108 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_1518 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_1518  hypothetical protein  100 
 
 		 189 aa  383  1e-106  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2811  hypothetical protein  96.3 
 
 		 189 aa  373  1e-103  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2816  hypothetical protein  96.83 
 
 		 189 aa  373  1e-103  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2738  hypothetical protein  96.3 
 
 		 189 aa  372  1e-102  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2908  hypothetical protein  96.3 
 
 		 189 aa  371  1e-102  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.590499 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1373  hypothetical protein  88.89 
 
 		 189 aa  348  3e-95  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1268  hypothetical protein  89.42 
 
 		 189 aa  347  4e-95  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1336  hypothetical protein  89.42 
 
 		 189 aa  347  4e-95  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3011  protein of unknown function DUF162  89.42 
 
 		 189 aa  347  4e-95  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.014585 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1350  hypothetical protein  88.36 
 
 		 189 aa  343  6e-94  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2998  hypothetical protein  77.25 
 
 		 189 aa  310  1e-83  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3922  hypothetical protein  79.89 
 
 		 189 aa  308  4e-83  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3006  hypothetical protein  77.25 
 
 		 189 aa  300  6.000000000000001e-81  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1854  hypothetical protein  72.87 
 
 		 187 aa  273  1.0000000000000001e-72  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.360306  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2443  hypothetical protein  55.03 
 
 		 189 aa  186  2e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0429594  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3417  protein of unknown function DUF162  38.92 
 
 		 208 aa  127  7.000000000000001e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2977  hypothetical protein  42.56 
 
 		 196 aa  125  4.0000000000000003e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.123013  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3175  protein of unknown function DUF162  39.59 
 
 		 196 aa  122  3e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.775002  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3067  protein of unknown function DUF162  39.09 
 
 		 196 aa  119  3e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3930  protein of unknown function DUF162  37.24 
 
 		 194 aa  118  3.9999999999999996e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5746  protein of unknown function DUF162  37.31 
 
 		 195 aa  118  6e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.021165 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1435  hypothetical protein  54.46 
 
 		 196 aa  114  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4920  protein of unknown function DUF162  39.1 
 
 		 193 aa  110  1.0000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0840479  normal  0.348092 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2948  protein of unknown function DUF162  37.5 
 
 		 193 aa  105  4e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4210  hypothetical protein  38.35 
 
 		 195 aa  103  2e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.364052  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0697  protein of unknown function DUF162  45 
 
 		 203 aa  92  5e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1173  YkgG family protein  32.81 
 
 		 204 aa  89.7  2e-17  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2617  hypothetical protein  33.17 
 
 		 201 aa  81.6  0.000000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.183316 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2840  protein of unknown function DUF162  33.17 
 
 		 201 aa  81.3  0.000000000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.516916  normal  0.547198 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2647  protein of unknown function DUF162  31.63 
 
 		 201 aa  78.6  0.00000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.585819  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1271  protein of unknown function DUF162  25.95 
 
 		 195 aa  70.9  0.00000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.51876  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5427  protein of unknown function DUF162  25.52 
 
 		 195 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5819  hypothetical protein  30.32 
 
 		 179 aa  65.5  0.0000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.68053  normal  0.186475 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2928  hypothetical protein  31.44 
 
 		 201 aa  64.3  0.0000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1178  hypothetical protein  23.04 
 
 		 195 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0392457  normal  0.790539 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3244  hypothetical protein  33.67 
 
 		 205 aa  57.4  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00147785  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1867  protein of unknown function DUF162  32 
 
 		 209 aa  56.2  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1032  protein of unknown function DUF162  31.73 
 
 		 214 aa  55.8  0.0000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.00153846  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2721  protein of unknown function DUF162  27.63 
 
 		 231 aa  54.3  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0341  hypothetical protein  36.19 
 
 		 209 aa  53.5  0.000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.349947  normal  0.615412 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0969  hypothetical protein  31.37 
 
 		 234 aa  52.8  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1272  protein of unknown function DUF162  39.53 
 
 		 240 aa  52  0.000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2255  protein of unknown function DUF162  26.32 
 
 		 197 aa  50.8  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000000220864  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2306  hypothetical protein  31.03 
 
 		 187 aa  50.4  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2448  hypothetical protein  25.79 
 
 		 228 aa  49.7  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.608615  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0390  protein of unknown function DUF162  34.65 
 
 		 241 aa  48.9  0.00004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1452  conserved hypothetical protein (DUF162 domain protein)  31.58 
 
 		 216 aa  48.5  0.00005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0000739876  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0029  protein of unknown function DUF162  35.56 
 
 		 229 aa  48.5  0.00006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.738112  normal  0.18947 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4387  hypothetical protein  32.18 
 
 		 203 aa  48.1  0.00008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4474  hypothetical protein  32.18 
 
