More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_1583 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_1583  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 		 248 aa  497  1e-140  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.806898  normal  0.017842 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3242  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  61.73 
 
 		 257 aa  291  7e-78  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4222  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.75 
 
 		 242 aa  98.2  1e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.186526  normal  1 
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_16295  predicted protein  37.2 
 
 		 237 aa  96.7  3e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0303319  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3968  short chain dehydrogenase  34.83 
 
 		 269 aa  90.9  2e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0231224  normal  0.018096 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0897  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.16 
 
 		 260 aa  89.7  4e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0717939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4044  hypothetical protein  62.5 
 
 		 78 aa  89  7e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.489915  normal  0.150808 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0521  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.64 
 
 		 253 aa  88.6  8e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.413243 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3844  short chain dehydrogenase  38.1 
 
 		 267 aa  87  2e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000447473 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3918  short chain dehydrogenase  38.1 
 
 		 267 aa  87  2e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000420  oxidoreductase short-chain dehydrogenase/reductase family  36.81 
 
 		 239 aa  87.4  2e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.637186  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4040  short chain dehydrogenase  38.1 
 
 		 267 aa  87  2e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0416  short chain dehydrogenase  38.1 
 
 		 267 aa  87  2e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0526  short chain dehydrogenase  33.82 
 
 		 279 aa  86.3  4e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.928222  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2798  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.15 
 
 		 235 aa  86.3  4e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05303  oxidoreductase  37.42 
 
 		 239 aa  86.3  4e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2186  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.13 
 
 		 248 aa  86.7  4e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0361624 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0818  short chain dehydrogenase  32.2 
 
 		 242 aa  86.3  5e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4853  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.54 
 
 		 248 aa  85.5  6e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.154391  normal  0.241568 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2637  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.32 
 
 		 249 aa  85.5  8e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33490  short-chain alcohol dehydrogenase  33.91 
 
 		 247 aa  84.7  0.000000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.343117  normal  0.392445 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0736  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.64 
 
 		 272 aa  84.7  0.000000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1902  short chain dehydrogenase  31.07 
 
 		 269 aa  84.7  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0327948  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0488  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  33.52 
 
 		 253 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.596302  normal  0.0751805 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4539  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.06 
 
 		 276 aa  84  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0761  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.55 
 
 		 253 aa  84  0.000000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.562893  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3953  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.71 
 
 		 292 aa  84.3  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0101  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.98 
 
 		 272 aa  84  0.000000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1126  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.87 
 
 		 338 aa  84.3  0.000000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0542  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.16 
 
 		 253 aa  83.6  0.000000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0795693 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0441  short chain dehydrogenase  36.31 
 
 		 267 aa  83.6  0.000000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1744  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.48 
 
 		 258 aa  83.2  0.000000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.084821  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0438  short chain dehydrogenase  36.9 
 
 		 267 aa  83.2  0.000000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4482  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.77 
 
 		 244 aa  83.2  0.000000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000123251 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2639  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.87 
 
 		 238 aa  83.2  0.000000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.37123  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3608  Male sterility domain protein  35.19 
 
 		 637 aa  82.8  0.000000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.619777  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3588  short chain dehydrogenase  36.31 
 
 		 267 aa  83.2  0.000000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0437  short chain dehydrogenase  36.31 
 
 		 267 aa  83.2  0.000000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5220  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.7 
 
 		 279 aa  82.4  0.000000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8214  short chain dehydrogenase  33.94 
 
 		 248 aa  82.4  0.000000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3310  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.79 
 
 		 276 aa  82  0.000000000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1803  short chain dehydrogenase  31.48 
 
 		 705 aa  81.3  0.00000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3735  short chain dehydrogenase  32.97 
 
 		 281 aa  81.3  0.00000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1321  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.72 
 
 		 282 aa  81.3  0.00000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.889604  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3404  short chain dehydrogenase  35.71 
 
 		 267 aa  81.6  0.00000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12680  short chain dehydrogenase  35.54 
 
 		 278 aa  81.3  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3324  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.71 
 
 		 273 aa  81.6  0.00000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.180623  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_61312  predicted protein  30.77 
 
 		 253 aa  81.6  0.00000000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.243713  normal  0.492851 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4381  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.55 
 
 		 248 aa  81.6  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.297747  hitchhiker  0.00314525 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0271  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.93 
 
