More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_1645 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_1645  hippurate hydrolase  100 
 
 		 368 aa  767    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2454  amidohydrolase  68.96 
 
 		 394 aa  526  1e-148  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2199  amidohydrolase  55.98 
 
 		 395 aa  397  1e-109  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.320841  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0219  peptidase M20D, amidohydrolase  52.02 
 
 		 390 aa  366  1e-100  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4114  amidohydrolase  50.54 
 
 		 385 aa  349  5e-95  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3092  hippurate hydrolase  39.89 
 
 		 397 aa  250  3e-65  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.422678 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3523  peptidase M20D, amidohydrolase  39.55 
 
 		 385 aa  249  5e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00484515  normal  0.807548 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4829  amidohydrolase  39.19 
 
 		 384 aa  249  7e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.316322  normal  0.642966 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5562  amidohydrolase  38.04 
 
 		 399 aa  247  2e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.596197  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0901  amidohydrolase  39.29 
 
 		 387 aa  247  2e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2037  M20/M25/M40 family peptidase  39.56 
 
 		 387 aa  246  4e-64  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.403946  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0022  amidohydrolase  37.54 
 
 		 380 aa  246  4.9999999999999997e-64  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2955  peptidase M20D, amidohydrolase  37.64 
 
 		 387 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0814312  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3897  amidohydrolase  37.47 
 
 		 387 aa  246  4.9999999999999997e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00269559 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2229  amidohydrolase  38.13 
 
 		 395 aa  246  6e-64  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.359386  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1519  amidohydrolase  37.09 
 
 		 390 aa  245  6.999999999999999e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4586  putative amidohydrolase family protein  35.47 
 
 		 389 aa  245  8e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4250  amidohydrolase  38.93 
 
 		 390 aa  245  8e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.456638  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3609  amidohydrolase  37.2 
 
 		 387 aa  245  8e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.752392  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26260  putative hydrolase  39.56 
 
 		 389 aa  245  8e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.474103  normal  0.713071 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1959  M20/M25/M40 family peptidase  39.01 
 
 		 387 aa  244  3e-63  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.980827  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1813  peptidase M20D, amidohydrolase  39.95 
 
 		 388 aa  243  3.9999999999999997e-63  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.301487  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0180  peptidase M20D, amidohydrolase  35.33 
 
 		 393 aa  243  3.9999999999999997e-63  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0152  amidohydrolase  36.56 
 
 		 396 aa  241  1e-62  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.468392  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1288  amidohydrolase  39.3 
 
 		 388 aa  241  2e-62  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0866095  normal  0.389955 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1169  peptidase M20D, amidohydrolase  35.62 
 
 		 387 aa  241  2e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1550  amidohydrolase  35.44 
 
 		 387 aa  241  2e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.388214  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1649  amidohydrolase  35.62 
 
 		 387 aa  241  2e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0453  amidohydrolase  39.01 
 
 		 401 aa  240  2.9999999999999997e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.719857  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0444  amidohydrolase  39.01 
 
 		 401 aa  240  2.9999999999999997e-62  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.186163  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3007  peptidase M20D, amidohydrolase  37.47 
 
 		 397 aa  239  4e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3382  amidohydrolase  38.27 
 
 		 402 aa  239  4e-62  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3159  peptidase M20D, amidohydrolase  37.83 
 
 		 397 aa  239  4e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1569  amidohydrolase  35.16 
 
 		 387 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.115888  normal  0.271355 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2111  peptidase M20D, amidohydrolase  38.54 
 
 		 398 aa  239  5.999999999999999e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.959227  normal  0.0805645 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1734  peptidase M20D, amidohydrolase  37.84 
 
 		 389 aa  239  6.999999999999999e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.169236  normal  0.0172136 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1698  amidohydrolase  37.09 
 
 		 406 aa  238  8e-62  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.31217  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6364  amidohydrolase  38.74 
 
 		 395 aa  239  8e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.557183  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1825  amidohydrolase  35.16 
 
 		 387 aa  238  9e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0704154  normal  0.023648 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6067  amidohydrolase  38.74 
 
 		 395 aa  238  9e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6268  amidohydrolase  38.19 
 
 		 395 aa  238  9e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.843577  normal  0.0558872 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1624  amidohydrolase  35.44 
 
 		 387 aa  238  1e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.538958  hitchhiker  0.00444937 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5133  amidohydrolase  36.78 
 
 		 407 aa  238  1e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.519765  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0803  hippurate hydrolase  34.7 
 
 		 383 aa  238  1e-61  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5199  hippurate hydrolase  36.16 
 
 		 403 aa  238  1e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1882  peptidase, M20/M25/M40 family  38.98 
 
 		 385 aa  238  2e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.237725  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2671  peptidase M20D, amidohydrolase  37.93 
 
 		 394 aa  238  2e-61  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00976662  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1248  amidohydrolase  39.29 
 
 		 425 aa  236  3e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.144528  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1067  hippurate hydrolase  34.43 
 
 		 383 aa  236  4e-61  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.956056  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4882  amidohydrolase  37.87 
 
