182 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal195_3793 on replicon NC_009997
Organism: Shewanella baltica OS195



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009997  Sbal195_3793  short chain dehydrogenase  100 
 
 		 207 aa  418  1e-116  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3670  short chain dehydrogenase  93.69 
 
 		 208 aa  396  1e-109  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0789  short chain dehydrogenase  80.1 
 
 		 205 aa  335  2.9999999999999997e-91  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0657  short chain dehydrogenase  57.21 
 
 		 202 aa  242  1.9999999999999999e-63  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.769936  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3138  short chain dehydrogenase  51.52 
 
 		 200 aa  203  2e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4312  short chain dehydrogenase  44.95 
 
 		 199 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4284  short chain dehydrogenase  46.7 
 
 		 201 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.206363 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1238  short chain dehydrogenase  43.15 
 
 		 199 aa  178  4.999999999999999e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.945039 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0927  short chain dehydrogenase  45.27 
 
 		 200 aa  178  4.999999999999999e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.115438  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4448  short chain dehydrogenase  46.19 
 
 		 201 aa  177  8e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3331  short chain dehydrogenase  47.74 
 
 		 201 aa  177  1e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0613  short chain dehydrogenase  47.21 
 
 		 201 aa  177  1e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0886445 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06295  short chain dehydrogenase  41.5 
 
 		 200 aa  175  3e-43  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50610  short chain dehydrogenase  43.5 
 
 		 223 aa  175  5e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0391945 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1664  short chain dehydrogenase  43.43 
 
 		 199 aa  171  5.999999999999999e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3200  short chain dehydrogenase  43.94 
 
 		 217 aa  167  9e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3526  short chain dehydrogenase  47.67 
 
 		 233 aa  166  2e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0150103 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4883  short chain dehydrogenase  42.71 
 
 		 202 aa  165  5e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5475  short chain dehydrogenase  42.21 
 
 		 202 aa  161  5.0000000000000005e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5387  short chain dehydrogenase  42.21 
 
 		 202 aa  161  5.0000000000000005e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.255767 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05280  short chain dehydrogenase  41.92 
 
 		 200 aa  160  2e-38  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5629  short chain dehydrogenase  40.5 
 
 		 198 aa  152  4e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.973642 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0313  short chain dehydrogenase  39.29 
 
 		 199 aa  152  5e-36  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0297  short chain dehydrogenase  39.29 
 
 		 199 aa  152  5e-36  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2512  short chain dehydrogenase  41.62 
 
 		 199 aa  150  1e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.296656  normal  0.253878 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1873  short chain dehydrogenase  39.8 
 
 		 201 aa  148  5e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1736  short chain dehydrogenase  40.1 
 
 		 201 aa  146  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.544896  normal  0.157452 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2493  short chain dehydrogenase  39.2 
 
 		 200 aa  143  2e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2619  short chain dehydrogenase  37.56 
 
 		 201 aa  141  7e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1726  short chain dehydrogenase  39.2 
 
 		 200 aa  141  8e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl362  short chain dehydrogenase  37.13 
 
 		 202 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  3.68833e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2520  short chain dehydrogenase  41 
 
 		 199 aa  139  3e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0216463  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3613  short chain dehydrogenase  38.38 
 
 		 199 aa  129  4.0000000000000003e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4306  short chain dehydrogenase  32 
 
 		 197 aa  116  3e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.331066 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1778  short chain dehydrogenase  34.33 
 
 		 202 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6188  short chain dehydrogenase  36.32 
 
 		 198 aa  109  4.0000000000000004e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2324  short chain dehydrogenase  31.69 
 
 		 245 aa  73.6  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2087  short chain dehydrogenase  30.77 
 
 		 245 aa  70.5  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.319948  normal  0.613238 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0802  short chain dehydrogenase  28.49 
 
 		 238 aa  65.5  0.0000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.414553  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2913  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.12 
 
 		 234 aa  65.1  0.0000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.98827 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2533  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.59 
 
 		 243 aa  64.7  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2123  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.41 
 
 		 224 aa  60.8  0.00000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1057  short chain dehydrogenase; 3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  29.76 
 
 		 230 aa  60.5  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.474453 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2958  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.56 
 
 		 238 aa  60.5  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06495  oxidoreductase  31.01 
 
 		 222 aa  59.3  0.00000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2173  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.59 
 