 		 295 aa  80.5  0.00000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.617433  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2558  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.63 
 
 		 296 aa  80.1  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1007  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.23 
 
 		 245 aa  80.1  0.00000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.553727  normal  0.0273902 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0825  hypothetical protein  31.86 
 
 		 258 aa  80.1  0.00000000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2629  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.16 
 
 		 317 aa  79.3  0.00000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5927  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.35 
 
 		 248 aa  79  0.00000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.142802 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4296  short chain dehydrogenase  32.63 
 
 		 280 aa  79  0.00000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2757  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.94 
 
 		 258 aa  79  0.00000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00507501  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00620  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like  33.95 
 
 		 260 aa  79  0.00000000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.297652  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2238  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.43 
 
 		 317 aa  79  0.00000000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4660  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.33 
 
 		 261 aa  78.6  0.00000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.268545  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1025  short chain dehydrogenase  32.11 
 
 		 274 aa  78.2  0.0000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.150864  normal  0.667254 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4560  short chain dehydrogenase  32.46 
 
 		 280 aa  78.2  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0967831  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3312  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.33 
 
 		 260 aa  78.2  0.0000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0982  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.33 
 
 		 268 aa  78.2  0.0000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4071  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.19 
 
 		 256 aa  78.2  0.0000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.254174 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2906  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.53 
 
 		 258 aa  78.2  0.0000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2049  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  31.48 
 
 		 230 aa  77.4  0.0000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3003  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.96 
 
 		 257 aa  77  0.0000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.605713  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2336  short chain dehydrogenase  29.22 
 
 		 706 aa  77.4  0.0000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.308198  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2235  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.44 
 
 		 266 aa  77.4  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.30257  normal  0.665507 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0016  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.26 
 
 		 260 aa  77.4  0.0000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5138  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.95 
 
 		 248 aa  77.4  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2609  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.76 
 
 		 250 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.328906 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0159  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.73 
 
 		 249 aa  77.8  0.0000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.410897  normal  0.168063 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0262  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.18 
 
 		 274 aa  76.6  0.0000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0106192 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0293  short chain dehydrogenase  31.33 
 
 		 267 aa  77  0.0000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0904  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.74 
 
 		 254 aa  76.3  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3927  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.55 
 
 		 272 aa  76.3  0.0000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.743458 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3902  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.59 
 
 		 246 aa  76.6  0.0000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.809389  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3333  short chain dehydrogenase  31.12 
 
 		 280 aa  76.6  0.0000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2999  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.42 
 
 		 250 aa  76.3  0.0000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.109628  normal  0.14985 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1249  short chain dehydrogenase  31.03 
 
 		 279 aa  75.9  0.0000000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09810  short-chain alcohol dehydrogenase  36.97 
 
 		 261 aa  75.9  0.0000000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0913042  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3415  short chain dehydrogenase  34.13 
 
 		 268 aa  76.3  0.0000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.560569  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2828  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.94 
 
 		 250 aa  76.3  0.0000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3170  putative Short-chain dehydrogenase/reductase  34.13 
 
 		 544 aa  75.9  0.0000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0745281 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2746  short chain dehydrogenase  29.17 
 
 		 705 aa  75.9  0.0000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1331  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.26 
 
 		 332 aa  75.9  0.0000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.261589  normal  0.281891 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2188  thiamine pyrophosphate protein central region  29.63 
 
 		 847 aa  75.9  0.0000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.941679 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1704  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.56 
 
 		 327 aa  75.5  0.0000000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.151565  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1115  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.3 
 
 		 281 aa  75.5  0.0000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.299534  normal  0.313819 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1520  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.38 
 
 		 287 aa  75.5  0.0000000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3798  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.07 
 
 		 246 aa  75.5  0.0000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.317605  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3687  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.54 
 
 		 243 aa  75.5  0.0000000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3871  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.07 
 
 		 246 aa  75.5  0.0000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4141  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  32.52 
 
 		 243 aa  75.1  0.0000000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3104  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.15 
 
 		 252 aa  75.1  0.0000000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0982  short chain dehydrogenase  32.93 
 
 		 285 aa  75.1  0.0000000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4252  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.57 
 
 		 246 aa  75.1  0.0000000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1220  short chain dehydrogenase  33.33 
 
 		 254 aa  75.1  0.0000000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0140677 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>