More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_1203 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_1203  peptidase M23B  100 
 
 		 214 aa  400  1e-111  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.609657  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1314  peptidase M23B  81.56 
 
 		 164 aa  220  9.999999999999999e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3992  Peptidase M23  60.31 
 
 		 175 aa  146  2.0000000000000003e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0988  Peptidase M23  56.49 
 
 		 174 aa  145  5e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.635023  normal  0.110335 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1973  peptidase M23B  57.04 
 
 		 161 aa  142  4e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.537655 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1992  peptidase M23B  56.3 
 
 		 161 aa  140  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2038  peptidase M23B  56.3 
 
 		 161 aa  140  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.101119  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1383  Peptidase M23  53.57 
 
 		 193 aa  138  6e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000013113 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12905  hypothetical protein  54.29 
 
 		 249 aa  137  1e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00765288  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2208  peptidase M23B  54.81 
 
 		 162 aa  136  2e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.345144  normal  0.323665 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2508  Peptidase M23  57.97 
 
 		 191 aa  135  6.0000000000000005e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.744479  normal  0.326949 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09880  metalloendopeptidase-like membrane protein  53.52 
 
 		 219 aa  131  6e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1366  peptidase M23B  44.57 
 
 		 173 aa  130  2.0000000000000002e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0643294  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2103  Peptidase M23  52.17 
 
 		 174 aa  128  6e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.29214  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3582  peptidase M23B  54.76 
 
 		 291 aa  127  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3244  peptidase M23B  56.03 
 
 		 211 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.6882  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0675  hypothetical protein  62.22 
 
 		 362 aa  126  3e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4134  peptidase M23B  49.64 
 
 		 162 aa  124  1e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.300034  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1528  Peptidase M23  53.73 
 
 		 139 aa  124  1e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0244521 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1160  peptidase M23B  46.34 
 
 		 269 aa  124  1e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.37426 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1859  peptidase, M23/M37 family  57.25 
 
 		 223 aa  120  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.986198  hitchhiker  0.00477913 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1657  Peptidase M23  50.36 
 
 		 169 aa  119  3e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10110  metalloendopeptidase-like membrane protein  50.36 
 
 		 238 aa  116  1.9999999999999998e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3114  Peptidase M23  59.56 
 
 		 170 aa  115  3.9999999999999997e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00153698  normal  0.0803767 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5912  Peptidase M23  51.82 
 
 		 331 aa  115  5e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00345275  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1483  Peptidase M23  51.85 
 
 		 203 aa  114  1.0000000000000001e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.22964  normal  0.326208 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1179  Peptidase M23  49.65 
 
 		 193 aa  113  2.0000000000000002e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.949137  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0950  peptidase, M23 family  34.36 
 
 		 205 aa  111  8.000000000000001e-24  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1003  Peptidase M23  44.35 
 
 		 170 aa  111  1.0000000000000001e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.760596  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1543  peptidase M23B  50.81 
 
 		 254 aa  107  2e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.358584 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0396  M23/M37 family membrane peptidase  41.35 
 
 		 195 aa  102  4e-21  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00347919  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1412  peptidase M23B  51.88 
 
 		 177 aa  93.6  2e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.21699 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11180  metalloendopeptidase-like membrane protein  40.44 
 
 		 271 aa  90.5  2e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.00950153  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0268  M23 peptidase domain protein  31.25 
 
 		 417 aa  63.2  0.000000003  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.171768  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0483  M23/M37 peptidase domain-containing protein  31.72 
 
 		 312 aa  62.4  0.000000004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0302091  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0370  peptidase M23B  37.17 
 
 		 402 aa  61.6  0.000000008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.890076  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1070  peptidase M23B  34.88 
 
 		 470 aa  61.6  0.000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000663159  hitchhiker  0.00472125 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1858  peptidase M23B  35.94 
 
 		 375 aa  61.2  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000219165  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3607  peptidase M23B  33.33 
 
 		 469 aa  60.5  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0610326  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0505  peptidase M23B  38.02 
 
 		 465 aa  60.1  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0535  peptidase M23B  32.85 
 
 		 247 aa  60.1  0.00000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1541  peptidase M23  39.32 
 
 		 425 aa  58.2  0.00000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.759696  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0043  Peptidase M23  32.33 
 
 		 305 aa  57  0.0000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000681555  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6410  peptidase M23B  35 
 
 		 491 aa  57  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.101162  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0475  peptidase M23B  33.04 
 
 		 464 aa  57  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0764227  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4765  peptidase M23B  37.21 
 
 		 420 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.467777 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3154  membrane proteins, metalloendopeptidase-like  35.33 
 
 		 388 aa  57.4  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4473  peptidase M23B  31.88 
 
 		 491 aa  57  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1618  peptidase M23B  39.83 
 
 		 412 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.278524  normal  0.127445 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4212  M24/M37 family peptidase  36.89 
 
