More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_3055 on replicon NC_009050
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007494  RSP_3410  TRAP-T family transporter periplasmic binding protein  99.37 
 
 		 317 aa  637    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.523204  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3055  hypothetical protein  100 
 
 		 317 aa  641    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.150263  normal  0.0186232 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03721  conserved hypothetical protein  36.98 
 
 		 324 aa  206  5e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03670  hypothetical protein  36.98 
 
 		 324 aa  206  5e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4211  periplasmic binding protein  36.98 
 
 		 324 aa  205  8e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00352553 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1719  hypothetical protein  37.72 
 
 		 326 aa  192  8e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0711752  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0982  hypothetical protein  33.64 
 
 		 326 aa  182  6e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0298  hypothetical protein  36.9 
 
 		 323 aa  180  2e-44  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3869  hypothetical protein  38.97 
 
 		 332 aa  180  2.9999999999999997e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0415956  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3545  hypothetical protein  33.33 
 
 		 350 aa  178  1e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.874099  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3966  hypothetical protein  35.44 
 
 		 356 aa  177  2e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0682449  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3931  hypothetical protein  31.94 
 
 		 320 aa  174  1.9999999999999998e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0498  hypothetical protein  30.95 
 
 		 318 aa  172  5.999999999999999e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5327  hypothetical protein  36.36 
 
 		 322 aa  170  2e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0097  hypothetical protein  36.12 
 
 		 316 aa  168  1e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0114  hypothetical protein  35.74 
 
 		 316 aa  166  2.9999999999999998e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4047  extra-cytoplasmic solute receptor  33.89 
 
 		 329 aa  167  2.9999999999999998e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0364236  normal  0.64466 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3516  hypothetical protein  32.65 
 
 		 318 aa  166  4e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000184229  normal  0.0629404 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0309  twin-arginine translocation pathway signal  41.01 
 
 		 328 aa  165  6.9999999999999995e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4557  hypothetical protein  38.2 
 
 		 327 aa  165  6.9999999999999995e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.634039  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2776  hypothetical protein  36.05 
 
 		 332 aa  165  1.0000000000000001e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.918758  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1913  hypothetical protein  39.41 
 
 		 333 aa  163  4.0000000000000004e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0165718  hitchhiker  0.00808178 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5551  extra-cytoplasmatic solute receptor  35.29 
 
 		 322 aa  161  1e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5584  hypothetical protein  35.16 
 
 		 337 aa  161  1e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0384253  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0256  hypothetical protein  40 
 
 		 327 aa  159  5e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3420  hypothetical protein  33.66 
 
 		 320 aa  159  6e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.21089  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3894  hypothetical protein  36.24 
 
 		 321 aa  159  7e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0107663  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3442  hypothetical protein  34.85 
 
 		 324 aa  159  7e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0502272 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2123  hypothetical protein  35.06 
 
 		 326 aa  159  8e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0729826  normal  0.176092 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0842  hypothetical protein  33.99 
 
 		 325 aa  158  1e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6283  hypothetical protein  32.17 
 
 		 321 aa  157  2e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.120039  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5221  Bug family extra-cytoplasmic solute receptor  34.38 
 
 		 347 aa  157  2e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.334182 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1815  hypothetical protein  34.75 
 
 		 325 aa  157  2e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00540737  normal  0.0160042 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3530  hypothetical protein  37.09 
 
 		 331 aa  157  3e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.175021  hitchhiker  0.00737093 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4142  hypothetical protein  34.74 
 
 		 328 aa  157  3e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.627286  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  33.23 
 
 		 328 aa  156  4e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3513  hypothetical protein  34.46 
 
 		 333 aa  156  4e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1604  hypothetical protein  36.7 
 
 		 334 aa  156  4e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0478  hypothetical protein  33.57 
 
 		 325 aa  156  5.0000000000000005e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.606939  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0183  hypothetical protein  32.99 
 
 		 333 aa  156  5.0000000000000005e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.248413 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4314  hypothetical protein  34.08 
 
 		 322 aa  155  6e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.210006  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1334  hypothetical protein  32.47 
 
 		 325 aa  155  7e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000781341 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4280  hypothetical protein  35.76 
 
 		 333 aa  154  1e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.711918  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3949  hypothetical protein  34.83 
 
 		 339 aa  154  1e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187886  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1370  hypothetical protein  34.36 
 
 		 338 aa  155  1e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5060  hypothetical protein  33.12 
 
 		 331 aa  154  1e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1906  hypothetical protein  34.97 
 
 		 325 aa  155  1e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.375062  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4356  hypothetical protein  35.66 
 
 		 323 aa  154  2e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0210  hypothetical protein  33.72 
 
 		 322 aa  154  2e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1047  hypothetical protein  36.33 
 
 		 316 aa  154  2e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0384871  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2596  hypothetical protein  33.7 
 
