139 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_2068 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_2068  hypothetical protein  100 
 
 		 349 aa  729    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.604941 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2449  hypothetical protein  36.68 
 
 		 318 aa  209  7e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.340294  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2369  hypothetical protein  35 
 
 		 323 aa  205  1e-51  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.366253  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2280  hypothetical protein  36.28 
 
 		 317 aa  204  1e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2249  hypothetical protein  33.75 
 
 		 327 aa  191  2e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.497774  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0467  hypothetical protein  34.67 
 
 		 321 aa  182  6e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1490  hypothetical protein  35.99 
 
 		 326 aa  182  1e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00153565  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2054  hypothetical protein  33.22 
 
 		 318 aa  177  2e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.285922  normal  0.509055 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1838  hypothetical protein  33.33 
 
 		 317 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26920  hypothetical protein  33.55 
 
 		 318 aa  172  6.999999999999999e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1898  hypothetical protein  33.97 
 
 		 342 aa  171  1e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3010  protein of unknown function DUF58  33.01 
 
 		 333 aa  166  8e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.29026  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1884  hypothetical protein  34.47 
 
 		 323 aa  165  1.0000000000000001e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.65449  normal  0.844493 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2349  hypothetical protein  28.74 
 
 		 417 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2531  hypothetical protein  30.03 
 
 		 372 aa  164  3e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1576  hypothetical protein  30.07 
 
 		 339 aa  163  4.0000000000000004e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0183217  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1878  hypothetical protein  33.33 
 
 		 330 aa  162  7e-39  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2777  hypothetical protein  29.39 
 
 		 337 aa  162  1e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.668338  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1218  hypothetical protein  32.52 
 
 		 355 aa  162  1e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.892265  normal  0.23692 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1324  protein of unknown function DUF58  33.22 
 
 		 344 aa  161  2e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.12431  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1966  hypothetical protein  33.65 
 
 		 329 aa  160  3e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2624  hypothetical protein  31.55 
 
 		 329 aa  160  3e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.681677  normal  0.0502315 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3147  hypothetical protein  34.02 
 
 		 337 aa  157  2e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.210354 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2518  hypothetical protein  30.87 
 
 		 316 aa  154  2e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.451759  normal  0.113037 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2417  hypothetical protein  28.93 
 
 		 338 aa  152  8e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.479744  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1244  hypothetical protein  30.65 
 
 		 336 aa  150  3e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0164654  normal  0.183066 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3625  hypothetical protein  32.57 
 
 		 316 aa  150  5e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2108  hypothetical protein  30.37 
 
 		 354 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3378  protein of unknown function DUF58  30.58 
 
 		 323 aa  147  3e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.476103  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2815  hypothetical protein  32.18 
 
 		 341 aa  147  4.0000000000000006e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.682313  normal  0.278413 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2385  hypothetical protein  32.19 
 
 		 344 aa  146  5e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2304  protein of unknown function DUF58  32.18 
 
 		 341 aa  146  5e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2075  protein of unknown function DUF58  29.01 
 
 		 315 aa  146  6e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0220521  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2127  hypothetical protein  30.32 
 
 		 334 aa  140  3e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5566  hypothetical protein  30.21 
 
 		 346 aa  137  2e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.708703  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2243  hypothetical protein  31.87 
 
 		 361 aa  137  2e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.760307  normal  0.435241 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2162  hypothetical protein  32.1 
 
 		 339 aa  138  2e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0151001  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2097  hypothetical protein  31.46 
 
 		 372 aa  138  2e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03012  hypothetical protein  32.5 
 
 		 352 aa  137  3.0000000000000003e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.606349 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2151  hypothetical protein  30.91 
 
 		 346 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2530  hypothetical protein  29.75 
 
 		 341 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4562  hypothetical protein  31.76 
 
 		 365 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2276  hypothetical protein  31.76 
 
 		 365 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2050  hypothetical protein  32.38 
 
 		 365 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2097  hypothetical protein  32.38 
 
 		 365 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2288  protein of unknown function DUF58  32.08 
 
 		 365 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.523334  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1855  hypothetical protein  31.87 
 
 		 361 aa  133  5e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.270651  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02556  hypothetical protein  27.59 
 
 		 374 aa  132  7.999999999999999e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1777  hypothetical protein  31.87 
 
 		 361 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3969  protein of unknown function DUF58  29.39 
 
 		 357 aa  128  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.068653 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3855  protein of unknown function DUF58  29.39 
 
 		 357 aa  128  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1944  hypothetical protein  27.07 
 
 		 353 aa  125  7e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0820  hypothetical protein  29.41 
 