 		 203 aa  48.1  0.00008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4768  hypothetical protein  32.18 
 
 		 203 aa  48.1  0.00008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0673  hypothetical protein  30.69 
 
 		 213 aa  47.4  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2283  hypothetical protein  31.25 
 
 		 228 aa  47.8  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00564388  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0886  hypothetical protein  25.84 
 
 		 213 aa  47.4  0.0001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1026  hypothetical protein  33.68 
 
 		 236 aa  47  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0565  protein of unknown function DUF162  23.73 
 
 		 189 aa  47.4  0.0001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.476806  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1032  putative transmembrane protein  26.14 
 
 		 243 aa  47  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.635857  normal  0.76334 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1053  hypothetical protein  27.81 
 
 		 220 aa  47  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000873871  normal  0.361547 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1898  hypothetical protein  33.33 
 
 		 227 aa  46.6  0.0002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.482836  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0432  hypothetical protein  31.82 
 
 		 342 aa  47  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.110787  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1315  protein of unknown function DUF162  29.41 
 
 		 183 aa  46.6  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000245285 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0897  protein of unknown function DUF162  32.58 
 
 		 239 aa  46.2  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0189235 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2910  protein of unknown function DUF162  29.41 
 
 		 183 aa  46.2  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0962  protein of unknown function DUF162  32.58 
 
 		 239 aa  46.2  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.898925  normal  0.0872687 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1728  protein of unknown function DUF162  23.08 
 
 		 210 aa  46.2  0.0003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.488819  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3988  ykgG family protein  32.98 
 
 		 236 aa  45.8  0.0004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1356  ykgG family protein  32.98 
 
 		 236 aa  45.1  0.0006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0200  hypothetical protein  30.77 
 
 		 224 aa  45.1  0.0007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0689  hypothetical protein  27.47 
 
 		 187 aa  45.1  0.0007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05110  hypothetical protein  27.52 
 
 		 220 aa  44.7  0.0008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2595  protein of unknown function DUF162  31.03 
 
 		 213 aa  44.7  0.0009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.252822  normal  0.0430329 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0984  protein of unknown function DUF162  29.33 
 
 		 426 aa  44.7  0.0009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000000554666  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4214  hypothetical protein  27.72 
 
 		 220 aa  44.7  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000286287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0153  hypothetical protein  27.37 
 
 		 184 aa  43.9  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000024635  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2202  hypothetical protein  28.26 
 
 		 220 aa  44.3  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000275393  normal  0.467535 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1220  hypothetical protein  32.63 
 
 		 236 aa  44.3  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.795  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0809  hypothetical protein  26.44 
 
 		 220 aa  43.9  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0239766  normal  0.348083 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2931  protein of unknown function DUF162  25.9 
 
 		 220 aa  43.9  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00316375  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1458  ykgG family protein  32.63 
 
 		 236 aa  43.9  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.25356  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1999  protein of unknown function DUF162  29.82 
 
 		 218 aa  44.3  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000429287  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1621  hypothetical protein  26.61 
 
 		 212 aa  43.5  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1418  ykgG family protein  32.63 
 
 		 236 aa  43.5  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1218  ykgG family protein  32.63 
 
 		 236 aa  43.1  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1196  hypothetical protein  32.63 
 
 		 236 aa  43.5  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1198  hypothetical protein  32.63 
 
 		 236 aa  43.1  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1317  ykgG family protein  32.63 
 
 		 236 aa  43.1  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5898  hypothetical protein  30.83 
 
 		 236 aa  43.9  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.81355 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0391  hypothetical protein  23.64 
 
 		 185 aa  43.5  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.633551  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1010  hypothetical protein  39.34 
 
 		 382 aa  43.1  0.002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.12516  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1394  ykgG family protein  32.63 
 
 		 236 aa  43.1  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1767  hypothetical protein  63.33 
 
 		 226 aa  43.1  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.403313  normal  0.0258937 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0395  protein of unknown function DUF162  29.2 
 
 		 218 aa  43.1  0.003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.294344 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3261  hypothetical protein  24.88 
 
 		 230 aa  42.7  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2910  protein of unknown function DUF162  29.41 
 
 		 400 aa  42.7  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000447072  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1992  protein of unknown function DUF162  28.16 
 
 		 210 aa  42.7  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3561  protein of unknown function DUF162  32.69 
 
 		 212 aa  42.7  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0438326  normal  0.0115324 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0373  hypothetical protein  29.7 
 
 		 244 aa  42.4  0.004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2900  protein of unknown function DUF162  24.41 
 
 		 209 aa  42.4  0.004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.225002  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2956  hypothetical protein  24.41 
 
 		 230 aa  42  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0711  hypothetical protein  33.7 
 
 		 205 aa  42  0.005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>