More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_3619 on replicon NC_009427
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009427  Saro_3619  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 		 289 aa  591  1e-168  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2873  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.29 
 
 		 288 aa  234  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0728851  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4561  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.32 
 
 		 289 aa  197  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0163818  normal  0.320822 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0295  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.85 
 
 		 286 aa  186  5e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0304  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.85 
 
 		 286 aa  186  5e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.169713  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0314  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.85 
 
 		 286 aa  186  5e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.300458 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1491  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.5 
 
 		 274 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.106015  normal  0.290492 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3313  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.6 
 
 		 269 aa  159  4e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000066443  unclonable  0.000000222131 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1437  hypothetical protein  37.21 
 
 		 300 aa  154  1e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0211064 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1478  hypothetical protein  37.21 
 
 		 300 aa  155  1e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.520899  normal  0.0228599 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1038  hypothetical protein  34.69 
 
 		 289 aa  151  1e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.357237  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2115  hypothetical protein  41.86 
 
 		 292 aa  150  2e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1846  hypothetical protein  33.1 
 
 		 300 aa  146  3e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.124787 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1934  hypothetical protein  33.33 
 
 		 300 aa  142  7e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0777827  normal  0.376049 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1769  hypothetical protein  35.27 
 
 		 300 aa  141  9.999999999999999e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.657278  normal  0.187147 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2561  hypothetical protein  33.07 
 
 		 301 aa  141  1.9999999999999998e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.226357  normal  0.190933 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3363  hypothetical protein  35.38 
 
 		 301 aa  140  3e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.276324  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0158  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.34 
 
 		 271 aa  139  3.9999999999999997e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.722445  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1415  hypothetical protein  33.08 
 
 		 300 aa  139  7e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2003  hypothetical protein  36.29 
 
 		 301 aa  138  1e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.122286  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1700  hypothetical protein  36.29 
 
 		 301 aa  138  1e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.971 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0417  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.16 
 
 		 247 aa  136  3.0000000000000003e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3322  short chain dehydrogenase  36.36 
 
 		 588 aa  136  5e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.178301 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3311  short chain dehydrogenase  36.36 
 
 		 588 aa  136  5e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.768628  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3373  short chain dehydrogenase  36.36 
 
 		 588 aa  136  5e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.855673  normal  0.12205 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2868  hypothetical protein  34.38 
 
 		 301 aa  135  7.000000000000001e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.596125  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1784  hypothetical protein  34.31 
 
 		 305 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.59437 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2488  hypothetical protein  33.07 
 
 		 304 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2430  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.71 
 
 		 285 aa  133  3e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2443  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.59 
 
 		 300 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2268  hypothetical protein  32.96 
 
 		 304 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.484059  normal  0.281645 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5043  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.2 
 
 		 300 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.680577 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0101  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  37.1 
 
 		 302 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0120  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  37.1 
 
 		 302 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1074  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  37.1 
 
 		 302 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2673  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  37.1 
 
 		 302 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.181377  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2820  dehydrogenases with different specificities  37.1 
 
 		 302 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0404  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  37.1 
 
 		 302 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12242  short chain dehydrogenase  34.73 
 
 		 592 aa  130  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0208017  normal  0.29752 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1539  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  37.1 
 
 		 302 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1262  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  37.1 
 
 		 302 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4479  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.23 
 
 		 276 aa  130  3e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0643496  normal  0.318534 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3975  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.48 
 
 		 276 aa  130  3e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3989  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.48 
 
 		 276 aa  130  3e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.171067  normal  0.181158 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4049  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.48 
 
 		 276 aa  130  3e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2216  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.85 
 
 		 276 aa  129  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.742045 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3856  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.46 
 
 		 300 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.514987 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2833  hypothetical protein  33.57 
 
 		 309 aa  126  4.0000000000000003e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.643398 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4697  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.95 
 
 		 300 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.858083  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5413  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.19 
 
 		 308 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3665  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.95 
 
 		 300 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.196954  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8731  short chain dehydrogenase  37.66 
 
