More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_1056 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_1056  rare lipoprotein A  100 
 
 		 185 aa  362  1e-99  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0387657  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1255  rare lipoprotein A  55.48 
 
 		 320 aa  148  5e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.994921  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0482  rare lipoprotein A  53.5 
 
 		 303 aa  140  1.9999999999999998e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.241212  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0496  rare lipoprotein A, putative  45.99 
 
 		 224 aa  130  6.999999999999999e-30  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2700  rare lipoprotein A  56.45 
 
 		 318 aa  124  1e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1705  rare lipoprotein A  52.8 
 
 		 367 aa  118  4.9999999999999996e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0823  rare lipoprotein A  51.67 
 
 		 281 aa  118  4.9999999999999996e-26  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0647438  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3108  rare lipoprotein A  47.26 
 
 		 339 aa  116  1.9999999999999998e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.66001  normal  0.467764 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1470  rare lipoprotein A  55.17 
 
 		 282 aa  116  1.9999999999999998e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00612022  normal  0.287685 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1456  rare lipoprotein A  48.95 
 
 		 322 aa  115  3e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.12367  normal  0.0142155 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2153  rare lipoprotein A  51.26 
 
 		 382 aa  113  2.0000000000000002e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4323  rare lipoprotein A  53.6 
 
 		 314 aa  112  4.0000000000000004e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2474  rare lipoprotein A  50.41 
 
 		 195 aa  112  4.0000000000000004e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.379574  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2228  rare lipoprotein A  52.54 
 
 		 194 aa  111  6e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1579  rare lipoprotein A  46.58 
 
 		 408 aa  110  8.000000000000001e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00357969  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3111  rare lipoprotein A  47.52 
 
 		 315 aa  109  3e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.829805  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4362  rare lipoprotein A  52.59 
 
 		 342 aa  108  5e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0440112  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1466  rare lipoprotein A  52.59 
 
 		 279 aa  108  6e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.515787 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1179  rare lipoprotein A  50 
 
 		 375 aa  107  1e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00815633  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1971  rare lipoprotein A  47.14 
 
 		 323 aa  106  1e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3152  rare lipoprotein A  50 
 
 		 370 aa  107  1e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00554597  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12090  RlpA family lipoprotein  48.57 
 
 		 341 aa  106  1e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.751179  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2972  lipoprotein A domain-containing protein  57.94 
 
 		 143 aa  106  2e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4822  lipoprotein, rlpA family  51.72 
 
 		 342 aa  106  2e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2708  rare lipoprotein A  55.26 
 
 		 285 aa  105  3e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1109  putative lipoprotein  52.59 
 
 		 342 aa  105  3e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4106  hypothetical protein  50.86 
 
 		 283 aa  105  3e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.322542  normal  0.202617 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0175  rare lipoprotein A  48.95 
 
 		 324 aa  105  3e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.365013  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1108  rare lipoprotein A  60 
 
 		 360 aa  105  4e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1079  rare lipoprotein A  60 
 
 		 360 aa  105  4e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0749  rare lipoprotein A  50 
 
 		 275 aa  105  5e-22  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0714634  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0617  rare lipoprotein A  51.72 
 
 		 332 aa  105  5e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0426495  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2676  rare lipoprotein A  45.21 
 
 		 314 aa  105  5e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.36166  normal  0.127788 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1353  rare lipoprotein A  50 
 
 		 275 aa  105  5e-22  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.582482  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0696  rare lipoprotein A  49.17 
 
 		 270 aa  105  5e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0674  rare lipoprotein A  50 
 
 		 266 aa  104  6e-22  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.391975  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01654  rare lipoprotein A  44 
 
 		 322 aa  104  6e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000527551  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2012  rare lipoprotein A  52.59 
 
 		 312 aa  104  7e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.127741  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3795  rare lipoprotein A  50.41 
 
 		 337 aa  104  9e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.443521  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4804  rare lipoprotein A family  51.72 
 
 		 333 aa  103  1e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.641404 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2235  rare lipoprotein A  44.16 
 
 		 249 aa  103  1e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4967  rare lipoprotein A  45.95 
 
 		 335 aa  103  1e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1818  rare lipoprotein A, putative  40.8 
 
 		 274 aa  103  1e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.207585  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1495  rare lipoprotein A  40.8 
 
 		 274 aa  103  1e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4857  rare lipoprotein A  51.72 
 
 		 333 aa  103  1e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.292191  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0990  rare lipoprotein A family protein  50 
 
 		 421 aa  103  2e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1995  rare lipoprotein A  48.7 
 
 		 364 aa  103  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.359065  normal  0.0392025 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0958  rare lipoprotein A family protein  50 
 
 		 419 aa  103  2e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.138105  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0720  rare lipoprotein A  53.98 
 
 		 116 aa  103  2e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1190  rare lipoprotein a rlpa  50 
 
