126 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SAG0554 on replicon NC_004116
Organism: Streptococcus agalactiae 2603V/R



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004116  SAG0554  prophage LambdaSa1, Cro/CI family transcriptional regulator  100 
 
 		 63 aa  125  2.0000000000000002e-28  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4331  XRE family transcriptional regulator  47.46 
 
 		 88 aa  55.8  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0346  transcriptional regulator of molybdate metabolism, XRE family  44.07 
 
 		 377 aa  55.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3853  XRE family molybdate metabolism transcriptional regulator  42.37 
 
 		 377 aa  50.1  0.00001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.593506  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4055  molybdate metabolism transcriptional regulator  38.98 
 
 		 377 aa  49.7  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00182658  normal  0.26319 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0591  transcriptional regulator, XRE family  40.68 
 
 		 68 aa  50.1  0.00001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1115  transcriptional regulator, Cro/CI family  38.98 
 
 		 77 aa  48.9  0.00002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.253142  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3877  helix-turn-helix domain protein  38.98 
 
 		 383 aa  48.9  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.862285 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00425  transcriptional regulator, XRE family protein  39.06 
 
 		 67 aa  49.3  0.00002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0381282  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4042  molybdate metabolism transcriptional regulator  37.29 
 
 		 376 aa  48.5  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.805509  normal  0.419577 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0586  XRE family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 134 aa  48.1  0.00004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0875  XRE family transcriptional regulator  46.55 
 
 		 77 aa  48.1  0.00004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000023095  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4003  transcriptional regulator, XRE family  40.68 
 
 		 61 aa  47.8  0.00006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0248  hypothetical protein  42.11 
 
 		 233 aa  47.8  0.00006  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5402  XRE family transcriptional regulator  46.94 
 
 		 74 aa  47.4  0.00007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1655  transcriptional regulator, XRE family  38.98 
 
 		 81 aa  47.4  0.00007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1357  helix-turn-helix domain-containing protein  40.68 
 
 		 76 aa  47.4  0.00008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.222468  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1009  XRE family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 170 aa  47  0.00009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000623644  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3903  transcriptional regulator, XRE family  41.38 
 
 		 64 aa  47  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.009018  normal  0.0135287 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1460  molybdate metabolism transcriptional regulator  37.93 
 
 		 368 aa  47  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1681  XRE family transcriptional regulator  41.51 
 
 		 123 aa  46.6  0.0001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.527285 
 
 
-
 
NC_002936  DET1555  DNA-binding protein  38.1 
 
 		 72 aa  45.4  0.0002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00000236293  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2195  XRE family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 83 aa  45.4  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1301  XRE family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 96 aa  46.2  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.405872  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1816  XRE family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 191 aa  45.8  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00473491  hitchhiker  0.000617218 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0517  DNA-binding protein  41.38 
 
 		 67 aa  45.4  0.0002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00223122 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1848  XRE family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 76 aa  45.1  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1297  transcriptional regulator, XRE family  39.29 
 
 		 182 aa  45.4  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.814605  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0251  Cro/CI family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 72 aa  44.7  0.0004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1613  XRE family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 71 aa  44.7  0.0004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.307047 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46710  putative transcriptional regulator  40.35 
 
 		 216 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0037508  decreased coverage  0.000000167672 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0888  XRE family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 67 aa  44.7  0.0004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0092  XRE family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 210 aa  44.7  0.0004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4024  putative transcriptional regulator  40.35 
 
 		 195 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.181748  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_67  hypothetical protein  38.6 
 
 		 72 aa  45.1  0.0004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3624  XRE family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 75 aa  44.3  0.0005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0437  transcriptional regulator  40.35 
 
 		 212 aa  44.3  0.0006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.686873 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12593  repressor protein  36.21 
 
 		 67 aa  43.9  0.0007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0504  transcriptional regulator  45.61 
 
 		 75 aa  43.9  0.0007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1806  hypothetical protein  41.38 
 
 		 370 aa  43.9  0.0008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.057388 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3250  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  37.93 
 
 		 189 aa  43.5  0.0009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.653673  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0162  hypothetical protein  37.93 
 
 		 64 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3469  DNA-binding protein  37.93 
 
 		 189 aa  43.5  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.162788  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5158  transcriptional regulator, XRE family  41.38 
 
 		 198 aa  43.5  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.503819  normal  0.690311 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4158  XRE family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 403 aa  43.5  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0178123  normal  1 
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_2954  transcriptional regulator, XRE family  38.46 
 