 		 590 aa  126  4.0000000000000003e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.199229  normal  0.347677 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5364  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.9 
 
 		 267 aa  126  5e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.676071  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1295  short chain dehydrogenase  38.12 
 
 		 602 aa  126  5e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.101432  normal  0.699766 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0520  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.78 
 
 		 602 aa  125  7e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2914  hypothetical protein  33.07 
 
 		 301 aa  125  1e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.445134  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3398  short chain dehydrogenase  39.55 
 
 		 595 aa  124  2e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5317  short chain dehydrogenase  39.55 
 
 		 595 aa  124  2e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.247804  normal  0.120372 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3569  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.69 
 
 		 308 aa  124  2e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.683076  hitchhiker  0.00146118 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4969  short chain dehydrogenase  39.55 
 
 		 595 aa  124  2e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.300188  normal  0.358584 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13102  short-chain type dehydrogenase/reductase  38.42 
 
 		 276 aa  124  3e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.432292  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2287  hypothetical protein  30.53 
 
 		 298 aa  123  4e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0709  short chain dehydrogenase  39.52 
 
 		 595 aa  122  5e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.944679  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0115  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.92 
 
 		 278 aa  122  6e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2798  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.82 
 
 		 256 aa  122  7e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0793  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.08 
 
 		 310 aa  122  8e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.190304  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6766  putative short-chain dehydrogenase  37.62 
 
 		 279 aa  121  9.999999999999999e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.353478  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1538  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR:glucose/ribitol dehydrogenase  33.86 
 
 		 269 aa  121  9.999999999999999e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0217494  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1359  short chain dehydrogenase  37.22 
 
 		 602 aa  121  9.999999999999999e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11271  short-chain type dehydrogenase/reductase  36.89 
 
 		 276 aa  121  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000317139  hitchhiker  0.0033897 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4910  short chain dehydrogenase  39.55 
 
 		 595 aa  120  3e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0391  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.31 
 
 		 279 aa  120  3e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.319463  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3649  short chain dehydrogenase  38.64 
 
 		 595 aa  120  3e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.236438  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44570  putative short-chain dehydrogenase  36.27 
 
 		 295 aa  119  7.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.30545 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1808  short chain dehydrogenase  38.86 
 
 		 596 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.67175  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4391  short chain dehydrogenase  38.64 
 
 		 618 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.21601 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2174  short chain dehydrogenase  38.86 
 
 		 596 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.828892  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0820  short chain dehydrogenase  38.86 
 
 		 596 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0913  short chain dehydrogenase  38.86 
 
 		 596 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.427766  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3796  putative short-chain dehydrogenase  36.27 
 
 		 295 aa  117  3e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.205058  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1266  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 		 278 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.343225  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2356  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.27 
 
 		 282 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0998128  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3753  short chain dehydrogenase  32.02 
 
 		 294 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0637159 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3510  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.95 
 
 		 251 aa  114  2.0000000000000002e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.439576 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2621  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.27 
 
 		 295 aa  113  3e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.786359 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3110  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.29 
 
 		 283 aa  113  3e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0643  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.47 
 
 		 271 aa  112  6e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.224446 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4406  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.1 
 
 		 253 aa  112  7.000000000000001e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.410481  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0808  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.72 
 
 		 252 aa  112  8.000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1562  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.32 
 
 		 275 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0498761  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21050  short chain dehydrogenase  34.86 
 
 		 592 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3319  d-beta-hydroxybutyrate dehydrogenase  35.57 
 
 		 256 aa  111  1.0000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0697406  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1627  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  32.51 
 
 		 271 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0861444  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3599  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.36 
 
 		 296 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0346  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.19 
 
 		 256 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0244456  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3699  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.6 
 
 		 280 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0817481  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4162  oxidoreductase  37.81 
 
 		 284 aa  110  3e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.602267  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1963  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.02 
 
 		 257 aa  110  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.922459 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1385  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.22 
 
 		 248 aa  110  3e-23  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2070  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.63 
 
 		 275 aa  109  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0241632 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>