104 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_1566 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_1566  IclR family transcriptional regulator  100 
 
 		 255 aa  521  1e-147  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.207708  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1527  regulatory proteins, IclR  60.41 
 
 		 257 aa  329  3e-89  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1557  transcriptional regulator, putative  56.5 
 
 		 264 aa  291  9e-78  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.149561  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0152  IclR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 255 aa  138  1e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.957112  normal  0.234996 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5355  IclR family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 254 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5506  IclR family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 254 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1596  regulatory proteins, IclR  33.48 
 
 		 241 aa  128  1.0000000000000001e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.134859 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4766  IclR family transcriptional regulator  34.96 
 
 		 254 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.556682 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3258  IclR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 278 aa  122  6e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1798  regulatory protein IclR  28.63 
 
 		 279 aa  104  1e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.334584  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5307  IclR family transcriptional regulator  31.08 
 
 		 255 aa  103  3e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.144609  normal  0.0901346 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6484  regulatory protein, IclR  28.81 
 
 		 259 aa  94.4  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.476341  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0315  regulatory protein, IclR  31.52 
 
 		 279 aa  93.6  3e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.24948  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5401  IclR family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 260 aa  92.4  6e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3621  regulatory protein, IclR  26.11 
 
 		 268 aa  68.9  0.00000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.685113 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1486  transcriptional regulator, IclR family  27.35 
 
 		 260 aa  68.6  0.00000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1568  IclR family transcriptional regulator  27.07 
 
 		 247 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0605  regulatory proteins, IclR  25.4 
 
 		 243 aa  66.6  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1624  transcriptional regulator, IclR family  25.97 
 
 		 275 aa  66.6  0.0000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2600  IclR family transcriptional regulator  25 
 
 		 249 aa  65.5  0.0000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.248836 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1092  IclR family transcriptional regulator  29.19 
 
 		 257 aa  63.5  0.000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0515709 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1189  IclR family transcriptional regulator  26.52 
 
 		 247 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1669  IclR family transcriptional regulator  26.52 
 
 		 247 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.307399  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5040  transcriptional regulator, IclR family  25.98 
 
 		 243 aa  62.8  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4817  IclR family transcriptional regulator  26.27 
 
 		 247 aa  62  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.384435 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1642  IclR family transcriptional regulator  26.52 
 
 		 247 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.338475  normal  0.153676 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1587  IclR family transcriptional regulator  27.85 
 
 		 247 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.236869  normal  0.497654 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2407  IclR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 251 aa  59.3  0.00000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4394  IclR family transcriptional regulator family  29.25 
 
 		 336 aa  58.5  0.00000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0442658  normal  0.275605 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4716  transcriptional regulator, IclR family  24.48 
 
 		 245 aa  58.5  0.00000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4517  regulatory protein, IclR  25.1 
 
 		 255 aa  58.2  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.530625  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1811  regulatory proteins, IclR  27.89 
 
 		 254 aa  58.2  0.0000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0178  transcriptional regulator, IclR family  31.03 
 
 		 281 aa  58.5  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3960  transcriptional regulator, IclR family  27.35 
 
 		 255 aa  58.2  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4887  transcriptional regulator, IclR family  30.69 
 
 		 255 aa  58.5  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1572  IclR family transcriptional regulator  25.53 
 
 		 247 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0370671 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08220  transcriptional regulator, IclR family  23.53 
 
 		 257 aa  57.4  0.0000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2257  IclR family transcriptional regulator  26.52 
 
 		 259 aa  57.4  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.115222 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4604  regulatory proteins, IclR  23.9 
 
 		 251 aa  55.8  0.0000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0349  IclR family transcriptional regulator  22.69 
 
 		 265 aa  55.5  0.0000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000127041  hitchhiker  0.00000770433 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3702  transcriptional regulator, IclR family  19.91 
 
 		 252 aa  55.1  0.000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.8457  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3480  transcriptional regulator, IclR family  25.97 
 
 		 250 aa  54.7  0.000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4386  transcriptional regulator, IclR family  19.89 
 
 		 257 aa  54.3  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.7103e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2032  transcriptional regulator, IclR family  24 
 
 		 254 aa  54.7  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.716752  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4433  regulatory proteins, IclR  23.44 
 
 		 254 aa  53.5  0.000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.343959  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3333  transcriptional regulator, IclR family  29.81 
 
 		 252 aa  52.8  0.000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.950577  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2053  IclR family transcriptional regulator  27.8 
 
 		 277 aa  52.4  0.000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3174  regulatory protein, IclR  25.3 
 
 		 264 aa  52  0.000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.234934  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4038  transcriptional regulator, IclR family  32.1 
 
 		 260 aa  51.2  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3765  IclR family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 272 aa  51.2  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0150652 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6282  regulatory protein, IclR  30 
 
 		 255 aa  50.1  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.302936  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2285  transcriptional regulator, IclR family  22.5 
 