 		 237 aa  57.4  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.129059  normal  0.0371904 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1849  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.59 
 
 		 237 aa  57  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00951861 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0030  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase, putative  22.53 
 
 		 245 aa  56.2  0.0000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1079  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.27 
 
 		 237 aa  56.6  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.236839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0027  putative 3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  22.53 
 
 		 245 aa  56.6  0.0000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3279  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.94 
 
 		 238 aa  55.5  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.996874 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3742  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.14 
 
 		 227 aa  55.8  0.0000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3578  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.87 
 
 		 238 aa  55.1  0.0000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.261739  normal  0.184222 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2386  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.46 
 
 		 238 aa  55.1  0.0000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.290784  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3870  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  23.24 
 
 		 259 aa  54.7  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1392  short chain dehydrogenase  30.65 
 
 		 237 aa  53.9  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.663645  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1352  short chain dehydrogenase  30.65 
 
 		 204 aa  53.9  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.297804  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3062  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.3 
 
 		 238 aa  53.9  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11298  short chain dehydrogenase  24.42 
 
 		 232 aa  53.1  0.000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0142  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  22.86 
 
 		 255 aa  53.1  0.000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3127  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.43 
 
 		 253 aa  52.4  0.000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.984455  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4560  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.81 
 
 		 241 aa  52  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.84586  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2735  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.43 
 
 		 253 aa  51.2  0.000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.534255 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1106  short chain dehydrogenase  27.94 
 
 		 240 aa  50.8  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.256004  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1548  short chain dehydrogenase  27.94 
 
 		 240 aa  50.8  0.00001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0211  short chain dehydrogenase  27.94 
 
 		 240 aa  50.8  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0327074  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0953  short chain dehydrogenase  27.94 
 
 		 240 aa  50.8  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0453  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.22 
 
 		 225 aa  50.8  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2546  short chain dehydrogenase  25.4 
 
 		 238 aa  50.4  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1880  short chain dehydrogenase  27.94 
 
 		 270 aa  50.8  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0386097  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0819  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  24.74 
 
 		 236 aa  50.1  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1701  short chain dehydrogenase  27.94 
 
 		 240 aa  50.4  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.553815  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1727  short chain dehydrogenase  27.94 
 
 		 240 aa  50.4  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.169393  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3913  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  22.51 
 
 		 237 aa  50.8  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1583  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.15 
 
 		 248 aa  50.1  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.806898  normal  0.017842 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4883  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.04 
 
 		 275 aa  50.4  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2000  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.45 
 
 		 247 aa  50.1  0.00003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3482  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.27 
 
 		 248 aa  49.7  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2086  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.14 
 
 		 245 aa  49.3  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00879174  normal  0.332592 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2779  short chain dehydrogenase  25.4 
 
 		 238 aa  49.7  0.00004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000967722 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2764  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30 
 
 		 293 aa  49.3  0.00004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.133433  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4477  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  24.57 
 
 		 257 aa  49.3  0.00004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.211006  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0938  Short-chain alcohol dehydrogenase  25.58 
 
 		 242 aa  48.9  0.00005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00746042  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4885  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.65 
 
 		 235 aa  48.5  0.00006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0155643  normal  0.460753 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3156  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  24.06 
 
 		 284 aa  48.9  0.00006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7193  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25 
 
 		 250 aa  48.9  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.839106  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6829  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  21.58 
 
 		 237 aa  48.5  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.138862 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2984  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.28 
 
 		 249 aa  47.8  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00209875  normal  0.0179509 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4792  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.63 
 
 		 241 aa  47.8  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6186  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28 
 
 		 246 aa  47.8  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.139456 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2698  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.84 
 
 		 241 aa  47.4  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.682168  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2460  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  22.94 
 
 		 286 aa  47.8  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.239121  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5398  short chain dehydrogenase  29.37 
 
 		 237 aa  47  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.448232  normal  0.960589 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2695  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  23.86 
 
 		 285 aa  47  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00727931 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2606  short chain dehydrogenase  27.21 
 
 		 240 aa  46.6  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1467  short chain dehydrogenase  29.03 
 
 		 237 aa  46.6  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2612  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.23 
 
 		 231 aa  47  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1445  short chain dehydrogenase  29.03 
 
 		 237 aa  46.6  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.109689  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0662  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.7 
 
 		 224 aa  47  0.0002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.550294  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1638  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.95 
 
 		 235 aa  46.6  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>