 		 323 aa  123  4e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0863  protein of unknown function DUF58  30.43 
 
 		 314 aa  121  9.999999999999999e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.344005  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02437  hypothetical protein  28.1 
 
 		 318 aa  120  4.9999999999999996e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1211  hypothetical protein  27.76 
 
 		 319 aa  119  7.999999999999999e-26  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1117  hypothetical protein  27.76 
 
 		 319 aa  119  7.999999999999999e-26  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1675  hypothetical protein  26.52 
 
 		 353 aa  119  9.999999999999999e-26  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2913  hypothetical protein  30.59 
 
 		 362 aa  108  2e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.278272 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2043  protein of unknown function DUF58  29.2 
 
 		 267 aa  99.4  8e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1872  hypothetical protein  25.08 
 
 		 316 aa  97.8  2e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0727  protein of unknown function DUF58  25.25 
 
 		 302 aa  98.6  2e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1863  hypothetical protein  25.08 
 
 		 316 aa  97.1  4e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1793  transglutaminase-like protein  27.85 
 
 		 943 aa  93.2  6e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.634482  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2425  hypothetical protein  28.32 
 
 		 276 aa  89.7  6e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00337672  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3276  hypothetical protein  22.9 
 
 		 294 aa  77.8  0.0000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.864378  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0481  protein of unknown function DUF58  23.87 
 
 		 299 aa  75.1  0.000000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2053  hypothetical protein  30.07 
 
 		 263 aa  73.2  0.000000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0403432  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0048  protein of unknown function DUF58  27.35 
 
 		 363 aa  72.4  0.00000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0188  hypothetical protein  25 
 
 		 412 aa  68.9  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0623  hypothetical protein  22.73 
 
 		 419 aa  67.8  0.0000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6585  protein of unknown function DUF58  23.64 
 
 		 380 aa  66.6  0.0000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.433364 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1522  protein of unknown function DUF58  23.45 
 
 		 293 aa  63.9  0.000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0817  protein of unknown function DUF58  25.86 
 
 		 552 aa  62.8  0.000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3160  hypothetical protein  25.11 
 
 		 442 aa  61.6  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.491633  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2536  protein of unknown function DUF58  25.6 
 
 		 333 aa  57.8  0.0000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0959  hypothetical protein  26.35 
 
 		 407 aa  57  0.0000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1569  hypothetical protein  27.6 
 
 		 384 aa  56.2  0.0000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.339258  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3388  protein of unknown function DUF58  24.56 
 
 		 385 aa  55.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3834  protein of unknown function DUF58  33.06 
 
 		 399 aa  53.9  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00386989  normal  0.0608669 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4816  protein of unknown function DUF58  27.17 
 
 		 453 aa  53.1  0.000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1077  protein of unknown function DUF58  23.11 
 
 		 426 aa  52.8  0.000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0630  hypothetical protein  22.46 
 
 		 462 aa  53.1  0.000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.28147  normal  0.395261 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4604  hypothetical protein  21.7 
 
 		 380 aa  52.8  0.000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1099  hypothetical protein  30.39 
 
 		 392 aa  52.4  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.430277  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3750  protein of unknown function DUF58  27.12 
 
 		 434 aa  52.4  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.237776  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1642  hypothetical protein  28.18 
 
 		 386 aa  51.6  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.656469 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0929  hypothetical protein  28.57 
 
 		 384 aa  51.2  0.00003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.501071  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05640  hypothetical protein  25.36 
 
 		 410 aa  50.8  0.00004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1150  protein of unknown function DUF58  30.91 
 
 		 395 aa  50.4  0.00004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00641052  hitchhiker  0.0000843789 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2963  protein of unknown function DUF58  22.51 
 
 		 275 aa  50.4  0.00005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.023693 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4822  protein of unknown function DUF58  24.44 
 
 		 430 aa  48.9  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3578  protein of unknown function DUF58  27.61 
 
 		 370 aa  49.3  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2677  hypothetical protein  26.6 
 
 		 429 aa  48.9  0.0001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2888  hypothetical protein  23.53 
 
 		 426 aa  48.9  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3459  hypothetical protein  27.59 
 
 		 431 aa  49.3  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.887952  normal  0.027192 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0629  protein of unknown function DUF58  31.07 
 
 		 325 aa  48.9  0.0001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.165682 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2105  protein of unknown function DUF58  21.67 
 
 		 431 aa  48.9  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1633  hypothetical protein  21.88 
 
 		 257 aa  48.5  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000447033  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0461  protein of unknown function DUF58  28.08 
 
 		 395 aa  48.1  0.0002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>