More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_3242 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_3242  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
257 aa  504  9.999999999999999e-143  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1583  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  61.73 
 
 
248 aa  291  7e-78  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.806898  normal  0.017842 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4482  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.12 
 
 
244 aa  99  8e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000123251 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1686  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.28 
 
 
269 aa  94.4  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.292744  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3324  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.05 
 
 
273 aa  89  7e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.180623  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3953  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.42 
 
 
292 aa  88.6  1e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0195  short chain dehydrogenase  33.95 
 
 
705 aa  87.8  1e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4222  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.04 
 
 
242 aa  87.4  2e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.186526  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3104  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.2 
 
 
252 aa  87.4  2e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1803  short chain dehydrogenase  31.9 
 
 
705 aa  87.4  2e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4560  short chain dehydrogenase  37.72 
 
 
280 aa  86.7  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0967831  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3745  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.59 
 
 
279 aa  85.9  6e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0818  short chain dehydrogenase  34.62 
 
 
242 aa  85.9  6e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0542  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.42 
 
 
253 aa  85.9  6e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0795693 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2746  short chain dehydrogenase  33.33 
 
 
705 aa  85.5  8e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2036  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.87 
 
 
259 aa  85.1  9e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4296  short chain dehydrogenase  37.72 
 
 
280 aa  84.7  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0876  short chain dehydrogenase  30.43 
 
 
274 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1220  short chain dehydrogenase  37.95 
 
 
254 aa  84.7  0.000000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0140677 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0521  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.92 
 
 
253 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.413243 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00620  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like  40.25 
 
 
260 aa  84  0.000000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.297652  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0488  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  36.92 
 
 
253 aa  83.2  0.000000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.596302  normal  0.0751805 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0526  short chain dehydrogenase  36.96 
 
 
279 aa  83.6  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.928222  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2637  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.36 
 
 
249 aa  83.2  0.000000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4581  short chain dehydrogenase  34.71 
 
 
281 aa  83.6  0.000000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4669  short chain dehydrogenase  34.71 
 
 
281 aa  83.6  0.000000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4964  short chain dehydrogenase  34.71 
 
 
281 aa  83.6  0.000000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.337953 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1787  short chain dehydrogenase  34.83 
 
 
258 aa  83.2  0.000000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0410  short chain dehydrogenase  32.1 
 
 
701 aa  83.2  0.000000000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2667  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.92 
 
 
230 aa  82.8  0.000000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.224966  normal  0.349225 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0159  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.15 
 
 
249 aa  82.8  0.000000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.410897  normal  0.168063 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0016  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.77 
 
 
260 aa  82.8  0.000000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33490  short-chain alcohol dehydrogenase  36.31 
 
 
247 aa  82.4  0.000000000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.343117  normal  0.392445 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0875  Short-chain dehydrogenase of various substrate specificities  29.8 
 
 
264 aa  82.4  0.000000000000007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00123287 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3132  glucose-1-dehydrogenase  31.28 
 
 
261 aa  82  0.000000000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5927  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.26 
 
 
248 aa  82  0.000000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.142802 
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_16295  predicted protein  33.95 
 
 
237 aa  82  0.00000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0303319  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1902  short chain dehydrogenase  33.33 
 
 
269 aa  81.6  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0327948  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3968  short chain dehydrogenase  33.53 
 
 
269 aa  81.3  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0231224  normal  0.018096 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3170  putative Short-chain dehydrogenase/reductase  36.53 
 
 
544 aa  81.3  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0745281 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1321  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.21 
 
 
282 aa  81.6  0.00000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.889604  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2336  short chain dehydrogenase  32.1 
 
 
706 aa  81.6  0.00000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.308198  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0265  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  36.13 
 
 
248 aa  81.6  0.00000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.534726  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3692  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.26 
 
 
263 aa  81.3  0.00000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0762  short chain dehydrogenase  35.54 
 
 
274 aa  81.6  0.00000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2798  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.67 
 
 
235 aa  81.6  0.00000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1972  short chain dehydrogenase  31.48 
 
 
705 aa  81.3  0.00000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000839125  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0776  short chain dehydrogenase  35.54 
 
 
274 aa  81.6  0.00000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0756  short chain dehydrogenase  35.54 
 
