More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_1925 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013162  Coch_1925  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
225 aa  463  9.999999999999999e-131  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.452035  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0453  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  59.73 
 
 
225 aa  270  1e-71  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05445  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family protein  55.95 
 
 
227 aa  255  3e-67  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3274  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.92 
 
 
233 aa  179  4e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.883465  normal  0.897297 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4937  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  37.43 
 
 
239 aa  108  9.000000000000001e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.396795  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0664  cylG protein  31.94 
 
 
240 aa  107  1e-22  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05303  oxidoreductase  34.05 
 
 
239 aa  102  5e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0684  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.91 
 
 
245 aa  100  2e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.015461  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2479  short chain dehydrogenase  36.81 
 
 
279 aa  100  2e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0433  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.18 
 
 
244 aa  99.8  3e-20  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00087459  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3310  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.87 
 
 
276 aa  99.8  3e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000420  oxidoreductase short-chain dehydrogenase/reductase family  32.97 
 
 
239 aa  97.4  1e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.637186  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3299  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.5 
 
 
279 aa  96.7  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000868521 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1994  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.8 
 
 
245 aa  97.1  2e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37020  short-chain dehydrogenase of unknown substrate specificity  33.52 
 
 
279 aa  97.4  2e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0086  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.86 
 
 
272 aa  97.1  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3206  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.69 
 
 
283 aa  95.9  5e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1115  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.58 
 
 
281 aa  95.5  6e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.299534  normal  0.313819 
 
 
-
 
NC_003296  RS05466  dehydrogenase oxidoreductase protein  29.17 
 
 
255 aa  94  1e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.968817  normal  0.104137 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2512  3-oxoacyl-(acyl-carrier protein) reductase  28.89 
 
 
236 aa  94.7  1e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0588198  normal  0.237046 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0480  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.51 
 
 
243 aa  94.4  1e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.853199  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6492  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.97 
 
 
282 aa  94.4  1e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5739  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.97 
 
 
282 aa  94.4  1e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.749773 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3687  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.51 
 
 
243 aa  94.4  1e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3905  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.51 
 
 
282 aa  93.6  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.635531 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2524  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.32 
 
 
254 aa  94  2e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.16188  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2775  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30.38 
 
 
471 aa  94  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.477935  normal  0.498001 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4746  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.76 
 
 
293 aa  93.6  2e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.935944  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0824  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.34 
 
 
243 aa  94  2e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5291  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.76 
 
 
293 aa  93.6  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.993386  normal  0.426918 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1616  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.42 
 
 
248 aa  93.6  2e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0140794 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2698  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.84 
 
 
241 aa  93.6  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.682168  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0509  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  29.71 
 
 
245 aa  93.2  3e-18  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2359  short chain dehydrogenase  31.13 
 
 
277 aa  93.2  3e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0184  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  31.15 
 
 
239 aa  93.2  3e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2515  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.75 
 
 
247 aa  92.8  3e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4057  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.51 
 
 
239 aa  93.2  3e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1406  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.81 
 
 
267 aa  93.2  3e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0615665  normal  0.271714 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0934  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  29.17 
 
 
247 aa  92.8  3e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00491532  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4758  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.16 
 
 
227 aa  92.4  4e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1671  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.2 
 
 
246 aa  92.8  4e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1675  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  29.36 
 
 
472 aa  92.8  4e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.438072 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2507  short chain dehydrogenase  30.88 
 
 
661 aa  92.8  4e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0313  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.81 
 
 
239 aa  92.4  6e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00087118  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000603  putative 3-oxoacyl-(acyl carrier protein) reductase  30.21 
 
 
239 aa  92  7e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0031423  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0580  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.84 
 
 
255 aa  91.7  7e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0348  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.67 
 
 
244 aa  92  7e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.708158  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2367  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.86 
 
 
241 aa  91.7  8e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0818645 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1303  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.02 
 
 
258 aa  91.7  9e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11090  Short-chain dehydrogenase/reductase  27.57 
 
