More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_0453 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_0453  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
225 aa  458  9.999999999999999e-129  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1925  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  59.73 
 
 
225 aa  270  1e-71  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.452035  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05445  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family protein  54.98 
 
 
227 aa  245  3e-64  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3274  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.06 
 
 
233 aa  186  2e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.883465  normal  0.897297 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2524  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.16 
 
 
254 aa  103  2e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.16188  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4376  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.4 
 
 
285 aa  102  6e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.896027  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4299  putative short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.03 
 
 
291 aa  101  8e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1368  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.74 
 
 
283 aa  101  9e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1468  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.92 
 
 
277 aa  100  2e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.875416  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1385  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.52 
 
 
248 aa  100  2e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0425  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.64 
 
 
241 aa  99.8  3e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.116852  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2901  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.36 
 
 
256 aa  99  5e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0631  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.77 
 
 
265 aa  98.6  7e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.76513  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2297  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.22 
 
 
267 aa  98.6  7e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0843841 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4937  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  31.67 
 
 
239 aa  98.2  8e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.396795  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6101  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.97 
 
 
285 aa  97.4  2e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0097  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.92 
 
 
262 aa  96.7  2e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1520  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.88 
 
 
287 aa  97.1  2e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1059  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.87 
 
 
284 aa  97.4  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.102631 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1783  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.29 
 
 
264 aa  97.4  2e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.314701  normal  0.825727 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3278  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.16 
 
 
276 aa  96.7  3e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.28535  normal  0.153995 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2206  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.53 
 
 
276 aa  96.3  4e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.56422  normal  0.0351935 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6378  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.71 
 
 
280 aa  96.3  4e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0226  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.13 
 
 
259 aa  96.3  4e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.996462  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4967  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.58 
 
 
254 aa  95.9  4e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1840  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.11 
 
 
279 aa  95.9  5e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.205485  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4792  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.51 
 
 
256 aa  95.5  5e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.438607  normal  0.336746 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3930  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.04 
 
 
274 aa  95.9  5e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4498  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.51 
 
 
256 aa  95.5  5e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.285018  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1996  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.8 
 
 
279 aa  95.1  8e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000141613  normal  0.0207226 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1211  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.98 
 
 
274 aa  95.1  8e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.12295  normal  0.414584 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0580  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.4 
 
 
255 aa  95.1  8e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3948  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.77 
 
 
236 aa  94.7  1e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.206698  normal  0.50217 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4411  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.57 
 
 
259 aa  94.7  1e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3798  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.51 
 
 
281 aa  94.7  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00884029  normal  0.105583 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36870  putative short-chain dehydrogenase  29.34 
 
 
286 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1946  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.45 
 
 
299 aa  93.6  2e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3299  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.05 
 
 
279 aa  94  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000868521 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2412  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.88 
 
 
248 aa  93.2  3e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.253805  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3245  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.38 
 
 
246 aa  92.8  3e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7123  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.64 
 
 
249 aa  93.2  3e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4623  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.43 
 
 
265 aa  92.4  5e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1452  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.05 
 
 
259 aa  92  6e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0433  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  29.83 
 
 
244 aa  92  6e-18  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00087459  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2515  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.42 
 
 
247 aa  92  6e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6443  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.65 
 
 
253 aa  92  7e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.246968  normal  0.169503 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6492  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.51 
 
 
282 aa  92  7e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1101  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.98 
 
 
250 aa  91.7  8e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2306  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.63 
 
 
284 aa  90.9  1e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.361211  hitchhiker  0.00000740353 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1675  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.26 
 
 
472 aa  91.3  1e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.438072 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5739  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.51 
 
 
282 aa  90.9  1e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.749773 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4348  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.57 
 
 
236 aa  91.3  1e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.823656 
 
 
-
 
NC_004310  BR0445  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  33.16 
 
 
246 aa  90.5  2e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2764  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.27 
 
 
293 aa  90.9  2e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.133433  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5145  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.8 
 
 
279 aa  90.5  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.016311  normal  0.275605 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2629  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.57 
 
 
317 aa  90.5  2e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0178  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.86 
 
 
247 aa  90.5  2e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000108862  hitchhiker  0.000102827 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0452  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  33.16 
 
 
255 aa  90.5  2e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8438  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.7 
 
 
236 aa  90.5  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3619  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.89 
 
 
247 aa  90.1  2e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00790972  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3215  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.5 
 
 
251 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.707751 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0313  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  31.78 
 
 
243 aa  90.9  2e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_10306  predicted protein  32.46 
 
 
267 aa  90.5  2e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.275208  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4292  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.33 
 
 
236 aa  90.5  2e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0244  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.24 
 
 
291 aa  89.7  3e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.864634 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1324  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.57 
 
 
244 aa  89.7  3e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.521571  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1472  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.68 
 
 
283 aa  89.7  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3640  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.56 
 
 
251 aa  89.7  3e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.137586 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1522  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.03 
 
 
254 aa  89.7  3e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0490038  normal  0.520511 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1973  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.98 
 
 
245 aa  90.1  3e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0324346  normal  0.993482 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2591  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.5 
 
 
250 aa  89.7  4e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.573259 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3641  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.63 
 
 
256 aa  89.4  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6893  putative 3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30.96 
 
 
266 aa  89.4  5e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00227102  normal  0.0503904 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3568  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 
253 aa  89  5e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0281  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.77 
 
 
255 aa  89  5e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000634692  hitchhiker  0.00117931 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2398  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.91 
 
 
247 aa  89  5e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.332896 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1152  putative Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.06 
 
 
258 aa  89  6e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3357  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.98 
 
 
255 aa  88.6  6e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1718  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.49 
 
 
253 aa  89  6e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1115  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.79 
 
 
281 aa  89  6e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.299534  normal  0.313819 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0042  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.5 
 
 
282 aa  88.6  7e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.144902 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2759  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 
261 aa  88.6  7e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0911  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.41 
 
 
246 aa  88.6  7e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.411552  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0559  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.64 
 
 
246 aa  88.2  8e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2775  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.26 
 
 
471 aa  88.6  8e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.477935  normal  0.498001 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0162  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.92 
 
 
246 aa  88.6  8e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0270  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.61 
 
 
263 aa  88.6  8e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1559  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.98 
 
 
258 aa  88.6  8e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00992918 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0706  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.94 
 
 
287 aa  88.2  9e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2801  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.11 
 
 
249 aa  88.2  9e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1050  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.8 
 
 
253 aa  88.2  9e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.150046 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2944  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.31 
 
 
291 aa  87.8  1e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0718028  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0348  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.51 
 
 
244 aa  88.2  1e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.708158  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3437  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.58 
 
 
262 aa  88.2  1e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1298  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  32.97 
 
 
249 aa  88.2  1e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.145366  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3543  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.99 
 
 
259 aa  87.8  1e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1180  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.22 
 
 
293 aa  87.8  1e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0727781  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4387  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33 
 
 
247 aa  87.4  1e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3917  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 
252 aa  87.4  1e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.139666  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1004  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.37 
 
 
234 aa  87.8  1e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.159825  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>