127 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_3491 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_3261  N-acylglucosamine 2-epimerase  83.76 
 
 
425 aa  716    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.522006  normal  0.608155 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3491  N-acylglucosamine 2-epimerase  100 
 
 
425 aa  853    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0507934 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1736  hypothetical protein  59.89 
 
 
407 aa  417  9.999999999999999e-116  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4598  N-acylglucosamine 2-epimerase  57.58 
 
 
427 aa  394  1e-108  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00161711  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1306  N-acylglucosamine 2-epimerase  57.25 
 
 
404 aa  384  1e-105  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19630  N-acyl-D-glucosamine 2-epimerase  51.73 
 
 
634 aa  375  1e-103  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0180286  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3177  N-acylglucosamine 2-epimerase  54.73 
 
 
410 aa  377  1e-103  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0554967 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3113  N-acylglucosamine 2-epimerase  52.11 
 
 
414 aa  368  1e-101  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3278  hypothetical protein  51.61 
 
 
414 aa  365  1e-100  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.198731  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1942  N-acylglucosamine 2-epimerase  49.12 
 
 
416 aa  359  5e-98  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5327  N-acylglucosamine 2-epimerase  42.61 
 
 
413 aa  349  5e-95  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.78432 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0269  N-acylglucosamine 2-epimerase  49.25 
 
 
417 aa  349  6e-95  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.475155  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4265  N-acylglucosamine 2-epimerase  42.36 
 
 
413 aa  348  1e-94  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4298  N-acylglucosamine 2-epimerase  42.61 
 
 
413 aa  347  2e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4344  N-acylglucosamine 2-epimerase  42.61 
 
 
413 aa  347  2e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.395722  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4253  N-acylglucosamine 2-epimerase  42.61 
 
 
413 aa  347  2e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03765  predicted glucosamine isomerase  42.11 
 
 
413 aa  347  3e-94  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4106  N-acylglucosamine 2-epimerase  42.11 
 
 
413 aa  347  3e-94  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03714  hypothetical protein  42.11 
 
 
413 aa  347  3e-94  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4403  N-acylglucosamine 2-epimerase  42.11 
 
 
413 aa  347  3e-94  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4371  N-acylglucosamine 2-epimerase  49.38 
 
 
419 aa  346  6e-94  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.931508  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4210  N-acylglucosamine 2-epimerase  50.86 
 
 
408 aa  346  6e-94  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4231  N-acylglucosamine 2-epimerase  42.36 
 
 
413 aa  344  1e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4409  N-acylglucosamine 2-epimerase  42.61 
 
 
413 aa  344  2e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1014  hypothetical protein  50.12 
 
 
416 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10140  N-acyl-D-glucosamine 2-epimerase  46.19 
 
 
415 aa  322  6e-87  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.215819  normal  0.404919 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1052  N-acylglucosamine 2-epimerase  49.09 
 
 
417 aa  318  2e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0420922  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0388  N-acylglucosamine 2-epimerase  48.4 
 
 
424 aa  315  9.999999999999999e-85  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1762  N-acylglucosamine 2-epimerase  45.1 
 
 
418 aa  308  1.0000000000000001e-82  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0295295 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0199  N-acyl-D-glucosamine 2-epimerase  41.41 
 
 
411 aa  303  5.000000000000001e-81  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.552163  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2629  N-acylglucosamine 2-epimerase  45.65 
 
 
417 aa  302  7.000000000000001e-81  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.257892  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4855  N-acylglucosamine 2-epimerase  47.31 
 
 
391 aa  299  8e-80  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.331313  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1277  hypothetical protein  41.73 
 
 
435 aa  269  7e-71  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2936  N-acylglucosamine 2-epimerase  41.48 
 
 
418 aa  266  4e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0790  N-acylglucosamine 2-epimerase  42.09 
 
 
417 aa  259  6e-68  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.942264  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2652  N-acylglucosamine 2-epimerase  38.38 
 
 
414 aa  249  7e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2912  N-acylglucosamine 2-epimerase  38.5 
 
 
419 aa  247  3e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.600422  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2707  N-acylglucosamine 2-epimerase  40.59 
 
 
418 aa  243  3e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2967  hypothetical protein  36.08 
 
 
418 aa  241  2e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1773  N-acylglucosamine 2-epimerase  37.44 
 
 
419 aa  229  8e-59  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.384213  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2732  N-acylglucosamine 2-epimerase  40.26 
 
 
403 aa  206  9e-52  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.687371 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1919  N-acylglucosamine 2-epimerase  42.32 
 
 
419 aa  182  9.000000000000001e-45  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.266603  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0502  N-acylglucosamine 2-epimerase  40.07 
 
 
392 aa  177  3e-43  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0332  N-acylglucosamine 2-epimerase  31.87 
 
 
406 aa  173  5e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0370198  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1778  N-acylglucosamine 2-epimerase  33.7 
 
 
408 aa  172  1e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.212898  normal  0.77071 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5844  N-acylglucosamine 2-epimerase  36.31 
 
 
398 aa  164  2.0000000000000002e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.742486  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0453  N-acylglucosamine 2-epimerase  34.73 
 
 
412 aa  161  2e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01636  N-acylglucosamine 2-epimerase  33.44 
 
 
401 aa  161  3e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.137096  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1271  hypothetical protein  33.14 
 
 
401 aa  158  2e-37  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3020  N-acylglucosamine 2-epimerase  34.43 
 
