More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_0704 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_0704  inner-membrane translocator  100 
 
 		 304 aa  561  1.0000000000000001e-159  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0207782  hitchhiker  0.00233788 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0762  inner-membrane translocator  91.84 
 
 		 328 aa  422  1e-117  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3319  inner-membrane translocator  41.98 
 
 		 329 aa  165  1.0000000000000001e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2848  inner-membrane translocator  39.46 
 
 		 337 aa  144  2e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.172129  normal  0.525645 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0734  putative branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  32.86 
 
 		 315 aa  102  6e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3651  inner-membrane translocator  34.2 
 
 		 335 aa  101  1e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1620  inner-membrane translocator  34.87 
 
 		 368 aa  100  3e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.779012 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3307  inner-membrane translocator  30.72 
 
 		 314 aa  99  8e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3483  inner-membrane translocator  29.56 
 
 		 328 aa  99  9e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.742895  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3133  inner-membrane translocator  34.67 
 
 		 322 aa  98.2  1e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0212  inner-membrane translocator  34.8 
 
 		 337 aa  95.9  8e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0079  inner-membrane translocator  34.48 
 
 		 361 aa  95.5  1e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3759  hypothetical protein  30.17 
 
 		 322 aa  95.5  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.232972  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2304  inner-membrane translocator  29.57 
 
 		 329 aa  94.7  1e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1583  inner-membrane translocator  31.08 
 
 		 319 aa  94.4  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2987  inner-membrane translocator  30.87 
 
 		 340 aa  94.4  2e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.465915  normal  0.488268 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0936  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  32.05 
 
 		 656 aa  94.4  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0175058  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2520  inner-membrane translocator  30.99 
 
 		 323 aa  93.6  3e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2332  inner-membrane translocator  30.99 
 
 		 324 aa  94  3e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.404854  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6025  inner-membrane translocator  31.85 
 
 		 333 aa  92.8  6e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2951  inner-membrane translocator  29.21 
 
 		 323 aa  92.4  9e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0213557  normal  1 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4746  inner-membrane translocator  31.76 
 
 		 340 aa  91.3  2e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.333311  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0021  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  30.8 
 
 		 323 aa  91.3  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.901563  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3911  inner-membrane translocator  32.08 
 
 		 323 aa  91.3  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.658147  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2952  inner-membrane translocator  33.33 
 
 		 333 aa  90.9  2e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.211647 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4183  inner-membrane translocator  30.67 
 
 		 358 aa  90.5  3e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.708738  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3164  inner-membrane translocator  29.34 
 
 		 324 aa  90.1  5e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.317947  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2059  inner-membrane translocator  33.33 
 
 		 344 aa  89.7  5e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2770  inner-membrane translocator  31.62 
 
 		 320 aa  89  8e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0631444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1675  inner-membrane translocator  31.3 
 
 		 314 aa  89  1e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.675221  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0634  inner-membrane translocator  32.68 
 
 		 324 aa  88.6  1e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2452  inner-membrane translocator  32.95 
 
 		 344 aa  88.6  1e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3535  inner-membrane translocator  29.5 
 
 		 334 aa  87  3e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0298292 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3367  inner-membrane translocator  28.47 
 
 		 342 aa  87  4e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4660  inner-membrane translocator  33.46 
 
 		 343 aa  86.3  5e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.886685 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4369  inner-membrane translocator  34.27 
 
 		 346 aa  86.3  6e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0543124  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0010  inner-membrane translocator  27.37 
 
 		 309 aa  85.9  7e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00370487 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0617  inner-membrane translocator  31.18 
 
 		 339 aa  85.9  8e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0657  inner-membrane translocator  31.18 
 
 		 339 aa  85.9  8e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.558006  normal  0.165436 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1079  inner-membrane translocator  26.88 
 
 		 333 aa  85.9  8e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.710188  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1019  ABC transporter related  29.8 
 
 		 594 aa  85.9  8e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0177  inner-membrane translocator  31.98 
 
 		 333 aa  85.9  8e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0836  inner-membrane translocator  32.01 
 
 		 318 aa  85.5  9e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.997362 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4008  inner-membrane translocator  34.93 
 
 		 352 aa  85.5  0.000000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.731792  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0078  inner-membrane translocator  29.96 
 
 		 324 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3340  transmembrane ABC transporter protein  30.17 
 
 		 328 aa  84.3  0.000000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3531  inner-membrane translocator  24.82 
 
 		 340 aa  84  0.000000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.696528 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6572  inner-membrane translocator  32.81 
 
 		 351 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0236609  normal  0.0263346 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1795  inner-membrane translocator  34.36 
 
 		 338 aa  84  0.000000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.121113  hitchhiker  0.000132557 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2235  inner-membrane translocator  30.19 
 
 		 327 aa  83.6  0.000000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.344649  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2247  transmembrane ABC transporter protein  32.4 
 
