88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_0659 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_0659  lysozyme, putative  100 
 
 		 185 aa  377  1e-104  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2129  glycoside hydrolase family protein  90.27 
 
 		 188 aa  341  4e-93  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.471156  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2082  glycoside hydrolase family protein  89.73 
 
 		 188 aa  339  1e-92  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0227839  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0776  glycoside hydrolase family 24  49.72 
 
 		 174 aa  169  2e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.180108  normal  0.254443 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0749  glycoside hydrolase family protein  49.72 
 
 		 174 aa  168  4e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.719939  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0780  glycoside hydrolase family protein  48.62 
 
 		 177 aa  165  4e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00423151 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3605  glycoside hydrolase family protein  48.62 
 
 		 177 aa  162  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0767581  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1293  glycoside hydrolase family protein  44.89 
 
 		 163 aa  142  2e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.616877  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1671  glycoside hydrolase family protein  41.76 
 
 		 155 aa  130  9e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3256  glycoside hydrolase family protein  39.08 
 
 		 159 aa  121  5e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0715149  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0629  phage lysozyme  37.02 
 
 		 165 aa  102  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.194528  decreased coverage  0.000000266391 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00513  hypothetical protein  38.12 
 
 		 163 aa  95.1  6e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.770196  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00507  predicted lysozyme  38.12 
 
 		 165 aa  94.7  7e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.69492  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0827  phage lysozyme  38.12 
 
 		 165 aa  94.4  8e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.99177  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2900  phage lysozyme  37.5 
 
 		 165 aa  93.6  1e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.58341  hitchhiker  0.0000000713415 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3074  Lysozyme  37.5 
 
 		 165 aa  94.4  1e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0892  phage lysozyme  37.5 
 
 		 165 aa  92.8  2e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0394  phage lysozyme  36.36 
 
 		 167 aa  92.4  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.684429  decreased coverage  0.00000000000000176346 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1392  glycoside hydrolase family protein  36.57 
 
 		 157 aa  91.7  5e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.9576  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3886  glycoside hydrolase family protein  35.53 
 
 		 165 aa  86.7  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.047713  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1797  glycoside hydrolase family protein  35.53 
 
 		 165 aa  85.5  4e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5063  lysozyme  36.36 
 
 		 153 aa  84.3  9e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.232512  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0693  lysozyme  36.36 
 
 		 153 aa  84.3  9e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1920  hypothetical protein  32.89 
 
 		 165 aa  78.6  0.00000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.080974  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01975  hypothetical protein  31.07 
 
 		 159 aa  77.8  0.00000000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1695  hypothetical protein  31.76 
 
 		 163 aa  75.1  0.0000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.182005  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2648  Lysozyme  36.42 
 
 		 158 aa  74.3  0.000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.010454  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3526  lysozyme  38.28 
 
 		 177 aa  66.2  0.0000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.68891  hitchhiker  0.0000339599 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0944  phage lysozyme  31.22 
 
 		 177 aa  64.7  0.0000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.330694  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01346  hypothetical protein  35.92 
 
 		 177 aa  63.9  0.000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.288512  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01337  predicted lysozyme  35.92 
 
 		 177 aa  63.9  0.000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.343135  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2321  glycoside hydrolase family protein  30.72 
 
 		 341 aa  62.8  0.000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2254  phage lysozyme  35.21 
 
 		 177 aa  63.2  0.000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000386881 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1774  phage lysozyme  35.21 
 
 		 177 aa  63.2  0.000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.175131  normal  0.015497 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1644  phage lysozyme  35.92 
 
 		 177 aa  63.5  0.000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000011957  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1529  phage lysozyme  35.21 
 
 		 177 aa  62.8  0.000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3208  lysozyme  36.36 
 
 		 177 aa  62.8  0.000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0196212 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1858  lysozyme  36.36 
 
 		 177 aa  62.8  0.000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000403604 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0875  Lysozyme  36.94 
 
 		 143 aa  62.8  0.000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.225375  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1057  lysozyme  33.77 
 
 		 220 aa  62.8  0.000000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.738881  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0240  phage lysozyme  34.42 
 
 		 220 aa  62.4  0.000000004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0155947  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1270  phage lysozyme  34.27 
 
 		 177 aa  62.4  0.000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.209647  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3143  lysozyme  36.72 
 
 		 177 aa  62.4  0.000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.60318  hitchhiker  0.000000000619176 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1174  lysozyme  35.21 
 
 		 177 aa  61.6  0.000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.847559 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0702  phage-related lysozyme  33.33 
 