 		 404 aa  236  6e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.345507 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4062  amidohydrolase  37.74 
 
 		 387 aa  236  6e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3565  peptidase M20D, amidohydrolase  37.87 
 
 		 390 aa  235  7e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3456  amidohydrolase  38.04 
 
 		 388 aa  234  1.0000000000000001e-60  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6670  amidohydrolase  37.64 
 
 		 395 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2533  peptidase M20D, amidohydrolase  37.14 
 
 		 397 aa  234  1.0000000000000001e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0030908 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1004  hippurate hydrolase  34.06 
 
 		 383 aa  234  1.0000000000000001e-60  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2687  amidohydrolase  37.8 
 
 		 397 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.453314  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6435  peptidase M20D, amidohydrolase  37.64 
 
 		 395 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1132  amidohydrolase  37.7 
 
 		 402 aa  234  2.0000000000000002e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4797  peptidase M20D, amidohydrolase  34.62 
 
 		 387 aa  233  3e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.107968  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56480  putative hydrolase  37.85 
 
 		 406 aa  233  3e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2262  peptidase M20D, amidohydrolase  38.65 
 
 		 389 aa  233  4.0000000000000004e-60  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.891111  normal  0.0931897 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1589  amidohydrolase  35.62 
 
 		 387 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.855495  normal  0.041045 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0718  peptidase M20D, amidohydrolase  37.97 
 
 		 390 aa  233  4.0000000000000004e-60  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.178083  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3206  amidohydrolase  35.71 
 
 		 389 aa  232  8.000000000000001e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.057968 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2598  peptidase M20D, amidohydrolase  37.22 
 
 		 396 aa  232  8.000000000000001e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.572475  normal  0.542589 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1216  amidohydrolase  36.86 
 
 		 386 aa  232  9e-60  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0610  amidohydrolase  37.23 
 
 		 389 aa  231  2e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00962709  normal  0.632979 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4372  hippurate hydrolase  36.31 
 
 		 379 aa  230  2e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.362461  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0333  amidohydrolase  38.5 
 
 		 401 aa  231  2e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1291  peptidase M20D, amidohydrolase  36.73 
 
 		 391 aa  231  2e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.214577  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4367  amidohydrolase  38.81 
 
 		 388 aa  231  2e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3615  peptidase M20D, amidohydrolase  37.1 
 
 		 397 aa  231  2e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0044  peptidase M20D, amidohydrolase  36.93 
 
 		 385 aa  231  2e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1090  amidohydrolase  37.6 
 
 		 424 aa  230  3e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.321453  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4353  amidohydrolase  35.44 
 
 		 399 aa  230  3e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.980853  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3113  amidohydrolase  37 
 
 		 396 aa  230  3e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5140  amidohydrolase  37.14 
 
 		 389 aa  229  4e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.778625 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2692  amidohydrolase  38.87 
 
 		 388 aa  229  4e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5405  amidohydrolase  38.81 
 
 		 396 aa  229  6e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2748  amidohydrolase  36.73 
 
 		 396 aa  229  6e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5896  amidohydrolase  38.02 
 
 		 395 aa  229  6e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0480348 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7452  peptidase M20D, amidohydrolase  37.53 
 
 		 416 aa  228  9e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2919  amidohydrolase  38.61 
 
 		 388 aa  228  9e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.068301  normal  0.124085 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2925  amidohydrolase  37.13 
 
 		 388 aa  228  1e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3484  amidohydrolase  36.39 
 
 		 398 aa  228  1e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00282847  hitchhiker  0.00183478 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0948  peptidase M20D, amidohydrolase  37.33 
 
 		 395 aa  228  1e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.917959 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1729  peptidase M20D, amidohydrolase  37.57 
 
 		 390 aa  228  1e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0022862 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2573  amidohydrolase  38.27 
 
 		 387 aa  227  2e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0165265  normal  0.498174 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5519  amidohydrolase  37.33 
 
 		 396 aa  227  2e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.5258  normal  0.111633 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5679  amidohydrolase  37.29 
 
 		 408 aa  228  2e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.613587 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1030  metal-dependent amidase/aminoacylase/carboxypeptidase  36.94 
 
 		 379 aa  227  3e-58  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5651  amidohydrolase  36.56 
 
 		 396 aa  226  4e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.146235 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0719  peptidase M20D, amidohydrolase  36.1 
 
 		 387 aa  226  4e-58  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.093275  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2808  amidohydrolase  36.59 
 
 		 385 aa  226  4e-58  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4914  putative hydrolase  38.14 
 
 		 405 aa  226  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0472  putative hippurate carboxypeptidase, M20D- type  36.66 
 
 		 423 aa  226  6e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0745924  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3715  peptidase M20D, amidohydrolase  36.56 
 
 		 415 aa  226  6e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.410848  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4653  amidohydrolase  36.56 
 
 		 415 aa  226  6e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0295739  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0634  carboxypeptidase  34.65 
 
 		 396 aa  226  7e-58  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.062973  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>