 		 259 aa  49.7  0.00005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3431  IclR family transcriptional regulator  22.79 
 
 		 251 aa  48.9  0.00007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3751  DNA-binding transcriptional activator MhpR  34.65 
 
 		 278 aa  48.9  0.00007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4108  transcriptional regulator, IclR family  25.22 
 
 		 260 aa  48.9  0.00007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3024  DNA-binding transcriptional activator MhpR  34.65 
 
 		 278 aa  48.9  0.00008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0373  IclR family transcriptional regulator  23.72 
 
 		 275 aa  48.5  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2705  regulatory proteins, IclR  27.03 
 
 		 284 aa  48.5  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.393671  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2170  IclR family transcriptional regulator  23.11 
 
 		 252 aa  48.5  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0458  regulatory protein, IclR  21.49 
 
 		 252 aa  47.8  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0309456 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1174  transcriptional regulator, IclR family  19.5 
 
 		 263 aa  47.4  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5128  transcriptional regulator, IclR family  23.66 
 
 		 251 aa  47.4  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0668  transcriptional regulator, IclR family  23.39 
 
 		 257 aa  47.8  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000062061  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1231  IclR family transcriptional regulator  24.44 
 
 		 281 aa  47  0.0003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.418488 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3482  IclR family transcriptional regulator  21.24 
 
 		 263 aa  47  0.0003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4280  regulatory proteins, IclR  21.08 
 
 		 254 aa  47  0.0003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0373374  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2422  IclR family transcriptional regulator  22.01 
 
 		 260 aa  47  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0211  transcriptional regulator IclR  27.8 
 
 		 262 aa  47.4  0.0003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1186  transcriptional regulator, IclR family  19.67 
 
 		 264 aa  47  0.0003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000134584  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1407  transcriptional regulator, IclR family  26.92 
 
 		 257 aa  46.6  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0712  transcriptional regulator, IclR family  23.32 
 
 		 265 aa  46.6  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.93668  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0759  transcriptional regulator, IclR family  23.9 
 
 		 259 aa  46.6  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1018  regulatory proteins, IclR  29.94 
 
 		 266 aa  46.2  0.0005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.069044  normal  0.18825 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3210  transcriptional regulator, IclR family  21.86 
 
 		 251 aa  46.2  0.0005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2873  transcriptional regulator, IclR family  26.28 
 
 		 257 aa  46.2  0.0005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0130818 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3866  IclR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 246 aa  46.2  0.0006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.540674  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5943  transcriptional regulator, IclR family  27.4 
 
 		 257 aa  45.8  0.0007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3880  regulatory protein, IclR  23.63 
 
 		 268 aa  45.1  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0375  IclR family transcriptional regulator  21.91 
 
 		 254 aa  45.1  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.665673 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6969  IclR family transcriptional regulator  26.03 
 
 		 283 aa  44.7  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.255259  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0587  transcriptional regulator, IclR family  24.43 
 
 		 277 aa  45.1  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0391803 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2412  IclR family transcriptional regulator  27.07 
 
 		 258 aa  43.9  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6219  IclR family transcriptional regulator  27.92 
 
 		 254 aa  44.3  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16320  Transcriptional regulator IclR  20.43 
 
 		 255 aa  43.9  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  7.446e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0264  transcriptional regulator, IclR family  22.22 
 
 		 256 aa  43.9  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00966775  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4762  transcriptional regulator, IclR family  21.6 
 
 		 248 aa  44.3  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0099  transcriptional regulator, IclR family  21.17 
 
 		 262 aa  43.9  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5250  IclR family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 254 aa  43.9  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02910  IclR family transcriptional regulator  24.26 
 
 		 259 aa  43.9  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00186754 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2571  regulatory protein, IclR  27.62 
 
 		 258 aa  43.9  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.853506  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7517  transcriptional regulator, IclR family  38.89 
 
 		 281 aa  43.9  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0004  regulatory proteins, IclR  23.57 
 
 		 267 aa  43.1  0.004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.915259 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2225  Transcriptional regulator IclR  26.32 
 
 		 249 aa  43.1  0.004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0022  transcriptional regulator, IclR family  23.57 
 
 		 267 aa  43.1  0.004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4374  transcriptional regulator, IclR family  22.73 
 
 		 250 aa  43.1  0.005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0433228  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1174  IclR family transcriptional regulator  25.69 
 
 		 281 aa  42.7  0.006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0720169  normal  0.468935 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1683  transcriptional regulator  22.59 
 
 		 263 aa  42.4  0.006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1793  IclR family transcriptional regulator  22.59 
 
 		 263 aa  42.4  0.006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2702  transcriptional regulator, IclR family  21.34 
 
 		 254 aa  42.7  0.006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4381  transcriptional regulator, IclR family  26.43 
 
 		 254 aa  42.4  0.008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>