 		 142 aa  61.6  0.000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.513061  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1450  phage lysozyme  37.5 
 
 		 177 aa  61.2  0.000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1183  phage lysozyme  35.21 
 
 		 177 aa  60.8  0.00000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00117162  hitchhiker  0.0000000000363783 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2785  phage lysozyme  33.8 
 
 		 177 aa  60.1  0.00000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.455094  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1875  glycoside hydrolase family 24  29.52 
 
 		 179 aa  59.7  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0471339  normal  0.356094 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2083  lysozyme  35.21 
 
 		 177 aa  58.9  0.00000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.773263  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2090  Lysozyme  35.21 
 
 		 177 aa  58.9  0.00000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00497326  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1150  lysozyme  33.33 
 
 		 179 aa  58.9  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.258572  hitchhiker  0.0000000000000138553 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2609  lysozyme  33.15 
 
 		 178 aa  57.8  0.00000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.013223  normal  0.0317443 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1136  lysozyme  36.62 
 
 		 179 aa  56.2  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0965  glycoside hydrolase family protein  33.75 
 
 		 225 aa  55.1  0.0000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000238073  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2043  Lysozyme  31.87 
 
 		 150 aa  55.1  0.0000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0821  glycoside hydrolase family protein  33.75 
 
 		 225 aa  55.1  0.0000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000529126  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1305  glycoside hydrolase family protein  29.87 
 
 		 136 aa  54.7  0.0000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.340031 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1735  Lysozyme  31.25 
 
 		 150 aa  53.9  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0740685  normal  0.733452 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2248  lysozyme  34.62 
 
 		 178 aa  53.9  0.000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.158229 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3388  lysozyme  27.74 
 
 		 143 aa  52.8  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.836181  hitchhiker  0.000487886 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3296  prophage LambdaSo, lysozyme, putative  26.09 
 
 		 170 aa  52.8  0.000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.938297  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4784  lysozyme  31.06 
 
 		 148 aa  50.1  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.156327  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4258  lysozyme  31.06 
 
 		 148 aa  50.1  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00805915 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3077  glycoside hydrolase family 24  35.96 
 
 		 177 aa  50.1  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.154512  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0875  glycoside hydrolase family protein  32.73 
 
 		 178 aa  49.3  0.00003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1185  glycoside hydrolase family 24  29.23 
 
 		 175 aa  49.3  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1032  putative bacteriophage lysozyme  28.75 
 
 		 205 aa  48.1  0.00006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.326117  normal  0.312631 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2287  glycoside hydrolase family protein  31.41 
 
 		 168 aa  47.8  0.00009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.161394  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3043  phage lysozyme  30.19 
 
 		 170 aa  47  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00146006 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0931  phage lysozyme  30.19 
 
 		 170 aa  47  0.0001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0580  Lysozyme  27.5 
 
 		 153 aa  46.6  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2770  glycoside hydrolase family protein  30.19 
 
 		 171 aa  47  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.206287  decreased coverage  0.0000183318 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1743  glycoside hydrolase family protein  32.94 
 
 		 170 aa  46.2  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000121347 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02719  conserved hypothetical protein  29.6 
 
 		 186 aa  45.8  0.0003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.30064 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1402  phage lysozyme  30.67 
 
 		 149 aa  45.8  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000103436 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1065  phage lysozyme  30.67 
 
 		 149 aa  45.8  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000243456 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2642  glycoside hydrolase family protein  27.78 
 
 		 196 aa  45.8  0.0004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.118674  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2180  lysozyme  28.39 
 
 		 170 aa  45.8  0.0004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.233317 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2861  phage lysozyme  29.56 
 
 		 169 aa  45.4  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0912  lysozyme  29.87 
 
 		 164 aa  43.1  0.002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2819  phage lysozyme  29.45 
 
 		 149 aa  43.1  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.559643  normal  0.149188 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1729  putative endolysin (lysis protein) (lysozyme)  25.52 
 
 		 169 aa  43.5  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.171325  normal  0.0114013 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0449  glycoside hydrolase family protein  27.74 
 
 		 157 aa  43.1  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0116911 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2236  hypothetical protein  35.11 
 
 		 137 aa  42.4  0.003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.258479  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1158  phage-related lysozyme  31.53 
 
 		 166 aa  42.4  0.004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.901858  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4180  peptidoglycan binding domain-containing protein  38.89 
 
 		 414 aa  42  0.005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.988623 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1053  lysozyme  32.43 
 
 		 165 aa  41.6  0.006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.152359  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>