270 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_3064 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_3064  hypothetical protein  100 
 
 		 441 aa  886    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000514586 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0730  hypothetical protein  27.51 
 
 		 436 aa  139  1e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_2987  phosphoribosylglycinamide synthetase  26.5 
 
 		 410 aa  84.3  0.000000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.0000000000875543  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0721  hypothetical protein  27.01 
 
 		 402 aa  79  0.0000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.446517 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0170  phosphoribosylglycinamide synthetase ATP-grasp domain-containing protein  24.76 
 
 		 407 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0292  phosphoribosylglycinamide synthetase, ATP-grasp  24.76 
 
 		 407 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2020  phosphoribosylglycinamide synthetase  29.44 
 
 		 407 aa  74.7  0.000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2022  argininosuccinate lyase  28.05 
 
 		 900 aa  74.3  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.10658  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0344  phosphoribosylglycinamide synthetase  26.71 
 
 		 424 aa  74.3  0.000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2158  argininosuccinate lyase  28.05 
 
 		 914 aa  73.6  0.000000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2002  argininosuccinate lyase  28.05 
 
 		 900 aa  73.6  0.000000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.848902  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0754  protein of unknown function DUF201  22.98 
 
 		 409 aa  73.2  0.000000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4500  Cysteine synthase  29.55 
 
 		 756 aa  72.8  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.632569  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7725  hypothetical protein  30.81 
 
 		 411 aa  72  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.10668  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2668  phosphoribosylglycinamide synthetase  36.6 
 
 		 415 aa  72  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3626  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  32.39 
 
 		 432 aa  69.7  0.00000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2144  phosphoribosylglycinamide synthetase  33.67 
 
 		 416 aa  69.3  0.0000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0250211 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3660  hypothetical protein  33.82 
 
 		 411 aa  67.8  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.853995  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1971  argininosuccinate lyase  25.53 
 
 		 891 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4786  hypothetical protein  27.63 
 
 		 398 aa  65.1  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0924  D-alanine--D-alanine ligase  29.11 
 
 		 313 aa  64.7  0.000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.783773  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0200  hypothetical protein  21.14 
 
 		 405 aa  63.2  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.214933  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5090  hypothetical protein  26.92 
 
 		 453 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5770  hypothetical protein  26.92 
 
 		 453 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0282385 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3192  argininosuccinate lyase  25.53 
 
 		 924 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.655648  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1620  argininosuccinate lyase  26.59 
 
 		 896 aa  62  0.00000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1396  argininosuccinate lyase  26.59 
 
 		 926 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2560  argininosuccinate lyase  26.59 
 
 		 904 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2122  argininosuccinate lyase  26.59 
 
 		 894 aa  62  0.00000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3759  protein of unknown function DUF201  25.65 
 
 		 425 aa  61.6  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33390  biotin carboxylase  26.23 
 
 		 428 aa  60.8  0.00000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.465269 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2646  argininosuccinate lyase  26.59 
 
 		 904 aa  60.5  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2507  argininosuccinate lyase  26.59 
 
 		 912 aa  60.5  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7724  putative biotin carboxylase  28.34 
 
 		 430 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.211642  normal  1 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_37283  predicted protein  28.23 
 
 		 1033 aa  59.3  0.0000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0899  hypothetical protein  28.29 
 
 		 406 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0718  hypothetical protein  28.29 
 
 		 406 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.555879  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0732  hypothetical protein  28.29 
 
 		 406 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0240  hypothetical protein  28.21 
 
 		 410 aa  58.2  0.0000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0240  hypothetical protein  28.95 
 
 		 410 aa  58.2  0.0000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1514  hypothetical protein  24.23 
 
 		 412 aa  57.8  0.0000004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13270  D-alanine--D-alanine ligase  27.78 
 
 		 315 aa  56.6  0.0000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.122637  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1929  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  25.76 
 
 		 411 aa  55.8  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2663  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  29.22 
 
 		 413 aa  55.8  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0559  carbamoyl phosphate synthase large subunit  21.95 
 
 		 1059 aa  55.8  0.000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1339  D-alanine--D-alanine ligase  27.27 
 
 		 318 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.266833  normal  0.0340242 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3265  hypothetical protein  28 
 
 		 412 aa  55.5  0.000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4100  D-alanine--D-alanine ligase  28.27 
 
 		 319 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.555114 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4982  D-alanine--D-alanine ligase  28.46 
 
 		 319 aa  55.5  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.380222  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0467  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  23.41 
 
 		 1061 aa  55.8  0.000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2251  phosphoribosylglycinamide synthetase  28.04 
 
 		 418 aa  55.1  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000511987 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4510  D-alanine--D-alanine ligase  28.1 
 
 		 318 aa  54.7  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.926971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4648  protein of unknown function DUF201  32.67 
 
 		 404 aa  54.3  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.896666  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4671  D-alanine--D-alanine ligase  27.08 
 
