More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_2917 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_2917  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
282 aa  565  1e-160  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3844  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.61 
 
 
271 aa  128  1.0000000000000001e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6486  hypothetical protein  36.4 
 
 
278 aa  112  9e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10780  short chain dehydrogenase  33.2 
 
 
275 aa  109  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1597  short chain dehydrogenase  32.18 
 
 
274 aa  103  2e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5160  short chain dehydrogenase  32.95 
 
 
274 aa  103  3e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.694924 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4964  short chain dehydrogenase  32.57 
 
 
281 aa  101  1e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.337953 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4581  short chain dehydrogenase  32.57 
 
 
281 aa  101  1e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4669  short chain dehydrogenase  32.57 
 
 
281 aa  101  1e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2206  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.6 
 
 
261 aa  98.2  1e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0587036  normal  0.882414 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6377  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.85 
 
 
252 aa  97.4  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.185899  normal  0.130679 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6080  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.85 
 
 
252 aa  97.1  3e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.952753 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4660  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.31 
 
 
261 aa  94  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.268545  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1374  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.75 
 
 
253 aa  94  3e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.542817  normal  0.89387 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2753  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.87 
 
 
260 aa  92.4  7e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.53957  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6443  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.92 
 
 
259 aa  92.4  7e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0150364  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6034  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.92 
 
 
249 aa  92.4  8e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.311099  normal  0.357873 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1386  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.92 
 
 
251 aa  92.4  8e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4948  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.07 
 
 
252 aa  91.7  1e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3212  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.07 
 
 
252 aa  91.7  1e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4610  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.92 
 
 
261 aa  90.9  2e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4569  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.48 
 
 
244 aa  91.3  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.998929  normal  0.700957 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4887  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.62 
 
 
264 aa  90.5  3e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.845571  normal  0.46236 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0455  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.3 
 
 
269 aa  89.7  5e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3000  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.47 
 
 
241 aa  89.4  5e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1787  short chain dehydrogenase  34.24 
 
 
258 aa  89.4  6e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1302  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 
258 aa  89.4  6e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.12307  hitchhiker  0.00977234 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4559  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.08 
 
 
244 aa  89.4  6e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0125509  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2158  glucose 1-dehydrogenase  31.72 
 
 
250 aa  89.4  7e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0951  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.45 
 
 
261 aa  89  9e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05318  hypothetical protein similar to nonribosomal peptide synthetase 10 (Broad)  29.92 
 
 
1270 aa  88.2  1e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.556036  normal  0.849429 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4295  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.6 
 
 
244 aa  88.6  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2262  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.56 
 
 
244 aa  88.2  1e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.0000989308  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3758  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.55 
 
 
299 aa  88.6  1e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.297651  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1945  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.31 
 
 
258 aa  88.2  1e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1171  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.6 
 
 
238 aa  88.2  1e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.399765 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3779  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.89 
 
 
266 aa  87.4  2e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  hitchhiker  0.00111461  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5364  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.48 
 
 
267 aa  87.8  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.676071  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4216  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.5 
 
 
252 aa  87.8  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.746291 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2420  gluconate dehydrogenase  30.96 
 
 
253 aa  87.4  2e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.406064  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5867  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.48 
 
 
244 aa  87.4  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2838  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.98 
 
 
253 aa  87  3e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0908  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.62 
 
 
257 aa  87  3e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.117831  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0876  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.59 
 
 
255 aa  87  3e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.389264  normal  0.105725 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5539  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.13 
 
 
244 aa  87  3e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.101629  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3017  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.1 
 
 
250 aa  87  3e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6998  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.41 
 
 
244 aa  86.7  4e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5653  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.49 
 
 
251 aa  86.3  5e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.383425 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3104  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30 
 
 
252 aa  85.9  6e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6401  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.49 
 
 
249 aa  85.9  7e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.476786  normal  0.058074 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0154  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.84 
 
 
261 aa  85.5  9e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6423  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.41 
 
 
244 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2071  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.55 
 
 
239 aa  85.1  0.000000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.420603  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3138  short chain dehydrogenase  30.85 
 