 
426 aa  157  3e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.343521  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01231  N-acylglucosamine 2-epimerase  33.43 
 
 
401 aa  157  4e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0194609  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3983  N-acylglucosamine 2-epimerase  37.54 
 
 
408 aa  156  5.0000000000000005e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2883  N-acylglucosamine 2-epimerase  34.43 
 
 
426 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1239  N-acylglucosamine 2-epimerase  33.53 
 
 
401 aa  156  8e-37  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6322  N-acylglucosamine 2-epimerase  34.43 
 
 
426 aa  155  9e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4285  putative N-acylglucosamine 2-epimerase  32.48 
 
 
427 aa  155  2e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2973  N-acylglucosamine 2-epimerase  34.7 
 
 
426 aa  152  1e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2993  N-acylglucosamine 2-epimerase  34.7 
 
 
426 aa  152  1e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1756  N-acylglucosamine 2-epimerase  30.32 
 
 
394 aa  151  2e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2968  N-acylglucosamine 2-epimerase  34.24 
 
 
426 aa  150  5e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.636763  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0299  N-acylglucosamine 2-epimerase (GlcNAc 2-epimerase) family protein  35.05 
 
 
470 aa  149  7e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0424  N-acylglucosamine 2-epimerase  32.42 
 
 
427 aa  147  3e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.441616 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0149  N-acylglucosamine 2-epimerase  32.42 
 
 
420 aa  144  2e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0348  N-acylglucosamine 2-epimerase family protein  33.97 
 
 
489 aa  144  3e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0527  N-acylglucosamine 2-epimerase (GlcNAc 2-epimerase) family protein  33.97 
 
 
485 aa  144  4e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.491705  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3388  N-acylglucosamine 2-epimerase  31.74 
 
 
389 aa  144  4e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.2674 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3387  hypothetical protein  33.7 
 
 
483 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0835382  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2359  N-acylglucosamine 2-epimerase  37.93 
 
 
343 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3061  N-acylglucosamine 2-epimerase family protein  33.7 
 
 
483 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2032  hypothetical protein  33.7 
 
 
483 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0335  N-acylglucosamine 2-epimerase family protein  33.7 
 
 
500 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.448131  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2252  N-acylglucosamine 2-epimerase family protein  33.7 
 
 
483 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2647  hypothetical protein  31.99 
 
 
391 aa  141  3e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.372214  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4222  glucose-6-phosphate isomerase  34.01 
 
 
944 aa  140  3.9999999999999997e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0290  N-acylglucosamine 2-epimerase  33.96 
 
 
395 aa  140  4.999999999999999e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0118  N-acylglucosamine 2-epimerase  33.09 
 
 
395 aa  137  5e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.969015  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0560  hypothetical protein  31.44 
 
 
389 aa  125  1e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.351937 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3488  N-acylglucosamine 2-epimerase  32.38 
 
 
411 aa  124  4e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0932448  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5652  N-acylglucosamine 2-epimerase  24.73 
 
 
423 aa  79  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0887  N-acylglucosamine 2-epimerase  25.51 
 
 
416 aa  77.4  0.0000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4913  hypothetical protein  35.42 
 
 
404 aa  76.6  0.0000000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0603  N-acylglucosamine 2-epimerase  33.99 
 
 
404 aa  76.6  0.0000000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.587252 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1975  N-acylglucosamine 2-epimerase  22.03 
 
 
392 aa  75.1  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.341609  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4653  N-acylglucosamine 2-epimerase  31.87 
 
 
365 aa  73.2  0.000000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00263974  hitchhiker  0.00306786 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0559  N-acylglucosamine 2-epimerase  35.77 
 
 
377 aa  72  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0708498  normal  0.67916 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4917  N-acylglucosamine 2-epimerase  28.31 
 
 
376 aa  70.1  0.00000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000122235  hitchhiker  0.0000000000225976 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4738  N-acylglucosamine 2-epimerase  29.7 
 
 
366 aa  69.7  0.00000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000129483  hitchhiker  0.00000124856 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6381  N-acylglucosamine 2-epimerase  24.51 
 
 
427 aa  68.9  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4860  N-acylglucosamine 2-epimerase  28.92 
 
 
377 aa  68.2  0.0000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000600017 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4306  N-acylglucosamine 2-epimerase  33.33 
 
 
365 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.640944  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3294  N-acylglucosamine 2-epimerase  37.17 
 
 
394 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0462942 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4659  N-acylglucosamine 2-epimerase  23.08 
 
 
419 aa  63.5  0.000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0271  N-acylglucosamine 2-epimerase  22.9 
 
 
402 aa  63.2  0.000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.386108  normal  0.0632878 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5361  N-acylglucosamine 2-epimerase  34.97 
 
 
395 aa  63.2  0.000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00978655  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5499  N-acylglucosamine 2-epimerase  34.97 
 
 
395 aa  63.2  0.000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.140978  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4175  phosphomannose isomerase  32.5 
 
 
408 aa  62  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.693379 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5399  N-acylglucosamine 2-epimerase  23.43 
 
 
403 aa  60.5  0.00000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0761169 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4772  N-acylglucosamine 2-epimerase  34.27 
 
 
369 aa  60.5  0.00000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.504836 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4304  N-acylglucosamine 2-epimerase  31.58 
 
 
375 aa  60.1  0.00000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0505  mannose-6-phosphate isomerase  26.41 
 
 
385 aa  59.3  0.0000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0573939  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>