 		 324 aa  54.3  0.000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0129578  normal  0.448814 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4385  D-alanine--D-alanine ligase  28.1 
 
 		 318 aa  54.3  0.000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0215233  normal  0.165436 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1007  hypothetical protein  28.29 
 
 		 427 aa  53.5  0.000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01931  vibrioferrin biosynthesis protein PvsA  26.82 
 
 		 399 aa  53.5  0.000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0619  phosphoribosylglycinamide synthetase  23.97 
 
 		 410 aa  53.9  0.000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.241949  hitchhiker  0.00233057 
 
 
-
 
NC_011699  PHATRDRAFT_24195  CPS III, carbamoyl-phosphate synthase mitochindrial precursor  24.38 
 
 		 1463 aa  53.1  0.000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2274  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  28.51 
 
 		 459 aa  53.1  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.41756  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09340  hypothetical protein  26.41 
 
 		 399 aa  52.8  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.035454  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4069  phosphoribosylglycinamide synthetase ATP-grasp domain-containing protein  25.59 
 
 		 389 aa  52.4  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0194  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain-containing protein ATP-grasp  28.86 
 
 		 419 aa  53.1  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.296569  normal  0.160479 
 
 
-
 
NC_004310  BR0906  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  28.95 
 
 		 452 aa  52  0.00002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4501  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  22.68 
 
 		 1073 aa  52.4  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0836  protein of unknown function DUF201  22.69 
 
 		 351 aa  52.4  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.532579  normal  0.0458825 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2386  protein of unknown function DUF201  32.32 
 
 		 381 aa  52  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0996  phosphoribosylglycinamide synthetase  22.59 
 
 		 541 aa  52  0.00002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000037072 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0902  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  28.95 
 
 		 452 aa  52  0.00002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0875  hypothetical protein  29.1 
 
 		 420 aa  52.4  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.728931 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4191  carbamoyl phosphate synthase large subunit  22.68 
 
 		 1073 aa  51.2  0.00003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.725714  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0363  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  26.28 
 
 		 1099 aa  51.6  0.00003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.948928  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0380  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  26.92 
 
 		 1099 aa  51.2  0.00004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57320  D-alanine--D-alanine ligase  28.05 
 
 		 319 aa  51.2  0.00004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3091  PvsA  24.86 
 
 		 394 aa  50.8  0.00004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.324185  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0124  carbamoyl phosphate synthase large subunit  25 
 
 		 938 aa  50.8  0.00005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1270  protein of unknown function DUF201  25.41 
 
 		 399 aa  50.8  0.00005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.964812  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2969  hypothetical protein  28.42 
 
 		 402 aa  50.4  0.00005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2438  hypothetical protein  33.51 
 
 		 410 aa  50.4  0.00006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.658373 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0946  D-alanine--D-alanine ligase  27.27 
 
 		 318 aa  50.4  0.00006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.427679  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2191  propionyl-CoA carboxylase alpha subunit  22.91 
 
 		 695 aa  50.4  0.00006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0275  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  20.49 
 
 		 1074 aa  50.4  0.00006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1377  Carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  24.16 
 
 		 441 aa  50.4  0.00006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1042  carbamoyl phosphate synthase large subunit  22.5 
 
 		 1060 aa  50.1  0.00007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1446  carbamoyl phosphate synthase large subunit  25.85 
 
 		 1066 aa  50.1  0.00007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0069  carbamoyl phosphate synthase large subunit  34.18 
 
 		 1073 aa  50.1  0.00007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.503132  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4406  D-alanine--D-alanine ligase  27.85 
 
 		 319 aa  50.1  0.00008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.206514  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0912  biotin carboxylase-like protein  23.81 
 
 		 410 aa  50.1  0.00008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.527326 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1355  carbamoyl-phosphate synthase large subunit  25.4 
 
 		 1092 aa  49.7  0.00009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0316249 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0865  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding  22.91 
 
 		 666 aa  49.3  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.246208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3743  carbamoyl phosphate synthase large subunit  31.78 
 
 		 1112 aa  49.7  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0558638 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0709  carbamoyl phosphate synthase large subunit  22.45 
 
 		 1073 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0416816 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2302  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding  23.88 
 
 		 666 aa  49.3  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6137  Carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  25.35 
 
 		 667 aa  49.7  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.768375  normal  0.18157 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3292  acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  26.69 
 
 		 447 aa  49.7  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.15202  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4723  carbamoyl phosphate synthase large subunit  21.65 
 
 		 1073 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00575089 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1378  carbamoyl phosphate synthase large subunit  26.6 
 
 		 1075 aa  48.9  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3370  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding  24.56 
 
 		 680 aa  48.9  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.447293  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4589  carbamoyl phosphate synthase large subunit  21.65 
 
 		 1055 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.387511  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1093  Carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP- binding  26.19 
 
 		 459 aa  48.9  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>