137 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_E4634 on replicon NC_010658
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_0714  aerobactin siderophore biosynthesis protein IucA  63.4 
 
 		 590 aa  710    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0922  IucA/IucC family protein  65.05 
 
 		 581 aa  733    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.285296  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0786  IucA/IucC family protein  63.4 
 
 		 590 aa  710    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3182  aerobactin siderophore biosynthesis protein IucA  94.6 
 
 		 574 aa  1134    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4634  aerobactin synthase, IucA component  100 
 
 		 574 aa  1191    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0947  IucA/IucC family protein  82.72 
 
 		 574 aa  988    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.251332  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0585  IucA/IucC family protein  37.2 
 
 		 925 aa  353  4e-96  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0175917 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5062  IucA/IucC family protein  33.22 
 
 		 588 aa  274  4.0000000000000004e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00806169 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3257  IucA/IucC family protein  31.02 
 
 		 584 aa  266  8.999999999999999e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1814  siderophore synthetase component, IucA/IucC  29.17 
 
 		 560 aa  231  3e-59  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00455454  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0215  IucA/IucC family protein  31.2 
 
 		 645 aa  221  1.9999999999999999e-56  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0410  IucA/IucC  29.45 
 
 		 578 aa  207  5e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.4179  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2837  IucA/IucC  30.56 
 
 		 606 aa  204  3e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.296013  normal  0.292104 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3331  IucA/IucC family protein  29.64 
 
 		 601 aa  200  5e-50  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1844  IucA/IucC family protein  28.38 
 
 		 602 aa  197  6e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0027586  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1812  siderophore biosynthesis protein  27.88 
 
 		 602 aa  189  1e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000021038  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1795  siderophore biosynthesis protein  27.88 
 
 		 602 aa  188  3e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1838  siderophore biosynthesis protein  26.92 
 
 		 602 aa  187  4e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.846084  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1981  siderophore biosynthesis protein  26.92 
 
 		 602 aa  187  4e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.978268  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3334  IucA/IucC family protein  28.28 
 
 		 591 aa  186  8e-46  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2016  petrobactin biosynthesis protein AsbA  27.71 
 
 		 602 aa  186  9e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.2796000000000001e-41 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3346  petrobactin biosynthesis protein AsbA  27.71 
 
 		 602 aa  184  3e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00585589  hitchhiker  0.0000000000000409747 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1983  petrobactin biosynthesis protein AsbA  27.38 
 
 		 602 aa  183  8.000000000000001e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0967971  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0591  siderophore biosynthesis protein  27.94 
 
 		 810 aa  179  8e-44  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.124028  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3172  IucA/IucC family protein  25.22 
 
 		 818 aa  175  1.9999999999999998e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4016  IucA/IucC family protein  30.63 
 
 		 595 aa  171  3e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0306734  normal  0.343521 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2302  siderophore synthetase component  29.79 
 
 		 609 aa  171  5e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.867655  normal  0.869204 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1808  IucA/IucC family protein  28.85 
 
 		 601 aa  167  4e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.653544  normal  0.276743 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4392  IucA/IucC  30.02 
 
 		 596 aa  167  5e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3760  IucA/IucC family protein  30 
 
 		 594 aa  165  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.130185 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3522  IucA/IucC family protein  28.3 
 
 		 610 aa  163  6e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2632  IucA/IucC family protein  28.86 
 
 		 593 aa  163  7e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4055  IucA/IucC family protein  30 
 
 		 594 aa  163  7e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0250939  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4056  IucA/IucC  25.38 
 
 		 672 aa  157  5.0000000000000005e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.512402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0660  IucA/IucC family protein  29.25 
 
 		 570 aa  149  2.0000000000000003e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00702947  normal  0.916687 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3139  IucA/IucC family protein  28.8 
 
 		 586 aa  148  3e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0718  iron transporter  26.58 
 
 		 613 aa  143  9e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0698719 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0107  IucA/IucC family protein  24.49 
 
 		 578 aa  140  7.999999999999999e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0111  IucA/IucC family protein  24.49 
 
 		 578 aa  140  7.999999999999999e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1113  IucA/IucC  27.19 
 
 		 608 aa  139  2e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00878  siderophore biosynthesis protein  26.36 
 
 		 611 aa  136  9.999999999999999e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0338478  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0586  IucA/IucC  26.92 
 
 		 1148 aa  131  4.0000000000000003e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4783  IucA/IucC  26.72 
 
 		 610 aa  126  1e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001063  vibrioferrin amide bond forming protein PvsD  23.76 
 
 		 580 aa  121  3e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01928  iron transporter  25.83 
 
 		 576 aa  115  2.0000000000000002e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6952  IucA/IucC family protein  24.86 
 
 		 1153 aa  107  5e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09310  siderophore biosynthesis protein, IucA/IucC family  27.66 
 
 		 586 aa  107  6e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00047621  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2971  IucA/IucC family protein  28.03 
 
 		 555 aa  107  7e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.963882 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3094  iron transporter  27.72 
 
 		 584 aa  104  4e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3750  IucA/IucC family protein  27.52 
 
