More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_1928 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_1928  membrane-bound lytic murein transglycosylase B  100 
 
 		 331 aa  677    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00139398  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2442  lytic murein transglycosylase  53.25 
 
 		 331 aa  346  4e-94  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00214249  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2517  lytic murein transglycosylase  50.46 
 
 		 333 aa  318  7.999999999999999e-86  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000972564  normal  0.926391 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1897  lytic murein transglycosylase  48.77 
 
 		 370 aa  308  5.9999999999999995e-83  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000349949  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1870  lytic murein transglycosylase  48 
 
 		 370 aa  306  4.0000000000000004e-82  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000324668  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1904  lytic murein transglycosylase  47.84 
 
 		 370 aa  301  1e-80  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.025136  normal  0.972057 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2422  lytic murein transglycosylase  47.69 
 
 		 370 aa  300  2e-80  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000759063  hitchhiker  0.00536739 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2116  lytic murein transglycosylase  44.48 
 
 		 329 aa  287  2e-76  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0286626  normal  0.0851142 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2248  putative transglycosylase  46.08 
 
 		 333 aa  283  2.0000000000000002e-75  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00479266  normal  0.458492 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2171  putative transglycosylase  45.81 
 
 		 333 aa  281  8.000000000000001e-75  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000761177  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2380  putative transglycosylase  45.21 
 
 		 333 aa  279  5e-74  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00018447  normal  0.231561 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1631  membrane-bound lytic murein transglycosylase B  42.77 
 
 		 329 aa  271  8.000000000000001e-72  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00716763  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3516  putative transglycosylase  41.98 
 
 		 347 aa  267  2e-70  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.112608  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1075  lytic murein transglycosylase  40.54 
 
 		 349 aa  259  5.0000000000000005e-68  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00383925  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2182  putative transglycosylase  42.6 
 
 		 329 aa  255  8e-67  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00884137  hitchhiker  0.0000305333 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1069  hypothetical protein  42.9 
 
 		 324 aa  254  1.0000000000000001e-66  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.912642  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01141  putative transglycosylase  42.77 
 
 		 323 aa  241  7.999999999999999e-63  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.629651  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004084  membrane-bound lytic murein transglycosylase B  40.18 
 
 		 323 aa  241  1e-62  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00180088  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1543  putative lytic murein transglycosylase  41.74 
 
 		 323 aa  241  2e-62  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000590177  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1739  membrane-bound lytic murein transglycosylase  40.97 
 
 		 322 aa  240  2e-62  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01388  membrane-bound lytic murein transglycosylase B  40.18 
 
 		 323 aa  239  6.999999999999999e-62  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2801  lytic murein transglycosylase  40.8 
 
 		 331 aa  231  1e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2396  lytic murein transglycosylase  36.05 
 
 		 362 aa  196  4.0000000000000005e-49  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0276595  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2008  lytic murein transglycosylase  35.74 
 
 		 362 aa  194  1e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000275571  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2119  lytic murein transglycosylase  35.74 
 
 		 361 aa  194  1e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0387524  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2754  lytic murein transglycosylase  35.26 
 
 		 346 aa  189  7e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.00000000102797  hitchhiker  0.000133589 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00471  membrane-bound lytic transglycolase-related protein  30.03 
 
 		 421 aa  186  6e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2705  lytic murein transglycosylase  31.95 
 
 		 438 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000884934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0051  lytic murein transglycosylase  34.4 
 
 		 421 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2675  lytic murein transglycosylase  33.22 
 
 		 377 aa  183  3e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00742108  normal  0.0400647 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2591  lytic murein transglycosylase  31.95 
 
 		 411 aa  183  4.0000000000000006e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000114496  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2630  lytic murein transglycosylase  31.68 
 
 		 438 aa  182  8.000000000000001e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000526618  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1904  lytic murein transglycosylase  30.6 
 
 		 396 aa  182  9.000000000000001e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000413322  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1755  lytic murein transglycosylase  31.63 
 
 		 436 aa  182  1e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000443123  hitchhiker  0.00243223 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2786  lytic murein transglycosylase  34.96 
 
 		 419 aa  181  2e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.245296  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1125  membrane bound lytic murein transglycosylase B  34.96 
 
 		 417 aa  181  2e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.170659  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0498  lytic murein transglycosylase  31.88 
 
 		 409 aa  181  2e-44  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000929833  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2029  membrane-bound lytic transglycolase-related protein  31.17 
 
 		 401 aa  181  2e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000748498  normal  0.890774 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1465  lytic murein transglycosylase  37.14 
 
 		 400 aa  181  2e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.20045 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2988  hypothetical protein  33.44 
 
 		 320 aa  178  1e-43  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2846  hypothetical protein  33.44 
 
 		 320 aa  176  4e-43  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2341  lytic murein transglycosylase  30.74 
 
 		 424 aa  176  6e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000746143  normal  0.0730107 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1947  lytic murein transglycosylase  31.21 
 
 		 395 aa  175  8e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000327314  normal  0.0135301 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2459  lytic murein transglycosylase  30.28 
 
 		 430 aa  175  9e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000623044  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1706  lytic murein transglycosylase  33.78 
 
 		 454 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0024  lytic murein transglycosylase  30.94 
 
 		 330 aa  175  9.999999999999999e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.567632  normal  0.0161595 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2269  lytic murein transglycosylase  30.42 
 