 		 223 aa  43.1  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.00000000000401895  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0337  XRE family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 76 aa  43.5  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0583349  normal  0.335191 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3803  XRE family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 76 aa  43.5  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.151697  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0524  XRE family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 67 aa  43.1  0.001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.138157  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4290  transcriptional regulator, XRE family  38.6 
 
 		 70 aa  42.7  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.34926  normal  0.146409 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0943  XRE family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 182 aa  43.5  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0594  transcriptional regulator, XRE family  42.37 
 
 		 117 aa  43.5  0.001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_489  DNA-binding protein  39.66 
 
 		 67 aa  42.7  0.001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.140066  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1892  transcriptional regulator, XRE family  39.66 
 
 		 89 aa  43.1  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.883347  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2484  transcriptional regulator, XRE family  37.93 
 
 		 67 aa  43.5  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0251  transcriptional repressor LexA, putative  39.62 
 
 		 217 aa  42.7  0.002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00843575  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0274  transcriptional repressor LexA, putative  39.62 
 
 		 217 aa  42.7  0.002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0548  DNA-binding protein  39.66 
 
 		 67 aa  42.7  0.002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0884  transcriptional repressor LexA, putative  39.62 
 
 		 217 aa  42.7  0.002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0403534  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0023  transcriptional regulator  37.93 
 
 		 87 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0278  XRE family transcriptional regulator  45.1 
 
 		 128 aa  42.7  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000672654  normal  0.646275 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0501  XRE family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 68 aa  42.4  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.60564  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3707  molybdate metabolism transcriptional regulator  34.48 
 
 		 374 aa  42.4  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.487138  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4552  XRE family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 76 aa  42.4  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0101  XRE family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 71 aa  42.4  0.002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000391644  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0299  XRE family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 71 aa  42.4  0.002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000289962  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1325  cupin 2 domain-containing protein  36.84 
 
 		 175 aa  42.4  0.002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0153  transcriptional regulator  37.93 
 
 		 64 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3308  transcriptional regulator  36.21 
 
 		 187 aa  42  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.38656  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2087  XRE family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 195 aa  41.6  0.003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0099  transcriptional regulator, XRE family  38.6 
 
 		 194 aa  42  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.798061 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0970  XRE family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 182 aa  42  0.003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0077  phage repressor like transcriptional regulator  37.93 
 
 		 207 aa  42  0.003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5036  XRE family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 72 aa  41.6  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.899436  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5417  XRE family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 72 aa  41.6  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.602876  normal  0.653324 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2793  transcriptional regulator, XRE family  39.66 
 
 		 76 aa  42  0.003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08690  Helix-turn-helix protein  37.74 
 
 		 87 aa  41.6  0.003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.176489 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0009  HTH-type transcriptional regulator SinR  33.33 
 
 		 60 aa  42  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2770  XRE family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 192 aa  41.6  0.004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.169539 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2928  XRE family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 70 aa  41.6  0.004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  unclonable  0.000000000000595128  normal  0.0963674 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4897  XRE family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 219 aa  41.2  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4986  XRE family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 219 aa  41.2  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5265  XRE family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 219 aa  41.2  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.223709 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0591  XRE family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 113 aa  41.6  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1991  XRE family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 69 aa  41.6  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1806  transcriptional regulator, XRE family  36.84 
 
 		 181 aa  41.2  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2148  DNA-binding protein, putative  36.84 
 
 		 181 aa  41.2  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1650  DNA-binding protein  44.23 
 
 		 181 aa  41.2  0.005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000412674  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6209  hypothetical protein  38.98 
 
 		 120 aa  41.2  0.005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.280043  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1781  DNA-binding protein  44.23 
 
 		 181 aa  41.2  0.005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1530  XRE family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 403 aa  41.2  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0255908 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1795  DNA-binding protein  47.92 
 
 		 181 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3132  putative transcription regulator protein  38.6 
 
 		 209 aa  40.8  0.006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.25062  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4868  DNA-binding protein; transcriptional regulator  35.09 
 
 		 68 aa  40.8  0.006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5404  DNA-binding protein  35.09 
 
 		 70 aa  40.8  0.006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0197  XRE family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 190 aa  40.8  0.006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0555347  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11150  putative transcriptional regulator  36.84 
 
 		 68 aa  40.8  0.006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00242881  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5920  transcriptional regulator, XRE family  39.66 
 
 		 72 aa  41.2  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2775  putative phage repressor  46.15 
 
 		 264 aa  40.8  0.006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2924  putative phage repressor  46.15 
 
 		 264 aa  40.8  0.006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>