aa  103  2e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1273  hypothetical protein  19.56 
 
 		 1125 aa  85.5  0.000000000000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1124  hypothetical protein  24.07 
 
 		 1326 aa  75.5  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0583  hypothetical protein  23.7 
 
 		 882 aa  65.1  0.000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1062  hypothetical protein  24.34 
 
 		 1231 aa  59.7  0.0000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000818904  hitchhiker  0.00000512763 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0994  hypothetical protein  22.66 
 
 		 309 aa  56.2  0.000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0997  hypothetical protein  26.85 
 
 		 706 aa  55.5  0.000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0114  hypothetical protein  23.15 
 
 		 1231 aa  52.4  0.00004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1310  N-6 DNA methylase  24.59 
 
 		 1041 aa  52.4  0.00005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.881884  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4881  type I restriction-modification system M subunit  33.05 
 
 		 489 aa  51.6  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.900731 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0823  N-6 DNA methylase  33.94 
 
 		 493 aa  51.2  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5860  type I restriction-modification system, M subunit  33.05 
 
 		 493 aa  51.2  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.822857 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1892  protein of unknown function DUF450  22.22 
 
 		 1058 aa  50.8  0.0001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6045  type I restriction-modification system subunit M  32.46 
 
 		 489 aa  51.2  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0475301  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1333  protein of unknown function DUF450  20.21 
 
 		 995 aa  50.8  0.0002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.126844  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4741  type I restriction-modification system, M subunit  33.03 
 
 		 489 aa  50.8  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00410686 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4455  N-6 DNA methylase  29.82 
 
 		 492 aa  50.4  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.435107  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02073  type I restriction enzyme EcoEI M protein  31.82 
 
 		 489 aa  49.7  0.0003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2210  type II restriction enzyme, methylase subunit  28.25 
 
 		 836 aa  49.3  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000292861  normal  0.0590871 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0441  hypothetical protein  22.7 
 
 		 1426 aa  48.5  0.0007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.141765 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2953  putative DNA methylase  34.29 
 
 		 1239 aa  48.1  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.468848  normal  0.142335 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3141  N-6 DNA methylase  35.38 
 
 		 746 aa  47.8  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3055  protein of unknown function DUF450  26.05 
 
 		 950 aa  47.4  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1133  N-6 DNA methylase  36.26 
 
 		 490 aa  47  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.813419  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4612  N-6 DNA methylase  30.17 
 
 		 489 aa  47  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000590691 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1159  hypothetical protein  21.96 
 
 		 1036 aa  46.6  0.003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3271  putative RNA methylase  34.86 
 
 		 479 aa  46.6  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.11081  normal  0.0311183 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2397  hypothetical protein  26.73 
 
 		 792 aa  45.8  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0502  N-6 DNA methylase  31.86 
 
 		 493 aa  46.2  0.004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.173184 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3191  hypothetical protein  24.27 
 
 		 288 aa  45.8  0.004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1545  hypothetical protein  28.32 
 
 		 1195 aa  46.2  0.004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0985179  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4877  hypothetical protein  26.17 
 
 		 481 aa  45.8  0.005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3315  type II restriction enzyme, methylase subunit  28.17 
 
 		 929 aa  45.4  0.006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2547  type IIS restriction endonuclease, putative  21.99 
 
 		 1076 aa  45.4  0.006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00176401  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05210  hypothetical protein  27.27 
 
 		 1209 aa  45.4  0.007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4598  Type I restriction-modification system methyltransferase subunit-like  37.1 
 
 		 416 aa  45.1  0.008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2863  N-6 DNA methylase  32.76 
 
 		 500 aa  44.7  0.01  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>