More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_05445 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014230  CA2559_05445  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family protein  100 
 
 
227 aa  459  9.999999999999999e-129  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1925  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.95 
 
 
225 aa  255  3e-67  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.452035  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0453  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.98 
 
 
225 aa  245  3e-64  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3274  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.35 
 
 
233 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.883465  normal  0.897297 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4299  putative short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.17 
 
 
291 aa  105  5e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4937  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  34.43 
 
 
239 aa  103  2e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.396795  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0295  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.69 
 
 
289 aa  101  1e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.312268  normal  0.0519409 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2524  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.63 
 
 
254 aa  100  2e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.16188  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5457  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.89 
 
 
291 aa  99.8  3e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4865  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.89 
 
 
291 aa  99.8  3e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.321588  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5405  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.89 
 
 
291 aa  99.8  3e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.403602  normal  0.010149 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6492  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.91 
 
 
282 aa  97.4  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0796  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.82 
 
 
281 aa  97.4  2e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.35999 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3619  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.52 
 
 
247 aa  97.1  2e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00790972  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4746  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.37 
 
 
293 aa  97.4  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.935944  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5291  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.37 
 
 
293 aa  97.4  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.993386  normal  0.426918 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0184  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  32.24 
 
 
239 aa  96.3  3e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0980  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.48 
 
 
238 aa  96.3  3e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000000633587  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000420  oxidoreductase short-chain dehydrogenase/reductase family  33.69 
 
 
239 aa  96.3  3e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.637186  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3206  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.97 
 
 
283 aa  96.7  3e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3278  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.98 
 
 
276 aa  96.3  4e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.28535  normal  0.153995 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1298  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  31.18 
 
 
249 aa  95.5  5e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.145366  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0395  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.02 
 
 
275 aa  95.9  5e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0244  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.74 
 
 
291 aa  95.5  5e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.864634 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3969  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.54 
 
 
253 aa  95.5  7e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1835  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.38 
 
 
244 aa  95.1  8e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.686329  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5739  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.38 
 
 
282 aa  95.1  8e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.749773 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3905  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.41 
 
 
282 aa  95.1  9e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.635531 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05303  oxidoreductase  32.43 
 
 
239 aa  94.4  1e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4822  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.09 
 
 
253 aa  94.4  1e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.237012  normal  0.451819 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6101  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.33 
 
 
285 aa  94.4  1e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2943  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.51 
 
 
282 aa  94  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.599912  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0599  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.86 
 
 
239 aa  94  2e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2375  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.17 
 
 
265 aa  93.6  2e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1352  oxidoreductase  28.39 
 
 
275 aa  93.6  2e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.904457  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0664  cylG protein  32.28 
 
 
240 aa  93.2  3e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1126  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.57 
 
 
338 aa  93.2  3e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0206  short chain dehydrogenase  33.52 
 
 
284 aa  93.2  3e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4042  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  32.65 
 
 
264 aa  92.8  4e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4268  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family  32.65 
 
 
264 aa  92.8  4e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4357  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  32.65 
 
 
264 aa  92.8  4e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4158  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family  32.65 
 
 
264 aa  92.8  4e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1468  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.92 
 
 
277 aa  92.8  4e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.875416  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3263  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase, putative  31.77 
 
 
255 aa  92.4  5e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2654  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.2 
 
 
265 aa  92.4  5e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5049  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.12 
 
 
250 aa  92.4  5e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.553116  normal  0.644711 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3798  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.51 
 
 
281 aa  92.4  5e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00884029  normal  0.105583 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3645  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.06 
 
 
268 aa  92.4  5e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2206  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.86 
 
 
276 aa  92  6e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.56422  normal  0.0351935 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7087  short chain dehydrogenase  32.42 
 
 
284 aa  92  6e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3299  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.79 
 
 
279 aa  92  7e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000868521 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1560  Short-chain dehydrogenase of various substrate specificities  32.63 
 
 
272 aa  92  7e-18  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2590  short chain dehydrogenase  38.27 
 
 
291 aa  91.7  8e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3881  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase  32.14 
 
 
264 aa  91.7  8e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2507  short chain dehydrogenase  38.89 
 
 
291 aa  91.7  8e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2783  short chain dehydrogenase  38.89 
 
 
291 aa  91.7  8e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0502462 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4057  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 
239 aa  91.7  8e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2629  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.43 
 
 
317 aa  91.7  9e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2778  short chain dehydrogenase  38.27 
 
 
281 aa  91.7  9e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.143428  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4205  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  32.49 
 
 
264 aa  91.3  1e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1096  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.37 
 
 
256 aa  91.3  1e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6378  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 
280 aa  90.9  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1765  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.03 
 
 
237 aa  91.3  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1914  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28 
 
 
225 aa  91.3  1e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4623  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.53 
 
 
265 aa  90.9  1e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3310  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.09 
 
 
276 aa  90.9  1e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3335  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.73 
 
 
246 aa  91.3  1e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2541  short chain dehydrogenase  37.88 
 
 
291 aa  90.5  2e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000142979  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3889  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  32.34 
 
 
264 aa  90.5  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.674087  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6298  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.85 
 
 
271 aa  90.5  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.1246  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1321  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.98 
 
 
282 aa  90.9  2e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.889604  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3745  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.19 
 
 
279 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2547  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.5 
 
 
272 aa  90.9  2e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.226537  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1840  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.05 
 
 
279 aa  90.5  2e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.205485  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09378  conserved hypothetical protein  35.83 
 
 
282 aa  89.7  3e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.141306 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5584  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.61 
 
 
344 aa  90.1  3e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.753226  normal  0.910238 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1999  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.56 
 
 
225 aa  90.1  3e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.570082  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0313  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  31.94 
 
 
239 aa  89.7  3e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00087118  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3141  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.79 
 
 
240 aa  90.1  3e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.76943  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01434  Short chain dehydrogenase family protein  31.71 
 
 
239 aa  89.7  3e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0250  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  33.33 
 
 
240 aa  89.7  4e-17  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.183431  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1039  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.13 
 
 
242 aa  89.4  4e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.967418  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2238  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.77 
 
 
317 aa  89.4  4e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0108  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.53 
 
 
254 aa  89  5e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0592411  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4618  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.31 
 
 
245 aa  89  5e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.978262  normal  0.20317 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2502  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.32 
 
 
279 aa  89  6e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.729969 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0544  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.67 
 
 
242 aa  88.6  7e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0425  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.86 
 
 
241 aa  88.6  7e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.116852  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3687  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.8 
 
 
243 aa  88.6  7e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3902  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.96 
 
 
246 aa  88.6  8e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.809389  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3333  short chain dehydrogenase  32.11 
 
 
280 aa  88.6  8e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2512  3-oxoacyl-(acyl-carrier protein) reductase  28.38 
 
 
236 aa  88.2  9e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0588198  normal  0.237046 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7123  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.19 
 
 
249 aa  88.2  9e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2582  short chain dehydrogenase  38.27 
 
 
291 aa  88.2  9e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0166341  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1321  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.84 
 
 
276 aa  88.2  9e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    decreased coverage  0.00000000000224332 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2555  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.9 
 
 
231 aa  88.2  9e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.459049  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1996  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.22 
 
 
279 aa  88.2  9e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000141613  normal  0.0207226 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4244  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family  32.49 
 
 
264 aa  88.2  9e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2505  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.9 
 
 
231 aa  88.2  9e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2585  short chain dehydrogenase  30.04 
 
 
239 aa  88.2  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>