 
274 aa  81.3  0.00000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.624051 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2049  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  29.94 
 
 
230 aa  80.5  0.00000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0097  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.43 
 
 
262 aa  81.3  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1518  short chain dehydrogenase  32.29 
 
 
254 aa  80.9  0.00000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.570528  normal  0.0138518 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0982  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.08 
 
 
268 aa  80.9  0.00000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1126  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.42 
 
 
338 aa  80.9  0.00000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12680  short chain dehydrogenase  36.47 
 
 
278 aa  80.1  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2852  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.46 
 
 
253 aa  80.1  0.00000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5160  short chain dehydrogenase  34.12 
 
 
274 aa  80.1  0.00000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.694924 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4044  hypothetical protein  59.72 
 
 
78 aa  79.7  0.00000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.489915  normal  0.150808 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2674  short chain dehydrogenase  34.88 
 
 
286 aa  79.7  0.00000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.570073  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4558  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.29 
 
 
240 aa  79.7  0.00000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00293136  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1964  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.94 
 
 
239 aa  79  0.00000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.130885  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2693  short chain dehydrogenase  33.93 
 
 
682 aa  79.3  0.00000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1995  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.94 
 
 
239 aa  79  0.00000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.591310000000001e-44 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3927  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.53 
 
 
272 aa  79.3  0.00000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.743458 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2810  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.73 
 
 
284 aa  79  0.00000000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.329601  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2065  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.94 
 
 
239 aa  79  0.00000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000861938  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3364  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.94 
 
 
239 aa  79  0.00000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.115947  hitchhiker  0.00000000000000894376 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0271  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.54 
 
 
295 aa  79  0.00000000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.617433  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4539  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.79 
 
 
276 aa  79  0.00000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4660  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.38 
 
 
261 aa  79  0.00000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.268545  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2044  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.94 
 
 
242 aa  79  0.00000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.252391  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1819  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.94 
 
 
242 aa  79  0.00000000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1793  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.94 
 
 
242 aa  79  0.00000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.512815  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1775  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.94 
 
 
242 aa  79  0.00000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4547  glucose-1-dehydrogenase  29.12 
 
 
261 aa  79  0.00000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2906  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.14 
 
 
258 aa  79  0.00000000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1958  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.94 
 
 
242 aa  79  0.00000000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1489  short chain dehydrogenase  34.15 
 
 
296 aa  78.6  0.00000000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0488  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.91 
 
 
261 aa  79  0.00000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4834  glucose-1-dehydrogenase  29.12 
 
 
261 aa  78.6  0.00000000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0992  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family  29.26 
 
 
264 aa  77.8  0.0000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1692  short chain dehydrogenase  32.96 
 
 
259 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.749857  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1115  short chain dehydrogenase  32.96 
 
 
259 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00652763  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1870  short chain dehydrogenase  32.96 
 
 
259 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0823567  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0218  short chain dehydrogenase  32.96 
 
 
259 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0481209  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4853  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.23 
 
 
248 aa  77.8  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.154391  normal  0.241568 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3312  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.36 
 
 
260 aa  78.2  0.0000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1716  short chain dehydrogenase  32.96 
 
 
259 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1557  short chain dehydrogenase  32.96 
 
 
259 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000396998  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1025  short chain dehydrogenase  32.67 
 
 
274 aa  78.6  0.0000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.150864  normal  0.667254 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2003  short chain dehydrogenase  30.25 
 
 
705 aa  78.2  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0943  short chain dehydrogenase  32.96 
 
 
259 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3481  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.94 
 
 
259 aa  78.6  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.187301  normal  0.768221 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1494  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.94 
 
 
239 aa  77.4  0.0000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000128809  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1007  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.37 
 
 
245 aa  77.8  0.0000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.553727  normal  0.0273902 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1826  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.33 
 
 
239 aa  77.4  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2639  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.93 
 
 
238 aa  77  0.0000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.37123  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4466  glucose-1-dehydrogenase  28.57 
 
 
261 aa  77  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1597  short chain dehydrogenase  34.12 
 
 
274 aa  77.4  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3017  short chain dehydrogenase  34.44 
 
 
260 aa  77  0.0000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>