 
286 aa  91.3  1e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1403  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.98 
 
 
244 aa  91.3  1e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2629  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.09 
 
 
317 aa  91.3  1e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4865  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.76 
 
 
291 aa  91.3  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.321588  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2202  short chain dehydrogenase  31.6 
 
 
276 aa  91.7  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.516821  decreased coverage  0.00204142 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5457  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.76 
 
 
291 aa  91.3  1e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1468  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.69 
 
 
277 aa  90.9  1e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.875416  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2717  short chain dehydrogenase  34.25 
 
 
276 aa  90.9  1e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5405  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.76 
 
 
291 aa  91.3  1e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.403602  normal  0.010149 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0599  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.45 
 
 
239 aa  91.3  1e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1687  short chain dehydrogenase  32.86 
 
 
279 aa  90.9  1e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4141  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  30.63 
 
 
243 aa  90.5  2e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1299  fatty acyl-CoA reductase protein  32.55 
 
 
295 aa  90.5  2e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0244  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.27 
 
 
291 aa  90.9  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.864634 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0425  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.19 
 
 
241 aa  90.5  2e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.116852  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2798  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.1 
 
 
235 aa  90.1  2e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1560  Short-chain dehydrogenase of various substrate specificities  33.17 
 
 
272 aa  90.9  2e-17  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4967  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.44 
 
 
254 aa  90.9  2e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2183  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.76 
 
 
244 aa  90.5  2e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.389501 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0295  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.05 
 
 
289 aa  90.5  2e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.312268  normal  0.0519409 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3263  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase, putative  32.46 
 
 
255 aa  89.7  3e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3278  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.1 
 
 
276 aa  89.7  3e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.28535  normal  0.153995 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2828  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.61 
 
 
250 aa  89.7  3e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0152  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.15 
 
 
223 aa  89.7  3e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1309  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.88 
 
 
267 aa  89.7  3e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1171  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.05 
 
 
238 aa  89.4  4e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.399765 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2194  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.68 
 
 
255 aa  89.4  4e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000131904  normal  0.0140674 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1840  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.65 
 
 
279 aa  89.7  4e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.205485  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5104  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.52 
 
 
284 aa  89.4  4e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5725  short chain dehydrogenase  31.25 
 
 
277 aa  89.4  4e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.519964  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4537  short chain dehydrogenase  31.13 
 
 
277 aa  89.4  4e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.791689 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2007  short chain dehydrogenase  31.6 
 
 
276 aa  89.7  4e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.372157  normal  0.691247 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0925  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  31.94 
 
 
251 aa  89.4  4e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.568448  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0964  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.69 
 
 
306 aa  89.4  5e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6919  short chain dehydrogenase  31.75 
 
 
276 aa  89  5e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5138  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.28 
 
 
248 aa  89  5e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2231  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.6 
 
 
253 aa  89.4  5e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0178  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.62 
 
 
247 aa  89  5e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000108862  hitchhiker  0.000102827 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0313  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  32.47 
 
 
243 aa  89  5e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4498  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.71 
 
 
256 aa  89  5e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.285018  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4792  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.71 
 
 
256 aa  89  5e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.438607  normal  0.336746 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0452  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  31.28 
 
 
255 aa  89  6e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1623  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  28.99 
 
 
244 aa  89  6e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000163996  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5709  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.49 
 
 
347 aa  89  6e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1379  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.77 
 
 
292 aa  88.6  6e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0182353  hitchhiker  0.000251864 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1360  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  31.13 
 
 
243 aa  89  6e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000000468393  normal  0.0479743 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0026  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.78 
 
 
269 aa  89  6e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09158  short chain dehydrogenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G01040)  34.41 
 
 
251 aa  88.6  7e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0445  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  31.46 
 
 
246 aa  88.6  7e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1321  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.62 
 
 
282 aa  88.6  7e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.889604  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1615  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.82 
 
 
235 aa  88.6  7e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>