 		 424 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00964574  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1149  membrane-bound lytic murein transglycosylase B  32.19 
 
 		 333 aa  174  1.9999999999999998e-42  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4798  lytic murein transglycosylase  33.56 
 
 		 438 aa  172  5.999999999999999e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.287921 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4357  hypothetical protein  32.67 
 
 		 445 aa  172  6.999999999999999e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1019  putative lytic murein transglycosylase  31.87 
 
 		 333 aa  172  6.999999999999999e-42  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2437  membrane-bound lytic murein transglycosylase B  33.12 
 
 		 363 aa  172  9e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4851  lytic murein transglycosylase  33.56 
 
 		 438 aa  171  1e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3997  lytic murein transglycosylase  33.53 
 
 		 422 aa  171  2e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.162973  normal  0.0839045 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4673  lytic murein transglycosylase  33.22 
 
 		 438 aa  171  2e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4817  HopAJ2 protein  32.33 
 
 		 445 aa  170  3e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1994  membrane-bound lytic transglycolase-related protein  32.47 
 
 		 433 aa  169  7e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2316  lytic murein transglycosylase  32.93 
 
 		 439 aa  168  1e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000000238033  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3599  lytic murein transglycosylase  30.77 
 
 		 410 aa  166  5e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.522427  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2141  lytic murein transglycosylase  28.35 
 
 		 437 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000451146  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3959  hypothetical protein  37.17 
 
 		 411 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.315352  normal  0.0796345 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2141  lytic murein transglycosylase  28.17 
 
 		 395 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000982897  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0016  lytic murein transglycosylase  33.47 
 
 		 415 aa  162  7e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0388549  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3967  lytic murein transglycosylase  35.84 
 
 		 413 aa  162  8.000000000000001e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3436  lytic murein transglycosylase  31.99 
 
 		 412 aa  161  1e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3229  membrane-bound lytic murein transglycosylase B  35.84 
 
 		 462 aa  162  1e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2313  lytic murein transglycosylase  29.17 
 
 		 415 aa  162  1e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.429417  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0623  lytic murein transglycosylase  32.44 
 
 		 438 aa  161  2e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3432  lytic murein transglycosylase  31.15 
 
 		 428 aa  160  2e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1837  lytic murein transglycosylase  32.87 
 
 		 474 aa  160  3e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.436573 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0061  lytic murein transglycosylase  31.37 
 
 		 434 aa  159  4e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.266485  normal  0.550387 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4961  lytic murein transglycosylase  30.33 
 
 		 440 aa  160  4e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08490  lytic murein transglycosylase  31.46 
 
 		 438 aa  158  9e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0470585  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1848  lytic murein transglycosylase  31.88 
 
 		 409 aa  159  9e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1653  lytic murein transglycosylase  35.65 
 
 		 424 aa  158  1e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.725775 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1939  lytic murein transglycosylase  31.05 
 
 		 427 aa  157  3e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.421247 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1030  lytic murein transglycosylase  32.55 
 
 		 438 aa  156  4e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3596  lytic murein transglycosylase  30.39 
 
 		 393 aa  156  4e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.662665  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2991  lytic murein transglycosylase  34.55 
 
 		 455 aa  156  5.0000000000000005e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.729746  normal  0.516476 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49280  transglycolase  32.4 
 
 		 398 aa  155  8e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.520721  normal  0.0136859 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4208  transglycolase  32.4 
 
 		 398 aa  155  1e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1688  lytic murein transglycosylase  32.17 
 
 		 466 aa  155  1e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3272  lytic murein transglycosylase  33.61 
 
 		 393 aa  155  1e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.657687 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2510  lytic murein transglycosylase  35.22 
 
 		 417 aa  154  2e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.577172 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1704  lytic murein transglycosylase  36.63 
 
 		 400 aa  154  2e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.030456  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1213  lytic murein transglycosylase  33.48 
 
 		 417 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0904  lytic murein transglycosylase  31.88 
 
 		 430 aa  153  2.9999999999999998e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3255  lytic murein transglycosylase  35.96 
 
 		 418 aa  153  5e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.278323  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1174  lytic murein transglycosylase  34.43 
 
 		 392 aa  152  5.9999999999999996e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1115  putative lipoprotein  33.33 
 
 		 448 aa  152  7e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.592751  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0212  lytic murein transglycosylase  28.43 
 
 		 395 aa  151  1e-35  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.740075  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0157  lytic murein transglycosylase  35.5 
 
 		 418 aa  150  2e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3470  lytic murein transglycosylase  30.65 
 
 		 400 aa  151  2e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2024  lytic murein transglycosylase  32.38 
 
 		 457 aa  150  3e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.796607  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4073  lytic murein transglycosylase  34.96 
 
 		 423 aa  149  4e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0024  lytic murein transglycosylase  33.61 
 
 		 419 aa  149  5e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0850  lytic murein transglycosylase  36.41 
 
 		 432 aa  149  7e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2957  lytic murein transglycosylase  31.84 
 
 		 470 aa  149  9e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.344089  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0031  transglycosylase, putative  33.2 
 
 		 427 aa  148  1.0000000000000001e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0704571  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0357  lytic murein transglycosylase  35.87 
 
 		 514 aa  148  1.0000000000000001e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>