62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_3004 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_3004  Acetyl xylan esterase  100 
 
 
325 aa  648    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000183119 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1965  acetyl xylan esterase  55.88 
 
 
321 aa  347  1e-94  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.141167  normal  0.18273 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4684  Acetyl xylan esterase  54.69 
 
 
321 aa  341  8e-93  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.115957  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0796  Acetyl xylan esterase  52.16 
 
 
324 aa  336  2.9999999999999997e-91  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.513241  normal  0.434806 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0201  Acetyl xylan esterase  52.12 
 
 
324 aa  327  1.0000000000000001e-88  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0886  Acetyl xylan esterase  51.32 
 
 
328 aa  325  8.000000000000001e-88  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.204765  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1058  Acetyl xylan esterase  55.84 
 
 
323 aa  323  2e-87  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.638201 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1231  Acetyl xylan esterase  54.55 
 
 
324 aa  318  6e-86  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.302621  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3816  Acetyl xylan esterase  52.74 
 
 
365 aa  318  7.999999999999999e-86  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.232688 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0926  Acetyl xylan esterase  51.81 
 
 
333 aa  317  2e-85  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.642395 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0870  Acetyl xylan esterase  49.84 
 
 
325 aa  310  1e-83  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2720  acetyl xylan esterase  54.49 
 
 
332 aa  308  1.0000000000000001e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0579954  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0847  Acetyl xylan esterase  49.51 
 
 
325 aa  307  1.0000000000000001e-82  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2045  Acetyl xylan esterase  49.38 
 
 
322 aa  305  8.000000000000001e-82  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0504  Acetyl xylan esterase  50.16 
 
 
329 aa  305  8.000000000000001e-82  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1761  Acetyl xylan esterase  49.37 
 
 
324 aa  300  3e-80  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0160667 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4187  Acetyl xylan esterase  50.62 
 
 
328 aa  295  6e-79  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05560  acetyl esterase (deacetylase)  51.91 
 
 
330 aa  293  2e-78  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.590468 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1462  acetyl esterase  53.29 
 
 
419 aa  294  2e-78  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.735696  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0265  Acetyl xylan esterase  49.04 
 
 
328 aa  290  2e-77  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33120  acetyl esterase (deacetylase)  46.65 
 
 
350 aa  288  1e-76  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.151535  normal  0.594264 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3115  Acetyl xylan esterase  49.69 
 
 
325 aa  281  8.000000000000001e-75  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0185974  normal  0.0232886 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3413  Acetyl xylan esterase  49.22 
 
 
332 aa  266  4e-70  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0804666  normal  0.178239 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01660  acetyl esterase (deacetylase)  47.37 
 
 
329 aa  264  2e-69  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1984  Acetyl xylan esterase  51.31 
 
 
327 aa  261  2e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.387898  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3303  Acetyl xylan esterase  45.09 
 
 
343 aa  259  6e-68  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2723  Acetyl xylan esterase  47.4 
 
 
352 aa  254  1.0000000000000001e-66  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3101  Acetyl xylan esterase  42.86 
 
 
339 aa  241  1e-62  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1237  Acetyl xylan esterase  38.84 
 
 
326 aa  240  2.9999999999999997e-62  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.808596  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1828  Acetyl xylan esterase  46.86 
 
 
320 aa  232  6e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2403  Acetyl xylan esterase  39.53 
 
 
309 aa  206  4e-52  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.00763458  normal  0.564898 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3063  Acetyl xylan esterase  38.87 
 
 
320 aa  179  8e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0210  Acetyl xylan esterase  33.23 
 
 
319 aa  171  1e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.453082  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0152  Acetyl xylan esterase  30.5 
 
 
321 aa  151  2e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0284  Acetyl xylan esterase  32.72 
 
 
333 aa  144  2e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000137645  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1848  acetylxylan esterase  30.67 
 
 
319 aa  130  2.0000000000000002e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000371827  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0931  Acetyl xylan esterase  30.84 
 
 
346 aa  117  3e-25  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.542507 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0041  acetyl xylan esterase, putative  29.74 
 
 
325 aa  112  1.0000000000000001e-23  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2229  Acetyl xylan esterase  28.48 
 
 
441 aa  98.6  1e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0209734  normal  0.221922 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1236  Acetyl xylan esterase  25.32 
 
 
432 aa  87  4e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.299345  normal  0.0188849 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2302  Acetyl xylan esterase  27.61 
 
 
454 aa  82  0.00000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  hitchhiker  0.000531088  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0486  Acetyl xylan esterase  27.97 
 
 
430 aa  67.4  0.0000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.144902 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5838  Acetyl xylan esterase  28.34 
 
 
330 aa  67  0.0000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.145692  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0930  Acetyl xylan esterase  23.34 
 
 
313 aa  53.1  0.000006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.554171 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01220  acetyl esterase (deacetylase)  28.92 
 
 
340 aa  51.6  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6460  peptidase S15  29.07 
 
 
308 aa  49.3  0.00008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.412944  normal  0.0890268 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2922  putative lipoprotein  28.93 
 
 
285 aa  47.8  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000434521 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0323  prolyl oligopeptidase family protein  29.95 
 
 
649 aa  48.1  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0864  hydrolase  28.12 
 
 
314 aa  47.8  0.0003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.020243  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3976  dienelactone hydrolase  28.36 
 
 
296 aa  47.4  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6038  hypothetical protein  27.44 
 
 
298 aa  47.4  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.491675  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2886  hypothetical protein  28.41 
 
 
301 aa  46.2  0.0007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6210  Acetyl xylan esterase  24.29 
 
 
402 aa  43.9  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3774  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  26.98 
 
 
661 aa  43.9  0.004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.455998 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3567  phospholipase/carboxylesterase  28.17 
 
 
290 aa  43.9  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.486808  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17781  hypothetical protein  24.32 
 
 
681 aa  43.5  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.46714 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6451  peptidase S15  29.67 
 
 
295 aa  43.5  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0515284  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6158  peptidase S15  28.95 
 
 
295 aa  43.1  0.007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0355  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  25.7 
 
 
662 aa  43.1  0.007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.824077 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3841  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  24.52 
 
 
654 aa  43.1  0.007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0594  dienelactone hydrolase  28.86 
 
 
305 aa  42.7  0.008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2592  hypothetical protein  25.32 
 
 
238 aa  42.4  0.01  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>