More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_1548 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_1548  ABC-2 type transporter  100 
 
 		 366 aa  720    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.299648  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_701  ABC transporter, permease protein  33.51 
 
 		 360 aa  213  3.9999999999999995e-54  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.222918  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0721  ABC-2 type transporter  33.88 
 
 		 360 aa  212  7e-54  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00179914  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0795  ABC transporter, permease protein  32.37 
 
 		 339 aa  193  4e-48  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0125503  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4230  ABC-2 type transporter  30.62 
 
 		 375 aa  186  4e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5132  ABC-2 type transporter  31.52 
 
 		 358 aa  167  2.9999999999999998e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.033585  normal  0.150856 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0703  ABC-2 type transporter  25.96 
 
 		 363 aa  129  6e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.422501  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3101  ABC-2 type transporter  30.06 
 
 		 344 aa  129  1.0000000000000001e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000558169  hitchhiker  0.0000121126 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0285  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  28.93 
 
 		 356 aa  128  2.0000000000000002e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5840  ABC-2 type transporter  26.19 
 
 		 367 aa  124  2e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.564028 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0094  ABC-2 type transporter  25.07 
 
 		 388 aa  113  6e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00282283  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2148  putative ABC transporter, permease protein  23.56 
 
 		 327 aa  112  9e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.249033  normal  0.497773 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4327  ABC-2 type transporter  30.03 
 
 		 378 aa  105  9e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4560  ABC-2 type transporter  33.33 
 
 		 257 aa  103  4e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4162  ABC-2 type transporter  27.69 
 
 		 384 aa  101  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.80712  normal  0.28462 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2769  ABC-2 type transporter  30.49 
 
 		 413 aa  100  3e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.160651  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3689  ABC-2 type transporter  27.69 
 
 		 384 aa  100  6e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.093618  normal  0.708678 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1067  putative ABC transporter, permease protein  23.69 
 
 		 341 aa  99.4  8e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7430  ABC efflux pump, inner membrane subunit  27.52 
 
 		 359 aa  98.2  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.104702  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1746  ABC efflux pump, inner membrane subunit  26.88 
 
 		 384 aa  97.8  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0249268  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0698  putative transmembrane protein  25.93 
 
 		 376 aa  98.2  2e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1654  hypothetical protein  33.17 
 
 		 261 aa  97.8  3e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8102  ABC-2 type transporter  28.57 
 
 		 379 aa  97.1  4e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9333  hypothetical protein  33.83 
 
 		 244 aa  96.7  6e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.312033 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2219  ABC-2 type transporter  37.04 
 
 		 261 aa  96.3  7e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000229601  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1340  ABC-2 type transporter  24.66 
 
 		 378 aa  96.3  8e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2826  hypothetical protein  27.47 
 
 		 376 aa  95.9  1e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2584  ABC-2 type transporter  31.86 
 
 		 251 aa  95.5  1e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.369437  normal  0.0868823 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4256  ABC-2 type transporter  30.15 
 
 		 249 aa  95.1  1e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2429  ABC-2 type transporter  31.37 
 
 		 251 aa  94.7  2e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0140653  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0495  ABC-2 type transporter  25.14 
 
 		 365 aa  95.1  2e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_460  ABC-type transport system, permease component  22.99 
 
 		 365 aa  94.7  2e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.185192  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3695  ABC-2 type transporter  36.63 
 
 		 250 aa  93.6  5e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.869493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0585  ABC-2 type transporter  24.05 
 
 		 371 aa  92.8  8e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000556211 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0348  multidrug ABC transporter permease component  25.8 
 
 		 384 aa  92  1e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6512  ABC-2 type transporter  25.94 
 
 		 359 aa  89.7  6e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.102415  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4202  ABC-2 type transporter  34.01 
 
 		 258 aa  89.7  8e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0519  ABC transporter, permease protein, putative  23.14 
 
 		 365 aa  89  1e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.180275  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0165  hypothetical protein  23.73 
 
 		 381 aa  89.4  1e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0147217  normal  0.470058 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001402  ABC-type multidrug transport system permease component  24.09 
 
 		 366 aa  88.6  1e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0113  ABC-2 type transporter  21.69 
 
 		 376 aa  89.4  1e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.816984  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0217  ABC-2 type transporter  21.59 
 
 		 380 aa  89.4  1e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.623242  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5656  ABC-2 type transporter  25.94 
 
 		 359 aa  89.4  1e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.78729  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3539  ABC-2 type transporter  22.97 
 
 		 369 aa  89  1e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6131  ABC-2 type transporter  26.49 
 
 		 358 aa  89.4  1e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.862302  normal  0.0100987 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6021  ABC-2 type transporter  25.94 
 
 		 359 aa  89.4  1e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.679719  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4746  ABC-type multidrug transport system permease component-like protein  31 
 
 		 232 aa  88.2  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.495874 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0407  hypothetical protein  26.08 
 
 		 382 aa  87.4  3e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.10374  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2368  hypothetical protein  25.91 
 