 		 239 aa  103  2e-21  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0545  rare lipoprotein A  50.41 
 
 		 341 aa  103  2e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1807  rare lipoprotein A  48.7 
 
 		 364 aa  103  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.206051  hitchhiker  0.00189733 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0301  rare lipoprotein A rlpa  43.54 
 
 		 240 aa  103  2e-21  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.665029  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08420  Rare lipoprotein, RlpA family  50.41 
 
 		 325 aa  102  3e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.108645  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1631  rare lipoprotein A family protein  51.49 
 
 		 242 aa  102  3e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2697  rare lipoprotein A  41.86 
 
 		 169 aa  102  3e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4679  rare lipoprotein A  50.86 
 
 		 333 aa  102  3e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.362563  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3488  rare lipoprotein A  46.15 
 
 		 265 aa  102  3e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000216134 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3399  rare lipoprotein A family protein  51.49 
 
 		 242 aa  102  3e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0569835  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2911  rare lipoprotein A family protein  51.49 
 
 		 230 aa  102  4e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.339601  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0043  rare lipoprotein A family protein  51.49 
 
 		 211 aa  102  4e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2970  rare lipoprotein A family protein  51.49 
 
 		 211 aa  102  4e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3902  rare lipoprotein A family protein  51.49 
 
 		 211 aa  102  4e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3150  rare lipoprotein A family protein  51.49 
 
 		 211 aa  102  4e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3821  rare lipoprotein A family protein  51.49 
 
 		 230 aa  102  4e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.577854  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2712  rare lipoprotein A  49.14 
 
 		 314 aa  102  4e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.824805 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1506  rare lipoprotein A  49.61 
 
 		 442 aa  102  4e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0428333  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1268  rare lipoprotein A  46.72 
 
 		 284 aa  101  6e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.149494  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3338  sugar fermentation stimulation protein  52.59 
 
 		 297 aa  101  7e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000024991  normal  0.0181355 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1557  rare lipoprotein A  43.17 
 
 		 321 aa  101  7e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000368198  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2633  rare lipoprotein A  51.72 
 
 		 257 aa  100  1e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2298  rare lipoprotein A  52.68 
 
 		 238 aa  100  1e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4283  rare lipoprotein A  47.66 
 
 		 367 aa  100  1e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1548  rare lipoprotein A  45.71 
 
 		 290 aa  100  1e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2450  rare lipoprotein A  49.15 
 
 		 171 aa  100  2e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0060097  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2087  rare lipoprotein A  51.72 
 
 		 169 aa  100  2e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1152  rare lipoprotein A  52.94 
 
 		 335 aa  99.8  2e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5099  hypothetical protein  58.06 
 
 		 125 aa  99.8  2e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.637831  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0200  rare lipoprotein A  49.5 
 
 		 203 aa  99.8  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58210  hypothetical protein  57.45 
 
 		 125 aa  100  2e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0214  rare lipoprotein A  49.5 
 
 		 203 aa  99.8  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.104099 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3389  rare lipoprotein A  49.5 
 
 		 214 aa  99  3e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0471  putative rare lipoprotein A  40.41 
 
 		 263 aa  99  4e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000420345  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0709  rare lipoprotein A  58.62 
 
 		 124 aa  99  4e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.416345  normal  0.119045 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2075  rare lipoprotein A  47.41 
 
 		 424 aa  98.6  4e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0268  rare lipoprotein A  49.5 
 
 		 203 aa  99  4e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.170156 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0195  rare lipoprotein A  49.5 
 
 		 202 aa  98.6  5e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.489761  hitchhiker  0.00000000287556 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2701  rare lipoprotein A  47.41 
 
 		 312 aa  98.2  5e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2624  hypothetical protein  49.14 
 
 		 160 aa  98.2  6e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2475  hypothetical protein  49.14 
 
 		 160 aa  98.2  6e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3377  rare lipoprotein A  52.53 
 
 		 115 aa  98.2  6e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.437587  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2856  rare lipoprotein A  47.46 
 
 		 154 aa  98.2  6e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0286  rare lipoprotein A  49.5 
 
 		 213 aa  98.2  6e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.838824  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1199  rare lipoprotein A  47.37 
 
 		 361 aa  97.8  7e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.670363  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0319  rare lipoprotein A  42.97 
 
 		 186 aa  97.8  7e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000762425  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2966  rare lipoprotein A  44.74 
 
 		 381 aa  97.8  8e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.508447  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2845  rare lipoprotein A  48.28 
 
 		 311 aa  97.8  8e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00000926657  hitchhiker  0.0000043303 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2537  rare lipoprotein A  50.89 
 
 		 243 aa  97.8  9e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.875468  normal  0.18015 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1294  rare lipoprotein A  43.97 
 
 		 346 aa  97.4  1e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.347531  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2591  rare lipoprotein A  49.11 
 
 		 278 aa  97.4  1e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00126384  normal  0.496007 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>