 		 299 aa  56.2  0.0000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1596  peptidase M23B  39.5 
 
 		 400 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.559907  normal  0.338058 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46000  metallopeptidase  32.77 
 
 		 480 aa  56.2  0.0000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.064748  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1140  peptidase M23B  39.5 
 
 		 421 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1518  peptidase M23B  39.47 
 
 		 425 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1620  peptidase M23B  39.5 
 
 		 421 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3167  Peptidase M23  36.43 
 
 		 391 aa  55.8  0.0000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3563  peptidase M23B  36.89 
 
 		 299 aa  55.8  0.0000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000153251  hitchhiker  0.0000000453788 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0393  peptidase M23B  36.89 
 
 		 299 aa  56.2  0.0000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000111959  unclonable  0.0000262337 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3736  peptidase M23B  36.89 
 
 		 299 aa  56.2  0.0000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000766225  hitchhiker  0.000000231142 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2737  Peptidase M23  34.31 
 
 		 281 aa  55.8  0.0000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.225501  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0015  Peptidase M23  31.48 
 
 		 395 aa  55.5  0.0000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.136901  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2983  peptidase M23B  37.69 
 
 		 392 aa  55.5  0.0000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.554502 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0514  M24/M37 family peptidase  31.54 
 
 		 386 aa  55.5  0.0000007  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000380878  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1350  M24/M37 family peptidase  31.75 
 
 		 386 aa  54.7  0.000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2345  peptidase M23B  32.16 
 
 		 452 aa  54.7  0.000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000378681  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3209  Peptidase M23  37.69 
 
 		 392 aa  54.3  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.626752  normal  0.571204 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4107  peptidase M23B  35.09 
 
 		 457 aa  54.3  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4409  putative peptidoglycan-binding LysM  30.41 
 
 		 484 aa  54.7  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.35842 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1228  M24/M37 family peptidase  32.54 
 
 		 386 aa  54.7  0.000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00112662  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0494  peptidase M23B  34.95 
 
 		 299 aa  53.9  0.000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000148053  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0435  M24/M37 family peptidase  31.09 
 
 		 475 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.269158  normal  0.0460462 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2173  peptidase M23B  32.37 
 
 		 301 aa  53.9  0.000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4768  peptidase M23B  31.09 
 
 		 472 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.000000282967  normal  0.90661 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3928  peptidase M23B  32.77 
 
 		 475 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.0000103245  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4673  Peptidase M23  31.36 
 
 		 446 aa  53.5  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0178  membrane proteins related to metalloendopeptidase-like  35.35 
 
 		 321 aa  53.9  0.000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5906  peptidase M23B  33.91 
 
 		 464 aa  53.5  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0141  metallopeptidase  34 
 
 		 471 aa  53.9  0.000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.000148736  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2529  peptidase M23B  29.93 
 
 		 445 aa  53.5  0.000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.073989 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0124  peptidase M23  34 
 
 		 471 aa  53.9  0.000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000771684  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0273  peptidase M23  35.25 
 
 		 285 aa  53.9  0.000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3797  peptidase M23B  33.98 
 
 		 299 aa  53.5  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000938222  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0465  peptidase M23B  31.09 
 
 		 473 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000494323  normal  0.161916 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2905  Peptidase M23  35 
 
 		 468 aa  53.5  0.000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1220  peptidase, M23/M37 family  33.03 
 
 		 385 aa  53.5  0.000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000900007  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4726  M24/M37 family peptidase  37.62 
 
 		 498 aa  53.1  0.000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2139  Peptidase M23  31.25 
 
 		 490 aa  53.1  0.000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00671131  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2382  Peptidase M23  31.39 
 
 		 286 aa  53.1  0.000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0468  peptidase M23B  31.09 
 
 		 473 aa  53.1  0.000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000910103  hitchhiker  0.00126388 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2119  Peptidase M23  30.71 
 
 		 323 aa  53.1  0.000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1249  M24/M37 family peptidase  33.33 
 
 		 244 aa  53.1  0.000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.838418  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0490  M24/M37 family peptidase  34.29 
 
 		 266 aa  53.1  0.000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0330087  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0607  peptidase, M23/M37 family  33.33 
 
 		 474 aa  52.8  0.000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0513451  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0525  peptidase M23  28.04 
 
 		 271 aa  52.8  0.000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0362  peptidase M23B  34.95 
 
 		 299 aa  52.8  0.000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000004833  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0304  hypothetical protein  35.25 
 
 		 272 aa  52.8  0.000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0795  peptidase M23B  36.63 
 
 		 253 aa  52.8  0.000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1370  M24/M37 family peptidase  32.48 
 
 		 273 aa  52.4  0.000005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0779116  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4566  peptidase M23B  33.33 
 
 		 475 aa  52.4  0.000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00491492  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2447  M23/M37 familypeptidase  37.9 
 
 		 499 aa  52.4  0.000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.372819  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>