 		 599 aa  103  7e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1276  IucA/IucC  26.18 
 
 		 684 aa  101  3e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8365  putative iron transport protein  27.46 
 
 		 519 aa  100  7e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2658  IucA/IucC family protein  25.99 
 
 		 572 aa  77.8  0.0000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.539637  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2584  IucA/IucC  24.87 
 
 		 594 aa  77  0.0000000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0652267  decreased coverage  0.000722878 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3180  aerobactin siderophore biosynthesis protein IucC  27.36 
 
 		 580 aa  77  0.0000000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4632  aerobactin synthase, IucC component  26.14 
 
 		 580 aa  77  0.0000000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1779  hypothetical protein  23.82 
 
 		 585 aa  72  0.00000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.762831  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2677  IucA/IucC family protein  25.88 
 
 		 628 aa  71.6  0.00000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.211511  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0949  IucA/IucC family protein  26.73 
 
 		 577 aa  71.6  0.00000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2212  hypothetical protein  24.58 
 
 		 656 aa  70.1  0.0000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2251  hypothetical protein  24.58 
 
 		 656 aa  70.1  0.0000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4056  IucA/IucC family protein  27.12 
 
 		 998 aa  70.1  0.0000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.88864  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1652  siderophore synthase  22.57 
 
 		 588 aa  67  0.0000000008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2210  hypothetical protein  23.08 
 
 		 585 aa  67  0.0000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2249  hypothetical protein  23.08 
 
 		 585 aa  67  0.0000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0712  aerobactin siderophore biosynthesis protein IucC  24.03 
 
 		 582 aa  67  0.0000000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0192  aerobactin siderophore biosynthesis protein IucC  24.03 
 
 		 582 aa  67  0.000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000752976 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0784  IucA/IucC family protein  24.03 
 
 		 582 aa  67  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4017  IucA/IucC family protein  26.75 
 
 		 991 aa  65.5  0.000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0297482  normal  0.327782 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1839  siderophore biosynthesis protein  22.36 
 
 		 610 aa  64.3  0.000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1813  siderophore biosynthesis protein  22.36 
 
 		 610 aa  64.3  0.000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00844264  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1982  siderophore biosynthesis protein  22.36 
 
 		 612 aa  64.3  0.000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2017  petrobactin biosynthesis protein AsbB  22.36 
 
 		 610 aa  64.3  0.000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.0614699999999996e-42 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3761  IucA/IucC family protein  25.81 
 
 		 998 aa  64.3  0.000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0951466 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0920  IucA/IucC family protein  24.29 
 
 		 582 aa  63.9  0.000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.185756  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1812  siderophore synthetase component, IucA/IucC  23.02 
 
 		 578 aa  62.8  0.00000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3255  IucA/IucC family protein  23.91 
 
 		 621 aa  62.4  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0108  IucA/IucC family protein  19.47 
 
 		 592 aa  62  0.00000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0112  IucA/IucC family protein  19.47 
 
 		 592 aa  62  0.00000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2439  IucA/IucC family siderophore biosynthesis protein  24.63 
 
 		 604 aa  61.6  0.00000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4393  IucA/IucC  23.7 
 
 		 577 aa  61.2  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1781  hypothetical protein  22.8 
 
 		 653 aa  60.5  0.00000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.478071  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1796  siderophore biosynthesis protein  22.05 
 
 		 610 aa  60.1  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2836  IucA/IucC family protein  21.75 
 
 		 608 aa  60.1  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.160458  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1811  IucA/IucC family protein  26.77 
 
 		 599 aa  59.7  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2631  IucA/IucC family protein  23.85 
 
 		 577 aa  60.1  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0181  IucA/IucC family protein  25.53 
 
 		 655 aa  59.7  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2674  IucA/IucC family protein  22.29 
 
 		 618 aa  59.7  0.0000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.247069  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2301  siderophore synthetase component  24.5 
 
 		 562 aa  59.3  0.0000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.800261 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1801  IucA/IucC family protein  24.72 
 
 		 799 aa  58.9  0.0000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.0000155987  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3523  IucA/IucC family protein  24.63 
 
 		 615 aa  58.5  0.0000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3734  IucA/IucC family protein  24.61 
 
 		 563 aa  58.9  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0245205  normal  0.144633 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2538  IucA/IucC family protein  24.33 
 
 		 604 aa  58.2  0.0000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.836144  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2587  IucA/IucC  28.25 
 
 		 619 aa  57.4  0.0000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.296644  hitchhiker  0.00946712 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1452  IucA/IucC family protein  20.84 
 
 		 629 aa  57.4  0.0000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00879  siderophore biosynthesis protein  25.25 
 
 		 589 aa  57.4  0.0000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0128879  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3032  siderophore biosynthesis protein, putative  23.31 
 
 		 601 aa  56.6  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3682  IucA/IucC  26.56 
 
 		 637 aa  56.6  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2672  IucA/IucC family protein  28.72 
 
 		 637 aa  56.2  0.000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5060  IucA/IucC family protein  23.85 
 
 		 615 aa  55.8  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00130311 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>