 
260 aa  85.1  0.000000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0721208  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2306  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.71 
 
 
253 aa  84.3  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5858  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.87 
 
 
244 aa  84  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3017  short chain dehydrogenase  31.38 
 
 
260 aa  84.3  0.000000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3793  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.77 
 
 
253 aa  84.3  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3124  short chain dehydrogenase  35.11 
 
 
262 aa  84.3  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4089  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.98 
 
 
234 aa  84.3  0.000000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4247  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.46 
 
 
275 aa  84.3  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.286455  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3367  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.95 
 
 
244 aa  84  0.000000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4180  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.92 
 
 
253 aa  84  0.000000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0388  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.43 
 
 
269 aa  83.6  0.000000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.14599 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4015  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.51 
 
 
266 aa  83.6  0.000000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.800927  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1337  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  31.58 
 
 
238 aa  83.6  0.000000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.541378  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2764  short chain dehydrogenase  30.43 
 
 
258 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.191986  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1626  3-hydroxy acid dehydrogenase  28.57 
 
 
248 aa  83.2  0.000000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000177661  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13074  short chain dehydrogenase  29.49 
 
 
287 aa  83.6  0.000000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.486367 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0660  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.15 
 
 
284 aa  83.2  0.000000000000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09810  short-chain alcohol dehydrogenase  33.73 
 
 
261 aa  82.8  0.000000000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0913042  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4328  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.19 
 
 
294 aa  83.2  0.000000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0551  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.53 
 
 
275 aa  83.2  0.000000000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01498  L-allo-threonine dehydrogenase, NAD(P)-binding  28.57 
 
 
248 aa  82.8  0.000000000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000675994  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2106  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.57 
 
 
248 aa  82.8  0.000000000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000149507  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6264  short chain dehydrogenase  30.8 
 
 
703 aa  82.8  0.000000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.340053  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05820  rhamnulose-1-phosphate aldolase/alcohol dehydrogenase  34.27 
 
 
689 aa  82.8  0.000000000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3132  glucose-1-dehydrogenase  31.35 
 
 
261 aa  82.8  0.000000000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2155  3-hydroxy acid dehydrogenase  28.57 
 
 
248 aa  82.8  0.000000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000180953  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0330  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.8 
 
 
254 aa  82.8  0.000000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3907  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.32 
 
 
246 aa  82.8  0.000000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.267776 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2766  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.87 
 
 
244 aa  82.8  0.000000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.240645  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01509  hypothetical protein  28.57 
 
 
248 aa  82.8  0.000000000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000865743  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1748  3-hydroxy acid dehydrogenase  28.57 
 
 
248 aa  82.8  0.000000000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000124318  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3587  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.34 
 
 
254 aa  82.4  0.000000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.302231 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3908  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.41 
 
 
272 aa  82.4  0.000000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.106718  normal  0.186536 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2595  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.86 
 
 
254 aa  82.4  0.000000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1839  glucose 1-dehydrogenase  25.95 
 
 
263 aa  82.4  0.000000000000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0372378  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0062  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.16 
 
 
255 aa  82.4  0.000000000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.710312  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30890  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR protein  32 
 
 
252 aa  82  0.000000000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.972168  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1841  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  30.16 
 
 
250 aa  82.4  0.000000000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00165114  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1629  3-hydroxy acid dehydrogenase  28.16 
 
 
248 aa  82  0.000000000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  5.5514199999999995e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1096  glucose dehydrogenase  33.87 
 
 
244 aa  82  0.000000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0163868 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2119  3-hydroxy acid dehydrogenase  28.16 
 
 
248 aa  82  0.000000000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000142813  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2039  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.88 
 
 
250 aa  82  0.000000000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.664052 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2067  short chain dehydrogenase  30.85 
 
 
260 aa  82  0.000000000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0224014 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4612  glucose-1-dehydrogenase  28.96 
 
 
261 aa  82  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.548081  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1918  short chain dehydrogenase  31.74 
 
 
252 aa  82  0.00000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.633362  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1481  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.84 
 
 
239 aa  82  0.00000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.175599  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1363  short chain dehydrogenase  29.89 
 
 
258 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.737736 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>