 		 379 aa  87.4  3e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.305787  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0425  ABC-2 type transporter  24.66 
 
 		 366 aa  87.4  4e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0552  ABC-2 type transporter  26.18 
 
 		 336 aa  87.4  4e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3252  ABC-2 type transporter  25.74 
 
 		 375 aa  86.3  7e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.432582  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3574  ABC-2 type transporter  28.5 
 
 		 443 aa  86.3  7e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.473143  normal  0.674394 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4005  ABC-2 type transporter  30.39 
 
 		 280 aa  86.3  7e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.101832  hitchhiker  0.000201414 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2399  ABC-2 type transporter  32.14 
 
 		 241 aa  85.9  9e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.00000000000992199  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4363  ABC-2 type transporter  23.78 
 
 		 367 aa  85.1  0.000000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0054  ABC-2 type transporter  23.9 
 
 		 388 aa  84.3  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2919  ABC-2 type transporter  21.08 
 
 		 368 aa  83.6  0.000000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.856849  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2449  ABC-type multidrug transport system permease component  23.2 
 
 		 369 aa  83.2  0.000000000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0811  ABC-2 type transporter  21.69 
 
 		 377 aa  83.6  0.000000000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06359  hypothetical protein  24.58 
 
 		 366 aa  83.2  0.000000000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1781  ABC-2 type transporter  24.85 
 
 		 381 aa  82.8  0.000000000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.290069  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0093  ABC-2 type transporter  24.19 
 
 		 356 aa  82.4  0.00000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.154072  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3002  ABC-2 type transporter  26.01 
 
 		 375 aa  82.4  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.871422 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0504  ABC-2 type transporter  25.07 
 
 		 368 aa  82.4  0.00000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0820778  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0057  ABC-2 type transporter  23.01 
 
 		 387 aa  82.4  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2079  ABC-2 type transporter  32.5 
 
 		 269 aa  82.8  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.524343  normal  0.682712 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3534  hypothetical protein  21.73 
 
 		 381 aa  82  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0131  ABC-2 type transporter  25.54 
 
 		 378 aa  81.6  0.00000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.110874  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0655  hypothetical protein  23.89 
 
 		 376 aa  80.9  0.00000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00126989 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2544  ABC-2 type transporter  29.47 
 
 		 265 aa  81.3  0.00000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.408574  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2250  ABC-2 type transporter  31.19 
 
 		 275 aa  80.5  0.00000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000130225 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0608  ABC-2 type transporter  31.93 
 
 		 281 aa  80.1  0.00000000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2907  ABC-2 type transporter  24.59 
 
 		 376 aa  79.7  0.00000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1738  ABC-2 type transporter  24.22 
 
 		 372 aa  79.7  0.00000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5055  ABC-2 type transporter  25.76 
 
 		 371 aa  79.3  0.00000000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.863659 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1265  ABC-type multidrug transport system, permease component  23.9 
 
 		 365 aa  79.3  0.0000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000431089  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0909  ABC transporter protein  28.57 
 
 		 276 aa  79.3  0.0000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.982909  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4676  ABC-2 type transporter  22.7 
 
 		 379 aa  79  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3623  ABC-2 type transporter  27.94 
 
 		 280 aa  79  0.0000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4064  ABC-2 type transporter  24.62 
 
 		 371 aa  78.2  0.0000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1867  hypothetical protein  21.2 
 
 		 381 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.205494  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1990  putative integral membrane transport protein  32.66 
 
 		 261 aa  78.6  0.0000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0534  ABC-2 type transporter, permease protein  25.27 
 
 		 363 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.359277  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4575  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  21.04 
 
 		 370 aa  77.8  0.0000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.745541  normal  0.326628 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1610  multidrug ABC transporter, permease  23.39 
 
 		 381 aa  77  0.0000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.476781  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1917  hypothetical protein  21.13 
 
 		 381 aa  77.4  0.0000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5640  ABC-2 type transporter  23.32 
 
 		 368 aa  77.4  0.0000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.332161 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0699  hypothetical protein  25.27 
 
 		 363 aa  77  0.0000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.201685  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1419  hypothetical protein  24.25 
 
 		 369 aa  77  0.0000000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.779934  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0516  ABC-2 type transporter, permease protein  25.27 
 
 		 363 aa  77  0.0000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.948898  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4310  ABC-2 type transporter  25.13 
 
 		 390 aa  76.6  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1686  hypothetical protein  29.82 
 
 		 280 aa  76.6  0.0000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3460  hypothetical protein  25.07 
 
 		 373 aa  76.3  0.0000000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1806  hypothetical protein  22.92 
 
 		 381 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3151  ABC transporter, permease protein, putative  25.27 
 
 		 363 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0275  ABC-2 type transporter  31.12 
 
 		 231 aa  75.5  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1551  ABC-2 type transporter  24.03 
 
 		 373 aa  75.5  0.000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0121  ABC-2 type transporter, permease protein  25.27 
 
 		 363 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1467  putative ABC transporter, permease protein  25.27 
 
 		 363 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>