More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_5160 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_5160  short chain dehydrogenase  100 
 
 
274 aa  552  1e-156  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.694924 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4581  short chain dehydrogenase  92.67 
 
 
281 aa  514  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4669  short chain dehydrogenase  92.67 
 
 
281 aa  514  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4964  short chain dehydrogenase  92.31 
 
 
281 aa  513  1e-144  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.337953 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1597  short chain dehydrogenase  90.15 
 
 
274 aa  501  1e-141  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10780  short chain dehydrogenase  70.7 
 
 
275 aa  387  1e-106  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3844  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.95 
 
 
271 aa  243  1.9999999999999999e-63  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6486  hypothetical protein  50.78 
 
 
278 aa  239  5e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05318  hypothetical protein similar to nonribosomal peptide synthetase 10 (Broad)  33.2 
 
 
1270 aa  125  5e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.556036  normal  0.849429 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25000  short-chain alcohol dehydrogenase  36.51 
 
 
241 aa  119  3.9999999999999996e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1337  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30.2 
 
 
238 aa  118  9.999999999999999e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.541378  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5037  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.69 
 
 
238 aa  117  1.9999999999999998e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.293143  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3104  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.63 
 
 
252 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4381  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.03 
 
 
248 aa  116  3e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.297747  hitchhiker  0.00314525 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4745  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.03 
 
 
254 aa  116  3.9999999999999997e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.146753  normal  0.0678899 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1627  oxidoreductase  32.63 
 
 
255 aa  114  1.0000000000000001e-24  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1067  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.41 
 
 
258 aa  115  1.0000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4043  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.2 
 
 
254 aa  113  4.0000000000000004e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04715  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.62 
 
 
249 aa  113  4.0000000000000004e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.863639  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3364  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30.61 
 
 
239 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.115947  hitchhiker  0.00000000000000894376 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2065  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30.61 
 
 
239 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000861938  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2044  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30.2 
 
 
242 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.252391  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1819  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30.2 
 
 
242 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1793  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30.2 
 
 
242 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.512815  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1775  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30.2 
 
 
242 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1958  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30.2 
 
 
242 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1352  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.5 
 
 
272 aa  111  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.15703  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1964  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30.61 
 
 
239 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.130885  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1995  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30.61 
 
 
239 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.591310000000001e-44 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4636  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.79 
 
 
254 aa  111  2.0000000000000002e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1826  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30.61 
 
 
239 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1126  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.9 
 
 
338 aa  110  3e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5030  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.9 
 
 
248 aa  109  4.0000000000000004e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.574158  normal  0.46394 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1494  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30.61 
 
 
239 aa  109  4.0000000000000004e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000128809  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0488  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.15 
 
 
261 aa  109  5e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7167  short chain dehydrogenase  31.78 
 
 
249 aa  108  1e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0302  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.74 
 
 
232 aa  108  1e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0295505  normal  0.114297 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2536  short chain dehydrogenase  33.16 
 
 
241 aa  106  3e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1097  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.24 
 
 
247 aa  106  4e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000264481  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4049  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.68 
 
 
238 aa  106  5e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3217  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.88 
 
 
247 aa  105  6e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0808  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.51 
 
 
252 aa  105  8e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3453  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.71 
 
 
267 aa  105  8e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.282255  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5892  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.2 
 
 
240 aa  104  1e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.197583  normal  0.684579 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3967  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.52 
 
 
264 aa  105  1e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0321162  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1147  short chain dehydrogenase  35.38 
 
 
261 aa  105  1e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11068  oxidoreductase  34.69 
 
 
301 aa  104  1e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.205536 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0044  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.31 
 
 
264 aa  104  1e-21  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0159  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30 
 
 
249 aa  103  2e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.410897  normal  0.168063 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3131  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.49 
 
 
245 aa  104  2e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1787  short chain dehydrogenase  36.22 
 
 
258 aa  104  2e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2238  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.99 
 
 
317 aa  104  2e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3240  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.1 
 
 
264 aa  104  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.538223  normal  0.0864217 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2186  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.45 
 
 
248 aa  104  2e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0361624 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2917  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.95 
 
 
282 aa  103  2e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3138  short chain dehydrogenase  35.23 
 
 
260 aa  104  2e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0721208  normal 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3251  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.36 
 
 
259 aa  103  3e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4660  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.62 
 
 
261 aa  103  3e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.268545  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3950  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.48 
 
 
246 aa  103  3e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.661417  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3071  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 
258 aa  103  3e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.13463  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1293  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.48 
 
 
246 aa  103  3e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.252649  hitchhiker  0.0000000000000846656 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3908  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.52 
 
 
272 aa  103  4e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.106718  normal  0.186536 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1263  short chain dehydrogenase  35.9 
 
 
270 aa  102  5e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1110  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.51 
 
 
246 aa  102  5e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2737  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.71 
 
 
245 aa  102  5e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0992  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family  34.07 
 
 
264 aa  102  5e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3017  short chain dehydrogenase  33.68 
 
 
260 aa  102  6e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2554  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.64 
 
 
285 aa  102  6e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3738  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.74 
 
 
245 aa  102  6e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.880926  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1566  short chain dehydrogenase  36.36 
 
 
258 aa  102  7e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3838  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.73 
 
 
247 aa  102  8e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.483923  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2831  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.87 
 
 
264 aa  102  8e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4205  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  33.52 
 
 
264 aa  102  9e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3674  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.04 
 
 
246 aa  102  9e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.119797  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2764  short chain dehydrogenase  35.86 
 
 
258 aa  101  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.191986  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2470  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.8 
 
 
244 aa  101  1e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47104  non ribosomal peptide synthase  28.28 
 
 
1367 aa  101  1e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4042  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  32.97 
 
 
264 aa  100  2e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4244  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family  33.52 
 
 
264 aa  101  2e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3889  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  33.52 
 
 
264 aa  101  2e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.674087  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1020  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.98 
 
 
246 aa  100  2e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0122832  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4357  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  32.97 
 
 
264 aa  100  2e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0736  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.36 
 
 
272 aa  100  2e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3899  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30.92 
 
 
246 aa  101  2e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000498723  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4316  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.33 
 
 
267 aa  101  2e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.691417  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4268  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family  32.97 
 
 
264 aa  100  2e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8706  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.2 
 
 
255 aa  100  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2998  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.06 
 
 
261 aa  100  2e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3687  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.57 
 
 
243 aa  101  2e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3893  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.61 
 
 
246 aa  100  3e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3702  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.61 
 
 
246 aa  100  3e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.852261  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3592  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.61 
 
 
246 aa  100  3e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3610  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.61 
 
 
246 aa  100  3e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4158  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family  32.97 
 
 
264 aa  100  3e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3989  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.61 
 
 
246 aa  100  3e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0408742  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3865  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.61 
 
 
246 aa  100  3e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.78131e-47 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3488  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.86 
 
 
239 aa  100  3e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.640458 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2479  short chain dehydrogenase  33.79 
 
 
279 aa  100  3e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1951  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.36 
 
 
247 aa  100  4e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00262535 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2461  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.98 
 
 
242 aa  99.8  4e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.162516  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>