 		 327 aa  154  2e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.523201  normal  0.428813 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0710  hypothetical protein  33.9 
 
 		 328 aa  154  2.9999999999999998e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4232  extra-cytoplasmic solute receptor  36.69 
 
 		 314 aa  153  2.9999999999999998e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.125597  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6257  hypothetical protein  36.91 
 
 		 332 aa  153  4e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.460323  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0023  hypothetical protein  31.87 
 
 		 323 aa  153  4e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.908143  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1436  hypothetical protein  32.09 
 
 		 318 aa  153  4e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.779932  normal  0.517463 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0969  putative lipoprotein  38 
 
 		 322 aa  153  4e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.288033  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4146  extra-cytoplasmic solute receptor  37.11 
 
 		 339 aa  153  4e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00162583  normal  0.322023 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0005  hypothetical protein  31.56 
 
 		 323 aa  152  7e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.736537 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3983  extra-cytoplasmic solute receptor  35.96 
 
 		 328 aa  152  8.999999999999999e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0104878 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1712  hypothetical protein  33.45 
 
 		 325 aa  152  1e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.407863  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4614  hypothetical protein  36.27 
 
 		 322 aa  151  1e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.25356  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5887  hypothetical protein  35.36 
 
 		 318 aa  151  1e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.947907  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2429  hypothetical protein  32.09 
 
 		 326 aa  150  2e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2514  hypothetical protein  32.79 
 
 		 325 aa  151  2e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1323  hypothetical protein  33.44 
 
 		 333 aa  150  3e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.520366  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1635  hypothetical protein  35.07 
 
 		 333 aa  150  3e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.345549  normal  0.902401 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1829  hypothetical protein  35.64 
 
 		 327 aa  150  3e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2980  hypothetical protein  36.24 
 
 		 327 aa  150  4e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4957  hypothetical protein  36.81 
 
 		 331 aa  149  4e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0102082  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4137  hypothetical protein  33.55 
 
 		 326 aa  150  4e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.864349 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1755  hypothetical protein  32.33 
 
 		 325 aa  150  4e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.191519  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4438  extra-cytoplasmic solute receptor  33.87 
 
 		 329 aa  150  4e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000369974  normal  0.285012 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0719  hypothetical protein  34.8 
 
 		 326 aa  149  6e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.32495 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2106  hypothetical protein  35.47 
 
 		 337 aa  149  7e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.150501  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  32.08 
 
 		 327 aa  149  7e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4644  hypothetical protein  33.96 
 
 		 321 aa  149  7e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.206487  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0709  hypothetical protein  34.4 
 
 		 328 aa  149  7e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.802476 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3510  hypothetical protein  37.55 
 
 		 332 aa  149  7e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1992  hypothetical protein  36.17 
 
 		 317 aa  149  8e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.108122  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1404  hypothetical protein  32.42 
 
 		 328 aa  149  8e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5896  hypothetical protein  34.27 
 
 		 332 aa  148  1.0000000000000001e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.971815  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0187  hypothetical protein  32.98 
 
 		 332 aa  148  1.0000000000000001e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2083  hypothetical protein  35.55 
 
 		 332 aa  148  1.0000000000000001e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.280461  normal  0.301608 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3496  hypothetical protein  31.77 
 
 		 327 aa  148  1.0000000000000001e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.192421 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5547  hypothetical protein  35.96 
 
 		 325 aa  148  1.0000000000000001e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0012  hypothetical protein  35.47 
 
 		 323 aa  148  1.0000000000000001e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  34.54 
 
 		 330 aa  148  1.0000000000000001e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4691  hypothetical protein  33.11 
 
 		 324 aa  148  1.0000000000000001e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.23954  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0130  hypothetical protein  35.45 
 
 		 328 aa  148  1.0000000000000001e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.090251 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  34.11 
 
 		 330 aa  148  1.0000000000000001e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3056  hypothetical protein  34.33 
 
 		 332 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.176831  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1625  hypothetical protein  31.99 
 
 		 325 aa  148  2.0000000000000003e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.354122  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0454  hypothetical protein  35.79 
 
 		 329 aa  147  2.0000000000000003e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.746083  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2249  hypothetical protein  31.99 
 
 		 325 aa  147  2.0000000000000003e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.570594 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0463  hypothetical protein  35.79 
 
 		 329 aa  147  2.0000000000000003e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.474593  normal  0.230992 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2828  hypothetical protein  33.45 
 
 		 328 aa  147  2.0000000000000003e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.384643  normal  0.180289 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5370  extra-cytoplasmic solute receptor  34.88 
 
 		 322 aa  147  2.0000000000000003e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.114035  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3801  extra-cytoplasmic solute receptor  30.99 
 
 		 330 aa  147  2.0000000000000003e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.828068  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3084  hypothetical protein  34.98 
 
 		 326 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.482393  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>