 		 341 aa  83.6  0.000000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0431032  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1401  inner-membrane translocator  30.27 
 
 		 439 aa  83.6  0.000000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.296284  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5160  inner-membrane translocator  27.36 
 
 		 332 aa  83.6  0.000000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.767449  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0089  inner-membrane translocator  29.54 
 
 		 324 aa  83.2  0.000000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.828472 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1905  inner-membrane translocator  33.1 
 
 		 338 aa  83.2  0.000000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.802473 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0838  inner-membrane translocator  32.61 
 
 		 345 aa  82.8  0.000000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.825897  normal  0.140783 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3045  inner-membrane translocator  30.96 
 
 		 323 aa  82.8  0.000000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.926794  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3407  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  24.7 
 
 		 298 aa  82.8  0.000000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000473911 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1228  inner-membrane translocator  35.71 
 
 		 354 aa  82.4  0.000000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0580355  normal  0.0656558 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2609  inner-membrane translocator  29.57 
 
 		 415 aa  82  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6433  inner-membrane translocator  29.1 
 
 		 344 aa  82  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0224691  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0354  inner-membrane translocator  31.33 
 
 		 311 aa  82  0.00000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.112024  normal  0.284931 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0733  ABC transporter related  32.93 
 
 		 597 aa  81.6  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4219  inner-membrane translocator  30.19 
 
 		 335 aa  81.3  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1331  inner-membrane translocator  32.86 
 
 		 363 aa  81.3  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.412363  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3779  inner-membrane translocator  31.3 
 
 		 349 aa  81.3  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3269  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  31.22 
 
 		 324 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.251109 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2564  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  31.47 
 
 		 355 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4270  inner-membrane translocator  30.71 
 
 		 325 aa  81.6  0.00000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4079  inner-membrane translocator  26.62 
 
 		 323 aa  80.1  0.00000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3690  inner-membrane translocator  34.57 
 
 		 610 aa  79.7  0.00000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00194124  normal  0.651023 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1935  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  24.67 
 
 		 333 aa  79.3  0.00000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1480  inner-membrane translocator  28.41 
 
 		 407 aa  79.3  0.00000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0010  inner-membrane translocator  28.81 
 
 		 318 aa  78.6  0.0000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.429526  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3477  inner-membrane translocator  30.1 
 
 		 333 aa  79  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.783038  normal  0.228237 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1805  inner-membrane translocator  33.44 
 
 		 337 aa  78.6  0.0000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.50221  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1818  inner-membrane translocator  30.86 
 
 		 313 aa  77.8  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3270  ABC transporter related  29.83 
 
 		 313 aa  78.2  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2899  ABC transporter related  30.19 
 
 		 852 aa  78.2  0.0000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3595  inner-membrane translocator  29.6 
 
 		 311 aa  77.4  0.0000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.612179 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0567  inner-membrane translocator  29.82 
 
 		 443 aa  78.2  0.0000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.856247  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0195  inner-membrane translocator  33.58 
 
 		 337 aa  78.2  0.0000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0085  inner-membrane translocator  32.2 
 
 		 324 aa  78.2  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4216  inner-membrane translocator  31.66 
 
 		 630 aa  78.2  0.0000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.105315 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8053  inner-membrane translocator  27.95 
 
 		 331 aa  77.4  0.0000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4452  inner-membrane translocator  27.95 
 
 		 331 aa  77.4  0.0000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.37302  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3675  putative branched-chain amino acid transport system ATP-binding protein  28.72 
 
 		 632 aa  77  0.0000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1448  inner-membrane translocator  32.73 
 
 		 337 aa  77  0.0000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00412694  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2023  inner-membrane translocator  31.86 
 
 		 445 aa  77  0.0000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.102668  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3209  inner-membrane translocator  29.07 
 
 		 334 aa  76.6  0.0000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1286  inner-membrane translocator  32.73 
 
 		 337 aa  77  0.0000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.20936  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3242  inner-membrane translocator  28.29 
 
 		 329 aa  76.6  0.0000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.194129  normal  0.515147 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2025  inner-membrane translocator  31.67 
 
 		 339 aa  76.6  0.0000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3185  inner-membrane translocator  30.21 
 
 		 334 aa  76.6  0.0000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.798731 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1839  inner-membrane translocator  28.79 
 
 		 350 aa  76.6  0.0000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3556  inner-membrane translocator  32.37 
 
 		 340 aa  76.6  0.0000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0669576  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1681  inner-membrane translocator  31.86 
 
 		 445 aa  76.6  0.0000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1990  inner-membrane translocator  29.95 
 
 		 315 aa  76.6  0.0000000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.97086  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0610  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  29.96 
 
 		 389 aa  75.9  0.0000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0957  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  27.08 
 
 		 331 aa  75.9  0.0000000000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.834531  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>